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Las protenas son macromolculas que se encuentran en estado coloidal, representan ms del 50% de peso seco de la clula. Las protenas estn compuestas por aminocidos, existen 20 aminocidos diferentes que se unen entre s por enlaces polipeptdicos. Para una mejor comprensin de lo que son las protenas, cuales son sus propiedades, cmo actan, etc., las protenas se clasifican de diferentes formas Clasificacin de protenas Por el tipo de protenas Protenas Simples: Son aquellas que al hidrolizarse (degradarse) slo producen aminocidos. Protenas conjugadas: Son aquellas que al hidrolizarse, producen aminocidos y otros compuestos orgnicos e inorgnicos. Estas pueden ser: Metalprotenas, nucleoprotenas, fosfoprotenas. Por su conformacin Protenas fibrosas: Son aquellas que estn formadas por cadenas polipeptdicas, formando estructuras compactas llamadas fibras. Tienen cadenas largas de estructura secundaria. Son insolubles en agua y poseen gran resistencia fsica. Por ejemplo: colgeno, queratina, elastina. Protenas globulares: Estn formadas por cadenas polipeptdicas que adoptan una forma esfrica. Tienen una estructura muy irregular y posee complejos patrones de plegamiento (es tpica la estructura terciaria). Por ejemplo: enzimas, anticuerpos, hormonas.

Por su estructura tridimensional La estructura tridimensional de una protena es un factor determinante en su actividad biolgica. Tiene un carcter jerarquizado, es decir, implica unos niveles de complejidad creciente que dan lugar a 4 tipos de estructuras: primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria. -Estructuras Proteicas: * Primaria El ordenamiento es lineal y las uniones son peptdicas. Esta estructura obedece a un plan predeterminado en el ADN. * Secundaria La configuracin es alfa hlice y beta plegada. Las uniones son del tipo puente hidrgeno Ej: miosina en los musculos , queratina del cabello(elsticas), fibrona de la seda (rigidez) * Terciaria La configuracin es globular y las uniones del tipo puente hidrgeno , puente disulfuro e interaccin electrosttica ( fuerzas de Van der Waals; interacciones inicas e interacciones hidrofbicas) de los grupos R

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Ej: Mioglabina, algunas enzimas. * Cuaternaria Nivel de organizacin en la que intervienen dos o ms cadenas polipectdicas, que ya cuentan con estructura terciaria propia. Cada unidad recibe el nombre de protmero Ej: Hemoglobina( cuatro subunidades) y enzimas alostricas.

Estructura terciaria Hemoglobina

Estructura de un aminocido H NH2 (grupo amino) COOH (grupo carboxilo) H2N C COOH R (grupo sustituyente)

El grupo amino es ionizable y bsico, con un pKa de aprox. 9,4. El grupo carboxilo tambin es ionizable, pero le da el carcter cido al aminocido. Tiene un pKa aprox. 2,2 El carbono central es quiral y soporta la cadena lateral. La cadena lateral es variable y le proporcionar las propiedades qumicas al aminocido.

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En la naturaleza existen unos 80 aminocidos diferentes, pero de todos ellos, slo unos veinte forman parte de las protenas. Muchos de estos aminocidos son polares sin carga y polares con carga. Los aminocidos que un organismo no puede sintetizar y, por tanto, tienen que ser suministrados con la dieta, se denominan aminocidos esenciales; y aquellos que el organismo puede sintetizar se llaman aminocidos no esenciales. Para la especie humana son esenciales ocho aminocidos: treonina, metionina, lisina, valina, triptfano, leucina, isoleucina y fenilalanina. Puede aadirse la histidina como esencial durante el crecimiento, pero no para el adulto. Los aminocidos son compuestos slidos, incoloros, cristalizables, de elevado punto de fusin (habitualmente por encima de los 200 C), solubles en agua, con actividad ptica y con un comportamiento anftero (en soluciones neutras se comportan como iones dipolares). Clasificacin de aminocidos

