Bioquimica Separata 1 y degrabada 1 Enzimas Es un tipo de protena que actuca como catalizador en reacciones qumicas Incrementa le velocidad de reaccion

on sin cambiar el punto de equilibrio Como catalizador o Es especifico para cada reaccin o Esta sujeto a diversos mecanismos de regulacin de modo tal que no produzca mas producto del necesario Actividad enzimtica Forma de medida de una enzima Se mide bajo la reaccin catalica bajo la forma de desaparicin del sustrato por unidad de tiempo Tambin por modificacin del producto o del cofactor Unidades Katal=moles de sustrato/segundo U INTERNACIONAL= UNMOL/MINUTO 1U=16,7N KAT Clases de enzimas Oxidoreductasas transfieren electrones de un sustrato a otro oxido reduccin Tranferasas transfieren un grupo funcional de una molecula a otra. (metilos,acilos,fosfato) Hidrolasas: rompen enlaces entre carbono u otras molculas con adicion de molecula de agua Liasas Rompen enlaces CC,CS,CN; sin ingreso de molecula de agua Isomerasas Transforman un ismero en otro, transfiriendo un grupo funcional de una posicin a otra. Ligasas Forman enlaces CC CN CO Y CS, uniendo dos molculas con gasto de energa.

Sitio activo Porcin espacial de la enzima creada por la coincidencia de varias cadenas laterales de amino- acidos especficos Aminocidos que generalmente estn presentes: arginina e histidina Reacciona por puentes de hidrogeno y forma el sitio activo Hay residuos de aminocidos unos son de captura y otros son de catlisis para la propia funcin de la enzima

Tipo de especificidad enzimtica Modelo del molde rgido Sitio activo tiene estructura rgida, se llama llave y cerradura y es complementario del sustrato la enzima no cambia el sustrato debe entrar exactamente y complementarse ah, luego de la actividad enzimtica el producto es liberado. Especificidad del sustrato aun a nivel de ismeros(estructuras casi idnticas) Modelo de molde inducido Sitio activo mas flexible, se le llama mano y guante. Cuando el sustrato se acerca a la enzima, se producen cambios conformacionales que llevan a una exacta unin entre ambos. Conforme se forma el proceso enzima sustrato los dos cambian para asi adherirse, al final se forma el producto y la enzima vuelve a la normalidad Trminos relacionados a la actividad enzimtica Apoenzima o parte proteica de la enzima Holoenzima o protena unidad a una coenzima o/y ion metalico Grupos prostticos o Estn estrechamente integrados en la estructura de una enzima o Incorporacin estale mediante fuerzas covalentes o no covalentes o Metales son los grupos protesticos mas comunes metaloproteinas o Fosfato de piridoxal, FMN, FAD, biotina o Iones metlicos de : Co, Cu, Mg, Mn y zinc Cofactor o Unin es reversible con enzima o sustrato o Mas comunes son iones metalicos o iones inorgnicos

complejos orgnicos (coenzimas)

Coenzima Sirven como transbordadores de sustrato, o agentes de transferencia de grupo Asociacin de la coenzima estabiliza sustrato como atomos de hidrogeno Otras porciones qumicas que transporta : grupos metilos (folatos), grupos acilos (coenzima A) y oligosacridos (dolicol) Las vit b hidrosolubles proporcionan componentes importantes de muchas coenzimas. Nicotinamida ( NAD,NADP), riboflavina (FMN, FAD), Acido pantotenico (coenzima A) Principales Coenzimas FAD (flavn-adenn dinucletido): transferencia de electrones y protones. FMN (Flavn mononucletido): transferencia de electrones y protones. NAD+ Coenzima A: transferencia de grupos acetilo (por ejemplo, en la descarboxilacin del cido pirvico) y de grupos acilo en general. Vitaminas relacionas con coenzimas Vitamina B1 o tiamina: pirofosfato de tiamina Vitamina B2 o riboflavina: gran poder reductor como el FAD y el FMN. Vitamina B3 o niacina: gran poder reductor como el NAD+ o el NADP+. Vitamina B5 : Coenzima A (cido pantotnico) Vitamina B6 :PLP (fosfato de piridoxal) y PMP (fosfato de piridoxamina) Vitamina B8: biotina Vitamina B9: cido tetrahidroflico

