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23-03-2011

2. Biomolculas composio qumica, estructura e reactividade


AULA 4 BIOQUMICA

PR O TE N A S
PROPRIEDADES, FUNES E ESTRUCTURAS

Nveis hierrquicos na estrutura das protenas


Motivos

Sequencia de aminocidos

Domnios

E. Secundria - Arranjos estruturais locais que resultam num processo de enrolamento de partes da proteina

E. Terciria -Estrutura 3D assumida pelo arranjo das estruturas secundrias. E. Quaternria - Estrutura 3D assumida pelo arranjo de vrias polipptidos ditos subunidades.

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Tipos de interaces que determinam a estrutura de uma protena

Interaco electrosttica

Ponte de H

Ponte /ligao persulfureto

Efeito hidrofbo

Interaces de Van der Waals

Esqueleto da cadeia polipeptidica Ligao peptdica


A ligao peptdica planar, e rgida devido ao caracter parcial de ligao dupla. No tem liberdade para rodar.

As ligaes N-Ca e Ca-C podem rodar com ngulos especficos e . Por conveno, e so definidos como 0 quando as duas ligaes associadas ao mesmo tomo C esto no mesmo plano. Esta conformao proibida na cadeia de uma protena, devido a interferncia estrica entre o oxignio do carbonilo e o hidrognio do grupo amino. Fi - e Psi-

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A estrutura secundria consequncia dos impedimentos estreos da ligao peptdica e das cadeias laterais dos aminocidos

Em teoria, os ngulos e podem assumir qualquer valor entre -180 e +180. As conformaes possveis das protenas so definidas pelos valores dos ngulos e . E podem ser visualizadas graficamente , nos grficos de Ramachandaran As reas azul escuras englobam conformaes sem interferncia estrica e so completamente permitidas; azul mdio involvem conformaes permitidas no limite dos contactos atmicos desfavorveis; azul claro reflecte conformaes s permitidas se alguma flexibilidade for permitida nos ngulos e . A assimetria do grfico resulta da estereoqumica em L dos aa.

Grfico de Ramachandran indica os valores de e de para vrias estructuras secundrias permitidas

As pontes de H ajudam a estabilizar as estruturas secundrias A glicina no sofre tantos impedimentos estreos Alguns aminocidos tm estruturas preferenciais (Gly, Pro, Val)

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A Hlice ,
um dos elementos de estrutura secundria mais abundantes
Esqueleto peptdico Estrutura c ompacta, enrolada para a direita Distncia de 1,5 entre cada resduo Cada volta da hlice tem 3.6 resduos (5,4 ) Rotao de 100 por resduo, de forma que a cadeia lateral projectada para fora, em intervalos regulares Vista de topo A hlice no oca, pois os tomos do centro esto em contacto prximo Cadeias laterais Vista s C

A Hlice ,
um dos elementos de estrutura secundria mais abundantes

A prolina incompatvel com a hlice Leva a kinks H-bond A glicina introduz uma elevada flexibilidade na hlice.

H-bond

A estrutura estabilizada por pontes de hidrognio entre o grupo carbonilo e o hidrognio do grupo amina a uma distncia de 4 aminocidos N-H As cadeias laterais podem estabilizar ou destabilizar a estrutura em hlice. Ex. S Asp, levava a repulso das R

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A Hlice ,
um dos elementos de estrutura secundria mais abundantes

Dependendo dos resduos de aa, e das suas cadeias laterias, as hlices podem ser polares, hidrofbicas, ou anfipticas.

Hlices anfipticas podem ajudar a estabilizar arranjos tridimensionais com um core apolar, no caso de protenas soluveis, ou polar, no caso de protenas membranares.

Conformao e Folha ,
outro elemento de estrutura secundria predominante
As cadeias (unidade bsica) tm uma estrutura estendida, em zig-zag, com as cadeias laterais alternando acima ou debaixo do esqueleto. Duas ou mais cadeias criam uma topologia em folha , que estabilizada com ligaes de H entre resduos de aminocidos muito distantes. Dependendo da orientao das cadeias peptidicas podem ser: Folhas antipararelas

Folhas paralelas

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Conformao e Folha ,
outro elemento de estrutura secundria predominante
Folhas paralelas Apresentam uma toro menor que as antiparalelas As pontes de H no so to estveis

As estruturas so estabilizadas por pontes de H entre as cadeias adjacentes (aa longnquos)

Folhas antipararelas Tm uma estrutura ligeiramente entortada para a direita (L-aa)

Conformao e Folha ,
outro elemento de estrutura secundria predominante
Arranjo de folhas antipararelas em barril Tm uma estrutura ligeira toro para a direita (L-Aa)

Barril -barrel

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Os Reverse turn ou elementos de reverso


elementos mais simples de ES (3-4 resduos) que revertem a cadeia polipptidica

Beta-Turns (Tipo I e II) 4 resduos com Pontes de H


entre o 1e o 4. As volta tipo I ocorrem duas vezes mais frequentemente do que as do tipo II. As do tipo II tem sempre um resduo de glicina na terceira posio.

