Algoritmo Bacteriologico

BACTERIOLOGA
ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LAS MICOSIS

(SUPERFICIALES, SUBCUTNEAS, SISTEMICAS Y OPORTUNISTAS)
INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE MICOLOGA DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

1. 2. 3. 4. Las muestras de escamas de piel, uas, pelo, secreciones, exudados y otros debern acompaarse del formato nico, resumen de historia clnica y la solicitud del estudio. La falta de alguno de estos documentos causar rechazo temporal. Se informar al usuario y este contar con un lapso de ocho das para enviar la documentacin faltante. El incumplimiento del usuario, ocasionar el rechazo definitivo de la muestra. Las muestras debern enviarse en cantidad suficiente, envasadas y embaladas correctamente. El diagnstico de las micosis, se realizar de acuerdo al algoritmo correspondiente. Los resultados sern emitidos siete das hbiles despus de recibida la muestra.
Bibliografa
1. 2. Summerbell RC. Trichopyton, Microsporum, Epidermophyton and agents of superficial mycoses. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Pfaller MA, Yolken RH, eds. Manual of Clinical Microbiology. 8th ed. Washington, DC: asm Press, 2003. pp 1798-1819. Contreras PC, Shibayama HH, Gutirrez GP, Valenzuela TJ, Ros RC, Ramos BR. Manual de procedimientos de diagnstico en micologa mdica. InDRE, Mxico, 2000.
62
ALGORITMO PARA DIAGNSTICO SEROLGICO PARA HISTOPLASMOSIS Y COCCIDIODOMICOSIS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE MICOLOGA DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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1. Las muestras de suero en volumen mnimo de 1 mL. debern nico, resumen de historia clnica y la solicitud del estudio. acompaarse del Formato
2. 3. 4.
5.
El diagnstico serolgico para histoplasmosis y coccidioidomicosis se realizar de acuerdo al algoritmo correspondiente. Los resultados sern emitidos siete das hbiles despus de recibida la muestra.
La falta de alguno de estos documentos causar rechazo temporal. Se informar al usuario y este contar con un lapso de ocho das para enviar la documentacin faltante. El incumplimiento del usuario ocasionar el rechazo definitivo de la muestra. La muestra no deber de estar hemolizada, contaminada o lipmica. Si esto sucede, la muestra ser rechazada y se comunicar al usuario. Las muestras debern enviarse envasadas y embaladas correctamente, sin derrames.
Bibliografa
1. Walsh TJ, Larone DH, Schell WA, Mitchell TG. Histoplasma, Blastomyces, Coccidioides, and other dimorphic fungi causing systemic mycoses. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Pfaller MA, Yolken RH, eds. Manual of Clinical Microbiology. 8th ed. Washington, DC: asm Press, 2003. pp 1781-1797. Contreras PC, Shibayama HH, Gutirrez GP, Valenzuela TJ, Ros RC, Ramos BR. Manual de procedimientos de diagnstico en micologa mdica. InDRE, Mxico, 2000.
2.
64
ALGORITMO PARA LA IDENTIFICACIN DE CEPAS DE HONGOS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE MICOLOGA DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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1. 2. 3. 4. 5. Las cepas enviadas para su identificacin debern acompaarse del formato nico, resumen de historia clnica, fuente de aislamiento y la solicitud del estudio. La falta de alguno de estos documentos causar rechazo temporal. Se informar al usuario y este contar con un lapso de ocho das para enviar la documentacin faltante. El incumplimiento del usuario ocasionar el rechazo definitivo de la muestra. Las muestras debern enviarse envasadas y embaladas correctamente. No utilizar tubos con tapn de rosca. La identificacin de cepas de hongos se realizar de acuerdo al algoritmo correspondiente. Los resultados sern emitidos diez das hbiles despus de recibida la muestra.
Bibliografa
1. 2. Merz WG, Roberts GD. Algorthms for detection and identification of fungi. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Pfaller MA, Yolken RH, eds. Manual of Clinical Microbiology. 8th ed. Washington, DC: asm Press, 2003. pp 1668-1684. Contreras PC, Shibayama HH, Gutirrez GP, Valenzuela TJ, Ros RC, Ramos BR. Manual de procedimientos de diagnstico en micologa mdica. InDRE, Mxico,
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ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO SEROLGICO DE CLERA INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE PRODUCCIN DE SUEROS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO SEROLGICO DE CLERA INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE PRODUCCIN DE SUEROS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS. MUESTRAS PARA LA DETERMINACION DE ANTICUERPOS VIBRIOCIDAS Y ANTITOXINA COLERICA
1. 2. Las muestras de suero humano para diagnstico en volumen de al menos 1 mL debern de acompaarse del formato nico de envo de muestras del InDRE, del resumen de historia clnica y de la solicitud del estudio. Para la determinacin de anticuerpos vibriocidas y antitoxina colrica, debern tomarse muestras de suero pareadas, la primera en el inicio de la enfermedad la cual se conservar en refrigeracin y la segunda entre 15 y 20 das despus de tomada la primera, ambas sern enviadas al InDRE en el mismo paquete en condiciones de refrigeracin. La falta de alguno de los documentos o de alguna de las muestras, as como las condiciones inadecuadas de la muestra como son: sin refrigerantes, muestras de sangre completa, hemolizada, contaminada, lipmica o que los datos no sean legibles, como nombre, fecha de toma de la muestra y procedencia, causar el rechazo temporal de la misma. Se notificara al usuario por escrito dando un periodo de gracia de ocho das para enviar la documentacin completa o la muestra faltante. De no ocurrir as se rechazar la muestra definitivamente y se notificar por escrito al usuario o responsable del envo. El diagnstico serolgico de clera cumplir los algoritmos correspondientes. Los resultados sern emitidos dos semanas despus de recibidas las muestras y la documentacin adecuadas. Para estudios epidemiolgicos se puede recibir una sola muestra con la documentacin y las condiciones antes mencionadas. En algunos casos especiales en que solo se envi una muestra para el diagnstico o las dos muestras no son adecuadas ni la documentacin de acuerdo con lo indicado anteriormente, pero el usuario considera que la muestra es de alto valor deber hacerlo saber al laboratorio de Produccin de Sueros por escrito aceptando que el resultado no es confiable para ser interpretado con una sola muestra o con las condiciones inadecuadas
3.
4. 5. 6.
Bibliografa
1. 2. 3. Mtodos de laboratorio para el diagnstico de Vibro cholerae CDC/NCID, OPS Washington, D. C., Estados Unidos de Amrica 1994 . Norma Oficial Mexicana NOM-016-SSA2-1994, Para la vigilancia, prevencin, control, manejo y tratamiento del clera. Norma Oficial Mexicana NOM-017-SSA2-1994, Para la vigilancia epidemiolgica
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE LA BRUCELOSIS HUMANA INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE BRUCELOSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE LA BRUCELOSIS HUMANA INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE BRUCELOSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO BACTERIOLGICO DE BRUCELOSIS EN ALIMENTOS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE BRUCELOSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS Muestras para serologa

