Anda di halaman 1dari 25

REPLIKASI

DNA merupakan makromolekul polinukleotida yang tersusun atas polimer nukleotida yang berulang ulang, tersusun rangkap, membentuk DNA heliks ganda. Setiap nukleotida terdiri atas tiga gugus molekul yaitu: 1. Gula 5 karbon (2-deoksiribosa). 2. basa nitrogen yang terdiri golongan purin yaitu adenin (Adenin = A) dan guanin (guanini = G), serta golongan pirimidin, yaitu sitosin (cytosine = C) dan timin (thymine = T). 3. gugus fosfat.

STRUKTUR KIMIA NUKLEOTIDA PENYUSUN ASAM NUKLEAT

Basa N

Gula ribosa

REPLIKASI DNA

Replikasi DNA adalah proses penggandaan molekul DNA untai ganda. Pada sel, replikasi DNA terjadi sebelum pembelahan sel. Prokariota terus-menerus melakukan replikasi DNA. Pada eukariota, waktu terjadinya replikasi DNA sangatlah diatur, yaitu pada fase S siklus sel, sebelum mitosis atau meiosis I.

MODEL2 REPLIKASI DNA

Model konservatif yaitu dua rantai DNA lama terpisah dan rantai yang berfungsi sebagai cetakan untuk dua rantai DNA baru. Model semikonservatif yaitu dua rantai DNA lama terpisah dan rantai baru disintesis dengan prinsip komplementasi pada masing masing rantai DNA lama tersebut. Model dispertif yaitu beberapa bagian dari kedua rantai DNA lama digunakan sebagai cetakan untuk sintesis rantai DNA baru.

MODEL2 REPLIKASI DNA

REPLIKASI DNA --- MODEL SEMIKONSERVATIF

GARPU REPLIKASI Garpu replikasi atau replication fork ialah struktur yang terbentuk ketika DNA bereplikasi. Garpu replikasi ini dibentuk akibat enzim helikase yang memutus ikatan-ikatan hidrogen yang menyatukan kedua untaian DNA Masing-masing cabang tersebut menjadi "cetakan" untuk pembentukan dua untaian DNA baru berdasarkan urutan nukleotida komplementernya.

DNA polimerase membentuk untaian DNA baru dengan memperpanjang oligonukleotida yang dibentuk oleh enzim primase dan disebut primer. DNA polimerase membentuk untaian DNA baru dengan menambahkan nukleotida dalam hal ini, deoksiribonukleotidake ujung 3'-hidroksil bebas nukleotida rantai DNA yang sedang tumbuh.

Pembentukan leading strand leading strand ialah untaian DNA yang disintesis dengan arah 5'3' secara berkesinambungan. Pada untaian ini, DNA polimerase mampu membentuk DNA menggunakan ujung 3'-OH bebas dari sebuah primer RNA dan sintesis DNA berlangsung secara berkesinambungan, searah dengan arah pergerakan garpu replikasi.

Pembentukan lagging strand Lagging strand ialah untaian DNA yang terletak pada sisi yang berseberangan dengan leading strand pada garpu replikasi. Untaian ini disintesis dalam segmen-segmen yang disebut fragmen Okazaki. Pada untaian ini, primase membentuk primer RNA. DNA polimerase dengan demikian dapat menggunakan gugus OH 3' bebas pada primer RNA tersebut untuk mensintesis DNA dengan arah 5'3'. Fragmen primer RNA tersebut lalu disingkirkan (misalnya DNA Polimerase I pada pro dan ) dan deoksiribonukleotida baru ditambahkan untuk mengisi celah yang tadinya ditempati oleh RNA. DNA ligase lalu menyambungkan fragmen-fragmen Okazaki tersebut sehingga sintesis lagging strand menjadi lengkap.

The Biochemical Reactions

DNA replication begins with the "unzipping" of the parent molecule as the hydrogen bonds between the base pairs are broken. Once exposed, the sequence of bases on each of the separated strands serves as a template to guide the insertion of a complementary set of bases on the strand being synthesized. The new strands are assembled from deoxynucleoside triphosphates. Each incoming nucleotide is covalently linked to the "free" 3' carbon atom on the pentose (figure) as the second and third phosphates are removed together as a molecule of pyrophosphate (PPi). The nucleotides are assembled in the order that complements the order of bases on the strand serving as the template. Thus each C on the template guides the insertion of a G on the new strand, each G a C, and so on. When the process is complete, two DNA molecules have been formed identical to each other and to the parent molecule

heliks ganda DNA (merah) dibuka menjadi dua untai tunggal oleh enzim helikase (9) dengan bantuan topoisomerase (11) yang mengurangi tegangan untai DNA. Untaian DNA tunggal dilekati oleh protein-protein pengikat untaian tunggal (10) untuk mencegahnya membentuk heliks ganda kembali. Primase (6) membentuk oligonukleotida RNA yang disebut primer (5) dan molekul DNA polimerase (3 & 8) melekat pada seuntai tunggal DNA dan bergerak sepanjang untai tersebut memperpanjang primer, membentuk untaian tunggal DNA baru yang disebut leading strand (2) dan lagging strand (1). DNA polimerase yang membentuk lagging strand harus mensintesis segmen-segmen polinukleotida diskontinu (disebut fragmen Okazaki (7)). Enzim DNA ligase (4) kemudian menyambungkan potongan-potongan lagging strand tersebut.

REP PRO EU

Replikasi 2 arah terjadi pada prokariot maupun eukariot Replikasi pada plasmid colE1 : satu arah Proses pemisahan untaian DNA dilakukan oleh enzim DNA helikase Pd. E. coli : helicase rep., DNA helikase I, DNA helikase II dan protein DnaB Pd. prokariot, polimerisasi dikatalisis DNA polimerase III RNA primer pd fragmen Okazaki, didegradasi oleh aktivitas eksonuklease yg ada pd enzim DNA polimerase I.

Lihat animasi 1 Lihat animasi 2dna-rna2.swf Lihat animasi 3..\REPLIKASIDNA.ppt