Anda di halaman 1dari 2

GERAKAN MEMINDAH RIBOSOME Ribosomes tinggal pada tempatnya saat rantai polypeptide diperpanjang dengan memindahkan polypeptide yang

menghubungkan RNA di (dalam) lokasi P menuju aminoacyl-tRNA yang sekarang di lokasi A. Reaksi ditunjukkan Gambar 6.20. Aktivitas yang bertanggung jawab untuk sintesis peptide [ikatan/bon] disebut peptidyl transferase. Sifat alami reaksi perpindahan diungkapkan oleh kemampuan antibiotik puromycin untuk menghalangi sintesis protein. Puromycin menyerupai suatu asam amino yang menghubungkan dengan bagian terminal adenosine dari tRNA. Gambar 6.21 menunjukkan bahwa puromycin mempunyai suatu N sebagai ganti O yang menghubungkan dengan suatu asam amino ke tRNA. Antibiotik diperlakukan oleh ribosome seolah-olah suatu aminoacyl-tRNA. Kemudian polypeptide penghubung dengan peptidyl-tRNA ditransfer ke kelompok NH2 puromycin Karena separuh puromycin tidak mendukung menuju lokasi A dari ribosome, polypeptidylpuromycin menjauh dari ribosome dalam wujud polypeptidyl-puromycin. Penghentian sintese protein yang prematur ini adalah tanggapan dari aksi lethal oleh antibiotik. Peptidyl transferase adalah suatu fungsi subunit ribosomal yang besar ( 50S atau 60S). Transferase menjadi bagian dari suatu lokasi ribosomal di mana ujung peptidyl-tRNA dan aminoacyiltRNA dibawa mendekat bersamaan. Keduanya, rRNA dan 50S merupakan protein subunit bagi aktivitas ini. Aktivitas yang dimiliki RIBOSOMAL RNA subunit 50S lebih katalitis, dibanding protein individu lainnya (lihat di bawah). Siklus penambahan asam amino untuk pertumbuhan rantai polypeptide diselesaikan oleh translocation diilustrasikan pada gambar 6.22 di mana ribosome mempercepat tiga nucleotides sepanjang mRNA. Hasil translokasi adalah untuk menyingkirkan tRNA yang tidak dibebankan dari lokasi P, sehingga peptidyl-tRNA yang baru dapat masuk. Ribosome kemudian mempunyai lokasi A kosong yang siap untuk masuknya aminoacyl-tRNA yang sesuai dengan kodon berikutnya. Pada bakteri, tRNA yang dikeluarkan, meninggalkan ribosome melalui lokasi lain, yaitu lokasi E. Pada eukaryotes tRNA dikeluarkan secara langsung ke dalam cytosol. Proses menampung tRNA yang dikeluarkan dan peptidyl-tRNA berlangsung dua langkah. pertama Aminoacyl mengakhiri pemindahan tRNAs ( yang ditempatkan; terletak di subunit 50S) ke lokasi yang baru (ketika anticodon berakhir tersisa batasan anticodon dalam subunit 30S). Pada langkah ini, tRNAs secara efektif terperangkap di dalam lokasi bastar, terdiri dari 50S E/ 30S P dan 50S P/ 30 S di lokasi A. Kemudian pergerakan diperluas ke arah subunit 30S, sehingga sepasang daerah anticodon-codon menemukan lokasi yang benar. Model yang umum untuk pergerakan dua tahap ini adalah model keadaan hiybrid. Gambar menunjukkan dua kemungkinan untuk menciptakan keadaan hibyd. Keadaan hybrid melibatkan pergerakan relatif tRNA menuju ribosome, sehingga aminoacyl adalah akhir dari gerak tRN di dalam subunit 50S; anticodon berhenti bergerak yang kemudian terjadi translocation. Sebagai alternatif, keseluruhan subunit 50S mungkin pindah;gerakkan sehubungan dengan 30S subunit [itu], sehingga mengakibatkan translocation terdiri dari dua langkah, struktur normal ribosome diperbaiki pada langkah yang kedua . Ribosomes menghadapi suatu dilema menarik pada translocation. [Itu] harus pecah;kan banyak dari kontak nya dengan tRNA dalam rangka mengijinkan pergerakan. Sedikitnya sebagian dari kontak ini diperlukan untuk menstabilkan codon-anticodon interaksi yang dengan tak terpisahkan lemah. Tetapi pada waktu yang sama [itu] harus memelihara memasangkan antar[a] tRNA dan anticodon ( patahan memasangkan tRNA yang deacylated hanya di saat/momen yang benar). Satu kemungkinan adalah bahwa ribosome tombol antar[a] alternatif, penyesuaian terpisah. Tombol bisa terdiri dari ber;ubah rRNA dasar [yang] memasangkan. Ketelitian terjemahan dipengaruhi oleh mutasi tertentu yang mempengaruhi alternatif yang base-pairing pengaturan. Penafsiran yang hampir bisa dipastikan adalah bahwa efek ditengahi oleh keketatan bersetuju untuk - tRNA penyesuaian alternatif. Translocation memerlukan GTP dan faktor pemanjangan lain, EF-G. Faktor ini adalah suatu unsur [yang] utama sel; [itu] hadir pada suatu tingkatan ~ 1 copy saban ribosome ( 20.000 molekul saban sel). Ribosomes tidak bisa mengikat EF-TU dan EF-G [yang] secara serempak, maka sintese protein mengikuti siklus [itu] menggambarkan menggambarkan 6.23 di mana faktor secara berurutan harus, dan bebas dari, ribosome [itu]. Maka EF-TUGDP harus dilepaskan [sebelum/di depan] EF-G dapat mengikat; dan kemudian EF-G harus dilepaskan [sebelum/di depan] aminoacyl-tRNAEFTuGTP dapat mengikat. Apakah kemampuan dari tiap faktor pemanjangan untuk mengeluarkan/meniadakan lain bersandar pada suatu efek allosteric pada [atas] keseluruhan penyesuaian ribosome atau pada [atas] kompetisi langsung untuk overlap mengikat lokasi? Gambar 6.24 menabur suatu persamaan luar biasa antar[a]