1. 2. 3. 4. El volumen mnimo de la muestra debe ser de 400l. de suero. La muestra no debe estar contaminada, lipmica o hemolizada. La muestra deber venir etiquetada con tinta a prueba de agua y deber venir acompaada de una breve historia clnica y del formato nico del InDRE. La muestra debe colocarse en recipientes slidos que cierren bien, a prueba de fugas, derrames y goteos. Las tapas se sellaran con cinta a prueba de agua, se transportaran y mantendrn previo a su procesamiento en condiciones de refrigeracin. No se congelaran. Si la muestra no viene acompaada de la documentacin sealada o le faltan datos se dar un rechazo temporal, se informara al usuario y este contar con 10 das naturales para enviar la faltante. El incumplimiento de este punto causa rechazo definitivo. Toda muestra recibida se le realizaran pruebas presuntiva y confirmatoria. El tiempo para la emisin de un resultado es de 48 horas y el tiempo mximo es de 4 das.
5. 6.
Muestras para bacteriologa

1. 2. 3. La muestra de sangre deber tomarse preferentemente en la fase febril, antes que la temperatura llegue al mximo. Las muestras de hemocultivo y mielocultivo debern enviarse al laboratorio inmediatamente despus de su inoculacin (Medio Ruiz-Castaeda), no requiere de refrigeracin. Las muestras de leche y derivados lcteos, cepas, ganglios debern enviarse en Tubos, Placas, Frascos o Recipientes estriles y adecuados segn se trate de la muestra, tendrn que venir bien identificada con tinta a prueba de agua y acompaadas de una breve historia clnica y del formato nico del InDRE. Si la muestra no viene acompaada de la documentacin sealada o le faltan datos se dar un rechazo temporal, se informara al usuario y este contar con 10 das naturales para enviar la informacin faltante. El incumplimiento de este punto causa rechazo definitivo. Las muestras de alimentos solo se procesarn en caso de brote y previa solicitud verbal para el apoyo. El tiempo mximo para la emisin de un resultado de hemocultivo es de 6 semanas. El tiempo mximo para la emisin de un resultado de identificacin de una cepa es de 10 das. El tiempo mximo para la emisin de un resultado de aislamiento de Brucella a partir de alimento es de 15 das.
4. 5. 6. 7.
Bibliografa
1. 2. 3. Alton G.G., Jones L.M. y Pietz D.E. Las tcnicas de laboratorio en brucelosis, 2. Edicin. Organizacin Mundial de la Salud. 1976. Ginebra. Hernndez M.I., Pea F.G. y Betancour M.X. Manual de procedimientos de laboratorio. INDRE/SAGAR Brucelosis 19. 1996. Mxico. NOM-022-SSA-2-1994. Para la prevencin y control de la brucelosis en el hombre.
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE ENTEROBACTERIAS A PARTIR DE MUESTRA FECAL INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE ENTEROBACTERIAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA RECEPCIN DE MUESTRAS HISOPO RECTAL

1. La muestra de materia fecal (hisopo rectal en medio de transporte) deber de acompaarse de la historia clnica, formato nico de envo de muestras del InDRE y de la solicitud del estudio. El tubo de Cary Blair que contiene la muestra debe rotularse con los datos del paciente en forma clara. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.
2.
Bibliografa
1. 2. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13BAC-47. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 181234,243-250, 251-265, 569-574, 579-592.
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ALGORITMO PARA EL CONTROL DE CALIDAD Y REFERENCIA DE ENTEROBACTERIAS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE ENTEROBACTERIAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS CEPAS BACTERIANAS