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Propiedades qumicas

Protenas 1 Propiedades cido/base

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Los aminocidos son anfteros, es decir, pueden comportarse tanto como un cido como una base, ya que contiene un grupo carboxilo que se puede ionizar y uno amino que tambin tiene esta caracterstica. Por este motivo, los aminocidos son zwitteriones. Un zwitterin es un compuesto qumico que es elctricamente neutro pero que tiene cargas formales positivas y negativas sobre tomos diferentes. Los anfolitos son molculas que contienen grupos cidos y grupos bsicos (y son, por tanto, anfteros) existiendo como iones dipolares en ciertos intervalos de pH. El pH al cual todas las molculas estn en la forma de ion dipolar se conoce como punto isoelctrico de la molcula. En presencia de cidos, estas molculas aceptarn iones hidrgeno, eliminndolos de la disolucin. Por el contrario, en presencia de bases, soltarn iones hidrgeno a la disolucin, amortiguando igualmente el pH. Pptidos y enlace peptdico Los pptidos son cadenas lineales de aminocidos enlazados por un enlace qumico de tipo amdico al que se denomina enlace peptdico. As pues, para formar pptidos los aminocidos se van enlazando entre s formando cadenas de longitud y secuencia variables. Para denominar a estas cadenas se utilizan prefijos convencionales como: a) Oligopptidos, si el nmero de aminocidos es menor que 10. Dipptidos, si el nmero de aminocidos es 2, Tripptidos, si el nmero de aminocidos es 3, Tetrapptidos, si el nmero de aminocidos es 4, b) Polipptidos o cadenas polipeptdicas, si el nmero de aminocidos es mayor que 10. c) Protena, si el nmero de aminocidos es mayor que 100 o el peso molecular es de 10.000. El enlace peptdico es un enlace covalente y se establece entre el grupo carboxilo (-COOH) de un aminocido y el grupo amino (NH2) del aminocido contiguo inmediato, con el consiguiente desprendimiento de una molcula de agua. Por otra parte, el carcter parcial de doble enlace del enlace peptdico (-C-N-) determina la disposicin espacial de ste en un mismo plano, con distancias y ngulos fijos. Como consecuencia, el 6

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enlace peptdico presenta cierta rigidez e inmoviliza en el plano a los tomos que lo forman. Cabe destacar que las distancias interatmicas medidas en los enlaces C-O y C-N son intermedias entre las del enlace sencillo y el doble enlace. Esta disposicin atmica est estabilizada por resonancia, de forma que los seis tomos implicados en la formacin del enlace peptdico estn contenidos en el mismo plano. Existen dos configuraciones posibles

Configuracin cis: los dos C se sitan del mismo lado del doble enlace Configuracin trans: los dos C se sitan a distinto lado del doble enlace

