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UNIVERSIDAD JUAN A.

MAZA CARRERA: NUTRICION MATERIA: BIOQUMICA DE LA NUTRICIN

ACIDOS NUCLEICOS
Se les d ese nombre por ser compuestos aislados originalmente de un material rico en ncleos celulares. Sus molculas contienen C, H, O, N y P; tienen carcter acdico y se encuentran en todos los seres vivientes. Son macromolculas formadas por polimerizacin de unidades estructurales llamadas nucletidos, en cadenas lineales. Funciones: a) contienen la informacin gentica y son responsables de t ransmitirla de padres a hijos y de una generacin celular a otra. b) Tienen un papel importante en la sntesis de protenas y dirigen el ensamble correcto de aa en secuencias definidas. En ltima instancia, se puede decir que la individualidad y el potencial funcional de cada ser son determinados por la informacin contenida en los cidos nucleicos.

NUCLETIDOS: son sustancias formadas por la unin de: base nitrogenada + monosacrido de 5 C (aldopentosa) + cido ortofosfrico. Bases nitrogenadas:

Las bases pirimdicas son timina (5-metil-2,4-dioxipirimidina), citosina (2-oxo-4-aminopirimidina) y uracilo (2,4-dioxipirimidina). Las bases pricas son adenina (6-aminopurina) y guanina (2-amino-6-oxipurina) Aldopentosas:

El monosacrido integrante puede ser D-ribosa o D-2-desoxirribosa. Segn la pentosa presente se distinguen cidos ribonucleicos (ARN RNA) y cido desoxirribonucleico (ADN DNA). Adoptan la forma furanosa, El compuesto formado por una base nitrogenada y aldopentosa, se llama nuclesido. El nucletido se forma por esterificacin con cido ortofosfrico del HO- del C5 de ribosa o desoxirribosa de un nuclesido.

Prof. Silvana E. DAngeli

Ao 2012

UNIVERSIDAD JUAN A. MAZA CARRERA: NUTRICION MATERIA: BIOQUMICA DE LA NUTRICIN ACIDOS NUCLEICOS Los nucletidos se unen entre s por enlaces ster; el fosfato forma un puente desde C5 de la pentosa de un nucletido al C3 de la pentosa del nucletido anterior. La primera unidad de la cadena tiene libre su fosfato, mientras la pentosa del tlimo nucletido tienen libre el HO- de C3. Los extremos se denominan 5 y 3. Esta estructura es vlida para los dos tipos de cidos nucleicos. La notacin prima es para los C de la pentosa, mientras que para las bases nitrogenadas, se usa directamente el nmero.

ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (DNA)

