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Terminacin

Vamos a continuar, nos qued una pequea colita la ltima vez que tiene que ver con la replicacin, con la terminacin de la replicacin. Particularmente la terminacin de la replicacin en organismos eucariotas conlleva un proceso que originalmente nadie le haba dado demasiada importancia, hasta que fuimos capaces de clonar un organismo completo que fue nuestra querida Dolly y que obviamente como ustedes se imaginarn despus de haber obtenido tal gran logro, la pequea ovejita fue seguida muy en detalle en cuanto a su crecimiento y desarrollo, y una de las caractersticas que se comenz a observar particularmente al hacerle una autopsia cuando desgraciadamente muri, es que celularmente se deca, por lo menos eso es lo que deca la prensa, que haba envejecido muy rpido, no fue por eso que muri, pero es una forma de decir, porque cada clula de nuestro cuerpo tiene un reloj interno, y ese reloj interno, son secuencias repetidas que se encuentran en los extremos de nuestros cromosomas y se llaman telomeros. Los telomeros son secuencias repetidas de ADN que no codifican para nada, que se encuentran en los extremos y se especula que tiene como objetivo proteger lo que es importante para aquellas secuencias internas de los cromosomas que si codifican para algo, Por qu?, porque el material gentico, en los extremos del ADN, por culpa de la terminacin de la replicacin se va acortando, producto de la replicacin. Cmo sucede aquello?

El proceso de replicacin, particularmente en los organismos eucariotas, comienza en diferentes puntos. Cada uno de estos tiene un origen de replicacin individual, aqu ustedes ven que tiene un centrmero, esto esquematiza un cromosoma cualquiera y si ustedes se dan cuenta, cada unidad replicativa, que en espaol se les dice replicn, cada replicn crece, cada burbuja de replicacin crece con su hebra conductora y retardada, de manera bidireccional, porque la replicacin es bidireccional y cuando los replicones internos se unen, se fusionan, no hay problema, pero siempre en una de las hebras, va a quedar uno de estos famosos partidores de inicio que son colocados por las primasas, siempre, recuerden que la ADN polimerasa no es autoiniciadora, no puede comenzar a trabajar de la nada, necesita de un hidroxilo 3 para comenzar a trabajar, y en una de las hebras (Color rojo en el esquema inferior de la imagen, donde estn las lupas), si o si necesita de un partidor, cuando una de las ADN polimerasa, retira uno de los partidores de RNA, recordar que es un partidor de RNA, cuando lo retira no lo rellena, por lo tanto queda un espacio ms corto, lo que muestra la lupa, siempre un pedacito ms corto, por lo general ese primer tiene unos 20 nucletidos, por lo que cada error de replicacin en ese extremo se acorta en 20 y 20. Quin los saca, los primer?, los primer se eliminan por la misma actividad del ADN polimerasa, en este caso estamos hablando de organismos eucariotas, por eso no puedo decir ni la ADN polimerasa I ni la II ni la III porque esas son procariotas; En eucariotas eso lo hacen una polimerasa en particular que tiene que ver con la reparacin del DNA etc, del cual yo no les habl, no s si les mencion que existan muchas ms polimerasas por lo menos [No entiendo que dice :c Se han descubierto muchas ltimamente app.]. . . . . . . en particular, la que est encargada de la reparacin es la ADNpolimerasa psilon de eucariota es equivalente a la ADNpol I de procariota (bacteria), y la ADNpol delta en eucariota es la equivalente a ADNpol III de los procariotas (bacterias). Eucariota Procariota

ADNpol psilon -------------------------------------- ANDpol I ANDpol Delta -----------------------------------------ANDpol III Pero veamos lo que pasa con esto, cada clula que se divide, todos los cromosomas se van a acortar en ambos extremos y eso pasa cada vez que la clula se divide, y una clula antes de morir se divide mltiples veces, de hecho esa divisin es limitada, y hoy en da se dice quien limita esa cantidad de veces que una clula puede dividirse es exactamente es la longitud que tiene los telomeros en los extremos. (Relacin con Apoptosis), en ese momento, cuando la clula detecta, porque hay diferentes molculas que estn encargadas de detectar precisamente tal acontecimiento, el que los telomeros ya son muy pequeos para continuar replicndose y detecta que ya no tienen por donde unirse, desencadena una serie de seales, la ms clsica, una cascada de caspasas y genera una serie de cambios dentro de la clula, donde lo fragmenta y finalmente la clula se suicida. Telomero se le llama al extremo de DNA, a los extremos del cromosoma, que pueden medir 2000, 3000, 5000, es variado. Y ese telomero, contiene repeticiones de secuencias, que son repeticiones telomricas. Siempre se va ir acortando.

