Regulacin gnica a Nivel transcripcional

Yudy Aguilar. Bact., Ph.D(c) Universidad de Antioquia

Regulacin de la expresin de los genes

El mismo genoma, pero funcin distinta FIBRA MUSCULAR HEPATOCITO

CMO ES POSIBLE?

MEDIANTE PATRONES DE REGULACIN GNICA

Control de la expresin gnica

Un gen: Es una secuencia de nucletidos en la molcula de ADN, equivalente a una unidad de transcripcin.
estructuras reguladores

constitutivos

inducibles

catabolismo de azcares reparacin de daos

represibles

sntesis de aminocidos sntesis de nucletidos

Niveles de Regulacin gnica

Transcripcin (sntesis de ARNs a partir de ADN) Maduracin (modificacin de los ARNs sintetizados, no es comn en procariotas)

Traduccin (sntesis de protenas)

Los genes se expresan con diferente eficiencia y se regulan por distintos mecanismos

B B B B

B B B B

B B B B

B B B B

Regulacin traduccional

Resultando en un aumento en la cantidad de protena

Los genes se expresan con diferente eficiencia y se regulan por distintos mecanismos

Aumenta el nmero de transcritos

Resultando en un aumento en la cantidad de protena

Regulacin transcripcional

En bacterias, el principal nivel de regulacin es el transcripcional

GENE CON Regulacin positiva (+) GENE CON Regulacin negativa (-)

El gene se enciende (se empieza a transcribir o se transcribe ms)

El gene se apaga (no se transcribe o se transcribe menos)

Niveles de regulacin superior al opern. Estos constituyen el sistema de regulacin global

Niveles de regulacin superior al opern.

Estos constituyen el sistema de regulacin global Formado por Regulones: conjunto de operones asociados a una va, funcin o proceso comn bajo el control de la misma protena reguladora Modulones: conjunto de operones relacionados a vas o funciones mltiples que responden a una protena reguladora comn Estimulones: conjunto de operones, regulones o modulones que responden frente a una seal ambiental comn. Ej. Quorum sensing en bacterias

En bacterias los genes estn organizados en operones

DNA
RNA polimerasa

Un opern es un conjunto de genes, localizados contiguamente en el DNA, que obedece a las mismas seales de encendido o apagado.

Componentes de un opern

DNA
RNA polimerasa

P: promotor de los genes estructurales E1, E2, E3 y E4 R: regulador (codifica una protena represora que regula la

transcripcin de los genes estructurales) O: operador (secuencia reconocida por la protena represora que impide la transcripcin)

Los operones se pueden clasificar segn su regulacin

Control negativo: el regulador es un REPRESOR

Control positivo: el regulador es un ACTIVADOR

Expresin inducible: El modelo del Opern lac

F. Jacob

J. Monod

A. Lwoff

Genes estructurales lac

Genes estructurales lac

Cuando no hay lactosa en el medio, el opern lac est apagado

El represor unido al sito operador previene la transcripcin de los genes z, y, a

Cuando hay lactosa en el medio, el represor se disocia del operador y los genes z, y, a pueden ser transcritos

El inductor se une al represor y ste ya no se une al DNA. La RNA polimerasa reconoce al promotor y transcribe los genes estructurales

El Operon lac se activa para poder utilizar a la lactosa como fuente de carbono

Genes estructurales
Gen regulador

La lactosa es convertida a alolactosa por la b galactosidasa. La alolactosa es el inductor del opern lac.

La activacin del opern lac requiere la participacin de un activador: CRP o CAP

Activador CRP. cAMP receptor protein
CRP une cAMP Tambin se le llama CAP: Catabolite Activator Protein.

Este activador regula la expresin con base en los niveles de glucosa presentes en el sistema

Si los niveles de glucosa son altos, hay poco cAMP.

Si los niveles de glucosa son bajos, hay mucho cAMP.

Cuando los niveles de cAMP se incrementan, ste se une a la CRP

El complejo CRP-cAMP se une al promotor del opern de lactosa y causa un giro en el DNA que facilita la unin de la RNA polimerasa al promotor, activndolo.

El complejo CRP-cAMP se une al promotor del opern de lactosa facilitando la unin de la RNA polimerasa al promotor e incrementando 50 veces la transcripcin

Cmo se regula el opern lac cuando hay glucosa en el medio?

