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2. Biomolculas composio qumica, estructura e reactividade

AULA 3 BIOQUMICA ESTRUTURA E PROPRIEDADES DOS AMINOCIDOS E PPTIDOS

Os aminocidos so os monmeros constituintes dos pptidos e das protenas

Existem ~700 aminocidos conhecidos S 20 aminocidos so usados para formar protenas. - aminocidos grupo amina e carboxilo ligado ao carbono Os aminocidos diferem nas suas cadeias laterais R Os pptidos e protenaas so cadeias de resduos de aminocidos ligados entre si por ligaes covalentes ligao peptdica

Grupo amina

grupo carboxilo

Cadeia lateral

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Estereoisomerismo dos aminocidos L-aminocidos

Os aminocidos tm um centro quiral no C, que permite configuraes espelhadas L ou D Nos sistemas biolgicos todos os aminocidos a configurao L
Imagens espelhadas
Grupo amina grupo carboxilo

Cadeia lateral

Unica excepo: Glicina Lei de CORN

L-se a palavra CO-R-N (milho) no sentido do ponteiro do relgio nos L-aminocidos

no quiral

Propriedades cido-base dos aminocidos: Comportamento anfotrico em soluo aquosa (Zwitterio)

Os aminocidos possuem pelo menos 2 grupos ionizveis
Io amnia+ io carboxilato Podem ter outros grupos ionizveis nas cadeias laterais

So molculas anfotricas
So ao mesmo tempo cido e base

H R
pH ~ 7 (neutro)
Condies fisiolgicas

pH < 7 (cido) Acid

H R COO- + H+ NH2

COONH3+

H R COONH3+

H R COO- + H+ NH3+

pH > 7 (bsico) Base

H R COOH NH3+

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Curva de titulao de um aminocido sem cadeia lateral ionizvel

espcies inicas predominantes ao longo da titulao

Comparao dos pKa

CH3COOH : 4.75 Glicina-COOH: 2.34 (cido mais forte) Estabilizao de carga CH3NH3 :10.6 Glicina-NH3 : 9.6 (cido mais forte) Efeito de remoo de electres

pI ponto isoelctrico
A carga total neutra No se move num campo elctrico As caixas azuis, centradas na vizinhana dos valores de cada pKa, representam as duas zonas de poder tampo. Fig. Curva de titulao de uma soluo de glicina a 0.1 M a 25 C.

Propriedades dos aminocidos dependem das caractersticas da cadeia lateral

Polaridade

carga

dimenso

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Aminocidos Apolares, com cadeia aliftica

interaces hidrofbicas

mais pequeno

Prolina iminocido, estrutura rgida

Aminocidos com cadeia aromtica

interaces hidrofbicas Pontes de H Phe Tyr e Trp

Absorvncia na regio UV da Tyr e Trp

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Aminocidos polares, com cadeia sem carga

Mais hidroflicos Pontes de H
Grupo OH : Serina, Treonina Grupo Amida : Asparagina, Glutamina Grupo tiol: Cistena Pontes persulfureto entre grupos tiol

Aminocidos polares, com cadeia com carga positiva

Os mais hidroflicos Interaes electrostticas Pontes de H
Lisina : grupo amina (pKa =10.53) Arginina : grupo guanidina (pKa=12.48) Histidina : grupo imidazolo (pKa=6.0)
Importante nas funes dos enzimas

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Aminocidos polares, com cadeia com carga negativa

Os mais hidroflicos Interaes electrostticas Pontes de H
Grupos carboxilo (pKa=~4)

Curvas de titulao de aminocidos com cadeia lateral com carga

Tm mais um grupo proteonvel, logo mais um ponto de equilbrio

7,58 3.22

pI calculado como metade dos pKas que rodeiam a espcie zwiterinica Quais os pI do glutamato e da histidina?

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Outros aminocidos resultam de modificaes pstranslacionais ou ps-traducionais

Hidroxiproline e hidroxiserina Essencial para a estabilizao das fibras de colagnio -carboxiglutamate Activao da Protrombina e osteocalcina Selenocisteina Superoxide dismutase Fosfotirosina, serina, treonina Activao/inactivao de diversas protenas sinalizao

A ligao peptdica
Rgida (no h rotao na ligao C-N) Ligao dupla parcial Estrutura de ressonncia

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Propriedades das cadeias laterais para o folding das protenas

carga polaridade
Interaco electrosttica Ponte de H Efeito hidrofbo

tamanho

Ponte /ligao persulfureto No disulfide ou disulfito ou persulfide

No cabe

Nomenclatura dos pptidos

Alanina

Glicina Orientao de leitura (N C

Terminal amina N-terminal Alan(ina) +il Glicina

Terminal carboxilo C-terminal

Alanilglicina Ala-Gli AG

dipptido

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Nomenclatura dos pptidos

Tetrapptido Alanilglutamilglicillisina

Pentapptido serilgliciltirosilalanilleucina ou SerGlyTyrAlaLeu.

Comportamento cido-base dos pptidos

serina

Leucina

Pentapptido serilgliciltirosilalanilleucina ou SerGlyTyrAlaLeu.

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Comportamento cido-base dos pptidos

pKN 9,7

pKR 10,5 pKc 2,2

pH

pKR 4,3

14 12 10 8 6 4 2 0 0 1 2 NaOH equivalents 3 4

Tetrapptido Alanilglutamilglicillisina

Exemplos de pptidos
Oxitocina Aspartame
L-aspartil-L-fenilalaninametil ster
O H3N+ N H O O O CH3

Nonapptido cclico hormona neuropptido

O
dipptido

lactoferrina
Pptido de 25 aminocidos Propriedades antibiticas

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Exemplos de pptidos
Insulina
hormona

Processamento ps-traducional

Exemplos de pptidos
glutationo
tripptido -glutamilcisteinilglicina

Muito importante agente antioxidante Regulador do estado redox da clula

GSH GSSG

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Pptidos e Protenas so cadeias de resduos de aminocidos com estrutura tridimensional bem definida
dipeptido : Aspartame Triptpido: glutationo Nonapeptido : oxitocina Insulina : 30 + 21

Pptidos < 50 aa< Protenas

Tamanho

Propriedades Fisico-qumicas
Somatrio das dos aminocidos Pptido Outras propriedades que no existiam nos aminocidos apenas - Protena

Peso molecular mdio dum aminocido nas protenas : ~110 Da ou g/mol

Exerccios

Propriedades cido-base dos aminocidos

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