1 Bachillerato Prof.

Luisa Olivera Estimados Estudiantes: A continuacin propongo algunas pautas a seguir para la realizacin del tra a!o de clase: RECUERDEN QUE EN LA PGINA ENCONTRARAN LECTURA DE APOYO "onceptos centrales #ue de er$ de emplear el estudiante en su e%posicin: 1. (. *. ,. .. /. 0. 2. 3. &ogma central de la iolog'a )en +'ntesis de prote'nas -ranscripcin -raduccin Elongacin 1aduracin de las prote'nas Polirri osomas Polip4ptido

15. Estructura cuaternaria 11. Plegamiento 1(. E%ones e intrones

Los procesos #ue de er$n e%plicarse con el modelo son:

1.

La formacin del A67 mensa!ero proceso conocido como transcripcin.

(. La salida del A67 mensa!ero del n8cleo9 hacia el ri osoma o hacia el comple!o de poli:ri osomas9 para #ue se lleve a ca o la traduccin de la s'ntesis de prote'nas. *. -raduccin del mensa!e por el 67A de transferencia9 elongacin ; terminacin. Por 8ltimo salida de p4ptido del ri osoma.

Estructuras celulares involucradas en la s'ntesis de prote'nas ; #ue se re#uieren para la actividad.

Evaluacin

Para evaluar esta actividad se sugiere el uso de la siguiente lista de cotejo, as como rubricas siguientes:
Elementos a evaluar La ela oracin de los modelos did$ctico necesarios El estudiante particip en la ela oracin de los modelos El material empleado resiste a la e%plicacin Los modelos son lo suficientemente grandes para ser vistos por todo el grupo Los modelos did$cticos no presentan errores estructurales Lista e cote!o +i 7o +i 7o +i 7o 0 7inguno error visi le 7o m$s de tres errores 1$s de tres errores Los modelos E%celentemente did$cticos son empleados Bien correctamente en la e%plicacin de la s'ntesis de prote'nas 6egular 1al 0 1.:&ogma central de <tiliz la iolog'a correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto <so correctos de (.:)en los conceptos centrales <tiliz correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto *.:+'ntesis prote'nas de <tiliz correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto ,.:-ranscripcin <tiliz 2.5 2.5 1.5 0 2.5 1.5 0 2.5 1.5 0 6 4 2 6 4 0 2 0 2 0 Ru"rica 4 0 Cali#icacin asi$na a

correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto ..:-raduccin <tiliz correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto /.:Elongacin <tiliz correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto 2.:Poli:ri osomas <tiliz correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto 3.:Polip4ptido <tiliz correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto

1.5 0

2.5 1.5 0

2.5 1.5 0

2.5 1.5 0

2.5 1.5 0

2.5 1*.:E%ones intrones e <tiliz correctamente el concepto <tiliz el concepto 7o utiliz el concepto 2.5 La formacin del E%plica A67 mensa!ero correctamente el proceso conocido proceso como transcripcin. Presenta algunos errores en la e%plicacin del proceso 7o e%plica correctamente el proceso 2.5 La salida del A67 E%plica mensa!ero del correctamente el n8cleo9 hacia el proceso 1.5 0 1.5 0 1.5 0

ri osoma o hacia el comple!o de poliri osomas9 para #ue se lleve a ca o la traduccin de la s'ntesis de prote'nas.

Presenta algunos errores en la e%plicacin del proceso 7o e%plica correctamente el proceso 10

-raduccin del mensa!e por el 67A de transferencia9 elongacin ; terminacin. Por 8ltimo salida de p4ptido del ri osoma.

E%plica correctamente el proceso Presenta algunos errores en la e%plicacin del proceso 7o e%plica correctamente el proceso

8 0

10 8 0

10 Procesos involucrados en la s'ntesis de prote'nas 8 0

La siguiente actividad esta diseada para promover la comprensin de algunos conceptos y procesos relacionados con el tema de sntesis de protenas. metodologia: Los estudiantes se integrarn en grupos de 4, utilizando la tcnica de aprendizaje cooperativo, en donde se repartir una lectura diferente por equipo. cada integrante del equipo se le asignar un n!mero del " al 4 y tam#in la distri#ucin de roles para optimizar el tra#ajo. $e sugiere formar % equipos, de 4 integrantes. &l tiempo para 'acer el anlisis de la lectura sera de "( minutos. )osteriormente los alumnos de manera individual ela#orarn un resumen que contenga las ideas principales, una vez terminado el resumen los estudiantes se integrarn en nuevos equipos de acuerdo al n!mero previamente asignado. *omo producto final los estudiantes ela#orarn un mapa conceptual integrando la informacin de toda la lectura en rompeca#ezas.