Normalmente, la configuracin trans est favorecida. Slo en el caso de que el segundo AA del enlace peptdico sea la prolina puede resultar favorecida la configuracin cis. Otra consecuencia importante de la resonancia es que incrementa la polaridad del enlace peptdico y se establece un momento dipolar. Por este motivo, cada enlace peptdico puede participar en dos puentes de hidrgeno. En uno de ellos, el grupo -NH- acta como donador de hidrgeno y en el otro, el grupo -CO- acta como receptor de hidrgeno. Esta propiedad contribuye notablemente al plegamiento tridimensional de las protenas, tal y como veremos ms adelante. Termodinmica del plegamiento En condiciones fisiolgicas, el proceso de plegamiento de una protena globular est claramente favorecido termodinmicamente, esto es, el incremento de energa libre global del proceso debe ser negativo (aunque alguno de sus pasos puede ser positivo). Este cambio se consigue equilibrando una serie de factores termodinmicos como la entropa conformacional, las interacciones carga-carga, los puentes de hidrgeno internos, las interacciones hidrofbicas y las interacciones de van der Waals Entropa conformacional Se define entropa conformacional del plegado como la disminucin de la entropa, de la aleatoriedad en definitiva, durante el paso desde una multitud de conformaciones de ovillo aleatorio hasta una nica estructura plegada. La energa libre, representada en la ecuacin G = H T S, demuestra que el S negativo realiza una contribucin positiva a G. Es decir, el cambio de entropa conformacional se opone al plegado. Por ello, el G global, que debe ser negativo, se debe a que o bien H es negativo y grande o a algn otro aumento de la entropa con el plegado. En la prctica se dan ambas cosas. La fuente de H negativo es el cmulo de interacciones favorables energticamente que se dan en el interior del glbulo proteico, interacciones que suelen ser no covalentes. Interacciones carga-carga Las interacciones carga-carga se dan entre grupos polares y cargados de las cadenas laterales de los aminocidos componentes del polipptido, puesto que los grupos carboxiloy amino del carbono alfa estn implicados en el enlace peptdico. De este modo, dichos grupos ionizados se atraen y forman un equivalente a sales entre residuos del polipptido: de hecho, se denominan a veces puentes salinos. Evidentemente, dichas interacciones desaparecen cuando el pH del medio es tal que se 7

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pierde el estado de ionizacin del grupo; de hecho, esta es una de las causas de la desnaturalizacin rpida de las protenas mediante adicin de cidos o bases, y subyuga a las protenas a un entorno de un pH tamponado y moderado, que es el fisiolgico, salvo excepciones, como puede ser el interior lisosomal en el entorno subcelular. Enlaces de hidrgeno internos Las cadenas laterales de muchos aminocidos se comportan como donadores o como aceptores de enlaces de hidrgeno (es el caso de los grupos hidroxilo de la serina y los grupos amino de la glutamina, por ejemplo). Adems, si los protones amida o los carbonilos del armazn polipeptdico no estn implicados en el enlace peptdico, pueden interaccionar tambin en este tipo de uniones estabilizadoras. Si bien los enlaces de hidrgeno son dbiles en disolucin acuosa.3 su gran nmero puede estabilizar, y lo hace, la estructura terciaria proteica. Interacciones de van der Waals El denso empaquetamiento en el ncleo de las protenas globulares facilita la interaccin dbil entre grupos moleculares sin carga. Dichos enlaces son de baja energa, pero su abundante nmero suple su debilidad. Cada interaccin individual slo contribuye en unos pocos kilojulios a la entalpa de interaccin negativa global. Pero la suma de todas las contribuciones de todas las interacciones s que puede estabilizar a la estructura plegada. De este modo, una contribucin energtica favorable a partir de la suma de las interacciones intramoleculares compensa de modo ms que suficiente la entropa desfavorable del plegado. Interacciones hidrofbicas Por definicin, cualquier sustancia hidrofbica en contacto con el agua provoca que sta huya y se agrupe en estructuras denominadas clatratos.4 Esta ordenacin corresponde a una disminucin de la entropa del sistema. En el caso de las protenas, los residuos hidrofbicos de los aminocidos quedan orientados, en su plegamiento, hacia el interior de la molcula, en contacto con sus semejantes y alejados del agua. En consecuencia, la internalizacin de los grupos hidrfobos aumenta la aleatoriedad del sistema 'protena ms agua' y, por consiguiente, produce un aumento de entropa al doblarse. Este aumento de entropa produce una contribucin negativa a la energa libre del plegado y aumenta la estabilidad de la estructura proteica. Funcin de los puentes disulfuro La estabilizacin de la protena recin plegada puede suceder mediante la formacin de puentes disulfuro entre residuos de cistena adyacentes o enfrentados. Dicho procesamiento se produce en muchos casos en el lumen del retculo endoplasmtico mediante la enzima disulfuro isomerasa, presente en todas las clulas eucariotas. Dicha enzima, que cataliza la oxidacin de los grupos sulfhidrilo o grupos tiol (-SH2) de los residuos de cistena, es especialmente abundante en rganos como el hgado o pncreas, donde se producen pequeas cantidades de protenas que contienen este tipo de enlaces.

