Proses biologis dalam sel Prokariot (Replikasi

)

By Lina Elfita

TOPIK
1. Replikasi 2. Transkripsi 3. Translasi

REPLIKASI
Replikasi: Adalah proses perbanyakan bahan genetik. Replikasi bahan genetik dapat dikatakan sebagai proses yang mengawali pertumbuhan sel, meskipun sebenarnya pertumbuhan merupakan suatu resultan banyak proses yang saling berkaitan satu sama lain.

Ada 3 hipotesis tentang replikasi DNA 1. Replikasi secara Konservatif 2. Replikasi secara semi konservatif 3. Replikasi secara Dispersif

Three Models of DNA Replication Conservative Semiconservative Dispersive .

sedangkan kedua untai DNA anakan terdiri atas molekul hasil sintesis baru. Replikasi secara Konservatif Molekul DNA untai ganda induk tetap bergabung.1. .

.2. Replikasi secara Semi Konservatif Setiap molekul untai ganda DNA anakan terdiri atas satu untai tunggal DNA induk dan satu untai tunggal DNA hasil sintesis baru.

.

3. . Replikasi secara Dispersif Molekul DNA induk mengalami fragmentasi sehingga DNA anakan terdiri atas campuran molekul lama (berasal dari DNA induk) dan molekul hasil sintesis baru.

.Pada tahun 1958 Matthew Meselson dan Franklin Stahl berhasil menunjukkan secara empiris bahwa replikasi DNA berlangsung dengan mekanisme secara semikonservatif.

Meselson & Stahl Experiments .

Mekanisme Replikasi Proses replikasi DNA diawali dengan pemutusan (denaturasi) ikatan antara untai DNA yang satu dengan untaian komplementernya (secara enzimatis). . Denaturasi awal terjadi pada bagian DNA yang dikenal sebagai ori (origin of replication) atau titik awal replikasi.

.Untaian DNA membuka membentuk struktur yang disebut sebagai garpu replikasi (replication fork).

Replication forks The point at which the two strands of DNA are separated to allow replication of each strand .

Bidirectional Two ways .

.

.

Semi-discontinues One strand (leading strand) is synthesized continuously. whereas the other strand (lagging strand) is synthesized discontinuously in short patches (Okazaki fragments) Reiji Okazaki Tsuneko Okazaki .

Replication fork .

dGTP 3.Komponen Penting dalam Replikasi 1. dTTP. Molekul deoksi ribonukleotida yaitu dATP. Enzim DNA Polimerase Yaitu enzim utama yang mengkatalisis proses polimerisasi nukleotida menjadi untaian DNA. 2. DNA template yaitu molekul DNA atau RNA yang akan direplikasi. . dCTP.

5. Enzim DNA Ligase yaitu enzim yang berfungsi untuk menyambung fragmen-fragmen DNA. 7. Enzim Primase yaitu enzim yang mengkatalisis sintesis primer untuk memulai replikasi DNA. . Protein SSB (single strand binding protein) yaitu molekul protein yang menstabilkan untaian DNA yang sudah terbuka. Enzim Helikase yaitu enzim yang membuka untai ganda DNA induk 6.4.

Tahap-tahap replikasi DNA 1. 4. Denaturasi (pemisahan) untaian DNA induk Inisiasi sintesis DNA Pemanjangan untaian DNA Ligasi fragmen-fragmen DNA Terminasi sintesis DNA . 2. 5. 3.

DNA ligase repairs the remaining nicks . RNase H degrades RNA primers and leaves gaps 8.Steps of DNA Replication (animation) 1. Primase makes RNA primers 5. DNA polymerase fills the gaps 9. DNA polymerase synthesizes DNA strand complementary to parental DNA 6. Topoisomerase removes supercoil DNA 4. SSB binds to ssDNA 3. Sliding DNA clamp bind to DNA polymerase to increase processivity 7. DNA helicase unwinds the parental dsDNA by at replication forks 2.

Transkripsi merupakan proses yang mengawali ekspresi sifat-sifat genetik yang nantinya akan muncul sebagai fenotip. .TRANSKRIPSI Transkripsi: Proses penyalinan kode-kode genetik yang ada pada urutan DNA menjadi molekul RNA.

mRNA Adalah RNA yang merupakan salinan kode-kode genetik pada DNA yang dalam proses selanjutnya (proses translasi) akan diterjemahkan menjadi urutan asam-asam amino yang menyusun suatu protein tertentu. yaitu: 1.Molekul RNA yang disintesis dalam proses transkripsi dapat dibedakan menjadi 3 kelompok molekul RNA. .

2. . tRNA Adalah RNA yang berperan membawa asam-asam amino spesifik yang akan digabungkan dalam proses sintesis protein 3. rRNA Adalah RNA yang digunakan untuk menyusun ribosom.

3. 4. 2.Komponen utama dalam proses transkripsi 1. Urutan DNA yang akan ditranskripsi Enzim RNA Polimerase Faktor-faktor transkripsi Prekursor untuk sintesis RNA .

Penempelan faktor-faktor pengendali transkripsi menyebabkan terbentuknya kompleks promoter yang terbuka 3. promoter. . RNA polimerase membaca cetakan (DNA template) dan mulai melakukan pengikatan nukleotida yang komplementer dengan cetakannya.Tahap-tahap Transkripsi 1. Faktor-faktor yang mengendalikan transkripsi menempel pada bagian 2.

.4. selanjutnya diikuti dengan proses terminasi yang ditandai dengan pelepasan RNA polimerase dari DNA yang ditranskripsi. Setelah terjadi proses pemanjangan untaian RNA hasil sintesis.

Promoter pada prokaryot terdiri atas beberapa bagian penting yang sekuennya selalu ada pada semua atau sebagian besar gen. Salah satu bagian penting promoter adalah Pribnow box pada urutan nukleotida posisi -10 dan posisi -35. .Promoter adalah urutan DNA spesifik yang berperan dalam mengendalikan transkripsi gen struktural dan terletak disebelah hulu (upstream) dari bagian struktural suatu gen.

Analisis terhadap 100 gen menunjukkan bahwa pada posisi -10 dan -35 terdapat urutan nukleotida konsensus. sebagai berikut: Posisi -10 : TATAAT Posisi -35 : TTGACA .

.

.

.

TRANSLASI Translasi: Proses penerjemahan urutan nukleotida yang ada pada molekul mRNA menjadi rangkaian asam-asam amino yang menyusun suatu polipeptida atau protein. .

Inisiasi 2.Tahap-tahap proses translasi 1. Pemanjangan (Elongasi) 3. Terminasi .

Tahap Inisiasi Translasi 1. 4. Pengikatan subunit 50S. IF-1 dan IF-3 terlepas . Pengikatan IF-3 pada subunit 30S 3. 2. 5. Pengikatan mRNA dan fMet-tRNA untuk membentuk kompleks inisiasi 30S. IF-2 dan GTP bersamasama dengan IF-3. Disosiasi ribosom 70S menjadi subunit 50S dan 30S dengan menggunakan faktor IF-1. Pengikatan IF-1.

6. IF-2 terlepas dari kompleks bersamaan dengan hidrolisis GTP sehingga terbentuk kompleks inisiasi 70S yang siap melakukan proses pemanjangan polipeptida. .

. Pengikatan aminoasil-tRNA yang terdapat pada ribosom. 2.Tahap Pemanjangan (Elongation) Translasi 1. Translokasi ribosom sepanjang mRNA ke posisi kodon selanjutnya. Pemindahan rantai polipeptida dari tRNA 3.

Translasi .