Gamma-Turns 3 resduos com Pontes de H entre


o 1e o 3. So voltas muito apertadas, com geometria relativamente desfavoravel. Menos comuns.

Nveis hierrquicos na estrutura das protenas: Estrutura super-secundria - Motivos


Combinaes simples de elementos de estructuras secundrias
-motivo hairpin: 2 folhas adjacentes e antiparalelas ligadas por um pequeno loop. - Motivo --: a hlice a central liga o C-terminal da primeira folha ao N-terminal da segunda folha escudando os residuos hidrofbicos de folhas b, da superfcie. -motivo hlice-volta-hlice: contm 2 hlices e esto normalmente associados ligao ao DNA. Normalmente ocorrem em protenas reguladoras. -chave grega: 4 folhas b ligadas topo a topo e enroladas em sandwich.

hairpin

Motivo --

hlice-volta-hlice HTH

chave grega

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Nveis hierrquicos na estrutura das protenas: Domnios Estruturais


A combinao de motivos estruturais origina estruturas mais complexas Combinao de domnios - origina um domnio designado por feixe de 4 hlices (four helix bundle) Os domnios podem ser classificados pelo tipo de estrutura secundria predominante: Domnios Domnios Domnios

Um domnio estrutural equivalente pode ocorrer em protenas com estrutura primria muito distinta. Em termos evolutivos existe muito maior conservao estrutural do que a nvel de estrutura primria.

Nveis hierrquicos na estrutura das protenas: Domnios Estruturais


Estrutura da Flavohemoglobina de uma bactria
flavin-binding (FAD) domain

Estrutura tetramrica da Hemoglobina de vertebrados

Domnio redutase

NAD-binding domain

globin domain

Um domnio uma parte estructural de uma protena que pode funcionar e por vezes existir de forma independente. Normalmente o seu enrolamento independente do resto da protena. Cada domnio forma uma estructura compacta tri-dimensional e muitas protenas tem vrios domnios estruturais, ao qual normalmente est associada uma funo fisiolgica especfica. Como os domnios so estveis, podem ser substitudos por tcnicas de engenharia gentica, resultando em protenas quimricas.

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Nveis hierrquicos na estrutura das protenas: Domnios Estruturais


Exemplos de Domnios Exemplos de Domnios
Barril

Domnio associado ligao a nucletidos

Estrutura terciria estrutura tridimensional da protena


Estrutura tridimensional resultante do enrolamento da cadeia polipeptidica e arranjo espacial de todos os tomos constituintes da cadeia. Corresponde ao valor mnimo da Energia de Gibbs O mecanismo de enrolamento das protenas designa-se por folding

folding

Estrutura Nativa

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Exemplo do enrolamento sequencial de uma protena, processo de folding aquisio da estutura nativa

Estrutura terciria estrutura tridimensional da protena


Numa protena globular, os elementos da estrutura secundria associam-se numa estrutura compacta estabilizada por interaces no covalentes: - pontes de H - interaces inicas - interaces de natureza hidrfoba E por interaces covalentes entre as cadeias laterais de L-Cistena oxidao

Ponte persulfureto

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Estrutura terciria estrutura tridimensional da protena

A estrutura nativa da protena estabilizada por pontes persulfureto

Processo de desnaturao, aquele em que a protena perde o seu fold nativo. Fica desnaturada.

No processo de refolding a protena retorna sua estrutura nativa

Folding in vivo Papel dos chaperones


Os chaperones so protenas com a capacidade de se ligarem a cadeias polipeptdicas nascentes e com intermedirios parcialmente desnaturados. Chaperones Pequenos (< 200 kDa) heat shock protein Hsp40, Hsp70, homlogos e co-chaperones Chaperones Grandes (> 800 kDa) o sistema GroE e chaperones tailess complex polypeptide-1 (TCP-1)

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Folding in vivo Papel dos chaperones pequenos


DnaJ (Hsp40) DnaK(hsp70) GrpE
Primeiro, o DnaJ ligase cadeia peptidica, e a seguir ao DnaK

O DnaJ vai estimular a actividade atpsica do DnaK, fazendo-o ficar ligado a ADP. O DnaK-ADP liga-se fortemente ao pptido

Outro factor, o GrpE, estimula a libertao do ADP O apo-DnaK, liga outro ATP, e solta a cadeia peptdica j enrolada.

