Parmetrosforensesy la variacin genticade 15loci STRautosmicosenlas poblaciones mestizasmexicanas delos Estados de Yucatny Nayarit.

Lizbeth Gonzalez-Herreraa,*, LourdesVega-Navarreteb, Cinthia Roche-Cantoc, Jorge Canto-Herreraa, Dany Virgen-Ponced, Gustavo Moscoso-Calocad, Erick Delgado-Njard, Betzabet Quintanilla-Vegaeand Ricardo M. Cerda-Flores f,g
aLaboratorio

de Gentica, Centro de Investigaciones Regionales, Universidad Autnoma de Yucatn, Mrida, Yucatn, Mxico bCentro de Estudios e Investigaciones ANIGEN, Distrito Federal, Mxico cProcuradura General de Justicia-Estado de Yucatn, Mrida, Yucatn, Mxico dProcuradura General de Justicia-Estado de Nayarit, Tepic, Nayarit, Mxico eDepartmento de Toxicologa, CINVESTAV-IPN, Mxico fUnidad de Biologa Molecular, Genmica y Secuenciacin, Centro de Investigacin y Desarrollo en Ciencias de la Salud, Universidad Autnoma de Nuevo Len (UANL), Mxico gFacultad de Enfermera, UANL, Mxico

Resumen:Las frecuencias allicasy seisparmetrosforensesderepeticiones en tndemcortasautosmicos(STR), as como la estructura genticaen dospoblaciones mestizasmexicanasse determinaron. Un totalde 356individuos no relacionadosde los estados deYucatn, en el sur de Mxico(N = 120) y Nayariten laCosta del Pacfico(N =236)fueronPCR-escrito por 15loci STRusando el poderPlex16kit dePromega. La distribucin de genotiposporcada locusestaba de acuerdo conlas expectativasde Hardy-Weinbergpara elSTR15 enambas poblaciones.Penta Ey FGAfueron losSTRcon el ndicems altoheterozygousity, 0,8893en Yucatn, y 0,9057en Nayarit.Penta Etambinmostraron el mayorpoder de discriminacinen las dos poblaciones, con 0,972y 0,980en Yucatn, en Nayarit. Paraambas poblaciones, el poder combinado dela exclusiny el poderde discriminacinfueron superiores a0,9999999. Basado en unanlisis de componentes principales, Yucatn y Nayaritseencuentraentre Espaa yMxicolas poblaciones indgenas(mayas de Campeche y Yucatn). Ambas poblacionesseencuentran en dosgrupos separados, lo que sugiere la estructura genticadiferente.Nuestro informeaportadatos deSTRenpoblaciones mexicanas, especialmente lasfrecuencias de los alelospara el Dy EPentaPentaen Yucatny proporcionadatos sobre la poblacinen Nayarit, donde no haybase de datos deSTRestaba disponible. Palabras clave: STR, datos de poblacin,las frecuencias allicas, mestizos mexicanos.

1. POBLACIN Mxico-mestizos son el resultado de la mezcla de espaoles, Amerindios y africanos. Los mestizos son la poblacin ms ampliamente distribuida en las dos regiones urbanas y rurales en todo el pas y constituyen casi el 93% de la poblacin total. Yucatn se encuentra en el sureste de Mxico y tiene una alta densidad de poblacin con ascendencia maya, mientras que Nayarit se encuentra en la costa del Pacfico de Mxico y muestra una importante influencia de las culturas tnicas de los coras y los huicholes. La poblacin estaba compuesta por 356 voluntarios sanos no relacionados mestizos que residen en Yucatn (N = 120) y Nayarit (N = 236), que fueron seleccionados como los mestizos, con el criterio de que ellos no pertenecen a algunos grupos tnicos especficos mexicanos y slo los individuos los que durante dos generaciones, incluida la propia haba nacido en Mxico. Una mestiza de Mxico se define como alguien nacido en Mxico que es un descendiente de los habitantes originales autctonas de la