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ngulos de rotacin (Ramachandran) En una cadena polipeptdica, se definen dos enlaces del armazn capaces de rotar: uno es el enlace entre el nitrgeno y el C, y el otro el enlace entre el C y el oxgeno del carbonilo. Ambos definen dos ngulos de rotacin:

El ngulo de rotacin , definido por los cuatro tomos sucesivos del esqueleto CO-NH-C-CO, implicando a dos aminocidos.

El ngulo de rotacin , definido por los cuatro tomos sucesivos del esqueleto: NH-C-CO-NH, que implica a dos aminocidos.

La orientacin del eje de giro considerada positiva por convencin se muestra en la imagen; corresponde a la propia de las agujas del reloj. Existen dos excepciones en los aminocidos que se representan en estos diagramas: la glicina, carente de un sustituyente, y la prolina, cclica debido a la tenencia de una estructura tipo pirrol, no cumplen los requisitos requeridos para una representacin convencional8 Se puede describir, por tanto, la conformacin del armazn de cualquier residuo concreto de una protena especificando estos dosngulos. Con estos dos parmetros podemos describir la conformacin de dicho residuo en un mapa mediante un punto, con coordenadas y . P ara determinados tipos de estructura secundaria, como la hlice alfa, todos los residuos comparten dichos ngulos, por lo que un punto en el mapa en determinada posicin puede describir una estructura secundaria. Estos mapas, denominados representaciones de Ramachandran, por el bioqumico G. N. Ramachandran que los us por ampliamente en [1963], permiten deducir dichas conformaciones. Cintica del plegado de protenas Aunque el plegamiento de las protenas parta de un estado lineal inicial y uno final bien definidos, el proceso de plegamiento no es algo brusco con un lugar de partida y un fin, sino que est plagado de intermedios temporalmente mensurables y de vital importancia. Incluso, la estructura final dista mucho de ser esttica: algunos autores imaginan a las protenas como entidades dinmicas que continuamente cambian de estructura, de un modo similar al latido cardaco11 La resolucin de la paradoja pasa por la aceptacin de la existencia de estados de plegamiento intermedios, en los que la protena se encuentra parcialmente desplegada, en una ruta como sigue: 1. Protena desplegada. 2. Nucleacin del plegado. 3. Estados intermedios. 4. Estado de glbulo fundido. 5. Reordenamientos finales.

6. Protena plegada.
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Plegamiento: nivel de organizacin Estructura primaria La estructura primaria viene determinada por la secuencia de AA en la cadena proteica, es decir, el nmero de AA presentes y el orden en que estn enlazados. Las posibilidades de estructuracin a nivel primario son prcticamente ilimitadas. Como en casi todas las protenas existen 20 AA diferentes, el nmero de estructuras posibles viene dado por las variaciones con repeticin de 20 elementos tomados de n en n, siendo n el nmero de AA que componen la molcula proteica. Por convencin, la secuencia de una protena se lee siempre a partir de su extremo amino (Figura superior). La estructura primaria viene determinada por la secuencia de AA en la cadena proteica, es decir, el nmero de AA presentes y el orden en que estn enlazados. Las posibilidades de estructuracin a nivel primario son prcticamente ilimitadas. Como en casi todas las protenas existen 20 AA diferentes, el nmero de estructuras posibles viene dado por las variaciones con repeticin de 20 elementos tomados de n en n, siendo n el nmero de AA que componen la molcula proteica.Esta secuencia determina el futuro plegamiento