Se encuentra casi totalmente en ncleos celulares, formando la cromatina. Hay una pequea cantidad en mitocondrias y cloroplastos. Todas las clulas somticas de individuos de la misma especie poseen la misma cantidad de DNA; por -6 ejemplo, en humanos, el contenido de DNA es de 6 pg (picogramos) 6 x 10 g (microgramos); as gametas femeninas y masculinas poseen la mitad y el contenido no vara con la edad ni por factores ambientales o nutricionales. La molcula de ADN es lineal, de gran longitud (puede alcanzar a medir centmetros). En cambio su eje transversal es de 2 nm, lo que permite que la hebra se corte fcilmente cuando se la separa y purifica. Dentro de la clula, el DNA se encuentra densamente empaquetado; por ejemplo, el cromosoma humano ms pequeo, con una longitud de 2 m, contiene una molcula 1,4 cm de largo. Si pudieran extenderse todas las molculas de ADN de los 46 cromosonas humanos, una a continuacin de otra, alcanzaran casi 2 metros de longitud. Por hidrlisis de su molcula, se obtienen los nucletidos constituyentes, y de su hidrisis, las bases pricas y pirimdicas, desoxirribosa y cido fosfrico. Sus bases son: adenina (A) y guanina(G) y las pirimdicas: citosina (C) y timina (T). Cualquiera sea su origen, el contenido molar de las bases pricas es igual al de las pirimdicas (A+G=C+T); a su vez, las relaciones A/T y G/C son siempre iguales a la unidad, o sea, el nmero de molculas de A=T y G=C. Estructura molecular del DNA: Watson y Crick elaboraron, en 1953, su modelo molecular, basados en estudios de difraccin de rayos X realizados previamente por Wilkins y Franklin. Segn este modelo, la molcula est formada por dos cadenas polinucleotdicas, enrolladas en hlice alrededor del mismo eje. El ADN es una doble hlice. En cada hlice, la hebra continua est formada por la sucesin de desoxirribosas y fosfatos tendidos como puentes entre C5 de una pentosa y C3 de la anterior. En la doble hlice, desoxipentosas y fosfatos, que son hidrfilos, quedan situados hacia el exterior de la molcula y toman contacto con el medio acuoso, mientras que las bases nitrogenadas, que son planas y muy poco polares, escapan del contacto con el medio, orientndose hacia el centro, en direccin perpendicular al eje central. En el conocido modelo, las bases se representan como peldaos de una escalera caracol. Cada vuelta de hlice tiene una extensin de 3,4 nm y cada base est a 0,34 nm de la siguiente; de esta manera, una vuelta completa de hlice completa comprende diez bases nitrogenadas. El dimetro o seccin transversal de la molcula es de 2 nm. El enrollamiento se hace en sentido de las agujas del reloj, por lo que se considera que la hlice es dextrgira. Las dos cadenas son antiparalelas, siguen direcciones opuestas. Mientas en una de ellas las uniones fosfato van de C5 a C3, la otra est orientada de C3 a C5; de esta forma, en un a punta se encuentra el extremo 5 de una cadena y el 3 de la otra. El ordenamiento o secuencia de nucletidos es de suma importancia, ya que la informacin gentica se encuentra cifrada o codificada en su secuencia de bases. Si consideramos las gran des dimensiones de la cadena y que est formada por cientos de miles a millones de unidades, las probabilidades de combinacin de las cuatro bases nitrogenadas son extremadamente grandes. El ordenamiento de nucletidos en los trozos de DNA correspondientes a los genes, indica la secuencia con la que habrn de disponerse los aa al construir una protena. Esta secuencia suele indicarse, en forma abreviada, colocando las iniciales de los nuclesidos constituyentes, separadas por p para indicar las uniones fosfato; ej.: pApGpCpTpApCpT tambin suprimiendo las p; AGCTAGCT Las unidades se mencionan comenzando desde el extremo 5. Las bases se mantienen unidas por puentes de hidrgeno: dos entre A-T y tres entre G-C. Gracias a estas uniones, la doble hlice es una estructura muy estable, debido a la gran cantidad de las mismas
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UNIVERSIDAD JUAN A. MAZA CARRERA: NUTRICION MATERIA: BIOQUMICA DE LA NUTRICIN que se presentan. A esto contribuyen en grado importante las fuerzas de Van der Walls y las interacciones hidrofbicas en los pares de bases apilados en el interior de la molcula. Si bien la doble hlice es un conjunto compacto, tienen flexibilidad como para arquearse y hasta enrollarse sobre s misma o sobre otras estructuras. Esto le permite empaquetarse en volmenes muy pequeos e interaccionar con otras molculas. Notas: 1.- las dos cadenas no son idnticas sino complementarias; los apareamientos A-T y G-C se producen cuando una cadena posee A exactamente frente a T de la otra y G frente a C. 2.