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La tpica repeticin telomrica humana: TTAGGG . . . . jejejeje. Multiples repeticiones telomricas. TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGG Qu se descubri?, ya hace bastantes aos, pero que sin embargo nadie le puso mayor atencin, es que sobre esa regin haba un complejo enzimtico que trabajaba de forma exclusiva, que se llam telomerasa. La telomerasa es la enzima que trabaja en ese sector y su funcin es tratar, intentar de contrarrestar ese acortamiento que sufren los extremos de los cromosomas, de alguna manera por decirlo es retardar el envejecimiento celular y en consecuencia retardar la muerte celular mediada por apoptosis.

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La telomerasa se caracteriza por ser una ribonucleoprotena, vale decir, que tiene un componente ribonucleico, un RNA, y un componente proteico. Ambos van de alguna manera cooperativamente a funcionar para la actividad de esta enzima, si ustedes quieren el componente ribonucleico que en humano se llama HTR o HTER y el componente proteco HTRT o HTERT. El ribonucleico funciona como un scaffold, como un andamio para que otras protenas se monten sobre ese andamio. La accin de la telomerasa se comprende de dos fases: 1) Primera fase [Extensin]: Donde el extremo del cromosoma, el telomero, curiosamente se descubri que el componente ribonucleico de la telomerasa en su secuencia tiene una secuencia que es completamente complementaria a la secuencia telomrica, a la repeticin telomrica, y ms an, ms curiosos, ms increble an, el ARN que continua a ese sitio de reconocimiento es molde para generar nuevas repeticiones telomricas, osea es una enzima que realmente est hecha para trabajar en eso, reconoce las secuencias telomricas y al mismo tiene es molde para generar nuevas repeticiones telomricas y de esa manera poder alargar el extremo telomerico. Y esa secuencia se encuentra en la parte ribonucleica?, si. Y por qu molde?, porque la telomerasa en su componente proteico es una polimerasa, si va a extender el extremo del telomero, si quiere definir la actividad de esa enzima, Qu es esa enzima? es una es una DNApolimerasa, porque va a agregar nucletidos, va a extender las repeticiones telomricas, con que?, con nuevas repeticiones telomricas, es una ADNpolimerasa y toda ADNpolimerasa para trabajar necesita de un molde o templado, en este caso la DNA polimerasa que es la telomerasa se dice que es una ADNpolimerasa dependiente de RNA, porque su molde es una molcula de RNA. El primer lo hace la extensin telomrica. La telomerasa es una DNApolimerasa dependiente de RNA. Otro DNApolimerasa con estas caractersticas es la transcriptasa reversa. Aqu estn las etapas de la primera fase: a) Colocacin de la telomerasa: La molcula o el sector de RNA reconoci su complemento que son las repeticiones telomricas. b) Primera elongacin: Luego, la enzima, que es el complemento proteco, comienza a extender a agregar nucleoticas, extiende nucletidos, es como si se soltara y se volviera a unir porque tambin es complementaria a lo que est sintetizando, porque est sintetizando las repeticiones telomericas y la telomerasa es afn a las repeticiones telomericas. c) Translocacin d) Segunda elongacin e) Sucesivas translocaciones y elongaciones [Luego habl de muchas cosas que ya estn dichas aqu, y luego muchos se re, preguntan cosas repetidas y bla bla. Ah!, y no, no continu hablando de las etapas.]

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El componente proteco de la telomerasa cataliza la elongacin del saliente 3 empleando como molde la hebra de RNA de la propia telomerasa.

La telomerasa se desliza sobre el saliente 3 previamente elongado, conservando la complementariedad gracias a la repeticin de secuencias.

De nuevo, la telomerasa elonga el saliente 3 por el mismo mecanismo de la etapa A2.

[Lo negro es el ADN, y la cosa rosada con el hilo verde, es toda la enzima telomerasa] [Lo verde se trata del componente ribonucleico y lo de color rojo, las letras rojas, se trata del componente proteco.]

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2) Segunda fase [Relleno] a) Sntesis de un cebador por DNApola/prim b) Elongacin por DNApola/prim c) Sellado de la mella por la ligasa

Aunque se da entender que el ADN se alarga de forma casi infinita, la realidad es que se va acortando inevitablemente, puesto que se acorta mucho ms rpido de lo que se alarga.

