Anda di halaman 1dari 10

X. Pindah Silang dan Peta Kromosom 1. Linkage (keterpautan) Penelitian Wiliam Bateson dan R.C.

Punnett menggunakan dua kultivar kacang polong, yaitu: 1. Kultivar berbunga ungu, dan berbutir tepungsari panjang 2. Kultivar berbunga merah dan berbutir tepung sari bulat. Hasil penelitian diketahui bahwa:

1. warna ungu (U) dominan terhadap merah (u) 2. polen panjang (P) dominan terhadap bulat (p)
3. pada persilangan monohibrid, pada generasi F2 setiap karakter memberikan rasio 3:1, tetapi pada persilangan dihibrid tidak memenuhi rasio 9:3:3:1. Percobaan dihibrid yang dilakukan Bateson dan Punnet sebagai berikut (Persilanngan 1). P F1 F2 Fenotip Ungu, panjang Ungu, bulat Merah, panjang Merah, bulat Jumlah UUPP x uupp ungu panjang merah bulat UuPp ungu panjang Hasil pengamatan 296 19 27 85 427 Hasil yang diharapkan 240 80 80 27 427

Data hasil persilangan menunjukkan bahwa: 1. data tidak sesuai rasio 9:3:3:1, yaitu rasio yang diharapkan apabila dua pasang gen mengendalikan dua karakter yang bersegregasi bebas.

2. jika setiap karakter dianalisis terpisah, maka rasio yang diperoleh


sebagai berikut. Ungu : merah = (296 + 19) : (27 + 85) = 315 : 112 = 2.8 : 1 Panjang : bulat = (296 + 27) : (19 + 85) = 323 : 104 = 3.1 : 1

Data tersebut menunjukkan bahwa untuk masing-masing karakter sesuai dengan nisbah yang diharapkan yaitu 3: 1 (untuk monohibrid) yang menunjukkan segregasi bebas. 3. Berdasarkan hasil tersebut Bateson dan Punnet mengandaikan gen dominan untuk warna ungu dan gen dominan untuk polen panjang cenderung untuk tetap terikat, demikian pula gen resesif untuk bunga merah dan polen bulat. Untuk membuktikannya maka dilakukan persilangan antara tanaman berbunga ungu berpolen bulat dengan tanaman berbunga merah berpolen panjang (Persilangan 2). P F1 F2 Fenotip Ungu, panjang Ungu, bulat Merah, panjang Merah, bulat UUpp x uuPP ungu bulat merah panjang UuPp ungu panjang Hasil pengamatan 226 95 91 1 Hasil yang diharapkan 235 78 79 26

Berdasarkan data F2 hasil persilangan di atas diketahui bahwa hasil pengamatan tidak sesuai dengan yang diaharapkan, yaitu 9:3:3:1. Langkah selanjutnya, Bateson dan Punnet melakukan testcross pada F1 heterozigot dari kedua persilangan yang dilakukan ke tetua homozigot resesif. Testcross yang dilakukan sebagai berikut. Persilangan Testcross Ungu, panjang Ungu, bulat Merah, panjang Merah, bulat UUPP x uupp UuPp x uupp 7 1 1 7 UUpp x uuPP UuPp x uupp 1 7 7 1 Diharapkan

1 1 1 1

Rasio testcross

dari kedua F1 ternyata tidak sesuai dengan

rasio yang diharapkan. Dengan demikian kedua gen pengendali warna

bunga

dan

bentuk

polen

pada

kacang

polong

ternyata

tidak

bersegregasi bebas. Hukum Mendel ternyata tidak berlaku umum. Untuk memberikan pengertian dari percobaan Bateson dan Punnet di atas digunakan penjelasan melalui keadaan keterpautan antara kedua gen apakah dalam kondisi coupling atau repulsion. 1. Coupling Satu tetua membawakan kedua gen dominan dan tetua lainnya membawa kedua gen resesif. Contohnya pada persilangan 1, yaitu antara UUPP x uupp. Susunan ini sekarang dikenal sebagai cisarrangement atau susunan cis. 2. Repulsion Satu tetua membawakan satu gen dominan dan satu gen resesif; tetua lainnya membawakan gen dominan dan resesif lainnya. Contohnya pada persilanga 2, yaitu antara: UUpp x uuPP. Susunan ini sekarang dikenal sebagai trans-arrangement atau susunan trans. Melalui keadaan keterpautan diatas, maka susunan gen-gen yang linkage atau terpaut dari studi Bateson dan Punnet pada warna bunga dan bentuk polen kacang polong adalah sebagai berikut.