regin y de las personas, principalmente espaoles de raza blanca y / o el origen Negro, que llegaron a Amrica durante el siglo 16. Fueron reclutados por invitacin abierta y de trabajo de casos de pruebas de paternidad de rutina. Todos los participantes firmaron el consentimiento informado de acuerdo a las cuestiones ticas de la Declaracin de Helsinki. 2. Extraccin de ADN
La extraccin del ADN se realiz mediante la recopilacin de un golpe de manchas de sangre en tarjetas FTA Classic (Whatman) y las clulas bucales. ADN se purific mediante TLC reactivo purificacin (Whatman BM 120204) en un Promega Maxwell 16, siguiendo las instrucciones del fabricante. 3. . PCR La amplificacin se realiz mediante PCR mltiple en un Perkin-Elmer modelo 9700 termociclador usando el kit comercial PowerPlex 16 System (Promega). 4. ESCRIBIR La separacin de fragmentos de ADN amplificados se realiz empleando electroforesis multicapillary en un ABI Prism 3100 AvantGeneticAnalyzer (AppliedBiosystems) y NIT (Patrn interno Lane) a cada muestra. La genotipificacin se realiz despus de la comparacin de los fragmentos de STR a la escalera allica y de tamao estndar interno utilizando ID GeneMapper v3.2 del software. Todos los pasos fueron de acuerdo a las normas de control de laboratorio y controles internos del equipo y las pruebas de competencia proporcionado por PromegaCorporation. 5. ANLISIS ESTADSTICO El mtodo de recuento directo de genes se utiliza para comprobar las frecuencias de los alelos STR. Parmetros de la gentica de poblacin, como probabilidad de clasificacin (MP), poder de discriminacin (PD), contenido de informacin polimrfica (PIC), el Poder de la exclusin (PE) y el ndice de Paternidad Tpica (TPI) se calcularon con el Powerstats 1.2 Software [1]. La desviacin de equilibrio de Hardy-Weinberg para cada locus se comprob con la prueba exacta a travs de permutaciones de 2000, utilizando el paquete de software Arlequin [2]. La correccin de Bonferroni se utiliz para la prueba de equilibrio de Hardy-Weinberg, lo que supone que un nivel de significacin de 0,05 sobre 15 pruebas (una por locus) se obtiene un nivel de significacin real de 0,0033. El R x C prueba de la tabla de contingencia exacta [3] fue utilizado para comparar la distribucin de alelos para cada uno de los STR CODIS que se encuentran en Yucatn y Nayarit, la evaluacin de diferenciacin de la poblacin con otras poblaciones tnicamente relacionados, tales como los mestizos mexicanos del centro de Mxico [4], Mxico de la ciudad [5], el Valle de Mxico [6], Nuevo Len [7], Jalisco, Puebla, Yucatn y una poblacin previamente probado con Identifiller kit [8]. Un anlisis de componentes principales se realiz entre las poblaciones antes mencionadas, excepto el centro de Mxico, utilizando el programa SPSS-PC, teniendo en cuenta las frecuencias allicas de 10 STR: D18S51, D21S11 y D3S1358, TH01, FGA, D8S1179, SVA, D7S820, D13S317, D5S818, ya que solo estas STR se reportan a las poblaciones ancestrales de representacin utilizadas en este estudio: la regin del suroeste de Espaa [9], tres del sudoeste de los indios norteamericanos comunidades (Apache, Navajo y Pueblo), que representa nativo -americanos las frecuencias de alelos ancestrales [10] y dos poblaciones mayas nativos de Yucatn y Campeche.

6. RESULTADOS Y DISCUSIN Las frecuencias allicas de 15 STR autosmico del sistema de Plex de alimentacin para los mestizos mexicanos de Yucatn y Nayarit se muestran en las Tablas 1 y 2, respectivamente. La distribucin de genotipos por cada locus estaba de acuerdo con las expectativas de Hardy-Weinberg para todos los STR 15 despus de la correccin de Bonferroni. Seis parmetros forenses de la STR 15 autosmica para cada poblacin se muestran en la Tabla 3. Potencia combinada de la exclusin y la potencia combinada de la discriminacin fueron superiores a 0.9999999, tanto en Yucatn y Nayarit. La probabilidad combinada de coincidencia sobre la base de los dos alelos ms comunes a travs de la STR 15 para cada poblacin fue de 1,87 x 13.10 o 1 de cada 5,3 X1012 (1 en 5 billones de dlares) en Yucatn y 2.13 x 10.14 o 1 de 4,69 x 1013 ( 1 en 46 billones de dlares) en Nayarit. Como se inform anteriormente la poblacin mexicana utiliza el sistema Identifiler, este es el primer informe de las frecuencias de los alelos para el D y E PentaPenta en los mexicanos que utilizan PowerPlex 16 kit. Los 15 loci son altamente polimrficos en estas poblaciones de mestizos y el poder de la exclusin y el poder de los valores de la discriminacin son comparables con otros databases.Comparison cosmopolita de las frecuencias allicas entre Yucatn y Nayarit mostr diferencias significativas para el STR y THO1 D5S81, D7S820 y D16S539, D8S1179, TPOX y FGA (p <0,05). Comparacin de la distribucin de alelos entre Yucatn y otras poblaciones mexicanas se deleitaba, curiosamente, que si bien THO1 fue la cadena con el menor nmero de alelos en Yucatn, fue capaz de determinar la diferenciacin con otras poblaciones mexicanas (p <0,03), dado que THO1 mostraron diferentes alelos en las poblaciones. Por otra parte, la diferenciacin D7S820 muestra (p <0,003), con excepcin de Nuevo Len y Yucatn se inform anteriormente, con Identifiler juego, mientras que vWA mostr que se distribuye homogneamente entre Yucatn y las otras poblaciones, a excepcin de los mayas de Campeche (p = 0,004). Como era de esperar, la muestra estudiada de Yucatn no mostr diferencias significativas con la muestra de Yucatn ya se ha informado con Identifiler genotipo [8] (p> 0,05), lo que sugiere una distribucin homognea entre estas dos muestras de la poblacin de Yucatn y que subyace a la correspondencia en las frecuencias allicas de los dos sistemas humanos de identidad de ensayo. En este sentido, hemos contribuido a ampliar las frecuencias de los alelos para el Penta E y D Penta en los mestizos de Yucatn, el ingenio de este informe. Diferencias notables, importantes en la distribucin de los alelos se encontraron en las dos poblaciones de Yucatn y Nayarit, en comparacin con dos muestras de las personas autctonas mayas de Yucatn y Campeche. Los mestizos y los mayas de Yucatn mostr una distribucin alelo significativamente diferente para el STR THO1, D21S11, D18S51, D5S818, D7S820 y TPOX, lo que sugiere que estos marcadores podran ser los portadores de intercambio gentico durante el proceso de mezcla, y los posibles contribuyentes de ascendencia maya. En el caso de Nayarit, las frecuencias allicas de la CODIS STR-permite una clara diferenciacin con las dos poblaciones mayas nativas (p <0,03), a excepcin de D3S1358, D21S11 y CSF1PO de Yucatn y D18S51 de Campeche. Las frecuencias allicas de CODIS STR-se distribuyeron homogneamente entre Nayarit y Nuevo Len, y entre Nayarit y Jalisco (p> 0,05), a excepcin de CSF1PO. Las diferencias observadas entre Yucatn y Nayarit con otros tnicamente relacionados con poblaciones mexicanas, podra reflejar que las poblaciones de mestizos son los estados ms cosmopolitas de Mxico, como la ciudad de Mxico, Jalisco, Puebla, Noreste (Monterrey, Nuevo Len), entre ellos. El anlisis de componentes principales mostr que los dos primeros componentes representaron el 95,09%de la variacin total de la muestra (Fig. 1), y sugiere tres grupos, uno formado por las poblaciones de mestizos de la Costa del Pacfico-Norte de Mxico, incluyendo Nuevo Len, Nayarit y Jalisco. Un segundo que tiene poblaciones estrechamente relacionadas de Centro-Sur de Mxico, incluidas las poblaciones de Yucatn, la ciudad de Mxico, Valle de Mxico y Puebla, y el tercero con las poblaciones nativas estrechamente relacionados, incluyendo a los mayas de Yucatn y

