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Aula 9 15/10/12 Sumrio

Enzimas Papel das enzimas como catalisadores biolgicos Componentes da Reaco enzimtica Centro activo Substrato (especificidade e modelos de ligao Enzima-Substrato) Cofactores Ies metlicos Coenzimas Classificao e nomenclatura

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Funo Catalizadores Biolgicos

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Funo Catalizadores Biolgicos

So protenas(excepes) Presentes em todas as clulas vivas Aumentam a velocidade das reaces qumicas Permanecem inalteradas depois da reaco qumica
Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas

As enzimas aumentam a velocidade de uma reaco atravs: Diminuio da energia livre do estado de transio As enzimas no alteram a variao de energia livre (G)

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
1. Para que possam reagir entre si as molculas precisam atingir um elevado estado de energia: Estado de transio 2. Energia necessria para atingir o Estado de transio: Energia de Activao

3. Quanto mais elevada a variao de Energia livre para atingir o Estado de transio, mais lenta ser a taxa da reaco

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas

Enzima

Baixa a barreira energtica ao forar as molculas a atingir um diferente Estado de transio (cria um caminho novo) Este envolve a interaco com a enzima

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas

Enzima
G mantem-se

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas

Ea= 75 kJmol-1

Ea= 56 kJmol-1

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas

Ea= 75 kJmol-1

Ea= 56 kJmol-1

Ea= 23 kJmol-1

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas

1 molcula de Catalase converte 108 molculas de H2O2 por segundo


Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Componentes da reaco enzimtica

Centro activo da enzima Substrato Cofactores

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Enzimas
Centro Activo

Local da enzima onde se liga o Substrato formando o complexo ES

Frequentemente uma fenda ou um bolso criado pela estrutura terciria nica da protena (a conformao e ambiente qumico dentro do centro activo permite que a reaco qumica ocorra com mais facilidade)
Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Centro Activo

o S geralmente mantido no centro activo atravs do estabelecimento de interaces fracas com os grupos R dos aminocidos constituintes do Centro activo

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Enzimas
Substrato

O Substrato selectivamente reconhecido pela Enzima A especificidade controlada pelas caractersticas estruturais do S e do Centro activo Absoluta: Desidrogenase Succnica S; Succinato S; alcois

Relativa a uma classe de compostos: Desidrogenase alcolica

A especificidade geralmente relativa a uma configurao estrica (excepto racemases)

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Enzimas
Modelos de reconhecimento Enzima-Substrato Modelo Chave-Fechadura
A estrutura terciria da protena apresenta uma configurao esttica onde apenas o S com uma estrutura que encaixa no centro activo formar o complexo ES

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Enzimas
Modelos de reconhecimento Enzima-Substrato Modelo Induced Fit
A enzima interage com o S alterando a sua conformao de modo a adaptar-se sua estrutura (explica porque a mesma enzima pode reconhecer diferentes substratos)

Hexocinase sem (a) e com o substrato glucose (b)

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Cofactores:
Molculas adicionais (de natureza no proteica) necessrias ao funcionamento das enzimas Ies Metlicos

Coenzimas (compostos orgnicos): Grupos prostticos (fortemente ligado) Co-substratos (fracamente ligado; geralmente vitaminas)

Apoenzima enzima sem cofactor (inactiva) Holoenzima - enzima com cofactor (activa)
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Enzimas
Cofactores:
Ies Metlicos Aco resulta da capacidade de: 1. Apresentarem na forma de caties; 2. Possurem diferentes estados de ionizao 3. Poderem estabelecer ligaes com vrios ligandos

Geralmente pertencem primeira srie de transio podendo existir em 2 estados de oxidao: Fe2+/Fe3+ e Cu+/Cu2+

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Cofactores:
Ies Metlicos (podem encontrar-se como):
Ies isolados

Clusters metlicos (ex: Fe4S4; Fe2; FeMoCo)

Associados a compostos orgnicos (Cofactores organometlicos; ex: heme; cobalamina)

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Enzimas
Cofactores:
Ies Metlicos (funo):

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Cofactores:
Coenzimas Associadas a reaces redox Associadas a reaces que envolvem a transferncia de grupos

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Enzimas
Cofactores:
Coenzimas
Associadas a reaces redox

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Cofactores:
Coenzimas
Associadas a reaces redox

Bioqumica I (MICF; 12/13)

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Enzimas
Cofactores:
Coenzimas
Associadas a transferncia de grupos

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas
Cofactores:
Coenzimas
Associadas a transferncia de grupos

Bioqumica I (MICF; 12/13)

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Enzimas
Coenzimas nucletido de Adenina: Utilizam o nucletido Adenina para ligao Enzima
Dinucletidos de nicotinamida (NADH, NADPH)

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Enzimas
Coenzimas nucletido de Adenina: Utilizam o nucletido Adenina para ligao Enzima
Mono- e dinucleotidos de flavina (FAD)

Coenzima A

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Enzimas
Cofactores:
Coenzimas (vitaminas so as molculas precursoras)

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas Classificao
IUBMB (International Union Biochemistry and Molecular Biology) EC (Enzyme Commission) + 4 digtos

EC.n1.n2.n3.n4
Classe (6) N de srie na sub-subclasse Sub-classe Sub-subclasse

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Enzimas Classes:
Rx deoxidaoreduo:

Rx detransfernciade tomosougrupos funcionaisentreas molculas:

Rx dehidrlise; transfernciadegrupos funcionaisparaaH2O

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Enzimas Classes:
Rx deformaoou remoodeduplasligaes removendo/adicionando gruposfuncionais

Rx deisomerizao (transfernciadegrupos funcionaisnumamesma molcula)

Rx deformaodeligao entre2molculas acopladoshidrlisede umcompostocomelevada energia(ex:ATP)


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Enzimas Sub- Classes e subsubclasses:

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Enzimas Nomenclatura
E

Nome trivial: Desidrogenase alcolica Nome Sistemtico: Alcool-NAD oxidoredutase 3 regras: 1. Terminao - ase 2. Especificar a reaco catalisada 3. Especificar os intervenientes substrato(s) e cofactor

Classificao: EC 1.1.1.1 Classe: 1. Oxidoredutase Sub-classe: 1. Grupos -OH como dadores Sub-subclasse: 1- NAD ou NADP como aceitador

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