Lectura 1 La interpretacin del cdigo.

+espus del descu#rimiento de la estructura del +, , se desconoca el papel que desempea#a el -, , aunque se pensa#a que poda ser un intermediario entre el +, y las protenas. .ue el eminente fsico ruso /eorge /amo0, quien se interes en la relacin que podra e1istir entre el +, y las protenas. /amo0 supuso que tripletes de #ases servan para especificar ciertos aminocidos. &n la dcada de "2(3, )aul 4amecni5 que tra#aja#an en el 6ospital /eneral de 7assac'ussets de 8oston, tra#ajando con 'gado de rata, 'izo el importante 'allazgo de que las protenas se sintetiza#an en los ri#osomas9 posteriormente, junto con su colega 7a'lon 6oagland descu#ri que los aminocidos, antes de unirse en los ri#osomas, esta#an unidos a pequeas molculas de -, . &sto concorda#a con la 'iptesis de *ric5 de que de#a e1istir un :adaptador; <llamado -, de transferencia=, que llevara los aminocidos al sitio donde se sintetiza#an las protenas. )ara cada aminocido de#a e1istir una molcula adaptadora.)osteriormente, en "2%3 se descu#ri el -, mensajero, que permito la ela#oracin del modelo de sntesis de protenas> el -, mensajero con la informacin procedente del +, llega#a a los ri#osomas donde era :decodificado;. Los -, de trasferencia, cada uno con su aminocido especifico, se unan al -, mensajero, lo que asegura#a que el pptidos tuviera un orden adecuado antes de formar los enlaces peptdicos.$in em#argo, a!n falta#a determinar las reglas del cdigo que permitiera la traduccin de una secuencia de -, en una secuencia de aminocidos. La pregunta #sica era cual de los ?3 aminocidos se incorporara a la cadena peptdica, si solo e1isten cuatro #ases en el +, . )ara ?3 aminocidos 'aran falta por lo menos tres #ases, aunque con estas, la cantidad de com#inaciones seria de %4, lo que implicara que un aminocido podra estar representado por mas de un triplete. .inalmente *ric5 y $ydney 8renner, demostraron que los tripletes eran la #ase del cdigo gentico. 7ediante e1perimentos con sustancias mutgenas, pudieron insertar o eliminar #ases de una secuencia de +, , lo que provoca#a en la protena un cam#io de estructura. )ero, las inserciones y deleciones no tenan el mismo efecto si las #ases eliminadas o insertadas eran una o dos, lo que origina#a un cam#io que altera#a el orden de todos los aminocidos del pptido. $in em#argo, tres deleciones o inserciones no producan las mismas pertur#aciones en el orden de los aminocidos9 solamente elimina#an o agrega#an un aminocido a la cadena de pptidos. &sto 'izo que *ric5 emitiera la 'iptesis de que el cdigo gentico de#a ser un cdigo de tripletes. &n "2%", la #ioqumica francesa 7arianne /run#erg 7anago descu#ri una enzima que poda producir segmentos de -, como @ o ///////@ 7ars'al ,iren#erg y su colega 6einric' 7att'aei, utilizaron este 'allazgo para sintetizar un -, formado !nicamente por uracilo o poliAB que al ponerse en contacto con ri#osomas in Citro, empez a formar una cadena compuesta solo por el aminocido fenilanina. $e 'a#a descu#ierto que el triplete del cdigo gentico que codifica#an para la fenilanina tenia que ser BBB. &n los aos siguientes se 'icieron numerosos e1perimentos para descifrar los otros %D tripletes. 7uc'os de los e1perimento fueron 'ec'os por /o#ind E'orana, de la Bniversidad de Fisconsin y, para "2%% se esta#leci finalmente el papel que juga#an cada uno de los %4 tripletes del cdigo gentico. ,iren#erg, y E'orana reci#ieron en "2%G el )remio ,o#el de .isiologa y 7edicina.

Lectura 2 El dogma central de la biologa molecular.