Folding in vivo Papel dos chaperones grandes

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Folding in vivo Regulao


No caso da protena no conseguir atingir a sua estrutura nativa, ela marcada para ser destruda no proteassoma. A marcao feita por ligaes de mltiplas ubiquitinas protena. No protessoma a protena hidrolisada em fragmentos peptdicos.

Uma mutao que cause a alterao ou deleo de resduos de aminocidos, pode ser o suficiente para a protena no atingir a sua conformao nativa. Doenas genticas

Folding das protenas, degradao e agregao

Ubiquitina

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Agregao de protenas mal enroladas a base de doenas neurodegenrativas como o Alzheimer ou o Parkinson

Estrutura terciria determinao da estrutura tridimensional da protena


A primeira estrutura de uma protena foi determinada por difraco de Raios-X, a partir dum cristal da mioglobina de cachalote. Este ainda o mtodo mais usado, mas h outros tais como a espectroscopia de ressonncia magntica nuclear (NMR). A partir de estruturas j identificadas possvel prever computacionalmente, ou modelar a estrutura de uma protena

Lisozima cristalizada

Estrutura tridimensional da lisozima

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Diferentes modos de representao da estrutura tridimensional da protena


Balls and Sticks Bolas(tomos) e traos (ligaes) Superfcie de Van der Waals

Superfcie exposta ao solvente, com colorao pela carga Representaes esquemticas dos motivos de estrutura secundria

tomos (bolas) com raio de Van der Waals

Estrutura quaternria
H protenas que so constitudas por mais do que uma cadeia polipptdica, sendo esta associao essncial sua funo. Chamam-se oligmeros ou oligomricas, e tm uma estrutura quaternria, que resulta da estrutura tridimensional adquirida pelo folding/associao das diferentes subunidades. Classificam-se pelo nmero de subunidades: dimeros, trimeros, tetrameros... Dependendo da natureza dos seus monmeros (constiutintes) homo-oligomeros (mesma subunidade) hetero-oligomeros (diferentes subunidades)

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Estrutura quaternria
Hemoglobina Heterotetramero (duas subunidades e 2 )

Ferritina 24 subunidades iguais

Estrutura quaternria
Complexo I da cadeia respiratria 15 subunidades diferentes na bactria Thermus thermophylus

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Protenas Fibrosas
As protenas fibrosas distinguem-se das protenas globulares pela estrutura tridimensional global e pela funo que desempenham. Estas protenas apresentam conformaes estendidas regulares e insoluveis em gua, em contraste globulares que se enrolam sobre si prprias. Estas protenas desempenham funes estruturais, conferindo rigidez e/ou elasticidade s estruturas fisiolgicas.

Estructura da seda. Fibrona As fibras da malha da seda so compostas pela protena fibrona. a) A fibrona composta por camadas de folhas b anti-paralelas ricas em alanina (roxo) e glicina (amarelo). b) Fitas de fibrona (azul) de seda de aranha vistas ao microscpio electrnico.

Protenas Fibrosas -queratina e o cabelo


(a) -queratina composta de hlices- super-enroladas. Pares desta hlice inter-enrolados formam coiled coils que se combinam em estructuras ordenadas chamadas protofilamentos e protofibris. 4 protofibris 32 cadeias de -queratina combinam-se para formar um filamento intermdio. A estrutura de um cabelo um conjunto de muitos filamentos de -queratina.
A quebra e rearranjo de pontes persulfureto a base bioqumica das permanentes

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Protenas Fibrosas o colagnio


Estructura do colagnio. a) a cadeia de colagnio tem uma estructura secundria repetida nica. A sequncia tripeptdica Gly-X-Pro adopta uma estrutura em hlice a rodar para a esquerda com trs resduos por volta. c) 3 hlices deste tipo, em cinzento, azulclaro e azul escuro enrolam-se umas volta das outras, no sentido da direita. d) A super-hlice do colagnio vista de topo. Os resduos de Gli (vermelho), esto sempre localizados no interior, onde as 3 cadeias esto em contacto, devido ao tamanho muito reduzido da sua cadeia lateral.

