Secara garis besar, protein dapat diklasifikasikan menjadi 2 macam, yaitu protein berdasarkan sifat dan tugas yang dilaksanakan serta berdasarkan strukturnya
Berdasarkan strukturnya, protein dibagi menjadi 4 bagian yaitu: Protein struktur Primer Protein struktur Sekunder Protein struktur Tersier Protein struktur kuartener
Berdasarkan sifatnya, protein dapat terbagi menjadi 3 bagian yaitu Protein serat (tidak larut dalam air) Protein Globular (larut dalam air) Protein Konjugasi (bersenyawa dengan zat lain)
Protein Serat
Protein serat atau dikenal juga sebagai protein struktural yaitu protein yang membentuk otot, kulit, dinding pembuluh darah dan rambut. Protein ini terdiri dari molekul panjang yang mirip benang dan tidak larut dalam air.
Protein globular
Yaitu protein yang bentuknya agak bulat karena rantai-rantainya melipat dan bertumpukkan. Protein ini larut dalam air. Protein ini melakukan berbagai fungsi penting pada suatu organsime, contohnya hemoglobin, antibodi dan fibrinogen
Protein Konjugasi
Yaitu protein yang dihubungkan ke suatu bagian non-protein. Cara hubungan yang lazim antara protein dan non-protein ialah dengan suatu rantai samping fugsional dari protein