Estructura secundaria Cuando la cadena principal o esqueleto de un polipptido se pliega en el espacio en forma de helicoide dextrgiro se adopta una conformacin denominada Esta estructura es peridica y en ella cada enlace peptdico puede establecer dos puentes de hidrgeno. Un puente de hidrgeno se forma entre el grupo -NH- del enlace peptdico del AA en posicin n y el grupo -CO- del enlace peptdico del AA situado en posicin n-4. El otro puente de hidrgeno se forma entre el grupo -CO- del enlace peptdico del AA en posicin n y el grupo -NH- del enlace peptdico del AA situado en posicin n+4. Cada vuelta de la hlice implica 3,6 AA, con una translacin media por residuo de 0,15 nm, lo que indica que la hlice tiene un paso de rosca de 0,54 nm. Dicho con otras palabras, una vuelta completa de la hlice representa una distancia de 0,54 nm y contiene 3,6 residuos de AA.

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Las cadenas laterales de los AA se sitan en la parte externa del helicoide, lo que evita problemas de impedimentos estricos la prolina se considera un terminador de la hlice ya que su C no tiene libertad de giro, y al estar integrado en un anillo, interfiere en la formacin de puentes de hidrgeno. Los AA muy polares (Lys, Glu) tambin desestabilizan la hlice porque los enlaces de hidrgeno pierden importancia frente a las interacciones electrostticas de atraccin o repulsin. Por este motivo, la estructura en hlice es la que predomina a valores de pH en los que los grupos ionizables no estn cargados. En caso contrario, adoptan la conformacin al azar. La conformacin al azar se produce cuando en algunas protenas, o en ciertas regiones de la misma, no existen interacciones de suficiente consideracin como para que se pueda distinguir un nivel de organizacin superior a la estructura primaria. Cuando la cadena principal de un polipptido estira al mximo que permiten sus enlaces covalentes se adopta una configuracin espacial denominada estructura . En esta estructura las cadenas laterales de los aminocidos se sitan de forma alternante a la derecha y a la izquierda del esqueleto de la cadena polipeptdica. Las estructuras de distintas cadenas polipeptdicas o bien las estructuras de distintas zonas de una misma cadena polipeptdica pueden interaccionar entre s mediante puentes de hidrgeno, dando lugar a estructuras laminares llamadas por su forma hojas plegadas u hojas Cuando las estructuras tienen el mismo sentido N-C, la hoja resultante es paralela, y si las estructuras tienen sentidos opuestos, la hoja plegada resultante es antiparalela . Esta conformacin es tpica de protenas fibrosas como la fibrona de la seda, donde numerosas estructuras antiparalelas dan lugar a varias hojas , pero tambin aparece en protenas globulares como las inmunoglobulinas. Tambin se pueden encontrar los giros . Son secuencias de la cadena polipeptdica con estructura o a menudo estn conectadas entre s por medio de los llamados giros . Son secuencias cortas, con una conformacin caracterstica que impone un brusco giro de 180oa la cadena principal de un polipptido.

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Se puede dar el caso de giros . No son muy frecuentes, se produce entre 3 aminocidos, siendo el segundo una Pro. Hay un puente de hidrgeno entre el C=O del 1 y el NH del 3. Estructuras supersecundarias Son asociaciones entre estructuras secundarias (dominios estructurales) que se pliegan de modo independiente durante la sntesis de protenas y definen patrones estructurales comunes. Eg: lazos --, vrtices -, conexiones dextrgiras y levgiras entre cadenas , disposicin barril Estructuras terciarias Se llama estructura terciaria a la disposicin tridimensional de todos los tomos que componen la protena, concepto equiparable al de conformacin absoluta en otras molculas. La estructura terciaria de una protena es la responsable directa de sus propiedades biolgicas, ya que la disposicin espacial de los distintos grupos funcionales determina su interaccin con los diversos ligandos. Para las protenas que constan de una sola cadena polipeptdica (carecen de estructura cuaternaria), la estructura terciaria es la mxima informacin estructural que se puede obtener. La Figura de la derecha corresponde a la protena triosafosfato isomerasa. La estructura terciaria es una disposicin precisa y nica en el espacio, y surge a medida que se sintetiza la protena. En otras palabras, la estructura terciaria est determinada por la secuencia de AA (estructura primaria). Se distinguen dos tipos de estructura terciaria:

Protenas con estructura terciaria de tipo fibroso en las que una de las dimensiones es mucho mayor que las otras dos. Son ejemplos el colgeno la queratina del cabello o la fibrona de la seda), En este caso, los elementos de estructura secundaria pueden mantener su ordenamiento sin recurrir a grandes modificaciones, tan slo introduciendo ligeras torsiones longitudinales, como en las hebras de una cuerda.

Protenas con estructura terciaria de tipo globular, ms frecuentes, en las que no existe una dimensin que predomine sobre las dems, y su forma es aproximadamente esfrica. En este tipo de estructuras se suceden regiones con estructuras al azar, acodamientos y estructuras supersecundarias. Las fuerzas que estabilizan la estructura terciaria de una protena se establecen entre las distintas cadenas laterales de los AA que la componen. Los enlaces propios de la estructura terciaria pueden ser de dos tipos: covalentes y no covalentes.

Los enlaces covalentes pueden deberse a (1) la formacin de un puente disulfuro entre dos cadenas laterales de Cys, o a (2) la formacin de un enlace amida (-CO-NH-) entre las cadenas laterales de la Lys y un

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Protenas 1 AA dicarboxlico (Glu o Asp).

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Los enlaces no covalentes pueden ser de cuatro tipos: (1) fuerzas electrostticas entre cadenas laterales ionizadas, con cargas de signo opuesto, (2) puentes de hidrgeno, entre las cadenas laterales de AA polares (3) interacciones hidrofbicas entre cadenas laterales apolares y (4)fuerzas de polaridad debidas a interacciones dipolo-dipolo Como resultado de estas interacciones, en las protenas con estructura terciaria globular:

las cadenas laterales con carcter apolar se orientan hacia el interior de la molcula evitando las interacciones con el disolvente, y forman un ncleo compacto con carcter hidrofbico. las cadenas laterales de los aminocidos polares se localizan en la superficie de la molcula, interaccionando con el agua y permitiendo que la protena permanezca en disolucin

No todas estas interacciones contribuyen por igual al mantenimiento de la estructura terciaria. Obviamente, el enlace que aporta ms estabilidad es el de tipo covalente, y entre los no covalentes, las interacciones ms importantes son las de tipo hidrofbico, ya que exigen una gran proximidad entre los grupo apolares de los AA. Cuando desaparecen estas interacciones la estructura terciaria de una protena se desestabiliza y pierde su estructura tridimensional caracterstica de manera que pierde su funcin y, a menudo precipita. Este fenmeno se conoce con el nombre de desnaturalizacin. Existen regiones diferenciadas dentro de la estructura terciaria de las protenas que actan como unidades autnomas de plegamiento y/o desnaturalizacin de las protenas. Estas regiones constituyen un nivel estructural intermedio entre las estructuras secundaria y terciaria reciben el nombre de dominios. Los dominios se pliegan por separado a medida que se sintetiza la cadena polipeptdica. Es la asociacin de los distintos dominios la que origina la estructura terciaria. La Figura de la derecha corresponde a la protena piruvato quinasa, que consta de 4 dominios, cada uno representado de un color. La prdida total o parcial de los niveles de estructuracin superiores al primario recibe el nombre de desnaturalizacin, que puede ser reversible o irreversible.