+ glucosa lactosa

Represor
RNApol

No se transcribe

Regulacin negativa

Qu le pasa al opern lac en presencia de lactosa an cuando exista glucosa?

+ glucosa + lactosa
inductor (lactosa)

RNApol

Debido a la presencia de lactosa el represor se inactiva, por lo que el opern se transcribe, aunque a un nivel bajo (transcripcin basal).

La clula prefiere usar la glucosa que otro azcar

Qu le pasa al opern lac cuando hay lactosa en el medio y no hay glucosa?

Activador

- glucosa + lactosa

La transcripcin es alta

Regulacin positiva

Qu le pasa al opern lac cuando no hay glucosa ni tampoco lactosa?

Como el represor est unido al promotor

- glucosa - lactosa

RNApol

No hay transcripcin!
Aunque los niveles de cAMP sean altos y el activador est presente....

Biosntesis de Trp y su opern

Cuando hay triptfano en el medio: Regulacin Negativa

Ausencia de triptfano en el medio: Regulacin Positiva

En el opern de triptfano hay una regin atenuadora en la que dos codones para Trp se encuentran muy juntos

[Trp] alta: el ribosoma traduce rpidamente el mRNA incluyendo los dos codones de Trp.=> forma un tallo-asa que provoca la terminacin de la transcripcin. [Trp ] baja: el ribosoma se detiene en los codones de Trp, por lo que no se forma el tallo-asa y la transcripcin continua.

Atenuacin transcripcional
Niveles altos de triptfano Polipptido en crecimiento
Bucle formado por unin de regin 3 y 4 seala terminacin de transcripcin

ARNpoli se separa del molde

Atenuador Niveles bajos de triptfano

Ribosoma se une a regin 1

Polipptido en crecimiento

Bucle alternativo entre regiones 2 y 3 (no seal de terminacin de transcripcin)

Transcripcin continua

Mecanismos de control en eucariotes

Genoma
Replicacin selectiva de ciertos genes Reordenamiento de genes Condensacin cromatina Metilacin ADN Acetilacin de histonas

Modificaciones en la cromatina relacionadas con la transcripcin

Cdigo de las histonas: metilacin, fosforilacin y acetilacin

Factores remodeladores del nucleosoma: no se modifican las histonas

Acetilacin de las histonas

Acetilacin de los residuos de lisina por los coactivadores con actividad acetiltransferasa de histonas (HAT)=> neutralizando la carga neta de la histona=> favoreciendo la actividad transcripcional.
Correpresores con actividad desacetilasa (HDAC) de histonas=> inhibe transcripcin

Secuencias de Regulacin
Promotores principales: Caja TATA e Inr=>unin especfico para los factores de transcripcin generales Secuencias de regulacin en cis: controlan la expresin de genes individuales, ej: caja GC

Secuencias de Regulacin
Secuencias localizadas a distancia que ligan factores transcripcionales que regulan la RNA pol
Estimuladores (enhancers) si estimulan Silenciadores (silencers) si la inhiben

Aisladores (insulators): dividen a los crs en dominios independientes e impiden que los enhancer acten sobre promotores adyacentes

Accin de factores unidos a enhancer y promotor sobre la ARN polimerasa

Accin de los represores eucariticos

Dominios de unin al ADN

FTRIIIA, factores reguladores de los promotores, receptores de homonas esteroideas Proteias activadora de catabolitos (CAP)

Accin de los represores eucariticos

Activador

Tambin acta con correpresores que actan modificando la cromatina

Represor

Represor compite con el activador por unin al ADN

Dominio represor

Represor se une al ADN e inhibe la transcripcin

Dominio de unin al ADN

Regulacin de factores de transcripcin: fosoforilacin Ej. p53

Estabilizacin y aumento de los niveles de p53

PCNA: antgeno de proliferacin nuclear

Regulacin de factores de transcripcin: hormonal

Control a nivel del procesamiento RNAm

Regulado por el splicing alternativo: Mediante un solo gen puede codificar una o ms protenas relacionadas.

 http://web.mit.edu/bioedgroup/animations.htm http://highered.mcgrawhill.com/sites/007337797x/student_view0/chapter13/flashcar ds.html http://cdserv1.wbut.ac.in/0-8053-46651/bc_russell_igen_mol_2/0,13714,5132917-,00.html