1. 2. 3. Las cepas de enterobacterias para el control de calidad y referencia, deben ser enviadas en agar BAB en tubo de 13x100 mm. La muestra deber de acompaarse de la historia clnica, formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente. Si las muestras o la documentacin, no cumple con los criterios de aceptacin establecidos, esto es causa de rechazo definitivo o temporal segn sea el caso; se llena el formato y se notifica al usuario. En caso de tratarse de un rechazo temporal el usuario cuenta con un perodo de 7 das naturales para hacer la correccin necesaria, de no ocurrir esto, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario o responsable del envo.
Bibliografa
1. 2. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13BAC-47. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 181234,243-250, 251-265, 569-574, 579-592.
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE ENTEROBACTERIAS EN MUESTRA DE ORINA INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE ENTEROBACTERIAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS UROCULTIVO

1. La muestra de orina (5 ml) debe ser tomada del chorro medio de la primera miccin del da, haciendo un previo aseo con agua y jabn de la zona genital, y asepsia con un antisptico (benzal) y depositada en un recipiente estril. La muestra debe rotularse con los datos del paciente en forma clara, deber de acompaarse del formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente. La muestra debe ser remitida al laboratorio en forma inmediata, de no ser posible esto, es necesario mantenerla en refrigeracin sin rebasar un tiempo mximo de 2 h desde la toma hasta su entrega al laboratorio, de lo contrario la muestra no se recibe, por perder su valor diagnstico.
2. 3.
Bibliografa
1. 2. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-103BAC-110. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F.181-234.
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE Salmonella EN MUESTRA DE SANGRE INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE ENTEROBACTERIAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS HEMOCULTIVO

1. La muestra de sangre (5 a 8 ml) debe ser tomada en condiciones de esterilidad y depositada en medio de Ruiz Castaeda. La muestra debe rotularse con los datos del paciente en forma clara, deber de acompaarse del formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente. La muestra no debe ser refrigerada, debe mantenerse a temperatura ambiente hasta su llegada al laboratorio. El resultado se emitir en un tiempo mximo de 21 das.
2. 3. 4.
Bibliografa
1. 2. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-139BAC-148 Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 181-234.
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE Vibrio cholerae EN MUESTRAS CLNICAS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE CLERA DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA RECEPCIN DE MUESTRAS Hisopo rectal