Hlices esquerda

Tripla Hlice de hlices

Relao Estrutura-Funo
A estrutura essencial funo. A estrutura tridimensional das protenas tem curvaturas, tem cavidades, tem superfcies com diferentes cargas (neutra, positiva, negativa) e estas caractersticas vo permitir protena o desempenho da sua funo. Durante a evoluo dos organismos, embora ocorra uma imensa variao da estrutura primria, a estrutura tridimensional (3ria, 4ria) mantem-se conservada, e observa-se conservao tambm de resduos dos locais funcionais.
Alinhamento da estrutura primria de Cu/Zn SOD
S_cerevisieae Homo_sapiens Xenopus Photobacterium Actinobacillus : : : : : * 20 * 40 * 60 * 80 * -------------VQAVAVLKGda--gvSGVVKFEQAsesepTTVSYEIAGNSPnAERGFHIHEFGDat--------ngCVSAGPHFNPF ------------aTKAVAVLKGdg--pvQGIINFEQKesngpVKVWGSIKGLTE-GLHGFHVHEFGDnt--------agCTSAGPHFNPL -------------VKAVCVLAGsg--dvKGVVHFEQQde-gaVSVEGKIEGLTD-GLHGFHIHVFGDnt--------ngCMSAGSHFNPE -------------QDLTVKMTDlqtgkpVGTIELSQNky--gVVFTPELADLTP-GMHGFHIHQNGScassekdgkvvlGGAAGGHYDPE kadnssveklvvqVQQLDPVKGnk---dVGTVEITESay--gLVFTPHLHGLAQ-GLHGFHIHQNPScepkekdgklvaGLGAGGHWDPK 6 g G 6 2 6 gl g hGFH6H g AG H51P 100 * 120 * 140 * 160 * KKt-HGaptdevrHVGDMGNVKTDenGVAKGSFKDSLIKLIgptSVVGRSVVIHAGQDDLGKGDTEESLKTGNAGPRPACgvigltn SRk-HGgpkdeerHVGDLGNVTADkdGVADVSIEDSVISLSgdhSIIGRTLVVHEKADDLGKGGNEESTKTGNAGSRLACgvigiaq NKn-HGapgdtdrHVGDLGNVTAEg-GVAQFKITDSLISLKgpnSIIGRTAVVHEKADDLGKGGNDESLKTGNAGGRLACgvigysp HTnkHGfpwtddnHKGDLPALFVSanGLATNPVLAPRLTLK---ELKGHAIMIHAGGDNHSDMPKALGGGGARVACGVIQ------ETkqHGypwsdnaHLGDLPALFVEhdGSATNPVLAPRLKKLd--EVKGHSLMIHEGGDNHSDHPAPLGGGGPRMACGVIK------HG P H GD6 6 G A 6 l 6 G 66H D1 : : : : : 67 67 65 74 84

S_cerevisieae Homo_sapiens Xenopus Photobacterium Actinobacillus

: : : : :

: : : : :

153 153 150 151 162

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Relao Estrutura-Funo Funes das Protenas Catlise (hexocinase) Estrutura (colagnio) Movimento (actina e miosina) Defesa (imunoglobulinas ou anticorpos) Regulao (insulina ou receptores de membrana) Transporte (Hemoglobina, transferrina)
Muitas vezes as protenas contm tambm outras molculas no peptidicas, que so essencias sua funo, ditos cofactores ou grupos prostticos. Designam-se por holoproteinas, ou sem o cofactor apoprotenas. Metaloprotenas, Heme-protenas ou protenas hmicas Flavoprotenas lipoprotenas glicoprotenas

Relao Estrutura-Funo
Flexibilidade estrutural das protenas relao estabilidade/funo
A estrutura tridimensional adquirida pelas protenas foi a de menor energia
Mas um aumento de enrgia no sistema (pex.Temperatura) Pode levar destabilizao da protena, e passagem para uma outra conformao no funcional ou desnaturada

fraco de protena desnaturada

10

30

50

T (C)

70

90

Dependendo da T de crescimento do organismo, as protenas tero estabilidade a diferentes temperaturas. Assim, enzimas de termfilos tm grandes aplicaes tecnolgicas Estas protenas so estabilizadas graas a um maior n de interaces, maior rigidez e empacotamento mais eficiente, e de reduo da entropia de unfolding

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Relao Estrutura-Funo Interaco protena ligando