Coenzimas NAD Y NADP FAD Y FMN Pirixodal fosfato Pirofosfato de tiamina Biotina Acido tetrahidrofolico Coenzima A

Vitamina Nicotinamida o B3 Ribolavina o B2 B6 B1 o tiamina B8 Acido flico O B9 Acido pantotenico vitamina B5

Enzima Deshidrogenasas Deshidrogenasas Transaminasas Glucgeno fosforilasa Piruvato descarboxilasa Piruvato carboxilasa Acetil-COA carboxilasa Transportador intermediario de grupos con un atomo de carbono o Transferencia de grupos acetilo pirvico descarboxilasa

Mecanismos de catlisis Por proximidad: molculas deben acercarse hasta ubicarse dentro de la distancia formadora de enlace de la otra, enzima se une a molculas de sustrato en su sitio activo y crea regin de concetracion local alta de sustrato. Acido bsica: grupos funcionales ionizables de cadenas laterales de aminoacilo y de grupos prostticos interactan como acidos o bases; pepsina catepsinas lisosomicas, proteasa del VIH Por tensin: reacciones que comprenden la rotura de un enlace covalente, las enzimas se unen a sus sutratos en una conformacin muy desfavorabl para el enlace que sufrir la divisin en estado de transicin, la tensin estira o deforma el enlace, esto lo debilita. Covalente: formacin de un enlace covalente entre la enzima y uno o mas sustratos. Modificacin qumica de la enzima es transitoria. Particularmente en reaccin de transferencia de grupos, por lo general participan los residuos de cistena o serina. Regulacin de actividad enzimtica Cantidad de enzimas presentes Cantidad de otros productos Eficacia de la actividad enzimtica No hay posibilidad la acumulacin de un producto especifico Cantidad de enzima Depende de equilibrio y velocidad de sntesis de la enzima presencia de inductores en el medio de cultivo de la celula o enzimas inducidas solamente se sintetizan cuando esta presente el sustatro o enzimas constituvias (independientes) presencia de catabolitos que reprimen la actividad enzimtica de una enzima en particular sntesis de enzimas como proenzimas sin actividad cataltica Enzimas aslostericas Aquellas que son reguladas mediante la presencia de efectores en un sitio alosterico, no ligado al sitio cataltico de la enzima Muestran una cinetica sigmoidea de saturacin con el sustrato Enzima es insesible a pequeas variaciones de sustrato Modificaciones covalentes Otra forma de regular activacin enzimtica, se habla de forsforilaciones En algunas enzimas la regulacin depende de modificaciones estructurales reversibles, como la unin covalente con un grupo fosfato. El proceso obtiene el fosfato del ATP y es dependiente del aporte de energa del mismo

Fosforilada y no fosforilada son diferentes una activa y otra inactiva y depende de la precensia de forforilasas y fosfatasas

Cuando se produce proceso de fosforilacion el grupo fosforilo proviene del ATP y se une a la enzima y la enzima que participa se llama fosforilasa y cuado es desfosforilacion de la enzima participa fofatasa Fosfatasa quita grupo fosfato Fosforilasa incorpora grupo fosfato

Enzimas en el plasma son aquellas que se estn eliminando y muy pocas LCAT (Lecitina colesterol acil transferasa) LLP (Lipasa lipoproteica) Ejercen su funcin a nivel plasmatico Isoenzimas Realizan las mismas funciones pero difieren en su estructura qumica y propiedades cinticas. Estructuras oligomericas con varios tipos de cadenas proteicas- dmeros o tetrmeros. Deshidrogenasa lctica LDH Cinco izoenzimas, cada una es un oli-gomero con cuatro protomeros de los tipos H y M, tiene un PM de 34000 ISOENZIMA LDH1 LDH2 LDH3 LDH4 LDH5 SUBUNIDADES HHHH HHHM HHMM HMMM MMMM TEJIDO PREDOMINANTE Corazn Corazn Rion y pulmn Hgado Hgado

Creatino fosfokinasa Tres tipos de isoenzimas de la creatino fosfoquinasa, cada una es un dimero formado por la combinacin de protomeros M y B Isoenzima CK1 CK2 CK3 Subunidades BB MB MM Tejidos predominante CEREBRO MUSCULO CARDIACO MUSCULO ESQUELETICO