1. La muestra de materia fecal (hisopo rectal en medio de transporte) deber de acompaarse de la historia clnica, formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio. El tubo de Cary Blair que contiene la muestra debe rotularse con los datos del paciente en forma clara. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.
2.
Bibliografa
1. 2. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13BAC-47. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional de Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 309-350, 579-592.
83
ALGORITMO PARA CONTROL DE CALIDAD Y REFERENCIA DE Vibrio cholerae EN CEPAS DE ORIGEN CLNICO INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE CLERA DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS CEPAS BACTERIANAS 1. 2. 3. Las cepas de Vibrio cholerae para referencia y control de calidad deben ser enviadas en agar BAB en tubo de 13x100 mm. La muestra deber de acompaarse del formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente. Si las muestras o la documentacin, no cumple con los criterios de aceptacin establecidos, esto es causa de rechazo definitivo o temporal segn sea el caso; se llena el formato y se notifica al usuario. En caso de tratarse de un rechazo temporal el usuario cuenta con un perodo de 7 das naturales para hacer la correccin necesaria, de no ocurrir esto, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario o responsable del envo.
Bibliografa
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ALGORITMO PARA CONTROL DE CALIDAD Y REFERENCIA DE Vibrio cholerae EN CEPAS DE ORIGEN AMBIENTAL Y DE ALIMENTOS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE CLERA DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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1. 2. 3. Las cepas de Vibrio cholerae para referencia y control de calidad deben ser enviadas en agar BAB en tubo de 13x100 mm. La muestra deber de acompaarse del formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente. Si las muestras o la documentacin, no cumple con los criterios de aceptacin establecidos, esto es causa de rechazo definitivo o temporal segn sea el caso; se llena el formato y se notifica al usuario. En caso de tratarse de un rechazo temporal el usuario cuenta con un perodo de 7 das naturales para hacer la correccin necesaria, de no ocurrir esto, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario o responsable del envo.
Bibliografa
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ALGORITMO PARA CONTROL DE CALIDAD Y REFERENCIA DE Aeromonas, Plesiomonas y Vibrio sp INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE CLERA DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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1. 2. 3. Las cepas de Aeromonas, Plesiomonas y Vibrios sp. para referencia y control de calidad deben ser enviadas en agar BAB en tubo de 13x100 mm. La muestra deber de acompaarse del formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente. Si las muestras o la documentacin, no cumple con los criterios de aceptacin establecidos, esto es causa de rechazo definitivo o temporal segn sea el caso; se llena el formato y se notifica al usuario. En caso de tratarse de un rechazo temporal el usuario cuenta con un perodo de 7 das naturales para hacer la correccin necesaria, de no ocurrir esto, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario o responsable del envo.
Bibliografa
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO, CONTROL DE CALIDAD Y REFERENCIA DE Bordetella pertussis y otras especies INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Este tipo de muestra se recomienda para el diagnstico de Tos ferina y la bsqueda de contactos intradomiciliarios.. 1. Se utiliza un hisopo que NO sea de algodn se recomienda que sea de alginato de calcio, rayn o dacrn con mango flexible (alambre de aluminio o plstico) para no lastimar al paciente. Depositar el hisopo con la muestra en 1 ml de medio de transporte (solucin salina con cefalexina a una concentracin de 40 g/ml) y trasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio en red fra (sin congelar). Nota: El tiempo de viabilidad de este microorganismo en la muestra en red fra es de 48 a 72 hrs.
2.
Cepas de Bordetella pertussis
Para enviar cepas de Bordetella pertussis u otras especies de Bordetella para control de calidad o confirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se debe emplear el medio de transporte de AMIES modificado con carbn activado .
Procedimiento:
1. 2. 3. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo Bordet-Gengou, Incubar hasta 72 hrs en aerobiosis y en bolsas de plstico. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES, cerrar el tubo, sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE). Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio en refrigeracin durante tres das como mximo.
4. 5. 6.
Informacin requerida:
La muestra o la cepa debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segunda toma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historia clnica y oficio de solicitud de estudio. La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causa de rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar la documentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurrir as, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo. Bibliografa 1. 2. 3. Nennig ME. Prevalence and incidence of adult pertussis in an urban population. JAMA.1996. 275:1672. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. Diagnstico Microbiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 pp. 419-424 SCHAECHTER M, MEDOFF G, SCHLESSINGER D. Mechanisms of Microbial Disease. Williams & Williams, 1989. pp. 283-289.
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ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DETERMINACIN DE ANTICUERPOS ANTI-PERTUSSIS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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1. 2. Se requiere de 1 a 3 ml de suero para la prueba, no debe estar hemolizado, lipmico contaminado. Se requiere de segunda muestra 15 das despus de la primera toma. Estas muestras se recolectan en tubo estril, sin anticoagulante y se transportan en red fra, sin congelar.
La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segunda toma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historia clnica y oficio de solicitud de estudio. La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causa de rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar la documentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurrir as, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.
Bibliografa
1. 2. Manclarck, P. R., & Meade, B. D. 1980. Serogical response to Bordetella pertussis. In: Manual of Clinical Immunology 2a. Ed. American Society for Microbiology, Washington, D. C. E.U.A. pp. 496 Nennig ME. Prevalence and incidence of adult pertussis in an urban population. JAMA.1996. 275:1672.
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ALGORITMO PARA AISLAMIENTO E IDENTIFICACIN DE Corynebacterium diphtheriae Y OTRAS ESPECIES E IDENTIFICACIN DE CEPAS TOXIGENICAS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS Toma de exudado farngeo
1.
La muestra de eleccin para el diagnstico por cultivo de Corynebacterium diphtheriae es el exudado farngeo. Se recomienda tomar una parte de la pseudomembrana, si se encuentra presente y depositarla en el medio de transporte.
1. 2.
Toma de Biopsias
Las muestras para cultivo de tejidos se remiten rpidamente al laboratorio en un recipiente estril con tapas adecuadas. Las muestras en formol no son adecuadas para su cultivo. Para la conservacin y transporte de estas muestras se recomienda el medio de PAI, que es un medio slido en tubo, inclinado.
Transporte
Depositar el hisopo con la muestra en el medio de transporte de PAI y trasladarlo a temperatura ambiente si el transporte es menor a 6 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 6 hrs, debido a que despus de este tiempo las protenas digeridas por esta bacteria, permiten el desarrollo de la flora acompaante dificultndose su aislamiento.
Informacin requerida
Bibliografa
1. 2. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. Diagnstico Microbiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 651-664. STEPHEN J, PIETROWSKI RA. Diphtheria toxin. In: Bacterials toxins, 2d. Edition. Washington DC: American Society for Microbiology, 1986. Pg. 25-30
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ALGORITMO PARA DETERMINACIN DE ANTICUERPOS ANTITOXINA TITNICA O DIFTRICA INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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1. Se requiere de 1 a 3 ml de suero para la prueba, no debe estar hemolizado, lipmico contaminado. Las muestras se recolectan en tubo estril, sin anticoagulante y se transportan en red fra, sin congelar.
Informacin requerida
Bibliografa
1. 2. 3. FARREL IN, REID DBW, KORMENDY A. C. Disk plate assay for diphtheria antitoxin in undiluted horse and human serum and infants whole blood. J. Immunol. 1963, 90: 201 2. CHATTERJEE SC. A COMPARATIVE STUDY OF THE HAEMAGGLUTINATION AND BIOASSAY PROCEDURES FOR THE ASSAY OF GUINEA-PIG ANTI-DIPHTHERIA AND ANTI-TETANUS SERA. Ind. Jour. Med . Res.,52, 12, December, 1964, pp. 1241-1249 3.COMPARATIVE STUDY OF THE HAEMAGGLUTINATION AND BIOASSAY PROCEDURES FOR THE ASSAY OF GUINEA-PIG ANTI-DIPHTHERIA AND ANTI-TETANUS SERA. Ind. Jour. Med . Res.,52, 12, December, 1964, Pg. 1241-1249.
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ALGORITMO PARA AISLAMIENTO, IDENTIFICACION Y SEROTIPIFICACIN DE Haemophilus influenzae Y OTRAS ESPECIES INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
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CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS Transporte y envo de cepas de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis:
Para enviar cepas de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis para control de calidad o confirmacin (referencia) a un laboratorio de referencia se debe emplear el medio de transporte de AMIES modificado con carbn activado.
4.
Procedimiento:
5. 6. 7. 8. 9.
10. 11. 12.
Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo de acuerdo al tipo de cepa como sigue: Si es Streptococcus pneumoniae en agar sangre de carnero al 5% Si es Haemophilus influenzae en agar chocolate enriquecido Si es Neisseria meningitidis en agar chocolate enriquecido agar sangre de carnero al 5%. Incubar de 18 a 24 horas a 35-37C en tensin parcial de CO2. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES, cerrar el tubo, sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE). Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio a temperatura ambiente durante cinco das como mximo.
Bibliografa
1. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual de Laboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos de Patgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo. USAID, OMS, CDC. 2004. Pg. 7-16, Apndice 4 Pg. 245-277
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ALGORITMO PARA AISLAMIENTO, IDENTIFICACIN Y SEROTIPIFICIACIN DE Streptococcus pneumoniae Y OTRAS ESPECIES INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
100
1. 2. 3. 4. 5. 6.
Procedimiento:
7. 8. 9.
Bibliografa
1. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual de Laboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos de Patgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo. USAID, OMS, CDC. 2004. Pg. 49-57 Apndice 4 Pg. 245-277; Apndice 6 Pg. 275-278
101
ALGORITMO PARA AISLAMIENTO, IDENTIFICACIN Y SEROTIPIFICACIN DE Neisseria meningitidis Y OTRAS ESPECIES INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
102
1.
Procedimiento:
2. 3. 4. 5. 6.
7. 8. 9.
Bibliografa
1. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual de Laboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos de Patgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo. USAID, OMS, CDC. 2004. Pg. 33-42; Apndice 4 Pg. 245-277 Manual para el Control de Enfermedades Transmisibles. Publicacin Cientfica No. 564. 16. edicin. 1997. Pg. 307-311. Organizacin Panamericana de la Salud. Abraham S. Benenson. Editor. Standardization and validation of serological assays for the evaluation of immune responses to Neisseria meningitides serogroup A/C vaccines. Departament of Vaccines and Biologicals. World Health Organization. Geneva. 1999. Thayer, JD., PF. and JE Martin. Thayer-Martin, selective medium for the cultivation of Neisseria meningitidis from the nasopharymx. Am. J. Pub. Health 55: 923-927. 1965.
2. 3. 4.
103
ALGORITMO PARA EL AISLAMIENTO, IDENTIFICACIN Y SEROTIPIFICACIN DE ESTREPTOCOCOS BETA-HEMOLITOS Y OTROS ESTREPTOCOCOS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
104