Uma das caractersticas mais importantes das protenas, a sua capacidade para ligarem com elevada especificidade ligandos (outras protenas, pequenas molculas, etc. ) O equilibrio de ligao segue as regras bsicas de equilibrio qumico:

[PL] KL = [P][L]
=

P + L PL

K L [P ][L] K L [P ][L] + [P ]

[PL] [P] + [PL]

[L] +

[L]
1 KL

Funo hiperbolica

Fraco de locais ocupados pelo ligando

Relao Estrutura-Funo Interaco protena ligando


Na base das interaces protena-ligando esto as interaces no covalentes (electrostticas, inicas, por pontes de H, hidrfobas) Efeito hidrfobo
A remoo da camada ordenada de molculas de gua favorece a formao do complexo enzima-substrato.
Camada de molculas de gua ordenadas

S aumenta
molculas de gua desordenadas, libertadas pela interaco do enzima com o substrato

Interaco enzimasubstrato estabilizada por pontes de hidrognio, interaces inicas ou hidrofbicas

Separados, o enzima e o substrato foram as molculas de gua vizinhas a formarem uma camada ordenada. A ligao do substrato enzima liberta algumas molculas de gua, aumentando a entropia do sistema (S) e portanto favorecendo energeticamente a reaco.

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Relao Estrutura-Funo complementaridade entre protena-ligando


As protenas so especficas. A ligao s se d com o ligando com o qual complementaridade. Se for ligar um ligando apolar, o local de ligao ser composto de forma a ser tambm apolar. Se o ligando tiver uma carga positiva, natural que no local de ligao estejam expostos grupos polares com carga negativa, e no positiva. Se o ligando grande, o pocket de ligao ser grande, mas se o ligando pequeno, natural que a conformao da protena crie um local de menores dimenses.

Relao Estrutura-Funo complementaridade entre protena-ligando


O caso do canal de potssio Qualquer io entra solvatado at cavidade Os dipolos das hlices vo forar o sentido de movimentao de ies atravs do canal

mas precisa de ter a carga certa e o tamanho certo para perder a solvatao pelas molcuals de gua por interaco com os grupos carbonilo da protena

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Relao Estrutura-Funo A alosteria nas protenas

A alosteria ocorre quando existem mais do que um local de ligao na protena Assim a ligao ao site 1 pode: - no afectar a ligao do 2 - ajudar a ligao do 2 - inibir a ligao ao site 2

Os efeitos alostereos so sentidos quando a ligao dum ligando leva a alterao da conformao da protena

Relao Estrutura-Funo A alosteria nas protenas Exemplo da hemoglobina


Hemoglobina Mioglobina

Constituida por 4 subunidades semelhante mioglobina

Funo de transporte de O2 no sangue, entre os pulmes e Funo de os tecidos armazenamento de O2 nos tecidos musculares

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Relao Estrutura-Funo A alosteria nas protenas Exemplo da hemoglobina


Hemoglobina Mioglobina

O binding site do O2 o Fe2+ do hemo b presente em cada cadeia de globina

Um hemo composto por anel porfirina Onde um io Fe pode ficar ligado

Relao Estrutura-Funo A alosteria nas protenas Exemplo da hemoglobina


Ligao de oxignio mioglobina e hemoglobina
A mioglobina apresenta um perfil hiperbolico de ligao, Com alta afinidade para o ligando

Alta afinidade

Baixa afinidade

A Hemoglobina apresenta um perfil sigmoidal de ligao Tem uma misturade baixa afinidade e de alta afinidade

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Relao Estrutura-Funo A alosteria nas protenas Exemplo da hemoglobina

Sem O2 ligado, todos os monmeros da hemoglobina esto no estado T, que tem baixa afinidade

A ligao de O2 a uma subunidade induz alteraes conformacionais nas outras subunidades para passarem ao estado R, com mais afinidade para o O2.. Assim mais O2 pode ser ligado.

A alterao conformacional induzida noutra cadeia, e sentida junto ao hemo o binding site

Relao Estrutura-Funo A alosteria nas protenas Exemplo da hemoglobina


A ligao de Oxignio hemoglobina afectada pelo pH, pelo efeito de Bohr. Quanto mais cido menor a afinidade.