struktur ternary yang kompleks aminoacyl-tRNAEF-TuGDP dan EF-G. Aminoacyl-Tra terikat[an] oleh EF-TU di sekitar amino akseptor nya bersumber. [Itu] sedang membentur [bahwa/yang] struktur protein [itu] EF-G meniru [itu] keseluruhan struktur protein yang complexed dengan RNA di (dalam) ternary kompleks. Ciptakan asumsi segera ini yang mereka bersaing untuk yang sama mengikat lokasi ( [yang] kiranya di [dalam] sekitar, hampiran Suatu lokasi). Kebutuhan akan faktor masingmasing untuk dilepaskan [sebelum/di depan] kaleng lain mengikat memastikan bahwa peristiwa sintese protein berproses [adalah] suatu cara rapi. Kedua-Duanya faktor pemanjangan adalah monomeric khas GTP-BINDING protein yang adalah aktip ketika harus GTP tetapi non-aktip ketika harus GDP. Triphosphate Format diperlukan untuk bersetuju untuk - ribosome, yang memastikan bahwa faktor masing-masing memperoleh akses kepada ribosome hanya di [dalam] [perusahaan/ rombongan] GTP bahwa itu harus memenuhi fungsi nya. EF-G mengikat . kepada ribosome [itu] untuk mensponsori translocation; dan kemudian dilepaskan mengikuti ribosome pergerakan. [Itu] adalah suatu penting bagian dari mekanisme untuk translocation. Hidrolisis GTP terjadi [sebelum/di depan] translocation dan mempercepat ribosome pergerakan [itu]. Mekanisme yang hampir bisa dipastikan adalah bahwa GTP hidrolisis menyebabkan suatu perubahan di (dalam) struktur EF-G, yang (mana) pada gilirannya memaksa suatu perubahan di (dalam) ribosome struktur. Suatu penghapusan daerah I ( yang ditempatkan; terletak pada [atas] 30S subunit) mengijinkan suatu translocation parsial,