1.
Exudado farngeo
2. 3. 4. 1.
Para la bsqueda de estreptococos beta-hemolticos se puede emplear hisopos de algodn, rayn o dacrn. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte de AMIES o Stuart y trasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente si el transporte es menor a 24 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs. Se recomienda que el volumen del medio de transporte no sea mayor de 3 ml para evitar la dilucin de los microorganismos presentes en la muestra. Nota: El tiempo de viabilidad de los microorganismos presentes en la muestra se incrementa si se utiliza medio de transporte de AMIES entre 48 a 96 hrs. Si se utiliza medio de transporte de Stuart, la viabilidad disminuye entre 24 y 48 hrs. Para enviar cepas de Estreptococos beta-hemolticos y otros estreptococos para control de calidad o confirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se puede emplear el medio de transporte de AMIES modificado con carbn activado o en tubos inclinados placas petri con agar sangre de carnero al 5%.
Cepas de Estreptococos beta-hemolticos
1. 2.
Procedimiento:
3. 4. 5. 6. 7.
Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo agar sangre de carnero al 5% (ASC) e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo, sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE). Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio a temperatura ambiente durante cinco das como mximo. Informacin requerida: La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segunda toma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historia clnica y oficio de solicitud de estudio. La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causa de rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar la documentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurrir as, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.
Bibliografa
1. 2. Facklam RR, Collins D. Identification of Enterococccus species isolated from human infectios by a conventional test scheme. J Clin Microbiol 1989, 27, Pg. 731-4. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. Diagnstico Microbiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 577-598
105
ALGORITMO DE DETERMINACIN DE ANTI-ESTREPTOLISINA O EN MUESTRAS PAREADAS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
106

1.
SUERO
Se requiere de 3 a 5 ml de suero para la prueba, no debe estar hemolizado, lipmico contaminado. Se requiere de segunda muestra 15 das despus de la primera toma. Las muestras se recolectan en tubo estril, sin anticoagulante y se transportan en red fra, sin congelar.
Bibliografa
1. Klein G.L. Manual of clinical inmunology, 264-273:1976
107
ALGORITMO PARA AISLAMIENTO E IDENTIFICACIN DE Staphylococcus aureus Y OTRAS ESPECIES INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
108

