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Universidad Nacional Autnoma de Nicaragua Facultad de Ciencias Mdicas Len

Escuela de Postgrado en Epidemiologa y Salud

Desarrollando las habilidades para el anlisis de datos estadstico en Epidemiologa

Dr. Juan R. Almendrez P. 23/03/2006.

Introduccin
El programa Epi-Info en su versin 3.3.2 para Windows es la configuracin de un conjunto de programas que ha desarrollado el Centro para el Control de las Enfermedades (CDC) de Atlanta, Estados Unidos y la Oficina de la Organizacin Mundial de la Salud en Geneva, Suiza. Igual que otros programas estadsticos trata de facilitar el anlisis de los datos producidos por la investigacin y la vigilancia epidemiolgica, pero se diferencia en que a pesar de que es considerado una potente herramienta, su distribucin es gratuita. Vamos a utilizar este programa para desarrollar un ejercicio de entrenamiento en estadstica, mediante un proceso de aprendizaje activo. Esperando que este esfuerzo sea de mucha utilidad en su aprendizaje, Dr. Juan Almendrez
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Objetivos
1. Disear un cuestionario en Crear Vistas
2. Introducir datos al cuestionario en Grabar datos 3. Procesar los datos en Analizar datos Diapositiva 24

4. Desarrollar diferentes anlisis estadsticos

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Presentacin
Estamos contando con informacin proporcionada por una base de datos de la Encuesta Nacional de Salud Sexual y Reproductiva realizada en el ao 2,000 en Nicaragua. En ese momento se realizaron 13060 encuestas a nivel nacional mediante un muestreo mediante procedimientos probabilsticos estratificados y multietpico (Estratificacin por regiones geogrficas, por departamento, por municipios, por lugar de residencia). De esa base de datos se han seleccionado solamente algunas variables, todas ellas definidas o codificadas en valores numricos: Edad, escolaridad, aos de estudio, procedencia, lugar de residencia, la presencia de recursos en el hogar como radio, telfono, televisor, refrigeradora, bicicleta, moto y vehculo a motor; adems de informacin sobre el acceso a la informacin, datos reproductivos, el conocimiento y uso de los mtodos de planificacin familiar. Los pasos para el anlisis se definen de la siguiente manera: Conocer los datos, para ello se deben revisar el cuestionario y en anlisis realizar frecuencias simples de todas las variables, procesamiento o manipulacin de las variables y anlisis propiamente dicho.
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Permite disear una base de datos o ver y modificar una ya existente.

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Este botn permite disear el cuestionario donde se van a introducir los datos

Si hacemos Click en este botn .

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Este es el men

Importante! Ponga atencin.

Aparecer esta nueva pgina de trabajo.

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Si va a abrir un archivo ya existente como en nuestro caso, Marque aqu.

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aqu

Podemos cambiar la direccin marcando aqu

Al seleccionar Abrir el programa nos muestra esta ventana por defecto. O sea que busca en el disco C en la carpeta Epi-Info.

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Si marcamos aqu

As podemos buscar nuestros archivos por el Sistema

Aparece esta ventana

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Es bueno revisarla para saber qu significan los nmeros que aparecen en los datos

Y, hay otras pginas ms

Al seleccionar el archivo Ejercicio nos pregunta por el nombre de la vista. En nuestro caso se llama Endesa. Al seleccionarlo aparece esta pgina.
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Si vamos a crear un archivo nuevo, Marque aqu

Seleccionar la opcin Nuevo para hacer un cuestionario.

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Encuesta

El programa le pedir que le ponga un nombre al archivo que va a crear y despus oprime en el botn Abrir del lado derecho del nombre que ha escrito.
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Datos

El programa le pedir que le ponga un nombre a la Vista o base de datos especfica. El programa Epi-Info tiene como plataforma al programa de Office Access. En este programa se pueden hacer varias bases de datos relacionadas. En un archivo de Epi-Info se pueden hacer varias bases de datos relacionadas tambin. Despus aprima Aceptar
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El programa muestra una pgina de trabajo y la especificacin Haga Click en el ratn derecho para crear un campo.

Recuerde el ratn tiene dos teclas una izquierda con el que se ejecutan las ordenes y uno derecho que genera opciones. Para crear campos se oprime la tecla derecha.

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Aqu se escribe la pregunta.


Se puede modificar la fuente de la pregunta Se define el tipo de variable El programa define un nombre para la variable, se puede modificar al inicio

Se define el nmero de caracteres de la variable

Al presionar la tecla derecha del ratn aparece esta ventana.

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Aqu se escribe la pregunta.

Se establecen algunos criterios

Otras

Al final se oprime opciones. en Aceptar

Se pueden crear valores legales

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Aqu se ingresa para introducir los datos en el cuestionario diseado en Crear Vistas

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Una vez que se ingresa a Grabar datos se abre en el men la opcin Archivos y se selecciona la opcin Abrir.

