Vias enzimticas
Clulas sintetizam substncias essenciais passo a passo em vias bioqumicas. Cada passo catalizado por uma enzima especfica.
gene 1 gene 2 gene 3 enzima 3 citrulina arginina
gene 1
gene 2
enzyme 1
enzyme 2 ornithine
gene 1 enzima 1
gene 2 enzima 2
citrulina
gene 3 enzima 3
arginina
ornitina
Os 20 Aminocidos
Amino Acid Alanine Argenine Asparagine Aspartic Acid Cysteine Glutamic Acid Glutamine Glycine Histidine Isoleucine 3letter Ala Arg Asn Asp Cys Glu Gln Gly His Ile 1letter A R N D C E Q G H I Amino Acid Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine 31-letter letter Leu L Lys K Met M Phe F Pro P Ser S Thr T Trp W Tyr Y Val V
Todas as clulas sabem que a a seqncias de aminocidos caracterstica de cada protena em particular.
A seqncia de aminocidos de uma protena determina: 1. A forma 3-D da molcula (protenas chaperonas podem facilitar o folding) 2. A funo da molcula.
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Osilao
O terceiro nt no cdon tem pareamento relaxado resultando em flexibilidade. Ento, mais de um cdon pode ligar-se ao mesmo tRNA (cdigo degenerado). Mltiplos cdons que especificam o mesmo aa diz-se que so sinnimos.
O mRNA e a cadeia polipeptdica so colineares. O AUG prximo a extremidade 5 do mRNA codifica o Nterminal da protena.
Terminao
Carregamento do tRNA
Aminoacil-tRNA sintetase reconhece um aminocido (aa) particular e todos os tRNAs que aceitam este aa. Ela adiciona o aa a adenina terminal do tRNA usando a energia do ATP. Note que a ligao formada com o mesmo tomo de carbono que ir participar na ligao peptdica na protena.
Carregamento do tRNA uma reao de 2 etapas:
Componentes da traduo
mRNA Aminoacil tRNAs, e.g., Met-tRNAMet Ribossomos Enzimes e cofactors, e.g., fatores de iniciao, alongamento & liberao ATP (para carregar tRNA) e GTP (para iniciao, alongao e terminao)
Iniciao
Cdon de iniciao: AUG (tambm GUG, ou UUG em E. coli) tRNA iniciao (formilmetionina em E. coli)
Seqncia consenso Shine-Dalgarno so necessrias para ligao da Subunidade menor do Ribossomo na Bactria
Alongamento
3 passos: 1) o tRNA carregado entra no stio A, 2) uma ligao peptdica criada entre aa nos stios A e P, e 3) o ribossomo transloca-se (movimenta-se) para o prximo cdon
Terminao
Viso geral:
Poliribossomos
O Cdigo Gentico