Nmero de especies
Cuando se disponga a grabar el archivo debe escoger el formato Texto (delimitado por tabulaciones) como se muestra en la siguiente Figura.
2. Cmo utilizar el programa EstimateS para el clculo de ndices de diversidad? El programa EstimateS est disponible en Internet en la direccin electrnica (http://viceroy.eeb.uconn.edu/estimates). Una vez cargado el programa se procede a importar el archivo con la informacin (ver paso 1). Para ello debe dar clic a File y luego escoger Load Input File.
Luego debe buscar el archivo tipo texto (delimitado por tabulaciones) que hemos creado dando clic al comando Abrir.
El programa muestra la siguiente pantalla indicando la lectura de los datos. Una forma de saber si todo anda bien es corroborando que el nmero de especies (Species) y columnas (Samples) que aparece en la pantalla coincida con el que existe en el archivo.
Al dar Ok a la pantalla anterior se despliega la siguiente pantalla que indica el tipo de formato que presenta el archivo. En nuestro caso se debe escoger el formato 1, que indica que el archivo est estructurado de modo que las especies se presentan en lneas (row) y las unidades muestrales (Samples) en columnas. Al dar Ok el programa regresa al men principal.
Una vez cargado el archivo, y desde el men principal se selecciona Diversity, y se da click a la opcin Diversity Setting....
A continuacin se muestra una pantalla para definir el nmero de aleatorizaciones que queremos se d en el clculo de los ndices de diversidad. En el ejemplo se muestra el nmero 50, la recomendacin es que entre mayor sea el nmero de columnas del archivo, mayor sea el nmero de aleatorizaciones. Tambin se debe dar clic a Other Options y ah activar el campo Compute Fishers alpha, Shannon, & Simpson indexes si se quiere que se calculen estos ndices.
Al dar aceptar el programa regresa al men principal, donde debe seleccionarse Diversity, y dar un clic a Compute Diversity Stats. Esto genera un cuadro de salida con los clculos.
Para salir de esta pantalla e ir al men principal se debe dar un clic en Done . Por ltimo, si se quieren grabar los clculos se debe seleccionar la opcin Export que queda junto a la palabra Done (vea la pantalla anterior), y grabar el archivo con los datos de clculos de EstimateS. Este archivo se puede abrir luego con el programa Excell. Hasta aqu hemos logrado usar satisfactoriamente el programa EstimateS para calcular los valores acumulados de especies y de ndices de diversidad de las muestras.