- las cadenas son antiparalelas, una marcha en sentido 5-3 y la otra 3-5 El enrollamiento de las dos cadenas de desoxirribosas y fosfatos, forma dos surcos o estras en la superficie de la molcula, paralelas a los giros de la hlice. En el fondo de los surcos quedan expuestos tomos componentes de las bases. Especialmente a nivel del surco mayor, las bases pueden establecer uniones con protenas y otras sustancias. Desnaturalizacin de ADN Diversos agentes como calentamiento, lcalis fuertes, urea, formamida, debilitan las fuerzas de unin mencionadas y promueven la separacin de las cadenas; este proceso se llama desnaturalizacin. Las hebras polinucleotdicas desenrolladas tienen una estructura flexible y adoptan disposicin al azar. La temperatura a la cual la mitad del DNA est desnaturalizado, es la temperatura de fusin o Tm. Este valor es caracterstico para cada ADN en condiciones definidas de concentracin salina y pH. El valor de Tm vara de 80 a 100 C; saber su valor ayuda a conocer aproximadamente la composicin de bases: como G-C estn unidos por 2 puentes de hidrgeno y A-T por 3, cuando mayor sea el contenido de G-C, ms resistente ser el ADN a la desnaturalizacin y mayor su temperatura de fusin. Renaturalizacin el proceso de desnaturalizacin puede revertirse en condiciones controladas de pH y concentracin inica. Si se disminuye lentamente la temperatura en la solucin donde el ADN se haba desenrrollado completamente, se produce reasociacin de las cadenas y se restablece la estructura original de doble hlice. Esta renaturalizacin por enfriamiento se denomina templado del ADN. Hibridacin: si, en condiciones adecuadas, se mezclan ADN desnaturalizados de dos organismos diferentes, algunos segmentos pueden tener trozos complementarios que forman doble hlices hbridas. Esto permite estudiar la proximidad o no de dos especies diferentes. Se pudo comprobar que ADN humano forma dobles hlices hbridas en mayor proporcin con ADN de monos Rhesus que con ADN de ratn. Cromatina: el ADN nuclear de clulas eucariotas, se encuentra en los cromosomas, cada uno de los cuales aloja una molcula de ADN (dos molculas inmediatamente luego de la replicacin, al formarse las cromtides hermanas. Se calcula que cada cromosoma humano aloja una doble hlice de 4 cm de largo). Estas enormes molculas se encuentran empaquetadas en los complejos nucleoproteicos que forman la cromatina. Dentro de las protenas nucleares, las ms abundantes son las histonas, de carcter bsico. Ms del 20% de los aa que las forman son lisina y arginina. Al tener grupos ionizables con carga positiva, se establecen atracciones electrostticas con grupos negativos de fosfatos de las cadenas de ADN. Existen 5 tipos de histonas H1, H2a, H2b, H3 Y H4. Solo se encuentran en clulas eucariotas. A intervalos regulares, la molcula de ADN da dos vueltas sobre un ncleo formado por un octmero de histonas H2a, H2b, H3 y H4 (dos unidades de cada una). Esta estructura se llama superhlice. El conjunto forma una partcula llamada nucleosoma. Una unidad de histona H1 est asociada a la doble hlice en el lugar de su entrada y salida del nucleosoma. El conjunto de nucleosoma y H1 se denomina cromatosoma. El ADN, luego de dar dos vueltas sobre las histonas, se extiende en un trozo de 50 o 60 pares de bases (ADN espaciador) antes de volver a formar una superhlice y as sucesivamente. Al microscopio electrnico, el conjunto de nucleosomas aparece como cuentas de un rosario enlazadas por hebras de DNA. ADN circular: Bacterias: la informacin gentica de organismos procariotas (sin ncleo) se encuentra en un nico cromosoma constituido por una doble hlice que no tiene extremos libres sino que se cierra sobre s misma, formando un crculo. Plsmidos: muchas bacterias presentan, adems, otras molculas de ADN circular, de pequeo
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UNIVERSIDAD JUAN A. MAZA CARRERA: NUTRICION MATERIA: BIOQUMICA DE LA NUTRICIN tamao, que se duplican independientemente y contienen informacin gentica accesoria. Generalmente, los genes de resistencia a antibiticos se encuentran en ellos. Pueden ser transferidos a otras bacterias a travs de las membranas celulares. Mitocondrias: se aislaron ADN semejantes al de bacterias, desde mitocondrias y cloroplastos. El de mitocondrias humano contiene informacin para la sntesis de ARN y algunas protenas de la organela. Genoma: es la totalidad del ADN contenido en cada clula. El tamao del genoma guarda relacin con la complejidad del organismo. En organismos de reproduccin sexual, las clulas somticas contienen el doble de DNA contenido en clulas haploides (gametos). As, el genoma o contenido total de ADN de una clula haploide humana (espermatozoide u vulo) est distribuido en 23 cromosomas, 22 autosmicos y uno sexual (X o Y). Las clulas diploides tienen un total de 46 cromosomas; cada uno de los 22 cromosomas autosmicos tienen un homlogo. Estos son similares pero no idnticos: uno proviene del padre y uno de la madre. Cada clula diploide tiene, adems, dos cromosomas sexuales: en la mujer 2 X y en hombre 1 X y 1 Y.