1. Para la bsqueda de Staphylococcus aureus se puede emplear hisopos de algodn, rayn o dacrn. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte de AMIES o Stuart y trasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente si el transporte es menor a 24 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs. Se recomienda que el volumen del medio de transporte no sea mayor de 3 ml para evitar la dilucin de los microorganismos presentes en la muestra. Nota: El tiempo de viabilidad de los microorganismos presentes en la muestra se incrementa si se utiliza medio de transporte de AMIES entre 48 a 96 hrs. Si se utiliza medio de transporte de Stuart, la viabilidad disminuye entre 24 y 48 hrs.
2. 3. 4.
Para enviar cepas de Staphylococcus aureus y otras especies de Staphylococcus para control de calidad o confirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se puede emplear el medio de transporte de AMIES modificado con carbn activado o en tubos inclinados placas petri con agar sangre de carnero al 5%.
Cepas de Staphylococcus aureus
Procedimiento:
1. 2. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo agar sangre de carnero al 5% (ASC) e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo, sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE). Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio a temperatura ambiente durante cinco das como mximo.
3. 4. 5.
Bibliografa
1. 2. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. Diagnstico Microbiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 527-551 2. Topley and Wilson`s. Microbiology and Microbial Infections. Novena edicin. Volmen 3.Pg. 231- 256
109
ALGORITMO PARA EL AISLAMIENTO E IDENTIFICACIN DE Bacillus anthracis Y OTRAS ESPECIES INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
110

1. Para la bsqueda de Bacillus anthracis a partir de Las muestras nasales se puede emplear hisopos de algodn, rayn o dacrn. El cultivo de fosas nasales slo se deben usar para apoyar una exposicin confirmada de B. anthracis o durante una investigacin epidemiolgica activa. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte . Etiquete el contenedor con el hisopo con la informacin del paciente e indique si es posible, el grado o probabilidad de exposicin y trasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente, si el transporte es menor a 24 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs. Otras muestras que se solicitan para el diagnstico de ntrax son: lquido cefalorraqudeo [LCR], biopsia de ndulo linftico). aspticamente fluido vesicular, escaras o costras, Cultivos de sangre, Heces, Hisopo rectal, Esputo: Hisopos: Transprtese directamente al laboratorio a temperatura ambiente. Para tiempos de transportacin mayores de 1 hora; mantenga de 2-8 C. Heces: Transporte al laboratorio las heces sin conservar dentro de una lapso de 1 hora. Para tiempos de transportacin mayores de 1 hora, consrvese de 2-8 C. El medio Cary-Blair u otro medio de trasporte equivalente es aceptable. Esputo: Transprtese en un contenedor estril con tapa de rosca, a temperatura ambiente para tiempos menores de 1 hora y de 2-8 C para tiempos mayores de 1 hora. Cultivo de sangre: Transporte directamente al laboratorio a temperatura ambiente.
2. 3.
4. 5.
1. 2. 3. 4.
Transporte y almacenamiento de muestras:
Para enviar cepas de Bacillus anthracis y otras especies de Bacillus sp para control de calidad o confirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se puede emplear el medio de transporte de AMIES modificado con carbn activado o en tubos inclinados o placas petri con agar sangre de carnero al 5%. 1. 2.
Cepas de Bacillus anthracis
Procedimiento:
3. 4. 5. 6.
Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo agar sangre de carnero al 5% (ASC) e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis. Cosechar el desarrollo con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo, sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE). Estos procedimientos se deben realizar en laboratorios de microbiologa en los que se implementan prcticas de Nivel 2 de Seguridad Biolgica (SBN-2). Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera y el paquete debe estar bien identificado y con el smbolo de material biolgico infectocontagioso. Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio a temperatura ambiente durante cinco das como mximo.
111
Bibliografa
1. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. Diagnstico Microbiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 636-644 International Protocol. Draft October 20,2001
112
ALGORITMO PARA EL AISLAMIENTO E IDENTIFICACIN DE Listeria monocytogenes Y OTRAS ESPECIES INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
113

1. Para la bsqueda de Listeria monocytogenes se puede emplear hisopos de algodn, rayn o dacrn. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte de AMIES o Stuart y trasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente si el transporte es menor a 24 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs. Se recomienda que el volumen del medio de transporte no sea mayor de 3 ml para evitar la dilucin de los microorganismos presentes en la muestra. Nota: El tiempo de viabilidad de los microorganismos presentes en la muestra se incrementa si se utiliza medio de transporte de AMIES entre 48 a 96 hrs. Si se utiliza medio de transporte de Stuart, la viabilidad disminuye entre 24 y 48 hrs. Para enviar cepas de Listeria monocytogenes y otras especies de Listeria para control de calidad o confirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se puede emplear el medio de transporte de AMIES modificado con carbn activado o en tubos inclinados placas petri con agar sangre de carnero al 5%. Procedimiento: Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo agar sangre de carnero al 5% (ASC) e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo, sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE). Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio a temperatura ambiente durante cinco das como mximo. Informacin requerida: La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segunda toma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historia clnica y oficio de solicitud de estudio. La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causa de rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar la documentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurrir as, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.
2. 3. 4. 1.
Cepas de Listeria monocytogenes
2. 3. 4.
5. 6. 7. 8. 9.
Bibliografa
1. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. Diagnstico Microbiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 644-649
114
ALGORITMO PARA LA IDENTIFICACIN DE MICROORGANISMOS NO FERMENTADORES INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
115

