Modelos Anidados

Diseño Experimental
Clase 9
Experimento
• Se seleccionan dos genotipos de
machos de D. melanogaster.
Estos machos son cruzados con
tres genotipos distintos de
hembras y se analiza el número
de cetas en la placa
esternopleural.
 Modelo Anidado
♂ Gen.1 ♂ Gen.2

♀ Gen.1 ♀ Gen.2 ♀ Gen.3 ♀ Gen.1 ♀ Gen.2 ♀ Gen.3

P P1 P1 P1 P1 P1 P1
r
P2 P2 P2 P2 P2 P2
o
g P3 P3 P3 P3 P3 P3
e
P4 P4 P4 P4 P4 P4
n
i P5 P5 P5 P5 P5 P5
e
Modelo Anidado
• Extensión de ANDEVA simple
• Grupos o Tratamientos tienen
sub-grupos
• Tratamientos de un factor
tienen diferentes niveles de
representación en niveles de
otro factor
– Clasificación jerárquica
– Diferentes niveles de B en A
Objetivo modelo Anidado
• Probar un factor
• Controlar por variabilidad en
otro factor
• En este ejemplo
– Determinar si hay diferencias
entre genotipos de machos,
controlando por diferencias entre
hembras dentro de machos
– Si no hay diferencias entre
hembras, todo se debe al genotipo
 Modelo
• Efecto de un
factor (β)
depende de nivel yijk = µ + α i + β j ( i ) + ε i ( jk )
de otro factor (α)
• ≈ Interacción
• Errores están
anidados !!!
• No se hace
factorial sino
ANDEVA-anidado
Hipótesis
• Hay hipótesis para cada nivel
• Ho1:
– No hay efecto del primer facto
• No hay diferencias entre machos
• Ho2:
– No hay diferencias del segundo factor
dentro de cualquier nivel del primer
factor
• Las hembras no difieren sin importar el
macho

• Segunda hipótesis usualmente es de

menos interés
Anidados Múltiples
• Se pueden
anidar varios
niveles
• Ejemplo
moscas
– Cada hembra
se le extraen
dos muestras
de larvas
– Muestra se
cultivan en dos
Modelo Anidado
♂ Gen.1 ♂ Gen.2

♀ Gen.1 ♀ Gen.2 ♀ Gen.3 ♀ Gen.1 ♀ Gen.2 ♀ Gen.3

M1 M2 M1 M2 M1 M2 M1 M2 M1 M2 M1 M2

P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1 P1

P2 P2 P2 P2 P2 P2 P2 P2 P2 P2 P2 P2

P3 P3 P3 P3 P3 P3 P3 P3 P3 P3 P3 P3

P4 P4 P4 P4 P4 P4 P4 P4 P4 P4 P4 P4

P5 P5 P5 P5 P5 P5 P5 P5 P5 P5 P5 P5
Fijos y aleatorios
• Diseños anidados pueden tener
factores fijos
• Análisis factores fijos
usualmente por factorial
• Pruebas de hipótesis normales:

MS A
F=
MS Error
Modelos Fijos
• Confusión con factoriales
• Si factor interesa, no puede ser
aleatorio:
– Ejemplo:
Se desea estimar la abundancia de
dos especies de cirripedio en dos
sectores de la playa: inmersa e
intermarea. Se escogen dos playas
distintas para hacer el estudio.
 Sub-muestreo
• Anidados comunes en sub-
muestreo
• Factores Aleatorios
• Se estiman Componentes de
Varianza
• Pruebas de Hipótesis Varían
Pruebas de hipótesis

MS A MS B
F= F=
MS B ( A) MSC ( AB )

MSC MS D
F= F=
MS D ( ABC ) MS Error
 Pueden existir
interacciones
• Los diseños experimentales pueden incluir
factoriales y anidados
• Primero se anida, luego se aplica estructura
factorial.
– Parcelas quemadas y sin quemar (Factor A)
– Dentro de parcelas cinco sitios aleatorios [Factor
B(A)]
– En parcelas la mitad se aplica raleo y en la otra no
(Factor C).
– Se mide la cantidad de plántulas de especies
forestales que regeneran
– Como cada tratamiento posee raleo y no, al igual
yijkl
que m + αparcela
= cada i + β j ( iposee
) + γ k ambos
+ αγ ik tratamientos:
+ βγ jk ( i ) + ε l (son
ijk )
cruzados
El problema de la
pseudoreplicación
• Anidados pueden llevar a
pseudoreplicación

• Se crean factores anidados sin

sentido

• Aumenta trabajo y no precisión

3 unidades experimentales/trat
A B C

1 2 3 1 2 3 1 2 3

1 2 3 4 1 2 3 41 2 3 41 2 3 41 2 3 41 2 3 41 2 3 41 2 3 41 2 3 4
Diseño 1
36 medidas en ambos experimentos Pseudoréplicas
A B C

1 2 3 4 5 6 1 2 3 4 5 6 1 2 3 4 5 6

1 2 1 2 1 2 1 21 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 21 2 1 2 1 2 1 2 1 21 21 2 1 2

6 unidades por tratamiento Diseño 2 Diseño 2 gana porque tiene

6 unidades por tratamiento
¿Por qué anidar?
• Sub-muestro genera anidación
• Algunos experimentos no
permiten factorial
– Diferentes sitios o bosques

• Usualmente impuesto por

diseño o estructura del
experimento
¿Pseudo-réplica?
• Para estudiar el efecto de estrés
hídrico sobre los nutrientes de
arbustos se removió: 0%, 20% y
40% de la masa de raíces de una
especie. Cada tratamiento se
aplicó a dos árboles
seleccionados al azar. De cada
árbol se seleccionaron tres hojas
al azar y de cada hoja, se
obtuvieron dos discos de 1cm2.
En total se obtuvieron 36 discos
foliares en los cuales se analizó
Trat (a = 3) 40% 20% 0%

Árbol (b = 2 ) 1 2 1 2 1 2

Hoja (c = 3 ) 1 2 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3 1 2 3

Réplica 1 2 1 2 12 1 2 1 2 12 1 2 1 2 12 1 2 1 2 12 1 2 1 2 12 1 2 1 2 12
(r = 2)

Unidades experimentales
Pseudoreplicas (2 réplicas/tratamiento)