Separata 2 Aminocidos y protenas Aminoacidos Estructuras qumicas con grupo amino y grupo carboxilo Son cuaternarias con C,H,O y N Proteinas se generan de 20 de ellos Importancia de los aminocidos Metabolismos intermediario Sntesis de protenas y aminocidos no esenciales Ciclos de Krebs y de la urea Proceso gluconeogenico Formacin de heme, colina, etanolamina, ATP, ADN-ARN Clasificacin de aminocidos Cadenas laterales alifticas Aminocidos hidrofobicos Se ubican en el interior de las protenas La glicina por ser pequea se acomoda a todas las curvas proteicas Glicina rica en colgeno Hidroxilados Son hidrofilicos, fosforilables y ocupan la superficie proteica Serina se encuentra en sitio activo de muchas enzimas Treonina Azufrados Participan en los enlaces interproteinas que mantinen estructurar terciarias y cuaternarias La metionina inicia la sntesis proteica Cistena Grupos acidos o sus amidas dicarboxilicos proporcionan cargas elctricas negativas a las protenas en solucin generan proteinatos al reaccionar con cationes glutamina y glutamato son neurotransmisores abundantes Grupos bsicos Proporcionas cargas positivas a las protenas Participan de los enlaces de hidrogeno y mantienen la estructura secundaria terciaria y cuaternaria de la protena Histidina se encuentre en sitios activos de las enzimas Las arginina es necesaria en la sntesis de la urea

Anillos aromticos Carcter hidrofobico por grupo aromtico Interior de la protena Dan color a las protenas Triptfano es precursor de la niacina Prolina es rica en colgeno Fenilalanina Tirosina Cargas elctricas de los aminocidos Carga negativa positiva o cero Ionizacin del carboxilo produce carga negativa y la captura del protn por parte del grupo amino produce carga positiva Aminocidos y su centro asimtrico Todos tienen menos la glicina Debido al carbono alpha que tiene 4 sustituciones distintas Configuraciones L y D L aminocidos propios de mamiferos

Proteinas Unin de aminocidos mediante diversas formas de enlace Oligopeptidos: 2 a 10 aminoacidos Polipetidos: 10 a 100 aminoacidos Protenas : mas de 100 aminoacidos Se clasifican por su forma, globulares y fibrosas Por su solubilidad, albuminas ( solubles en agua) y globulinas ( solubles en soluciones salinas) Por su composicin, simple (aminocidos), compuestas (glucoproteinas, lipoprotenas, metaloproteinas) Por su densidad: lipoprotenas (LDH,HDL,VLDL) Por su carga : a ph fisiolgico acidas y basicas

Enlaces covalentes Peptdicos y disulfuro Peptdico mas importantes de la estructura polipeptidica, mantiene la rigidez y la solidez de la protena. Entre el aplha carboxilo de un aminocido y el alfa amino de otro con eliminacin de una molecula de agua Disulfuro se genera por presencia de radicales SH de la cistena, formando uniones disulfuro entre prociones de una misma cadena y entre dos cadena, participa en la solidez de la estructura y aun permite la unin de dos polipetidos como en el caso de la insulina

Enlaces no covalentes e interacciones Son fuerzas de atraccin entre grupos de tomos, no son enlaces reales Enlace de H: atraccin entre el ncleo de H+ y el par de electrones no compartidos del otro tomo, en el caso de una protena es un oxigeno de otro aminocido Enlace hidrofobico: se genera por la semejanza estructural entre dos aminocidos Enlace ionico: entre carboxilos libres y amonios libres de aminocidos dicarboxilicos y diaminicos. Estructura proteica Estructura primaria Secuencia de aminocidos unidos por enlaces peptdicos Su carcter de doble enlace fija una estructura rigida, incapaz de girar en su mismo eje. Estructura fija coplanar (mismo plano) El movimiento se tramite a los enlaces del carbono alfa. Secuencia de aminocidos o Pasos de la secuencia son 1. Composicin de polipetidos por hidrlisis y cromatografa 2. Aminocido N terminal, con DNPB y aminocido C terminal con hidracina 3. Ruptura en pequeos fragmentos con tripsina, quimo tripsina, bromuro de ciangeno 4. Reconstruccin de la secuencia Estructura secundaria Son mantenidas por los puentes de hidrogeno de las protenas Alfa helicoidal Doble ligadura virtual del enlace peptdico limita las conformaciones de una cadena obligando al giro alrededor de un eje Puentes de hidrogeno:intracatenarios Posicin mas estable para aminocidos Esbilizacion por puentes de hidrogeno entre el H+ de un NH3y el O de un COOEstructura beta u hoja plegada Estabilizada por puentes de hidrogeno entre varias cadenas Paralela o antiparalela Estructura Terciaria Disposicin tridimensional de la cadena polipeptidica de una protena permitiendo las disposicin globular o fibrosa de la misma La mantienen todos los enlaces no covalentes y aun el enlace disulfuro Grupos hidrofilicos ocupan el exterior y grupos hidrofobicos el interior