Estructura cuaternaria Cuando una protena consta de ms de una cadena polipeptdica, es decir, cuando se trata de una protena oligomrica, decimos que tiene estructura cuaternaria. La estructura cuaternaria debe considerar: (1)el nmero y la naturaleza de las distintas subunidades o monmeros que integran el oligmero y (2) la forma 13

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en que se asocian en el espacio para dar lugar al oligmero. La figura de la derecha corresponde a la hemoglobina. En protenas con estructura terciaria de tipo fibroso, la estructura cuaternaria resulta de la asociacin de varias hebras para formar una fibra o soga. La miosina o la tropomiosina constan de dos hebras con estructura de hlice a enrolladas en una fibra levgira. La a-queratina del cabello y el fibringeno de la sangre presentan tres hebras en cada fibra levgira. El colgeno consta de tres hebras helicoidales levgiras que forman una fibra dextrgira. La fibrona de la seda presenta varias hebras con estructura de hoja b orientadas de forma antiparalela Cuando varias protenas con estructura terciaria de tipo globular se asocian para formar una estructura de tipo cuaternario, los monmeros pueden ser:

Exactamente iguales, como en el caso de la fosfoglucoisomerasa o de la hexoquinasa. Muy parecidos, como en el caso de la lactato deshidrogenasa. Con estructura distinta pero con una misma funcin, como en el caso de la hemoglobina. Estructural y funcionalmente distintos, que una vez asociados forman una unidad funcional,como en el caso de la aspartato transcarbamilasa, un enzima alostrico con seis subunidades con actividad cataltica y seis con actividad reguladora.

hemoglobina

aspartato transcarbamilasa

La estructura cuaternaria modula la actividad biolgica de la protena y la separacin de las subunidades a menudo conduce a la prdida de funcionalidad. Las fuerzas que mantienen unidas las distintas cadenas polipeptdicas son, en lneas generales, las mismas que estabilizan la estructura terciaria. Las ms abundantes son las interacciones dbiles (hidrofbicas, polares, electrostticas y puentes de hidrgeno), aunque en algunos casos, como en las inmunoglobulinas, la estructura cuaternaria se mantiene mediante puentes disulfuro. El ensamblaje de los monmeros se realiza de forma espontnea, lo que indica que el oligmero presenta un mnimo de energa libre con respecto a los monmeros. 14

Protenas 1 Desnaturalizacin de la protena

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Cuando la protena no ha sufrido ningn cambio en su interaccin con el disolvente, se dice que presenta una estructura nativa . Se llama desnaturalizacin de las protenas a la prdida de las estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria), quedando la cadena polipeptdica reducida a un polmero estadstico sin ninguna estructura tridimensional fija. Estado nativo Estado desnaturalizado

Cualquier factor que modifique la interaccin de la protena con el disolvente disminuir su estabilidad en disolucin y provocar la precipitacin. As, la desaparicin total o parcial de la envoltura acuosa, la neutralizacin de las cargas elctricas de tipo repulsivo o la ruptura de los puentes de hidrgeno falicitar la agregacin intermolecular y provocar la precipitacin. La precipitacin suele ser consecuencia del fenmeno llamado desnaturalizacin y se dice entonces que la protena se encuentra desnaturalizada. En una protena cualquiera, la estructura nativa y la desnaturalizada tan slo tienen en comn la estructura primaria, es decir, la secuencia de AA que la componen. Los dems niveles de organizacin estructural desaparecen en la estructura desnaturalizada. La desnaturalizacin provoca diversos efectos en la protena: 1. cambios en las propiedades hidrodinmicas de la protena: aumenta la viscosidad y disminuye el coeficiente de difusin 2. una drstica disminucin de su solubilidad, ya que los residuos hidrofbicos del interior aparecen en la superficie 3. prdida de las propiedades biolgicas Una protena desnaturalizada cuenta nicamente con su estructura primaria. Por este motivo, en muchos casos, la desnaturalizacin es reversible ya que es la estructura primaria la que contiene la informacin necesaria y suficiente para adoptar niveles superiores de estructuracin. El proceso mediante el cual la protena desnaturalizada recupera su estructura nativa se llama renaturalizacin. Esta propiedad es de gran utilidad durante los procesos de aislamiento y purificacin de protenas, ya que no todas la protenas reaccionan de igual forma ante un cambio en el medio donde se encuentra disuelta. En algunos casos, la desnaturalizacin conduce a la 15