1. 2. 3. 4. 5. 1. Para la bsqueda de Microorganismos no fermentadores a partir de exudados farngeos, se pueden emplear hisopos de algodn, rayn o dacrn. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte de AMIES o Stuart y trasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente si el transporte es menor a 24 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs. Se recomienda que el volumen del medio de transporte no sea mayor de 3 ml para evitar la dilucin de los microorganismos presentes en la muestra. Nota: El tiempo de viabilidad de los microorganismos presentes en la muestra se incrementa si se utiliza medio de transporte de AMIES sin carbn activado entre 48 a 96 hrs. Si se utiliza medio de transporte de Stuart, la viabilidad disminuye entre 24 y 48 hrs. Para enviar cepas de Microorganismos no fermentadores para control de calidad o Referencia a un laboratorio de referencia se puede emplear el medio de transporte de AMIES sin carbn activado o en tubos inclinados con base de agar sangre (BAS) o agar soya tripticasena (TSA). Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo base BAS o TSA e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo, sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE). Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio a temperatura ambiente durante cinco das como mximo.
Cepas de Microorganismos no fermentadores
2. 1. 2.
Procedimiento:
3. 4. 5.
Bibliografa
1. 2. 3. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. Diagnstico Microbiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 pp. 527-551 Topley and Wilson`s. Microbiology and Microbial Infections. Novena edicin. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual de Laboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos de Patgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo. USAID, OMS, CDC. 2004. pags 16-21,57-63. Apndice 7, pginas 279-282 Clinical and Laboratory Standards Institute/NCCLS. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Fifteenth Informational Supplement. CLSI/NCCLS document M100-S15 (ISBN 1-56238-556-9). Clinical and Laboratory Standards Institute, 940 West Valley Road,
116
4.
5.
Suite 1400, Wayne, Pennsylnania 19087-1898, USA., 2005.). Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically; Approved Standard-Sixth Edition.Document M7A6. Clinical and Laboratory Standards Institute/NCCLS. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Fifteenth Informational Supplement. CLSI/NCCLS document M100-S15 (ISBN 1-56238-556-9). Clinical and Laboratory Standards Institute, 940 West Valley Road, Suite 1400, Wayne, Pennsylnania 19087-1898, USA., 2005.) . Performance Standards for Antimicrobial Disk Susceptibility Tests Approved Standar-Eighth Edition Document M2-A8.
117
ALGORITMO PARA EL ESTUDIO BACTERIOLGICO Y DIAGNSTICO RPIDO EN LCR INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
118

1. El lquido cefalorraqudeo (LCR) es la muestra ms comn en infecciones del sistema nervioso central y debe tomarse preferentemente antes del tratamiento con antibiticos para aumentar las posibilidades de aislamiento.
El lquido cefalorraqudeo obtenido en condiciones estriles es separado en tres tubos estriles para las siguientes determinaciones: 1. Tubo 1: Examen citolgico (recuento de clulas y tipo de clulas que lo constituyen) 2. Tubo 2: Examen bioqumico: (anlisis de protenas, glucosa...) 3. Tubo 3: Examen microbiolgico: Cultivo, tincin de Gram y aglutinacin en ltex El volumen requerido es de 2 a 5 mL El tubo 3 debe ser llevado rpidamente a temperatura ambiente al laboratorio y procesarlo de inmediato para evitar prdida de viabilidad de los microorganismos sensibles a los cambios bruscos de temperatura. Si no se cuenta con recursos para procesar la muestra podr separar una parte para la deteccin directa de antgeno capsular y almacenar por un mximo de 8 horas entre 2 y 8C y s i no es posible enviarla, entonces congelar a 20 C por un mximo de 2 das y enviarla en red fra. La otra parte del lquido cefalorraqudeo se puede inocular en un frasco para hemocultivo chico o en 1 ml de caldo infusin cerebro corazn enriquecido y transportarla al laboratorio a temperatura ambiente. Preferentemente no utilizar hemocultivos para adultos, ya que se corre el riesgo de diluir la muestra y perder la oportunidad de aislamiento del agente etiolgico.
Toma de (LCR)
Transporte:
Bibliografa
4. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual de Laboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos de Patgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo. USAID, OMS, CDC. 2004. Apndice 4, Pg. 262-265.
119
ALGORITMO PARA EL ESTUDIO BACTERIOLGICO DE DIVERSAS MUESTRAS CLNICAS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
120