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Igual que en hacer vista nos aparece las opciones de archivos en la carpeta de Epi-Info. Si el archivo esta en otra carpeta se busca siguiendo las opciones.
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Nmero de pginas

Nmero de registro

Aparece la encuesta diseada en vistas pero listo a introducir datos. Se procede a introducir los datos segn informacin de las encuestas o registros de informacin.
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Procesar y analizar los datos almacenado

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Caractersticas de anlisis
El programa est conformado por tres pantallas:
Pantalla de comandos: Se encuentran definidas todas las rdenes que el programa puede ejecutar. Pantalla de Salida: Se registran los resultados de las rdenes que se definan. Pantalla de rdenes: Se registran las ordenes que se definieron. Si se graba puede ser un programa ejecutable siempre en anlisis.
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Pantalla de Comandos o de listado de rdenes

Pantalla de salida de resultados

Pantalla de rdenes
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Se inicia toda sesin abriendo o leyendo una base de datos. Para ello haga click en Abrir (Leer)/Importar

Pantalla de salida

Pantalla de rdenes

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Aparece esta pantalla. Ella te permite buscar tu archivo de trabajo. Vamos a trabajar con el archivo Ejercicio. Est en esta versin del Epi-Info.

Hacer Click Aqu para buscar el archivo

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Eso te lleva al men de bsqueda. Puede elegir donde buscar tu archivo. Posiblemente tu archivo est en un CD. Hay que buscarlo.

Modifica la direccin de tu archivo haciendo Click en Mi PC

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Una vez que has abierto tu archivo el programa te da alguna informacin importante:
Te dice del nombre de tu archivo y la direccin que tiene en tu PC Te dice del nmero de registros que has ingresado o que tiene Te muestra la orden que ejecutaste para que apareciera lo que hiciste.

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Orden ejecutada

Informacin sobre la base de datos

Orden ejecutada
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Ya podemos comenzar a trabajar !


Conocer los datos.
Corregir los datos Procesar o manipular los datos. Realizar el anlisis.
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Conocer los datos es saber que datos se han introducido en las variables del estudio. Saber si estn completos los datos en cada una de las variables.

Si faltan datos, conocer si es razonable que falten datos o si es necesario investigar para complementar los datos. Detectar errores en la introduccin de los datos.
Corregir los datos errados para su posterior utilizacin (Limpieza de la base de datos).
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Podemos iniciar calculando frecuencia a todas sus variables para conocer la informacin que tiene y como se distribuyen los datos

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Una vez que oprimiste la orden Frecuencia aparece una ventana donde se encuentra el listado de variables. Se alcanza presionando la pestaa en Frecuencia de:. Posteriormente se oprime el botn Aceptar. Si oprimes el asterisco * el programa calcular la frecuencia de todas las variables. As podrs ver como estn los datos introducidos en el programa.
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Si establecimos calcular la frecuencia de todo. EL Programa nos da primero un listado de los resultados por cada variable: Si presionamos una de las variables el programa nos enva a ver el resultado de esa frecuencia en esa variable.

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Cada nmero tiene un significado, revisar en vistas los significados.

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Tambin podemos hacer grficos para comprender mejor la distribucin de los datos

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Al marcar grfico nos aparece esta ventana y elegimos el tipo de grfico, las variables que queremos graficar, su ttulo.

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Este es un ejemplo de grfico: Tipo de grfico: Histograma. Variable: Edad:

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Corregir datos
Algunas veces los datos no concuerdan porque durante la recoleccin o la digitacin de los datos en el programa ENTER se cometieron errores. Se pueden hacer correcciones en la base de datos desde ANALISIS con la orden: Listar

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Seleccionar las variables a corregir

Permitir actualizaciones Ejecutar listar

Y aceptar

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Este es el nmero de registro o nmero de la ficha

Al finalizar las correcciones se cierra esta ventana

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En la base de datos Ejercicio de la Vista Endesa:


Todos los datos son numricos. Muchos tienen ms de dos categoras Unos como la edad son realmente numrico, pero se debera agrupar. Otros datos son categricos, pero estn codificados en varias opciones numricas.

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Una condicin para calcular Riesgo Relativo u Odds Ratio es agrupar la exposicin y el efecto en dos categoras cada una a = Personas con el efecto
E X P O S I C I n

Efecto

Si Si a

No b

Total a+b

No
Total

c
a+c

d
b+d

c+d
N
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y expuestas. b = Personas sin el efecto pero expuestas. c = Personas con el efecto pero no expuestas. d = Personas sin el efecto y no expuestas. a+b = Todos los expuestos. c+d = Todos los no expuestos A+c = Todos los que tienen el efecto. B+d = Todos los que no tienen el efecto

Puede que sea necesario agrupar TODAS O ALGUNAS de las variables en dos categoras o escalas:
Exposicin: Si/No Efecto: Si/No

Entonces, hay que manipular las variables.


