LES CHAMPIGNONS

I - Importance des champignons Question : pourquoi les champignons sont ils importants ?

-Si le monde sans champignons : arbres tombs, dbris vgtaux, animaux morts, dchets, matires organique resteraient la surface des sols envahissement rapide de la surface du globe qui aurait des allures de dcharges. -Activit de nombreux champignons avec d'autres agents dcomposeurs ( insectes, nmatodes, bactries...) qui vont dgrader les tissues morts et les transformer en composs simples : Prlvements par les vgtaux qui seront ensuite utiliss par les animaux herbivores qui leur tour seront consomms par les carnivores.................... Conclusion : Rle vital des champignons dans les mcanismes chimiques fondamentaux pour la vie de la plante. -Les champignons comme assistant : Fermentation des sucres et des carbohydrates par les champignons microscopique ( levure) pain, fromage, vin, bire... ( ex : Pnicillium roquefortii ; Botrytis cinerea (fabrication d'un vin : le soterme) ) Production par les micro-champignons de composs issus du mtabolisme secondaire : hormones vgtales, strodes, enzymes utilises en industries, antibiotique Utilisation dans l'alimentation ( acide citrique ) Dans les poudres de lavages

-Problme : 1/3 des rcoltes annuelles sont dtruites par des champignons et/ou des insectes Les plantes cultives subissent directement leur attaque

Pourtant les champignons ont + d'effets positifs que d'effets ngatifs ( ce que peu de gens savent) : Implication des champignons dans diffrentes activits que l'on commence seulement de dcouvrir et comprendre . Travaux en plein essor concernant les biotechnologies fongiques et les effets long termes des champignons sur l'homme.

-Interaction champignons-invertbrs dans le sol : Termitomyces avec les termites . -Interaction symbiotiques champignons-plantes ( mycorhizes) Les produits issus de la dcomposition par les champignons dans les rgions boises et les forts

sont essentiels au maintien de la vie long terme Acteur silencieux dont le maintien est essentiel Pour viter la disparition des vgtaux et de l'homme Pour l'agro-alimentaire et le domaine pharmaceutique : pertes annuelles ~ plusieurs millions d'euros s'il y avait disparition de l'une ou l'autre des espces fongiques ( armes usage alimentaire extraction lente et onreuse partir de fruits) Problme : Ce n'est que lorsqu'il y a des champignons curieux ( couleur, forme, taille... Destins l'alimentation vnneux sous la forme de moisissures filamenteuses

que l'on se proccupe rellement de l'existence des champignons Pourtant ils forment le 5me rgne ! -Origine des champignons au cours de l'volution Champignons sous la forme de fossiles dans des roches ( ~109 ans) Retrouvs associs aux plantes terrestres les plus anciennes, hypothse d'une covolution des plantes vasculaires et des champignons Ex : un prototaxite datant de 400 millions d'annes : champignon qui faisait de 2 9 mtre, associ une algues ou une cyanobactrie ( lichen ?) Parmi les champignons les plus anciens : endomycorhiziens ( se dveloppe l'intrieur des cellules ) Association avec les res mousses ou leurs anctres ( 450 million d'annes) Identification de champignons datant de 90 millions d'annes dans de l'ambre et des racines ptrifis ( re des dinosaures) Similitudes d'volution des champignons ( stades asexus; organes de fructification) et des plantes fleurs

II - Qu'est ce qu'un champignon ? Hypothse actuelle: champignons anctres communs avec d'autre organismes. Divergence il y a environ 500 millions d'annes . Origines des champignons Procaryotes : 3,5-4 milliards d'annes ( archobactries, Eubactries ) Eucaryotes : 2 milliards d'annes , union symbiotique entre 2 procaryotes ( analyse des gnomes mtc et chloro ) mitose

-Longtemps considrs comme de simples plantes tude molculaire ( phylognie) 5me rgne ( sur 7 admis actuellement : archaeobacteria, eubacteria, protozoa, chromista,plantae, eumycotae, animalia )