O pH mais cido nos capilares serve para facilitar a libertao de oxignio junto aos tecidos

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Relao Estrutura-Funo A alosteria nas protenas Exemplo da hemoglobina


Outros efectores na afinidade da hemoglobina para o oxignio: o CO2 e o 2,3-bifosfoglicerato O CO2 contribui para baixar o pH, e ao mesmo tempo reage com os Nterminais das cadeias da Hb, o que promove o estado T de baixa afinidade O 2,3-BPG liga-se Hemoglobina no interface das subunidades e baixa a afinidade para o oxignio, favorecendo o estado T.
Hb
O 2,3-BPG produzido numa via de desvio da gliclise

Relao Estrutura-Funo Aco mecnica por alterao conformacional da protenas


Motores moleculares o caso das clulas musculares Filamentos grossos (roxo): miosina super enrolada em coiledcoil tails empacotadas costas-comcostas

Filamentos finos (cinzento): actina (+ outras protenas (Tropomiosina, Troponina) Os discos Z e M so protenas que organizam e servem de ncora aos filamentos finos e grossos

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Relao Estrutura-Funo Aco mecnica por alterao conformacional da protenas


Motores moleculares o caso das clulas musculares O comprimento dos filamentos finos e grossos mantm-se constante. Os filamentos deslizam uns pelos outros Este movimento derivado da miosina caminhar (filamento grosso) caminhar ao longo da Factina (filamento fino) O resultado final haver contrao e disteno das fibras musculares

Relao Estrutura-Funo Aco mecnica por alterao conformacional da protenas


A miosina, atravs de actividade ATPasica consegue promover a contrao muscular. A clivagem do ATP leva-a a uma conformao flectida, preparando o power stroke. A mudana para esta conformao empurra a miosina ao longo do 6. ADP release filamento de actina
A libertao do Pi leva ao retorno da conformao inicial ATP reduz a afinidade da Miosina para a actina 5. Power stroke

1. ATP binding Actin dissociation

2. ATP hydrolysis Cocking of myosin head

A Miosina-ADP liga-se actina

4. Pi release Strong acting binding

3. Weak actin binding

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Ferramentas de biologia computacional utilizadas na determinao da funo de protenas

Expasy Tools

Multiplas ferramentas para prever peso molecular, pI, estrutura secundria, terciria, motivos ou sinais nas sequencias de aminocidos...

Blast comparao de sequencias de proteinas/DNA, procura de semelhanas nos genomas sequenciados Clustal e GeneDoc comparao/alinhamento de estruturas primrias ...

Bibliografia
Captulo 11, 12, 14, 15 . Captulo 16 (curiosidade)

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Questes
1. Descreva duas das mltiplas funes desempenhadas pelas protenas? 2. Defina estrutura primria de uma protena. 3. Qual a estrutura da ligao peptdica? 4. Examine o seguinte tetrapptido:

a) Desenhe caixas em torno de cada uma das ligaes peptdicas. b) Qual o significado dos grupos R? c) Entre que ligaes da cadeia principal existe livre rotao? 5. Como se designam genericamente as protenas constitudas por mais de uma cadeia polipeptdica?

Questes
6. Caracterize o padro de pontes de hidrognio numa hlice e numa folha . 7. A mioglobina uma protena monomrica com um enrolamento do tipo allalpha, constituda por oito segmentos de hlices . Um destes segmentos tem a seguinte sequncia: -Gln-Gly-Ala-Met-Asn-Lys-Ala-Leu-Glu-His-Phe-Arg-Lys-Asp-Ile-Ala-Ala a) Quais as cadeias laterais da hlice que estaro viradas para o interior da protena e quais as cadeias laterais que estaro viradas para o solvente? b) Este segmento representativo de uma hlice anfiflica? 8. Designa-se por tetramrica uma protena constituda por quatro subunidades. a) Distinga um homotetrmero de um heterotetrmero. b) D um exemplo de uma protena de uma protena heterotetramrica. 9. Defina domnio estrutural

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Questes
10. A ligao de um ligando a uma protena liberta molculas de gua coordenadas. Explique a razo pela qual este processo favorece a formao do complexo protena-ligando. 11. Explique a selectividade dos canais de potssio a ies K+ relativamente a ies Na+ 12. A hemoglobina uma protena com a funo especfica de transportar oxignio dos pulmes para todas as clulas do organismo. Descreva sucintamente em que consiste o efeito de Bohr e em que medida contribui para a funo normal da hemoglobina. 13. Podem existir protenas com uma sequncia de aminocidos da cadeia polipeptdica muito diferente e com uma estrutura tridimensional e uma funo idntica? 14. Qual a principal razo para terem surgido chaperones durante o processo evolutivo da sntese de protenas nos sistemas celulares? 15. Quais os factores determinantes para a estabilidade do estado nativo de uma protena?

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