U u

P p

U u

p P
repulsion (trans)

coupling (cis)

Kombinasi gen-gen terpaut ditulis dengan tanda / di antara kromosom, atau _________ dan ditulis sebagai UP/up atau U p . uP UP / UP x up / up ungu panjang merah bulat Uu / Pp ungu panjang
U P u p

dan

Up/uP atau Coupling: P F1

Repulsion: P

Up / Up x uP / uP

ungu bulat merah panjang F1 Uu / Pp ungu panjang Penyimpangan hukum Mendel juga ditemukan oleh Tomas Hunt Morgan ketika sedang mempelajari dua pasang gen autosom pada Drosophila. Salah satu pasangan gen mempengaruhi warna mata (ungu, pr dan merah pr+), sedangkan gen lainnya mempengaruhi panjang sayap (pendek, vg dan normal, vg+). Morgan membuat persilangan: pr pr vg vg x pr+pr+ vg+vg+ pr+pr vg+vg x pr pr vg vg (test cross) pr+vg+ 1339 pr vg 1195 pr+ vg 151 pr vg+ 154

F1

2839 Hasil test cross di atas menyimpang dari nisbah dugaan secara Mendelian yaitu 1 : 1 : 1: 1, dan tampak adanya gen-gen koupling seperti yang dikemukakan oleh Bateson dan Punnett.
+ +

Kombinasi

pr vg dan pr vg merupakan kelas fenotip terbesar yang asalnya dari gamet kedua tetua, nisbahnya mendekati 1 : 1, demikian juga nisbah tipe bukan tetuanya. Pengujian test cross dilakukan oleh Morgan dengan memilih tetua-tetua homozigot untuk satu gen resesif dan mengawinkannya. F 1 nya disilangujikan kembali: Tetua pr+pr+ vg vgx pr pr vg+vg+ F1 pr+pr vg+vg x pr pr vg vg pr+vg+ 157 pr vg 146 pr+vg 965 pr vg+ 1067 2335 Hasil yang diperoleh tidak mendekati nisbah Mendelian 1 : 1 : 1 : 1, akan tetapi kelas yang terbesar bukan yang kedua-dua gennya dominan atau resesif, melainkan salah satu gennya dominan dan yang lainnya resesif. Kembali lagi kelas terbesar yang berasal dari gamet-

gamet tetuanya. Bateson dan Punnett menggunakan istilah repulsion untuk bentuk asosiasi gen satu dominan dan satu resesif (pr+vg dan pr vg+) seperti pada tetua-tetua persilangan. Bateson dan Punnett tidak bisa menerangkan bagaimana bentuk asosiasi gen koupling dan repulsion. Morgan mengemukakan bahwa kedua gen yang sedang dipelajari berada pada sepasang kromosom homolog yang sama. Jadi, gen pr dan vg yang berasal dari salah satu tetua berada pada satu kromosom, sedangkan gen pr+ dan vg+ dari tetua lainnya juga berada pada kromosom yang sama homolognya seperti gambar di bawah ini.

Tetua

pr pr pr

vg vg vg pr+ pr+ vg+ vg+

pr+ pr+ pr+

vg+ vg+ vg+

gamet

F1

Selanjutnya

hipotesis

Morgan

juga

menerangkan

tentang

repulsion, yaitu bahwa salah satu kromosom tetua membawa pr dan vg+, dan kromoson tetua lainnya membawa pr+ dan vg. Bagaimana terjadinya kombinasi bukan tetua? Morgan menerangkan bahwa ketika meiosis kromosom homolog berpasangan, dan pertukaran fisik antar potongan kromosom homolog terjadi pada suatu proses yang disebut pindah silang. Susunan gen pada sepasang kromosom mula-mula disebut tipe tetua sedangkan susunan gen pada kromosom hasil pindah silang disebut tipe rekombinan. Hipotesis Morgan tentang adanya dua gen pada sepasang kromosom homolog yang sama dikenal sebagai keterpautan atau gen-gen terpaut. 2. Crossing Over (Pindah Silang) Gen-gen menunjukkan linkage/keterpautan satu sama lain karena terletak sangat berdekatan pada kromosom yang sama.

Rekombinasi dari gen-gen yang terpaut terjadi jika kromosom homolog bertukar bagian-bagiannya dan prosesnya disebut crossing over. Dengan menggunakan tiga gen pada kromosom jagung yaitu: v gl = warna hijau dari daun / virescent = kecambah mengkilat / glossy saat meiosis) dipelajari proses pindah silang tunggal (single crossing over) dan ganda (double crossing over). a. Pindah Silang Tunggal

va = sterilitas sebagian (distribusi yang tidak beraturan pada

Di sini terjadi pandah silang pada kromatid 2: 3. Tetapi pertukaran dapat pula terjadi antara kromatid tidak bersaudara 1 dengan 3 atau 2 dengan 4. Hasil akhir meiosis akan sama. b. Pindah Silang Ganda

Pada diagram diatas pertukaran materi DNA terjadi antara kromatid tidak bersaudara yang sama, yaitu antara kromatid 2 dengan kromatid 3 baik antara ge v dan gl serta gen Gl dan Va dengan masingmasing gen v dan gl serta gen gl dan va. Pertukaran materi DNA dapat terjadi antara kromatid tidak bersaudara yang berbeda dan antara kromatid tidak bersaudara

dengan kromatid bersaudara. Sebagai contoh: jika pindah silang pertama terjadi antara gen V dan GL pada kromatid 2 dengan gen v dan gl pada kromatid 3, tetapi pindah silang kedua terjadi antara gen Gl dan V dari kromatid 2 dengan gen gl dan va dari kromatid 4. Dalam hal ini meiosis akan berbeda sebagi terlihat dalam diagram berikut.