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prdida total de la solubilidad, con lo que la protena precipita. La formacin de agregados fuertemente hidrofbicos impide su renaturalizacin, y hacen que el proceso sea irreversible. Los agentes que provocan la desnaturalizacin de una protena se llaman agentes desnaturalizantes. Se distinguen agentes fsicos (calor) y qumicos (detergentes, disolventes orgnicos, pH, fuerza inica). Como en algunos casos el fenmeno de la desnaturalizacin es reversible, es posible precipitar protenas de manera selectiva mediante cambios en:

la polaridad del disolvente la fuerza inica el pH

El pH afecta al estado inico de los aminocidos, zwitteriones en definitiva, que no tienen implicado su grupo amino ni carboxilo en el enlace peptdico y, especialmente, a aqullos polares, con algn grupo cargado en su cadena lateral. El estado de ionizacin de ste afecta a la reactividad y posibilidad, por tanto, de producir un enlace qumico.

la temperatura

En la desnaturalizacin de la estructura cuaternaria, las subunidades de protenas se separan o su posicin espacial se corrompe.

La desnaturalizacin de la estructura terciaria implica la interrupcin de:

Enlaces covalentes entre las cadenas laterales de los aminocidos (como los puentes disulfuro entre las cistenas). Enlaces no covalentes dipolo-dipolo entre cadenas laterales polares de aminocidos. Enlaces dipolo inducidos por fuerzas de Van Der Waals entre cadenas laterales no polares de aminocidos.

En la desnaturalizacin de la estructura secundaria las protenas pierden todos los patrones de repeticin regulares como las alfa hlices y adoptan formas aleatorias. La estructura primaria, la secuencia de aminocidos ligados por enlaces peptdicos, no es interrumpida por las desnaturalizacin.

Chaperonas Las protenas tipo chaperona son un conjunto de protenas presentes en todas las clulas cuya funcin es la de ayudar al plegamiento de otras protenas, tras su sntesis o durante su ciclo de actividad (por ejemplo, en defensa de estrs trmico).Estas chaperonas no forman parte de la estructura primaria de la protena funcional, sino que slo se unen a ella para ayudar en su plegamiento, ensamblaje y transporte celular a otra parte de la clula donde la protena realiza su funcin. Los cambios de conformacin tridimensional de las protenas pueden estar afectados por un

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conjunto de varias chaperonas que trabajan coordinadas, dependiendo de su propia estructura y de la disponibilidad de las chaperonas. Existen sustancias qumicas no proteicas que pueden estabilizar a las protenas mediante el establecimiento de enlaces de puente de hidrgeno, en sustitucin a los del agua. Por ejemplo, es el caso de la trehalosa, un azcar que se emplea en biotecnologa para favorecer la viabilidad de las soluciones ricas en protena incluso en condiciones de estrs ambiental Las chaperonas, localizadas en todos los compartimentos celulares, se agrupan en dos familias generales. Chaperonas moleculares Que se unen y estabilizan a protenas desplegadas o parcialmente plegadas, evitando as que se agrupen y que sean degradadas. Integran la familia de las Hsp70 en el citosol y la matriz de la mitocondria, BiP en el retculo endoplasmtico y DnaK en las bacterias. Chaperoninas Que facilitan

directamente

el

plegado

de

las

protenas.

Incluyen

a: TriC,

en

eucariotas;

y GroEL,

en bacterias y cloroplastos.

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Protenas 1 Problemas de plegamiento: priones

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Problemas de plegamiento: amieloides Los amiloides son protenas de transmembrana. Cuando se encuentra en exceso, su proteolisis forma placas con los restos de las protenas. Estas placas pueden causar diversas enfermedades como el Alzheimer.

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