 Eumycotae = champignons ( champi parfait) Idem pour 2 phyla des chromista ( champi imparfait) schma rgne page 2 -volution des eucaryotes grce la miose , notion de gamtes -Champignon : phase vgtative haplode , reproduction sexue : diversit des eucaryotes -Protozoaires + Chromistes = cellules eucaryotiques les + simples -coopration entre cellules eucaryotiques organismes multicellulaires -spcialisation cellulaire = diffrenciation -dveloppement de tissus et d'organes 3 nouveaux rgnes -Plantes = organismes multicellulaires photosynthtiques ( produisent leur nourriture partir de molcules inorganique) -Animaux = OM non photosynthtiques auxquels les plantes servent de nourritures -Champignons = OM non photosynthtique qui se nourrissent des animaux et des plantes permet le recyclage -9 Phyla de plantes, environ 32 d'animaux et 5 de champignons -Champignons appartiennent 2 rgnes : les Chromistes ( pseudo fungi) les Eumycota ( vrai fungi ) Caractristiques

Eucaryotes ( noyau) Htrotrophes ( mitochondries mais pas de chloroplastes) Comportement osmotrophes ( absorption sous forme soluble) Vacuole Paroi ( chitine) Multicellulaires ou unicellulaires (levure) Hyphe = filament en forme de tube ( siphon ou cloisonn) Myclium = regroupement d' hyphes = forme permettant la reproduction asexue ( colonisation d'autres sites : sols, plantes, animaux ) Rhizomorphes : cordonnets ramifis d' hyphes : permet au champignon de se dplacer. Sclrotes : amas globuleux d' hyphes ( taille d'une graine celle d'un melon) Types et organes de reproduction

-Reproduction asexue : fragmentation du myclium production de spores par les rhizomorphes ou les sclrotes

-Reproduction sexue : entre 2 mycliums de polarit ( sexe) complmentaire Homothallisme ( auto-fcondation ) ou htrothallisme ( 2 champignon diffrent )

formation d'un myclium secondaire contenant 2 noyaux : dicaryons = plasmogamie ( premire tape de la reproduction sexu : mise en commun du contenue de 2 cellules pour aboutir a une cellule 2 noyaux ) Fusion des 2 noyaux ( caryogamie ) et division miotique Formation de spores haplode qui en germant forment du myclium haplode Le type de spore varie en fonction des champignons et sert la classification Oospores : fusion gamte mle ( anthridie + gamte femelle (oogone) Ex : chez le phytophotora infestans ( agent du mildiou de la pomme de terre) et chez le Plasmopara viticola ( agent du mildiou de la vigne ) Zygospores : partir de 2 gamtocystes issus d'une hyphe diffrente Ascospores : Fusion entre 2 hyphes , formation de l'asque l'intrieur duquel il y aura miose 4 ou 8 ascospores Basidiospores : 4 spores forms individualis

III - Principe de la classification -Terminologie ( poly page 6 ) -Classification actuelle du rgne fongique : 4 divisions Chrytridiomycota : espces vivant en milieu aqueux et se dveloppant sur les feuilles ( allomyces, monoblepharis ) ou sur les vgtaux ( plasmodiophora brassicae agent de la hernie du choux ) , il sont difficiles identifier

Sont l'origine des 3 autres divisions Zygomycota : souvent microscopique Mucorales dont certains sont utiliss dans l'industrie chimique ou pharmaceutique ( mucor glutaminus et d'autre provoquent des maladie chez l'homme Endogonales : champignons symbiotiques avec les plantes Entomophtorales : parasite de plante, d'animaux , ou mme d'autre champignon ( hyper -parasite) Ascomycota : division la + nombreuse ( 150 000 espces) Hmiascomycetes : pas de carpophore ( levure, saccharomyces cerevisiae ) Plectomycetes : pas de carpophore ( ceratocystis ulmi agent responsable de la graphiose de l'orme; aspergillus: penicillium ) Hymenoascomyctes : carpophore ( botrytis cinerea, morille, tuber ) Basidiomycota : ( 23000 espce) Tliomyctes : responsable des rouilles ( 7000 espce dont Puccinia graminis agent de la rouille du bl ) et des charbons ( 1000 espce dont les Ustilaginales ) . Les maladies

issus des ces champignon sont spcifiques d'une espce! Phragmobasidiomyctes : Oreille de Judas Homobasidiomyctes ( agarics, tricholome, coprin, amanites, russules, bolets ) Nombre de champignons Actuellement environ 250 000 espces diffrentes caractrises D'autres caractrises tous les jours Estimation d'aprs l'hypothse de Hawksworth : En Angleterre : 2000 espces de plantes fleurs pour 12 000 espces de champignons 1 pour 6 Dans le monde : 250 000 espces de plantes fleurs 6x plus de champignons = 1 500 000 espces .