1. Evitar la extraccin en catteres intraarteriales o intravenosos permanentes de muestras de sangre humana para hemocultivo,. Se recomienda hacer cambio de aguja antes de inocular la botella para hemocultivo o de medio bifsico tipo Ruiz Castaeda y se transportan al laboratorio a temperatura ambiente. El volumen de la muestra es crtico ya que la cantidad de microorganismos en la mayora de las bacteriemias es baja, especialmente si el paciente esta bajo tratamiento antimicrobiano. El volumen recomendado de sangre venosa es: Nios: 1 mL como mnimo, de 2 a 5 mL si es posible. Adultos: 5 a 10 mL (algunos autores recomiendan de 10 a 20 mL) Es muy importante considerar el volumen del medio de cultivo que se va a utilizar, procurar que se guarde una proporcin 1:10 de la sangre con el volumen final del medio de cultivo. Para incrementar la posibilidad de aislamiento de la bacteria es conveniente tomar varias muestras en casos de neumona, meningitis y sepsis. En pacientes sin tratamiento: Tomar dos muestras de sangre de sitios distintos antes de empezar el tratamiento. En pacientes con tratamiento: Tomar seis muestras en un intervalo de 48 horas, previo al momento de la siguiente dosificacin del antibitico.
2.
3.
4. 5.
6. Informacin requerida: La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segunda toma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historia clnica y oficio de solicitud de estudio. La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causa de rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar la documentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurrir as, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.
Bibliografa
1. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual de Laboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos de Patgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo. USAID, OMS, CDC. 2004. Apndice 3, pginas 237-244, 245-268, Apndice 5, 269-273
121
ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSIS RECEPCION DE MUESTRAS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
Recepcin de: 2a muestra de suero respuesta a causa de rechazo
Suero
Suero
Cultivo
PCR
En caso de ser necesario solicitar nueva muestra
122
ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSIS POR DETERMINACION DE IgM anti-leptospira INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
*Cuando se observa reactividad de acuerdo a los criterios establecidos por el fabricante y ve rifica dos p or el InDR E. Tiempo de emisin D-LEP-07
123
ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSIS POR AISLAMIENTO DE Leptospira INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
*Aislamiento de cualquier serovariedad de Leptospira se informa positivo indicando especie, serovariedad y cepa. Tiempo de emisin D-LEP-07 Norma oficial mexicana NOM-029-SSA2-1999, para la vigilancia epidemiolgica, prevencin y control de la leptospirosis en el humano. S. Faine (1982). Guidelines for the control of leptospirosis. Geneva, world health organization (WHO Offset Publication No. 67). S. Faine, B. Alder, C. Bolin, P. Perolat (1999). Leptospira and leptospirosis. 2nd ed. Melbourne, MedSci. P.H. Levett (2001). Leptospirosis. Clinical Microbiology Reviews, 14:296-326. WHO and World Health Organization. Human leptospirosis: Guidace for diagnosis, surveillance and control. 2003
Tipo de muestra Cantidad Sangre 3 a 5 mL
Observaciones Se requiere muestra estril no lipmica. De preferencia sin anticoagulante, en el caso de requerirlo utilizar heparina. Transportar en refrigeracin. Se requiere estril. Transportar a temperatura ambiente. Transportar en refrigeracin, colocar la muestra de preferencia en solucin reguladora de fosfatos estril. Realizar la toma del chorro medio, de la primera miccin del da. Transportar a temperatura ambiente no ms de 4 horas.
LCR
1mL
tejido
1mm3
Orina
20 a 30 mL
Aguas, lodos etc. 250 a 500 mL Realizar la toma del rea apacible.
124
ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSIS POR PCR INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
*Deteccin de DNA leptospiral el resultado emite solo positivo al genero Leptospira
125
ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSIS POR MICROAGLUTINACION INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
La toma se debe realizar a >7 das de haber iniciado la
2 muestra de suero respuesta a causa de rechazo
Condiciones de envo Cantidad Documentacin
126
ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSIS INTERPRETACION DE RESULTADOS INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA
Recepcin de 2a muestra de suero
127

Algoritmo Bacteriologico

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BACTERIOLOGA

ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LAS MICOSIS

INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS LABORATORIO DE MICOLOGA DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS Muestras para serologa

Muestras para bacteriologa

CONDICIONES PARA RECEPCIN DE MUESTRAS HISOPO RECTAL

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS CEPAS BACTERIANAS

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS UROCULTIVO

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS HEMOCULTIVO

CONDICIONES PARA RECEPCIN DE MUESTRAS Hisopo rectal

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS CEPAS BACTERIANAS

CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS CEPAS BACTERIANAS

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Cepas de Bordetella pertussis

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS Toma de exudado farngeo

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

10. 11. 12.

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Cepas de Estreptococos beta-hemolticos

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Cepas de Staphylococcus aureus

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Transporte y almacenamiento de muestras:

Cepas de Bacillus anthracis

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Cepas de Listeria monocytogenes

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Cepas de Microorganismos no fermentadores

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Recepcin de: 2a muestra de suero respuesta a causa de rechazo

En caso de ser necesario solicitar nueva muestra

Tipo de muestra Cantidad Sangre 3 a 5 mL

*Deteccin de DNA leptospiral el resultado emite solo positivo al genero Leptospira

La toma se debe realizar a >7 das de haber iniciado la

2 muestra de suero respuesta a causa de rechazo

Condiciones de envo Cantidad Documentacin

Recepcin de 2a muestra de suero

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