Aplikasi PCR

Polymerase Chain Reaction (PCR) telah menemukan aplikasi luas di banyak bidang analisis genetik. Ini adalah daftar dari beberapa aplikasi:

Aplikasi Medical
PCR telah diterapkan untuk sejumlah besar prosedur medis:

Aplikasi pertama PCuntuk pengujian genetik , dimana sampel DNA dianalisis untuk adanya penyakit genetik mutasi . Prospective parents can be tested for being genetic carriers , or their children might be tested for actually being affected by a disease . Calon orang tua dapat diuji untuk menjadi pembawa genetik , atau anak-anak mereka dapat dites untuk benar-benar terkena oleh penyakit . DNA samples for Prenatal testing can be obtained by amniocentesis , chorionic villus sampling , or even by the analysis of rare fetal cells circulating in the mother's bloodstream. sampel DNA untuk pengujian Prenatal dapat diperoleh dengan amniocentesis , chorionic villus sampling , atau bahkan oleh analisis sel janin jarang beredar di aliran darah ibu. PCR analysis is also essential to Preimplantation genetic diagnosis , where individual cells of a developing embryo are tested for mutations. Analisis PCR juga penting untuk diagnosis genetik praimplantasi , di mana sel-sel individual dari embrio berkembang diuji untuk mutasi. PCR can also be used as part of a sensitive test for tissue typing , vital to organ transplantation . PCR juga dapat digunakan sebagai bagian dari tes sensitif untuk mengetik jaringan , penting untuk transplantasi organ . As of 2008, there is even a proposal to replace the traditional antibody-based tests for blood type with PCR-based tests [ 2 ] . Pada tahun 2008, bahkan ada usulan untuk menggantikan tes antibodi berbasis tradisional untuk jenis darah dengan berbasis tes PCR [2] . Many forms of cancer involve alterations to oncogenes . Banyak bentuk kanker melibatkan perubahan terhadap onkogen . By using PCR-based tests to study these mutations, therapy regimens can sometimes be individually customized to a patient. Dengan menggunakan tes PCR-based untuk mempelajari mutasi ini, regimen terapi terkadang dapat secara individual disesuaikan dengan pasien.

[ edit ] Infectious disease applications [ sunting ] aplikasi penyakit menular

Characterization and detection of infectious disease organisms have been revolutionized by PCR: Karakterisasi dan deteksi organisme penyakit menular telah merevolusi oleh PCR:

The Human Immunodeficiency Virus (or HIV ), responsible for AIDS , is a difficult target to find and eradicate. Human Immunodeficiency Virus (atau HIV ), yang bertanggung jawab untuk AIDS, adalah target sulit untuk menemukan dan membasmi.

The earliest tests for infection relied on the presence of antibodies to the virus circulating in the bloodstream. Tes awal untuk infeksi mengandalkan adanya antibodi terhadap virus yang beredar dalam aliran darah. However, antibodies don't appear until many weeks after infection, maternal antibodies mask the infection of a newborn, and therapeutic agents to fight the infection don't affect the antibodies. Namun, antibodi tidak muncul sampai beberapa minggu setelah infeksi, ibu topeng antibodi infeksi bayi yang baru lahir, dan agen terapeutik untuk melawan infeksi tidak mempengaruhi antibodi. PCR tests have been developed that can detect as little as one viral genome among the DNA of over 50,000 host cells [ 3 ] . PCR tes telah dikembangkan yang dapat mendeteksi sekecil satu genom virus antara DNA lebih dari 50.000 sel inang [3] . Infections can be detected earlier, donated blood can be screened directly for the virus, newborns can be immediately tested for infection, and the effects of antiviral treatments can be quantified . Infeksi dapat dideteksi sebelumnya, darah yang disumbangkan dapat disaring langsung untuk virus, bayi baru lahir dapat segera diuji untuk infeksi, dan efek dari perawatan antivirus dapat diukur .