Estructura cuaternaria Se produce en aquellas protenas que tiene dos o mas cadenas polipeptidicas, iguales o diferentes con estructura terciarias Unido nicamente por fuerzas no covalentes en las cadenas individuales Hemoglobina: dos copias de cadenas polipetidica alpha y 2 de beta Enzimas y energa de activacin Aceleran velocidad para alcanzar punto de equilibrio Energa de activacin es la necesaria para que el sustrato se eleve al estado transitorio. La velocidad de reaccin es inversamente proporcional a la magnitud de energa de activacin. Enzimas disminuyen energa de activacin. Factores que modifican actividad enzimtica Temperatura del medio Ph del medio Concentracin de la enzima Concentracin del sustrato Temperatura Por cada 10 grados la velocidad de reaccin se dobla Ph Los extremos de ph inactivan las enzimas Enzimas digestivas trabajan en ph diferente Enzimas intracelulares: 5 y 9 ph

Concentracin de la enzima y constante de equilibrio Concentracin de la enzima incrementa la velocidad de reaccin pero no modifica la constante de equilibrio Concentracin del sustrato Aumenta la concentracin del sustrato la velocidad inicial de reaccin aumenta hasta un valor mximo (v max) el que se estabiliza Valor mximo, enzima esta saturada con el sustrato Michaelis menten V=Vmax (S)/Km+(S) Km= concentracin de sustrato V max= cuando todos los sitios activos estn saturados y es proporcional a la concentracin de la enzima Baja km indica alta afinidad de enzima con el sustrato. Inhibidores competitivos Estructuras semejantes al sustrato que compiten con el por el mismo centro activo

Inhibidores no competitivos Diferentes al sustrato por lo que se unen a un sitio independiente de la enzima Sustrato e inhibidor no competitivo pueden unirse al mismo tiempo a la enzima Efecto no puede revertirse aumentando la concentracin del sustrato Inhibidores irreversibles Reaccionan covalentemente con la cadena lateral de un aminocido de la enzima, para formar un complejo estable permanente inactivado. Substratos suicidas

Degrabada 2 separata 3 CARBOHIDRATOS Mas difundido e importante para el metabolismo humano: la glucosa y dentro de los alimentos el almidn Todos se transforman en glucosa antes de ser metabolizados Dos tipos: aldosas y cetosas Unidad bsica son los monosacridos y atendiendo a la qumica naturaleza del grupo funcional carboxlico, si es aldehdo aldosa y cetonico, cetosa. Monosacridos son polialcoholes con un grupo aldehdo o cetona. Cuando se unen para forma di, oligo o poli sacridos lo hacen mediante un enlace glucosidico Vegetales: almidn y celulosa Animales: glucgeno

Ismeros Compuestos con la misma formula global pero distinta formula espacial Casi todos los monosacridos de seis carbonos tienen la formula C6H1206: glucosa frutosa, manosa y galactosa Epimeros Cuando la diferencia radica en un solo atomo de carbono se les llama epimeros (tambin son ismeros) Ejemplo: glucosa y galactosa Clasificacin de los carbohidratos De acuerdo a su complejidad: monosacridos, disacridos, oligosacridos, polisacridos. Monosacridos de acuerdo al numero de carbonos: triosas, tetrosas, pentosas, hexosas y heptosas; mas importante las hexosas De acuerdo al grupo funcional pueden ser aldehdos o cetonas Glucosa, manosa galactosa son aldosas