Campeche y los amerindios. Poblaciones mestizas fueron intermedias a las poblaciones ancestrales espaoles y amerindios. Nuestros resultados son consistentes con las diferencias en los componentes de aditivos basados en el modelo trihybrid (amerindia, el Cucaso y / o africanos). Para Mxico, las diferencias en la mezcla gentica se han descrito a lo largo del pas, donde los estados del norte que tienen un mayor componente de raza caucsica que las poblaciones del sureste, que se caracteriza por un mayor componente amerindio [12]. Este gradiente tambin se ha demostrado con la ancestral-componente de estimacin en los mestizos mexicanos con base en 13 STR del CODIS, lo que sugiere que proporciones de mezcla en todo Mxico, muestra un claro Norte-Sur para aumentar el componente amerindio (38,3-75,7%), con una disminucin proporcional del componente europeo (50,3 a 8,5%), y viceversa [8, 13]. Por el contrario, la ascendencia africana se mantuvo relativamente baja y constante entre las poblaciones (9,4 18,5%) [8, 13]. El Proyecto Diversidad del Genoma Mexicano basado en una base de datos HapMap, al igual que con las frecuencias de SNP en los mexicanos confirmaron la presencia de una considerable variabilidad entre las subpoblaciones mestizas mexicanas y sugiri que esta diversidad se debe principalmente a una distribucin diferencial de los componentes ancestrales amerindias y europeas, en particular para los mestizos de Yucatn, que tienen una contribucin distintiva Ameridian Maya [14]. Las diferencias regionales en las contribuciones de diferentes fuentes de germoplasma de Mxico seala la necesidad de establecer bases de datos locales correspondientes para mejorar el impacto de los loci STR en clculos forenses en tales poblaciones mezcladas. Nuestros resultados sugieren que STR proporcionar una discriminacin potente y apoyar la importancia de la generacin de bases de datos locales en Mxico para proveer interpretaciones fiables perfil de ADN STR cuando se utiliza actualmente en casos forenses, principalmente en Nayarit y el sur de Mxico, donde no hay bases de datos. La disponibilidad de los datos genticos de estos loci debera aumentar nuestra comprensin de la estructura de la poblacin en las diferentes poblaciones mexicanas y mejorar la interpretacin estadstica de los resultados de ADN forense y filiacin de prueba. AGRADECIMIENTOS Este trabajo fue apoyado por la beca del Programa de Impulso y Orientacin a la Investigacin (PRIORI), Universidad Autnoma de Yucatn (CIRB-06-012). Los autores agradecen la colaboracin de Zoghbi Comercial y el Laboratorio de ANIGEN sus instrucciones amables e instalaciones.