Sans doute surestim mais possible surtout si on tient compte de tous les champignons qui auraient disparu ou sont en voie de disparition ( champignons microscopique difficiles observer ) IV - Le mode de vie des champignons Nutrition Carbone : pas de chloroplastes pas utilisation du CO2 Peuvent utiliser le glucose, le fructose, le mannose, le galactose ( travaux de Raulin) . Processus de respiration et de fermentation ( glucose, glycrol ) C6H12O6 -------> 2 C2H6O + 2CO2 ( alcool + CO2) C6H12O6 ---------------> C3H8O3 + C2H4O +CO2 ( glycrol + pyruvate +co2) Saccharomyces cerevisiae ( biere), S ellipsoides (vin) Certain basidiomycete peuvent dgrader la lignine en prsence d'une autre source de carbone ( cellulose, glucose ) Azote : indispensable mme si certains champignons sont autotrophes Utilisent NO3-, NH4+, les AA, Les protines, l'ure Souvent dans les milieux de culture renferment de l'hydrolysat de casine Vitamine ( facteur de croissance) : souvent htrotrophes apport de vitamines

B1 et B7 (thiamine = pyrimidine + thiazol ; et biotine, carboxylation) B2 et B3 ( riboflavine et acide nicotinique, dshydrognation ) B6 ( pyridoxine, transamination ) lments minraux essentiels : macrolments et micro-lments, sont capable d'utiliser l'acide sulfurique et de le transformer en H2S Champignon = htrotrophie spcialisation avec 4 types d'htrotrophie Saprophytes utiliser les substances organiques morte et les dcomposent ( dbris vgtaux, feuilles et de fruits qui tombent, dbris d'animaux, humus du sol ) essentiel pour permettre le recyclage des lments minraux partir de la matire organique ( carbone, soufre, azote, phosphore ) Agaricus campestris qui se dveloppe dans les prs frquents par les troupeaux de

vaches, chevaux ou de chvres . Installation progressive de diffrent champignons : cas du htre 1) Branches casses ( orage , blessure, attaque par rongeurs) dprissement Agaricales et Polyporales s'installent 2) Au niveau des sites de cassures du tronc : colonisation de haut en bas par l'Armillaire visqueux et de bas en haut par l'Armillaire couleur de miel ( bois phosphorescent la nuit ) Mort de l'arbre suite au dveloppement des carpophores de ces champignons sur le tronc 3) Installation de champignons qui vont provoquer le pourrissement du tronc et son affaissement ( Polypore amadouvier ) 4) Transformation du bois en sciure ( Pluteus, Volvaria ) 5) Utilisation de cette sciure par d'autre champignons transformation complte du htre Parasites Utiliser les substances organique d'tres vivants qu'ils vont rendre malade . avant de les tuer = Mycoses chez les animaux et maladie cryptogamiques chez les vgtaux Pourquoi parasitisme ? = volution physiologique rgressive : Perte d'enzymes permettant un comportement saprophytique comportement parasite pour pouvoir survivre Parasites obligatoire et parasites facultatif ( obligatoire = forme la plus volue ) Spcificit parasitaire : polyphage : attaque des plantes appartenant des familles diffrentes . Monophage : spcifique d'une plante volution de la polyphagie vers la monophagie Mode de vie : Dans les scrtions : = fumagines noirtres sur les agrumes ( Capnadium ) A l'extrieur et dans la paroi des cellules Entre les parois : tavelure des pommes ( Venturia inaequalis), rouille ( Puccinia ) Dans les cellules : pourriture noble ( Botrytis cinerea ) Raction de la plante : hypersensibilit Symbiotiques Animaux sont incapables de digrer la cellulose et la lignine permettent le dveloppement de certains champignons dans leur intestins pour faire le travail constituent de vritables niches alimentaires en favorisant le dveloppement de certains champignons et d'limination de tout contaminant ex : Fourmis coupeuses de feuilles ( Atta cephalotex) en Amrique du Sud, certaines termites ( Macrotermitinae), certain scarabes . Avec des plantes = mycorhizes ( racine-champignons)