Some disease organisms, such as that for Tuberculosis , are difficult to sample from patients and slow to be grown in the laboratory. Beberapa organisme penyakit, seperti bahwa untuk TBC , sulit untuk sampel dari pasien dan lambat untuk dapat ditumbuhkan di laboratorium. PCR-based tests have allowed detection of small numbers of disease organisms (both live or dead), in convenient samples . Berbasis tes PCR telah memungkinkan pendeteksian sejumlah kecil organisme penyakit (baik hidup atau mati), di nyaman sampel . Detailed genetic analysis can also be used to detect antibiotic resistance, allowing immediate and effective therapy. analisis genetik rinci juga dapat digunakan untuk mendeteksi resistensi antibiotik, memungkinkan terapi segera dan efektif. The effects of therapy can also be immediately evaluated. Efek dari terapi juga dapat segera dievaluasi. The spread of a disease organism through populations of domestic or wild animals can be monitored by PCR testing. Penyebaran suatu penyakit organisme melalui populasi domestik atau liar hewan dapat dipantau oleh tes PCR. In many cases, the appearance of new virulent sub-types can be detected and monitored. Dalam banyak kasus, penampilan baru virulen tipe sub- dapat dideteksi dan dimonitor. The sub-types of an organism that were responsible for earlier epidemics can also be determined by PCR analysis. Sub-jenis organisme yang bertanggung jawab atas epidemi sebelumnya juga dapat ditentukan dengan analisis PCR.

[ edit ] Forensic applications [ sunting ] aplikasi Forensik

The development of PCR-based genetic (or DNA ) fingerprinting protocols has seen widespread application in forensics : Pengembangan PCR berbasis genetik (atau DNA ) protokol fingerprinting telah melihat aplikasi yang luas di forensik :

In its most discriminating form, Genetic fingerprinting can uniquely discriminate any one person from the entire population of the world . Pada kebanyakan bentuk diskriminasi, sidik jari genetika dapat secara unik membedakan satu orang dari seluruh

penduduk dunia . Minute samples of DNA can be isolated from a crime scene , and compared to that from suspects, or from a DNA database of earlier evidence or convicts. Menit sampel DNA dapat diisolasi dari TKP , dan dibandingkan dengan yang dari tersangka, atau dari database DNA bukti sebelumnya atau narapidana. Simpler versions of these tests are often used to rapidly rule out suspects during a criminal investigation. versi Simpler tes ini sering digunakan untuk secara cepat menyingkirkan tersangka selama investigasi kriminal. Evidence from decades-old crimes can be tested, confirming or exonerating the people originally convicted. Bukti dari kejahatan yang berusia puluhan tahun dapat diuji, membenarkan atau mendukungnya orang awalnya dihukum.

Less discriminating forms of DNA fingerprinting can help in Parental testing , where an individual is matched with their close relatives. membedakan bentuk Kurang dari fingerprinting DNA dapat membantu dalam pengujian Parental , di mana seorang individu disesuaikan dengan kerabat dekat mereka. DNA from unidentified human remains can be tested, and compared with that from possible parents, siblings, or children. DNA dari manusia tetap tidak teridentifikasi dapat diuji, dan dibandingkan dengan yang dari orang tua mungkin, saudara, atau anak-anak. Similar testing can be used to confirm the biological parents of an adopted (or kidnapped) child. pengujian yang sama dapat digunakan untuk mengkonfirmasi orang tua kandung dari anak angkat (atau diculik). The actual biological father of a newborn can also be confirmed (or ruled out). Ayah biologis yang sebenarnya dari baru lahir juga bisa dikonfirmasi (atau dikesampingkan).

[ edit ] Research applications [ sunting ] aplikasi Penelitian

PCR has been applied to many areas of research in molecular genetics: PCR telah diterapkan untuk berbagai bidang penelitian dalam genetika molekuler:

PCR allows rapid production of short pieces of DNA, even when nothing more than the sequence of the two primers is known. PCR memungkinkan produksi yang cepat dari potongan pendek DNA, bahkan ketika tidak lebih dari urutan dua primer diketahui. This ability of PCR augments many methods, such as generating hybridization probes for Southern or northern blot hybridization. Ini kemampuan PCR menambah banyak metode, seperti menghasilkan hibridisasi probe untuk Selatan atau noda utara hibridisasi. PCR supplies these techniques with large amounts of pure DNA, sometimes as a single strand, enabling analysis even from very small amounts of starting material. PCR pasokan teknik ini dengan jumlah besar DNA murni, kadang-kadang sebagai untai tunggal, memungkinkan analisis bahkan dari jumlah yang sangat kecil bahan awal. The task of DNA sequencing can also be assisted by PCR. Tugas sekuensing DNA juga dapat dibantu dengan PCR. Known segments of DNA can easily be produced from a patient with a genetic disease mutation. Dikenal segmen DNA dapat dengan mudah dihasilkan dari pasien dengan mutasi penyakit genetik. Modifications to the amplification technique can extract segments from a completely unknown genome, or can generate just a single strand of an area of interest. Modifikasi untuk teknik amplifikasi dapat

mengambil segmen dari genom benar-benar tidak diketahui, atau dapat menghasilkan hanya untai tunggal pada daerah tertentu.