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Procesar o manipular variables


Se requieren dos pasos:
Definir una variable nueva, con su propio nombre pero de nombre parecido a la variable que ya existe: Si vamos a procesar la variable EDAD; el nombre de la variable a crear podra ser: EXAD2. El segundo paso es a partir de los datos existentes en la variable existente (EDAD), agregar datos recodificados en la variable nueva (EDAD2).
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Al presionar: DEFINIR

Aparece esta ventana

Aqu agregamos el nombre de la nueva variable: EDAD2.

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Si presionamos en recodificar

Aparece esta ventana

Aqu ponemos el nombre de la variable destino: EDAD2

Aqu ponemos el nombre de la variable inicial: EDAD

Aqu establecemos los valores de las escalas.

Aqu ponemos el valor en la nueva variable

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Comprobacin
Una vez que hemos realizado el procedimiento de recodificacin se procede a comprobar si el procedimiento fue el correcto. Para ello:
Se saca frecuencia de la variable Edad2 Se compara que exista igual nmero de registros que en la variable EDAD.

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Los datos concuerdan

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Ya tenemos una variable de exposicin: Edad organizada en dos grupos:


Expuestas= Adolescentes; No expuestas= Adultas.

Nos falta definir la variable efecto. En esta base de datos hay una variable que se llama: USAMETOD Que significa si usa algn mtodo anticonceptivo. El programa tiene 4 opciones:
0=No usa; 1=Usa mtodo folklrico; 2=Usa mtodo tradicional y 3=Usa mtodo moderno.

Debemos agrupar esta variable en dos categoras: Usa/No usa.


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Creamos una nueva variable: Planifica

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Recodificamos la nueva variable: Planifica en dos categoras: USA/NO USA, a partir de las 4 opciones de la vieja variable: USAMETOD que tena 4 categoras.
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Ahora podemos hacer un anlisis bivariado o cruce de variables mediante la tabla 2X2. y usar la estadstica que genera este tipo de anlisis.

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Es importante que la variable exposicin y la variable resultados est bien definida en cada una de sus ventanas correspondientes.
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Vemos la distribucin absoluta y relativa en porcentajes que puede ser interpretada como tasas de prevalencia.
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Vemos el resultado del anlisis simple de la tabla. Con su Odds Ratio y su intervalo de confianza. Adems de otras estadsticas.
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En este caso al cruzar la edad en dos categoras:


Adolescentes Adultas,

Contra: planificacin en sus dos categoras:


No usa Usa

Encontramos que las adolescentes tienen 11 veces ms probabilidades de no planificar que las mujeres adultas. (Dato tomado del OR=11) Y la asociacin se dice significativa porque el intervalo de confianza no contiene al 1

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Cuidado!
Recordemos que de todas las mujeres encuestadas algunas (667) estaban ya embarazadas por lo tanto no es correcto que se tomen en cuenta en este anlisis. Sera un error.

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Marcamos Seleccionar

Y definimos que a la variable Embarazada tomar en cuenta la opcin 0 que son las que no estn embarazadas y deberan planificar. La embarazada no debera planificar.

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El programa solo va a tomar en cuenta 12393 mujeres no las 13060 que inicialmente estaban, porque una parte estaba embarazada al momento de aplicar la encuesta.

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Los resultados han cambiado, han cambiado poco pero han cambiado. El OR no es de 11 es de 12.2 y siempre es estadsticamente significativa porque el intervalo de confianza no contiene elJRAP 1.

Otros anlisis
Podemos hacer otros como regresin lineal y regresin logstica. El programa tiene esa opcin. Para la primera podemos cruzar la variable edad con la variable hijos. (Ambas son cuantitativas, condicin para este tipo de anlisis).
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Nos da un coeficiente de regresin de 0.35 que nos indica una pequea asociacin a incrementar el nmero de hijos cuando aumenta la edad.
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Graficada esta asociacin se mirara as: Con una tendencia a aumentar el nmero de hijos a medida que aumenta la edad.

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Para hacer una regresin logstica y tomar en cuenta el peso de varias variables en el efecto de otra. En este caso el uso de mtodos anticonceptivos. Se selecciona regresin logstica y se seleccionan las variables en sus respectivas casillas: Resultados y Otras variables.
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Encontramos como peso el odds ratio de cada una de las variables. Siendo las variables de mayor peso en la causa del no uso de mtodos anticonceptivos el no conocimiento de los mtodos y el menor nmero de hijos JRAP vivos.

A practicar
Bueno ahora solo les toca practicar e innovar las ideas para usar el programa como una herramienta poderosa para la estadstica, la investigacin y la vigilancia epidemiolgica.

Saludos
Dr. Juan Almendrez juralpe@gmail.com

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