 Permettent une meilleure utilisation de certains lments du sol ( azote, phospate ) par la plante . Plante fournit au champignon des composs carbons Ectomycorhizes ( 2000 espces vgtales , 5000 espces fongiques) Endomycorhizes ( 300 000 espces vgtales, 200 espces fongiques ) Prdateurs 150 espces dont des Chytridiomycota, Oomycota, Zygomycota et des Dicaryomycota Nmatodes et petits animaux : Action grce des spores mobile ( chytridiomycota, Oomycota ) , Injection de spores ( Oomycota), spore adhsives ( zygomycete) ou encore ingestion ( ascomycetes) Gros animaux : Rotifres, Arachnides V - Moyens de lutte ( fongicides ) Destruction des plants de pomme de terre en 1840 en Irlande par Phytophtora infestans 1er fongicide mis au point 50 ans + tard ( Gayon, chimiste bordelais et Millardet, botaniste) 1/3 de la production vgtale est perdu chaque annes suite aux dgts engendrs par les champipoil. 1ere gnration = molcule inorganique ( ++ avant 1960 ) cas du mildiou de la vigne ( plasmopora viticola ) ou de la pomme de terre ( phytophtora infestans). Utilisation d'un mlange de CuSO4 et de CaOH2 = bouillie bordelaise. D'autre driv de cuivre peuvent tre utilis. Actif que sur les zoospores l'extrieur de la plante pourdre de soufre qui avec la chaleur gaz qui agit sur les spore mtaux lourd ( mercure) : pb toxicit 2e gnration = molcule organiques driv mercur dont certain on t interdit aprs 1971 driv phnolique ( pentachlorophnol, dimitrocrsol ) driv soufr Phtalamides ( captafol ) inhibiteur de la synthse des strols fongiques : biternatol, fendapanil... 3e gnration = molcule synthtique : molcule qui se dgradent pas la suite sont des molcules qui agissent aprs diffusion dans la plante synthse vers 1960 Bnomyl ( stable mais non toxique ) s'accumule dans les paroi via le xylme. Pb de rsistance acquise par certain pathogne. Fosetyl, metalaxyl : s'accumule dans le cytoplasme via le xylme et le phlome VI - Utilisation des champignons par l'homme Utilisation comme nourritures 10000 champi chair , seul quelque mortel mais trs commun pas de rgle simple pour les distinguer ( pice d'argent, limace) sinon de ne ceuillir que ceux que l'on connait

 champi que l'on sait cultiver champi qu'on l'on ne sait pas cultiver Utilisation dans les processus alimentaires boisson et aliment : C6H12O6 2C2H5OH + 2CO2 Panification ( saccharomyces cerevisae) Bire ( blonde : S carlsbergensis, anglaise : S cerevisae) Vin ( S cerevisae var ellipsoideus) Vins liquoreux ( sauterne, botrytis cinerea) Fromage ( camembert et brie avec penicillium , roquefort et gorgonzola) Sauce au soja et driv ( aspergillus oryzea) Toxine ergot du seigle ( gangrne, vasoconstriction des muscles, action sur le systme nerveux centrale hallucinogne ) neurotoxine vertige et titubation chez les animaux consommant l'herbe infect Aflatoxine ( aspergillus flavus ) provoquant des hmorragie, des cancer Mycotoxine : cancer oesophagien sesquiterpenes tetracyclique hemorragie , vomissement, nause, diarrhe Poisons et mollcule halucinogne mortel molcule du groupe des amanitines des phallotorines dgat sur le foie autre : monomthylhydrozine et orellanine ( gyromitra qui ressemble une morille ) non mortel molcule dont la coprine, muscarine, miscinol hallucinogne : psilocybine Exploitation mdical antibiotique penicilline : Fleming 1927 ( pennicilium molatum) ++ GRAM+ cephalosporine (1960) : isole a partir de cephalosporium +++GRAM griseofulvine (1950) : chez penicillium griseofulvum et ayant une activit anti fongique immunosuppressant cyclosporine (1970) : diminue raction immunologique ( rejet de greffe) et antifongique et antiviral , traitement de diabte, arthrose Exploitation autre molcule mtabolite ac citrique ( aspergillus niger) riboflavine ac gibbrellique ( fusarium monoliforen) Enzyme : amylase, invertase et pectinase ( prparation jus de fruit) Coloration des fibres ( 9 champi diffrent)