Frutosa es cetosa

Azucares comunes en el organismo aldehido Triosas Tetrosas Pentosas Hexosas Heptosas cetona Gliceraldehido Eritrosa Ribosa Xilosa Arabinosa Glucosa Manosa Galactosa Dihidroxicetona Eritrulosa Ribulosa Xilulosa Frutosa sedoheptulosa

Glucosa Adopta formas cclicas, en forma de anillo, semejante al pirano (heaxgonal) o al furano (pentagonal) Hemiacetales Menos del 1% de los azucares se encuentra bajo la forma de cadena abierta, siempre estn como anillos Estos anillos provienen de la reaccin de un grupo aldehdo con un alcohol Si el anillo tienen 6 carbones es un pirano si tiene 5 es un furano Es crea un nuevo carbono asimtrico se llama anomerico y da lugar a dos formas de azucares alpha y beta Reacciones qumicas de los monosacridos Si el oxigeno de un carbono anomerico de un carbohidrato no esta unido a otra estructura, esta tiene capacidad reductora Reacciones de los carbohidratos Los polisacridos no tienen poder reductor, tampoco el disacrido sacarosa. Por su enlace glucosidico pierden el poder reductor de su aldehida. Los grupos aldehdos pueden oxidarse para CHO=-COOH. Asi la glucosa se tranforma en acido gluconico y la galactosa en galactonico.

Importancia fisiolgica de las pentosas Pentosa Ribosa Ribulosa Arabinosa Xilosa Lixosa Xilulosa Hexosas Hexosa Glucosa Fructosa Galactosa Manosa Origen Frutas, cereales Frutas miel de caa Lactosa de la leche Gomas vegetales importancia Azcar del metabolismo Hgado la convierte en glucosa para su metabolismo Hgado convierte en glucosa para su metabolismo glicoproteinas Origen A. nucleicos Metabolismo Gomas de fruta Gomas de fruta Musculo cardiaco Metabolismo Importancia Estructura de los acidos nucleicos y las coenzimas Via de las pentosas Glucoproteinas Glucoproteinas Lixoflavina del musculo cardiaco Via de los acidos uronicos

Disacridos Azucars formadas por la unin de dos monosacridos mediante el enlace glucosidico. Los mas comunes son o Sacarosa: glucosa + fructosa o Lactosa: glucosa + galactosa o Maltosa: glucosa + glucosa Lactosa y maltosa tienen poder reductor Sacarosa no debido a que el enlace compromete ambos radicales reductores, el aldehdo de la glucosa y la cetona de la fructosa Oligosacridos Complejos de 3 a 12 monosacaridos y los polisacridos a los de mas de 12. Se pueden dividir : o Homopolisacaridos: polmero de un solo monosacrido. Ej almidn o Heteropolisacaridos: varios monosacridos. Ej glucosa aminoglucanos Los polisacridos los podemos encontrar en Reserva Almidon: formado por amilosa y amilopectina Glucgeno: musculo e hgado Dextrano: d glucosa , ramificaciones distintas Inulina: D fructosa

Estructurales Celulosa: polisacrido de los vegetales , no digerible Quitina: polmero de N-acetil glucosamina Lignina: alcholes aromticos Heteropolisacaridos: agar, goma, celulosa, pectina Polisacridos Almidon :esta formado por cadenas de glucosa unidas mediante enlaces glucosidicos del tipo alfa 1,4 y algunos alfa 1,6. Esta consituido por amilosa estructura helicoidal no ramificada. 80 a 85% por amilopectina que son cadenas ramificadas de glucosa unidas por enlaces 1,4 y 1,6. Glucgeno: estructura similar pero de origen animal, mas ramificada que el almidn con 12 a 14 residuos de glucosa unidos por enlaces 1,4 y ramificaciones 1,6. Celulosa: forma parte de la estructura de los vegetales y son un polmero de glucosa con enlaces beta 1,4 a diferencia del almidn que es de alfa 1,4 Inulina: polmero de fructosa que se encuentra en las races de las alcalchofas. Quitina: formada por unidades de N acetil glucosamina unida por enlaces beta glucosidicos Mucopolisacaridos o glucosaminoglucanos: contiene aminoazucares que cuando se le una a una protena se les conoce como proteoglucanos. Digestion de los carbohidratos Dos lugares la boca y la mucosa intestinal Comemos pocos monosacridos por los que se necesita endoglucosidasas y disacarasas que sirven para atacar a los poli, oligosacridos y disacridos Digestin en la boca Amilasa saliva rompe enlaces alfa 1,4 y 1,6 Se inhibe en un medio acido como el ph del estomago Componente que no se degrada: dextrina limitante No tenemos beta 1,4 glucosidasas que rompe la clulas, no podemos digerirla Amilopectina y glucgeno tienen enlaces alfa 1,6 como resultado tenemos maltosa e isomaltosa con enlaces 1,6 Digestin intestinal Enzima lactasa degrada a la lactosa en glucosa mas galactosa El almidon pasa a ser un oligosacrido por accin de una glucosidasa y se degrada mas haste llegar a glucosa La sacarosa se transforma en glucosa mas fructosa Absorcin intestinal Glucosa y galactosa van a requerir de ATP, liberacin de sodio y por una gradiente va a ingresar al intracelular y luego pasar a la sangre mediante el SGLT1.

