Nama Anggota Kelompok: Dian Farida (B1J006070) Inggit Dwijaningtyas (B1J006072) Waqi'atul Ma' muroh (B1J006076) Kode: K45-SPP-01

STRUKTUR UMUM tRNA DAN PERANAN tRNA PADA PROSES SINTESIS PROTEIN

Fungsi tRNA pada sintesis Protein

tRNA berperan penting pada translasi. tRNA merupakan molekul yang digambarkan oleh Francis Crick in 1956 (Crick, 1990 ). Fungsi tRNA adalah mentransfer asam-asam amino dari kolam asam aminonya ke ribosom. Ribosom menambahkan tiap asam amino yang dibawa oleh tRNA ke ujung rantai polipeptida yang sedang tumbuh. Untuk mengetahui bagaimana tRNA berperan maka kita harus mengetahui aminoasilasi, interaksi antara tRNA dengan mRNA dan kodon-antikodon.

Aminoasilasi: pengikatan asam amino pada tRNA

Bakteria terdiri dari 30-45 tRNA yang berbeda-beda sedangkan eukariotik paling banyak mempunyai 50 tRNA, hanya 20 macam asam amino yang dapat ditentukan kode genetiknya, ini menujukan bahwa semua organisme mempunyai kesamaan dalam mengindikasikan asam amino spesifik maka digunakan istilah penggunaan penggambaran tRNA yaitu digunakan 1, 2 dan lain sebagainya untuk membedakan isoacceptor contoh dua tRNA khusus untuk glysin ditulis sebagai tRNAGly 1 dan tRNAGly2.

Gambar 2. Aminoasilasi pada tRNA.

Semua RNAt Mempunyai Struktur yang Sama

RNAt terkecil hanya mempunyai panjang 70 nukleotida, dan RNAt terbesar terkadang mempunyai panjang lebih dari 90 nukleotida, tRNA yang berukuran kecil memungkinkan untuk menghilangkan tRNAs individual, dan merupakan asam nukleat yang pertama kali disekuen pada

tahun 1965 oleh Robert Holley dan teman-temannya di universitas Cornell, New York. Sekuen dapat menampakan suatu bagian utama yang tak didug-duga, seperti halnya standar nukleotida RNA (A, C, G dan U ), tRNA terdiri dari sejumlah modifikasi nukleotida, 5-10 berada pada tRNA utama dengan 50 modifikasi yang berbeda-beda. Pemeriksaan sekuen tRNAtpertama kali yaitu untuk tRNAAla dari Saccaromyces sama sekali berbeda. Setelah tRNA disekuen maka salah satu bagian tRNA tersebut akan hilang. Berikut ini adalah Cloverlef, bagian bagian utama Cloverleaf adalah sebagai berikut : 1. Acceptor arm, dibentuk oleh 7 pasang basa antara 5 dan ujung 3dari suatu molekul,. Asam amino diikatkan pada ujung 3 tRNA, pada terminal CCA. 2. D Arm, merupaksn nama setelah modifikasi nukleosida dihydrouridin, yang selalu ada pada struktur ini. 3. Antikodon arm, terdiri dari triplet nukleotida disebut antikodon yang mempunyai pasangan basa selama translasi. 4. V loop, terdiri dari 5-3 nukleotida pada kelas 1 RNA atau 13-21 nukleotida pada kelas 2 tRNA 5. TC arm, merupakan nama setelah sekuen thymidin-pseudouridin sitosin, yang selalu ada pada struktur ini. adenosin dari bermacam-macam sekuen

Gambar 1. cloverleaf pada tRNA Struktur cloverleaf dapat dibentuk oleh semua tRNAs, pengecualian utama pada mitokondria vertebrata, yang dikode oleidh genom mitokondria dan terkadang kekurangan bagian

tertent pada struktur.Sebagai contoh pada tRNAser mitokondria manusia, yang tidak mempunyai D arm. Selain itu, identifikasi nukleotida menunjukkan bahwa pada beberapa posisi yang sama mempunyai keseragaman yang komplek/invarian ( nukleotida sama ) atau semi invarian (selalu purin atau selalu pirimidin ) dan posisi dari modifikasi nukleotida hampir selalu sama. Beberapa posisi nukleotida invarian adalah penting pada struktur tersier dari RNAt . Kristaliografi Sinar- X memperlihatkan nukleotida pada D dan TC dan tRNA terpelintir dan melipat menjadi struktur dimensi kompak yang secara kasar berbentuk L. Setiap arm dari bentuk L kira-kira mempunyai panjang 7 nm dan diameter 2 nm, yang asam amino mengikat aktif antara ujung arm dengan ujung antikodon yang lain.

DAFTAR PUSTAKA http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.section.7603 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.7613 link gambar http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.7612 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.7615 Diakses tanggal 22 November 2008

SITUS TERKAIT Animasi http://sciencevideos.wordpress.com/2007/12/13/protein-synthesis-transcription-and-translationlinklist/http://cble.chem.uu.nl/biolip/TRANSLAT.SWF http://www.lewport.com/10712041113402793/lib/10712041113402793/Animations/Protein%20Synthesis%20%20l ong.swf http://www.biostudio.com/demo_freeman_protein_synthesis.htm Jurnal http://proton.chem.yale.edu/pdf/9162484.pdf http://public.carnet.hr/ccacaa/CCA-PDF/cca2005/v78-n3/CCA_78_2005_319-324_Weygand.pdf Html http://www.tomilab.net/alife/paper/ecal2005aca.pdf