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Conceptos Esenciales
La capacidad de una clula para mantener orden en un ambiente catico depende de la duplicacin exacta de la gran cantidad de informacin gentica transportada en su DNA. Cada una de las dos cadenas de DNA puede actuar como un molde para la sntesis de la otra cadena. Una doble hlice de DNA porta, por lo tanto, la misma informacin en cada una de sus cadenas. Una molcula de DNA es duplicada (replicada) mediante la polimerizacin de nuevas cadenas complementarias utilizando cada una de las cadenas viejas de la doble hlice de DNA como molde. Se forman dos molculas de DNA idnticas que permiten que la informacin gentica sea copiada y pasada de la clula madre a la cella hija, y del progenitor a la descendencia. A medida que una molcula de DNA se replica, sus dos cadenas son separadas formando una o ms horquillas de replicacin con forma de Y. La enzima DNA polimerasa situada en la horquilla establece una nueva cadena de DNA complementario sobre cada cadena progenitora y, de esa manera, da origen a dos nuevas molculas de doble hlice. La DNA polimerasa replica un molde de DNA con fidelidad notable ya que comete menos de un error por cada pares de bases ledas. Esta precisin es posible en parte, por un proceso de correccin en el que la enzima elimina sus propios errores de polimerizacin a medida que se desplaza a lo largo del DNA. Debido a que la DNA polimerasa puede sintetizar DNA nuevo nicamente en una direccin. Solo la cadena adelantada en la horquilla de replicacin puede ser sintetizada de manera continua. Sobre la cadena retrasada el DNA se sintetiza en un proceso discontinuo de pespunte hacia atrs, que produce fragmentos de DNA cortos, que posteriormente son unidos por la enzima DNA ligasa que produce una cadena de DNA continua. La DNA polimerasa es incapaz de comenzar una cadena de DNA nueva. En su lugar, la sntesis de DNA es cebada por una RNA polimerasa, denominada primasa, que produce RNA cortos (cebadores), que son alargados por la DNA polimerasa. Posteriormente son eliminados y reemplazados con DNA. La replicacin del DNA requiere de la cooperacin de muchas protenas; que forman una maquinaria de replicacin multienzimtica que cataliza la sntesis de DNA. En los eucariontes, una enzima especial que se denomina telomerasa replica al DNA en los extremos de los cromosomas. Los errores de copiado poco frecuentes que se deslizan por la maquinaria de replicacin del DNA son detectados con la protenas de reparacin de apareamientos errneos. La precisin global de la replicacin del DNA, incluida la reparacin de apareamientos errneos, es de un error cada nucletidos copiados.

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El dao del DNA es causado por reacciones qumicas ineludibles y es reparado por una variedad de enzimas que reconocen al DA daado y escinden un tramo corto de la cadena de DNA que contiene el defecto. El DNA perdido es nuevamente sintetizado por una DNA polimerasa de reparacin que utiliza la cadena no daada como molde. La unin de extremos no homlogos permite la reparacin rpida de las rupturas de DNA de doble cadena; el proceso suele alterar la secuencia de DNA en el sitio de la reparacin. La recombinacin homloga puede reparar fielmente las rupturas de DNA de cadena doble utilizando una secuencia de cromosomas homlogos como una gua. Durante la meiosis, un proceso de recombinacin homloga relacionado causa una reorganizacin de informacin gentica que crea molculas de DNA con secuencias nuevas. Los elementos genticos mviles o transposones, se mueven de un lugar a otro en los genomas de sus hospedadores, proporcionando una fuente de variacin gentica. Casi la mitad del genoma humano consiste en elementos genticos mviles. Dos clases de estos elementos se han multiplicado en nmeros especialmente alto de copias. Los virus sin un poco ms que genes empaquetados en cubiertas proteicas protectoras. Requieren de las clulas hospedadoras para reproducirse. Algunos virus tienen RNA en lugar de DNA como su genoma. Un grupo de virus de RNA los retrovirus- deben copiar sus genomas de RNA en DNA para poder replicarse.

Preguntas
Explique por qu los telomeros y la telomerasa son necesarios para la replicacin de los cromosomas eucariotes pero no para la replicacin de un cromosoma bacteriano circular. Dibuje un diagrama para ilustra su explicacin. Se necesitara an los telomeros y las telomerasas para completar la replicacin del cromosoma eucarionte si el DNA primasa siempre estableciese el cebador de RNA en el extremo 3 del molde para la cadena retrasada? Defina: a) Cebador: b) Primasa:

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