PCR has numerous applications to the more traditional process of DNA cloning . PCR memiliki aplikasi yang banyak untuk proses tradisional lebih dari kloning DNA . It can extract segments for insertion into a vector from a larger genome, which may be only available in small quantities. Hal ini dapat mengekstrak segmen untuk dimasukkan ke dalam vektor dari genom yang lebih besar, yang mungkin hanya tersedia dalam jumlah kecil. Using a single set of 'vector primers', it can also analyze or extract fragments that have already been inserted into vectors. Menggunakan satu set 'vektor primer', juga dapat menganalisis atau ekstrak fragmen yang sudah dimasukkan ke dalam vektor. Some alterations to the PCR protocol can generate mutations (general or site-directed) of an inserted fragment. Beberapa perubahan terhadap protokol PCR dapat menimbulkan mutasi (umum atau situs-diarahkan) dari sebuah fragmen dimasukkan. Sequence-tagged sites is a process where PCR is used as an indicator that a particular segment of a genome is present in a particular clone. Sequence-tagged situs adalah proses di mana PCR digunakan sebagai indikator bahwa segmen tertentu dari genom adalah hadir dalam klon tertentu. The Human Genome Project found this application vital to mapping the cosmid clones they were sequencing, and to coordinating the results from different laboratories. The Human Genome Project menemukan aplikasi ini penting untuk pemetaan klon kosmid mereka sequencing, dan untuk mengkoordinasikan hasil dari laboratorium yang berbeda. An exciting application of PCR is the phylogenic analysis of DNA from ancient sources , such as that found in the recovered bones of Neanderthals , or from frozen tissues of Mammoths . Aplikasi menarik dari PCR adalah kekerabatan analisis DNA dari sumber-sumber kuno , seperti yang ditemukan dalam tulang pulih dari Neanderthal , atau dari jaringan beku Mammoths . In some cases the highly degraded DNA from these sources might be reassembled during the early stages of amplification. Dalam beberapa kasus DNA yang terdegradasi dari sumber-sumber ini mungkin akan dipasang kembali pada tahap awal amplifikasi. A common application of PCR is the study of patterns of gene expression . Sebuah aplikasi umum dari PCR adalah studi tentang pola ekspresi gen . Tissues (or even individual cells) can be analyzed at different stages to see which genes have become active, or which have been switched off. Jaringan (atau bahkan sel-sel individual) dapat dianalisis pada tahapan yang berbeda untuk melihat yang gen telah menjadi aktif, atau yang telah dimatikan. This application can also use Q-PCR to quantitate the actual levels of expression Aplikasi ini juga dapat menggunakan Q-PCR menduga jumlah sebenarnya tingkat ekspresi The ability of PCR to simultaneously amplify several loci from individual sperm [ 4 ] has greatly enhanced the more traditional task of genetic mapping by studying chromosomal crossovers after meiosis . Kemampuan PCR untuk secara bersamaan memperkuat beberapa lokus dari sperma individu [4] telah sangat ditingkatkan tradisional tugas yang

lebih dari pemetaan genetik dengan mempelajari pindah silang kromosom setelah meiosis . Rare crossover events between very close loci have been directly observed by analyzing thousands of individual sperms. peristiwa crossover Langka antara lokus sangat dekat telah secara langsung diamati dengan menganalisis ribuan sperma individu. Similarly, unusual deletions, insertions, translocations, or inversions can be analyzed, all without having to wait (or pay for) the long and laborious processes of fertilization, embryogenesis, etc. Demikian pula, penghapusan biasa, insersi, translokasi atau inversi dapat dianalisa, semua tanpa harus menunggu (atau membayar untuk) proses panjang dan melelahkan pemupukan, embriogenesis, dll