3. Pendugaan Jarak Gen dan Pemetaan Genetik Metode yang pertama dilakukan adalah metode Alfred Stutevant. Morgan mengamati dari data hasil persilangan Drosophila, bahwa proporsi turunan tipe rekombinan gen-gen yang terpaut berbeda-beda bergantung pada pasangan gen yang dipelajari. Morgan memberikan data pengamatan hasil persilangannya kepada muridnya, Alfred Stutevant, yang pada waktu itu masih mahasiswa S1, dan diminta agar data pindah silang antar gen-gen terpaut bisa mempunyai arti. Sturtevant berhasil mengembangkan metode untuk menerangkan hubungan antar gen yang sampai sekarang masih digunakan Sturtevant menghitung jarak antar gen berdasarkan persentase tipe rekombinan yang terjadi. Misalnya jika frekuensi rekombinan antar gen A dan gen B adalah 5%, maka gen A dan gen B dipisahkan oleh 5 unit map (5 u.m). Bila diketahui gen A dan gen C dipisahkan oleh 3 u.m maka gen C dan gen B seharusnya dipisahkan oleh 8 u.m atau 2 u.m:

Peta berdasarkan rekombinasi: A 5 um B A 3 um C

maka kemungkinan peta A-B-C:

C 3 um atau A 3 um

A 5 um

B 2 um

Perlu disadari bahwa nilai jarak genetik ini adalah suatu hipotesis dan suatu nilai dugaan, sehingga tidak terlepas dari kesalahan persobaan, semakin besar proporsi yang dipakai maka semakin baik nilai dugaan. a. Uji Dua Titik Keterpautan Hasil uji silang tanaman heterozigot diperoleh data: UP / up UP / up Up / up uP / up up / up Jumlah x = = = = = up / up 70 10 10 70 160 Keterangan Tipe tetua Tipe rekombinan Tipe rekombinan Tipe tetua

Dari data di atas dapat diketahui bahwa: 1. dua gen tersebut terpaut, karena nisbahnya tidak sesuai dengan 1 : 1 : 1 : 1.

2. konfigurasi kedua gen pada tetua-tetuanya merupkan koupling,


karena fenotip kedua gen dominan dan kedua gen resesif lebih banyak daripada fenotip rekombinan.
10 + 10 X 100 % = 12,5% . 160

3. jarak antara U dan P adalah =


Peta genetik: U 12,5 um P

b. Uji Tiga Titik Keterpautan Uji tiga titik keterpautan lebih teliti, karena uji ini bisa melacak pindah silang ganda dan urutan gen. Misalkan uji silang tanaman jagung heterozigot untuk tiga gen menghasilkan turunan sebagai berikut: Gl Les Fl/gl les fl Gl Les Fl gl les fl Gl les fl gl Les Fl Gl Les fl gl les Fl Gl les Fl gl Les fl 111 42 33 16 16 838 Kelas turunan tipe tetua paling banyak yaitu 521 dari 838, kelas turunan pindah silang ganda dapat diidentifikasi sebagai kelas yang frekuensinya paling sedikit. Untuk menentukan frekuensi pindah silang antar 2 lokus adalah : Frek. pindah silang (ps) = (banyaknya ps tunggal + banyaknya ps ganda) x100% Jumlah semua turunan Ps (gl-les) = 99 + 111 + 16 + 16 x 100% 838 = 28.8 um jarak genetik gl dan les adalah 29 um Ps (les-fl) = 42 + 33 + 16 + 16 x 100% 838 = 12.8 um jarak genetik les dan fl adalah 13 um x 285 tipe tetua 236 99 tipe tetua satu pindah silang antara gl les fl/gl les fl

gl dan Les satu pindah silang antara Les dan fl dua pindah silang dua pindah silang

Dari perhitungan di atas ada dua kemungkinan peta genetik gen-gen gl-les-fl yaitu: 1. Fl 13 um atau 2. Gl 29 um Untuk menentukan mana yang benar maka perlu dihitung ps antara Gl dan Fl: Ps (gl-fl) = 99 + 111 + 42 + 33 x 100% 838 = 34 um Jarak genetik gl dan fl adalah 34 um. Jadi kemungkinan 1 yang benar, akan tetapi nila ps (gl-fl) = 34 um kurang dari jumlah (29 + 13) = 42 um, mengapa? Jika diperhatikan pada waktu menghitung ps (gl-fl) nilai ps ganda tidak dihitung sebagai ps untuk gel dan fl, padahal telah terjadi dua kali pindah silang. Oleh karena itu penghitungan ps (gl-fl) perlu ditambahkan 2 kali nilai ps ganda: ps (gl-fl) = 99 + 111 + 42 + 33 + 2 (16+16) x 100% = 41.7 um 838 Fl Les Les 29 um Gl

13 um

Jadi jarak genetik Gl dan fl adalah 42, sesuai dengan penjumlahan ps (gl-les) + ps (les-fl).