La fructosa a travs del GLUT 5 tienen una difusin facilitada, pasa sin gasto de energa. Al consumir sacarosa va a ser cortada por una sacarasa en glucos mas fructosa, la fructosa va a pasar al hgado y va a ser tranformada por una isomerasa en glucosa, osea el 50% de la sacarosa que era fructosa pasa rpidamente. En cambia la glucosa tiene que pasar mediante un cotransporte con el sodio, facilitada por una protena GLUT 4 para la glucosa. El cerebro usa GLUT 1

Metabolismo de azucares Aminoazucares Encontrados en las glucoproteinas N acetil glucosamina y N acetil galactosamina Esqueleto carbonado fundamental lo proporciona la fructosa, el acetilo, la acetil COA. El nitrgeno lo proporicona la glutamina Sntesis de N acetil nueraminico requiere de tres carbonos mas que los da el fosfoenol piruvato. Acido glucoronico Glucosa con el carbono 6 carboxilado Formacin de la bilirrubina Sorbitol Se forma a partir de glucosa por efecto de la aldosa reductasa en presencia de NADPH. En el hgado enzima sorbitol dehidrogenasa que transforma el sorbitol en fructosa. Glicoprotenas y proteoglucanos Contienen carbohidratos y protenas unidas covalentemente 15 a 20 monosacridos Contienen carbohidratos mediante cadenas llamadas glucosamino-glucanos con varios cientos de monosacridos. Son muchos disacridos formados por N acetil glucosamina o N acetil galactosamina con un acido uronico N acetil glucosamina es importante porque forma parte de las molculas de reconocimiento propios de cada persona expresada por sus genes, estn presentes en la superficie de la clulas Grupos importante de glicoprotenas unidos por enlaces O son los grupos sanguienos. Dependen de los monosacridos unidos a protenas localizadas en el hemate. Grupo A tiene N acetil galactosamina y Grupo B tiene galactosa

Proteoglucanos Mayores componentes en el medio extracelular Colgeno, elastina Estn compuestos por glucosaminoglucanos (Aminoazucar mas acido uronico) unidos a una protena por medio de una cadena tetrasacarido. Disacaridos Ac uronico Glucoronato Glucoronato e iduronato Glucoronato e iduronato Galactosa sulfato Tejido Aminoazucar GlcNAc GalNAc-S04 GalNAc-S04 GLlcNAc-S04 GalNAc-S04 GLlcNAc-S04 Liquido sinovial Cartlago, arterias, piel hueso Piel, vasos Cartlago, disco intervertebral Superficie celular, pulmones, vasos mastocitos

Ac Hialuronico Condritin sulfato Dermatan sulfato Sulfato de keratan

Sulfato de heparan Glucoronato e iduronato Heparina Glucoronato e iduronato

Metabolismo bacteriano de los glucanos o caries dental Los glucanos son polmeros de la glucos producidos por bacterias Streptococcus mutans, microbio de la caries produce polmero de glucano llamado mutano con enlaces a 1.6 y a 1.3. El mutano se forma a partir de sacarosa en una reacion catalizada por la glucosil transferasa, extracelular Fructanos polmeros de fructosa almacenan energa para las bacterias de la placa