ACIDO RIBONUCLEICO (RNA)

Es un polinucletido cuyas diferencias con ADN son: a) el azcar es D-Ribosa en lugar de D-2-desoxirribosa b) est presente la base pirimdica uracilo en lugar de timina. El resto de las bases son iguales c) RNA est formada solo por una cadena polinucleotdica. A pesar de esto, la cadena se doble en horquilla y se enrolla sobre s misma, en trozos que semejan la doble hlice de cadenas antiparalelas. d) la molcula tiene mayor flexibilidad conformacional y capacidad para ejercer diversas funciones e) al ser solo una cadena, no es necesario que se cumplan las relaciones molares entre bases; de hecho, la cantidad de guaninas no es necesariamente igual a citosinas, ni adeninas con uracilos. En las clulas, existen 4 tipos principales de ARN: mensajero (ARNm), ribosomal (ARNr), de transferencia (RNAt) y ARN nuclear pequeo. 1.- ARN mensajero: representa el 5% del total del ARN de la clula. Se encuentra en ncleo y citoplasma. Funcin: transmitir la informacin gentica desde ADN nuclear hacia el sistema de sntesis de protenas en citoplasma y servir de gua para el ensamble de aa en el orden correcto. Los RNAm son modificados en ambos extremos: al 5 terminal se le une 7 -metil-guanosina trifosfato, y el extremo 3 se une a AMP. Ambas modificaciones estabilizan al RNAm. 2.- ARN ribosomal: es la especie ms abundante. Constituye el 80% del contenido total. Es el ncleo prosttico de nucleoprotenas componentes de los ribosomas (pequeos grnulos localizados en el citoplasma, libres o unidos retculo endoplsmico rugoso. Ms del 55% de la masa del ribosoma corresponde a ARN, el resto a protenas. Los ribosomas presentan 2 unidades: una mayor, de 60 S (unidades Sdverberg del coeficiente de sedimentacin*), integrada por 3 molculas de RNA y 45 protenas diferentes; y una menor, de 40 S, con 1 molcula de RNA y 30 protenas. Ambas partculas presentan forma irregular. Las molculas de RNAr tienen plegamientos definidos y numerosos segmentos en doble hlice. Al microscopio electrnico, se observan conjuntos formados por varios ribosomas unidos a una hebra de RNAm como cuentas de un rosario; ese conjunto se denomina polisomas. RNAr tiene una funcin de mucha importancia en la sntesis proteica. (*) Coeficiente de sedimentacin: medida de la velocidad de sedimentacin de una partcula sometida a utltracentrifugacin 3.- ARN de transferencia: se lo llama tambin soluble; es el de menor tamao molecular. Participa en la sntesis proteica transportando aa libres del citosol hasta el lugar de ensamble. Acta como molcula adaptadora , que asegura la ubicacin de cada aa en el sitio correspondiente. En cada clula existen distintas especies de RNAt, especficos para cada uno de los aa. Los primeros estudios indicaron que la molcula semeja una hoja trilobulada, donde se reconocen 4 zonas de doble hlice y porciones desplegadas de la cadena, llamadas asas o lbulos de la molcula. El asa central contiene un grupo de 3 bases, el anticodn, responsable de la especificidad de aa y de la funcin de adaptador. El conjunto posee un tallo en cuyo extremo se encuentran los terminales 5 y 3 de la molcula. El tallo es llamado brazo aceptor debido a su funcin de fijar el aa. Modelos posteriores, construidos segn estudios de difraccin de RX, indican que la molcula tiene forma de L. El sitio aceptor del aa est en uno de los extremosde la L y en el otro, el asa anticodn. Si bien esta estructura es ms fidedigna, se sigue usando el esquema trilobular para representar la molcula.

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UNIVERSIDAD JUAN A. MAZA CARRERA: NUTRICION MATERIA: BIOQUMICA DE LA NUTRICIN 4.- ARN nuclear pequeo: existen partculas con RNA en las clulas, que integran las ribonucleoprotenas nucleares pequeas (snRNP, en ingls) y las ribonucleoprotenas citoslicas pequeas (scRNP) tambin se las indica como UsnRNP por su alto contenido en uracilo. Las primeras intervienen en el procesamiento de ARNm en el ncleo.

NUCLETIDOS LIBRES Son sustancias de tipo nucleotdico con funciones muy importantes, no como constituyente de cidos nucleicos sino libres o integrando molculas de pequeo tamao. Encontramos, entre ellos, compuestos difosforados y trifosforados, donde el ms abundante en el organismo es el ATP (adenosina trifosfato), cuya funcin es ser mediador en reacciones de transferencia de grupos fosforilo, acompaados por importantes cambios de energa. Se dice que es un compuesto rico en energa porque la hidrlisis de los enlaces entre el segundo y tercer fosfato tiene un G francamente negativo. Al producirse esta hidrlisis, el ATP pasa a ADP y ste a AMP. El GTP (guanosina trifosfato) participa tambin en procesos muy importantes. CTP y UTP tambien intervienen en reacciones de transferencia de grupo fosforilo. En el organismo, nuclesidos mono y difosfatos son convertidos en trifosfatos por procesos de captacin de la energa liberada durante la oxidacin de combustibles ingresados con los alimentos o por procesos como la fosforilacin a nivel de sustrato, a partir de intermediarios metablicos ricos en ella. Algunos nucletidos sirven como intermediario en sistemas de transmisin de seales, como el AMP-35-cclico y el GMP cclico.

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