Captulo 1.

Bioqumica MD VASUDEVAN

La estructura de las Molculas estn unidas por enlaces covalentes fuertes.

Comparten electrones entre los tomos

Estructuras tridimensional de las macromolculas biolgicas se produce por interacciones no covalentes o dbiles.

Son esenciales porque al ser dbiles le permiten romperse y volver a formarse continuamente en un interaccin molecular dinmica que es la vida

Enlace Inico: Atraccin entre dos tomos o grupos ionizados de cargas opuestas formados por la transferencia de uno o ms electrones.

Puente o Enlace de Hidrgeno: Son formados compartiendo un hidrgeno entre dos donantes de electrones.

El puente de hidrgeno resultan de la interaccin entre un tomo de Hidrgeno unido covalentemente a un grupo donador ( -O-H o =N-H ) y un par de electrones libres pertenecientes a un grupo aceptor electronegativo ( O=C- o N= ).

Existen diferentes dadores de hidrgeno para formar enlaces de hidrgeno. En los sistemas biolgicos los donantes y aceptores son: el grupo hidrxilo (OH) el grupo amino (NH2)

Interacciones Hidrofbicas: Grupos no polares se asocian entre s en un ambiente acuoso. Sirve para sostener cadenas laterales lipoflicas de aminocidos juntas.

Fuerzas de Van Der Waals Fuerzas muy dbiles entre tomos, son intermoleculares e intramoleculares que implican dipolos Ocurren en todos los tipos de molculas polares y no polares.

Muy importante en bioqumica, estabilizan la conformacin de las protenas.

El agua constituye el cerca de 70% a 80%

Las molculas de agua se estn unidas por red de puente de hidrgeno.

La estructura cristalina del hielo representa un arreglo tetradrico de molculas de agua. (4 puentes de H rodean cada oxgeno). En el agua lquida las molculas estn ms cerca y es ms densa que el hielo.

a.
b.

a y b Estructura del hielo c Estructura del agua lquida

Ciertas caractersticas del agua la convierten en el medio donde se realizan la reacciones bioqumicas e interacciones celulares:
1.

Es un dipolo, por lo tanto, sus molculas tienden a rodear a los iones aislndolos unos de otros, facilitando la disolucin de las sales.

2. Disolvente de compuestos polares, gracias a la

capacidad de formar puentes de hidrgeno con sustancias polares como alcoholes, aminas, glcidos (sustancias hidroflicas).

3. Disolventes de molculas anfipticas, se forman micelas

asociadas en su interior los grupos hidrfobos, mientras que los grupos hidroflicos se orientan hacia el exterior para contactar con el agua.
Por estas 3 propiedades se dice que el H2O es el disolvente universal, esto permite procesos de transporte, nutricin, smosis, etc.

1. Ley de Conservacin de la energa. La energa total de un sistema se mantiene constante. La energa ni se crea ni se destruye, solo se transforma de una forma a otra. Ej: los animales convierten la Energa qumica (ATP) en: Calor (mantenimiento Temperatura) Trabajo(Energa mecnica)

2. La entropa total de un sistema debe aumentar si un proceso ocurre espontneamente. La entropa es una medida del desorden o aleatoriedad de un sistema. La entalpa es el contenido de calor de un sistema y la entropa es la fraccin de la entalpa que no est disponible para hacer el trabajo til.

H = ENTALPA (contenido calrico del sistema) (J/mol) H = calor que se libera o se absorbe durante una reaccin H (-).... EXOTERMICA (libera calor) H (+) .... ENDOTERMICA (absorbe calor
S = ENTROPA (medida cuantitativa del desorden) (J/mol K) (S sistema + S entorno ) > 0 = proceso espontneo

3. La energa libre de Gibb (G) es la parte de energa de un

sistema capaz de hacer trabajo biolgico. Las reacciones espontneas van en la direccin de ms baja energa libre. Si se conoce G de una reaccin, se podr predecir si es espontnea o no: G (-), EXERGNICA, favorable o espontnea G (+), ENDERGNICA, no espontnea. G =0, equilibrio

G = H - T S (relaciona los dos principios) G = variacin de la Energa libre H = variacin de la entalpa (cambio calorfico) T = Temperatura absoluta S= variacin de la entropa (grado de orden)

El G energa libre estndar para las reacciones bioqumicas bajo condiciones de pH 7 y una concentracin 1 M. Las reacciones metablicas reversibles son cercanas al equilibrio y su G es casi cero. Las reacciones altamente exergnicas son irreversibles, se dan lejos del equilibrio y desencadenan la prdida total de reactantes. G (-), EXERGNICA, favorable o espontnea G (+), ENDERGNICA, no favorable o no espontnea. G =0, equilibrio
Una reaccin no favorable puede darse al realizarse junto a una reaccin favorable

Una reaccin no favorable puede llevarse a cabo al realizarse junto a una reaccin favorable:
EJEMPLO

Fosforilacin de la glucosa acoplada a la hidrlisis del ATP

G(kJ mol-1) Glucosa + fosfato ATP + H2O Glucosa-6-P + H2O ADP + fosfato +13,8 -30,5

REACCION 1 REACCION 2

ATP + glucosa

Glucosa-6-P + ADP

-16,7

Elementos

Una reaccin que requiera energa ( G>O) Una reaccin que libere energa ( G<O) Un intermediario comn fosfato

REACCION 1
REACCION 2

Cuando dos soluciones son separadas por una membrana permeable al agua y a los pequeos iones, y en uno de los lados hay iones impermeables (protenas)se difundirn los iones permeables hasta equilibrio dando como resultado lo siguiente:
1.

Antes

Despus

2. 3.

Los productos de los iones difusibles en ambos lados son iguales La neutralidad elctrica de cada lado se mantiene. El nmero total de cada in antes y despus del equilibrio se mantiene.

El R- tiene un peso molecular elevado y no puede difundir 1. 2. 3. 9 Na+ x 4 Cl- izquierda = 6 Na+ x 6 Cl- derecha 9 Na+ = 4 Cl- + 5 R- izquierda 6 Na+ = 6 Cl- derecha 5 Na++ 10 Na+ antes = 9 Na+ +6 Na+ despus 10 Cl- antes = 4 Cl- + 6 Cl- despus