&l modelo de Fatson y *ric5 tuvo un gran impacto en el desarrollo de la #iologa molecular al sealar que la informacin gentica esta#a contenida en la secuencia de las #ases nitrogenadas. &l flujo de informacin gentica que liga la informacin contenida en el +, , el paso a la molcula intermediaria o -, y la formacin de una protena a partir de esa informacin, fueron descritos como el dogma central de la #iologa molecular. +e acuerdo con el, e1isten tres flujos de la informacin gentica de una molcula de +, a otra, durante el procesos de replicacin que se efect!a en la fase $ del ciclo celular, lo que garantiza su permanencia a travs de las generaciones. &l segundo se efect!a cuando el +, que forma directamente protenas, se sirve de una molcula de -, como intermediario. La molcula de -, mensajero se forma en respuesta a una determinada secuencia de +, 9 el proceso se denomina transcripcin y se efect!a en el n!cleo de los eucariontes. Las molculas de -, mensajero sern usadas por los ri#osomas como moldes para dirigir la sntesis de protenas durante el proceso de traduccin, que constituye el tercer camino que sigue la informacin gentica. estas tres vas de flujo de informacin se 'an agregado otras> el descu#rimiento de los retrovirus que tienen su informacin gentica codificada en -, y que poseen una enzima denominada retrotranscriptasa, transfieren la informacin del -, a +, durante el ciclo infectivo para despus seguir los caminos regulares de flujo, cuando el +, viral se incorpore al genoma de la clula 'usped9 adems el -, de estos virus se replica para formar nuevas molculas de -, que pasarn a las nuevas partculas virales. )or otro lado, se integran en el dogma los genes para la sntesis de -, ri#osmico y -, de transferencia y los flujos de informacin que llevan a ca#o en la mitocondria y en el cloroplasto.

Lectura 3 Los genes en las clulas y en los cromosomas.

La molcula de +, presenta tres niveles estructurales> la estructura primaria que se refiere a la secuencia de nucletidos9 la estructura secundaria o do#le 'lice y la estructura terciaria representada por un enrollamiento posterior que permite que una enorme molcula pueda ser empaquetada por ca#er en el pequeo espacio de una clula procariota <4%3 millones de #ases en al caso de & coli= o en el n!cleo de los organismos eucariontes como los seres 'umanos, con los %433 millones de pares de #ases que se 'allan en una clula diploide. &l material gentico de las #acterias o nucleoide, se encuentran dispersos en el citoplasma formando grupos de +, , perfectamente visi#les #ajo el microscopio electrnico. &n la interfase del ciclo celular de las clulas eucariontes, el +, y sus protenas asociadas reci#en el nom#re de cromtina, que ocupa casi todo el espacio nuclear, pero en territorios #ien definidos. Los cromosomas propiamente dic'os solo se 'allan en la mitosis, especialmente en la metafase, cuando la cromatina se encuentra ms condensada. La cromatina en su estructura ms simple est constituida por la 'lice de +, 9 en un segundo nivel, la do#le 'lice y las protenas 'istonas, forman unidades denominadas nucleosomas. *ada nucleosoma est constituido por dos vueltas de +, alrededor de un octmero de 'istonas y una 'istona adicional que mantiene la estructura en su sitio. Hodo el conjunto <+, y protenas= tiene que aspecto de un collar de cuentas. Bn tercer nivel de complejidad se presenta al plegarse :el collar de cuentas; de manera apretada alrededor de un eje imaginario9 en el siguiente nivel, el solenoide formado de esta manera, se pliega nuevamente y cada plegamiento se ancla en un andamiaje nuclear constituido por fi#rillas de protena. &ste nivel es el que se presenta com!nmente en el n!cleo en interfase. *uando el n!cleo se divide, la cromatina se condensa a!n ms para constituir el cromosoma metafsico que es el que se aprecia con el microscopio de luz. La compactacin de la cromatina cam#ia constantemente adaptndose a los periodos de replicacin y transcripcin9 durante estos periodos, la cromatina tiene que volverse la1a para permitir la entrada de los complejos enzimticos de la +, polimerasa y la -, polimerasa. +e 'ec'o, ciertas zonas de la cromatina permanecen muy condensadas durante la interfase y se caracterizan por estar formadas por repeticiones de pocas secuencias que no se transcri#en. Los cromosomas metafsicos estn formados por dos cromtidas e1actamente iguales, pues pasaron antes por la fase $ del ciclo celular, en la que el +, se duplic. Las dos cromtidas se encuentran unidas por una constricin llamada centrmero que tiene una posicin definida en cada uno de los cromosomas. Los centrmeros son esenciales para que se efect!e la mitosis, pues, al final de la profase se agregan en este sitio protenas que forman el cinetocoro al cual se fijan los microt!#ulos del 'uso mittico.

Los telmeros constituyen otra parte fundamental del cromosoma9 se encuentran en la parte terminal de los cromosomas y tienen como funcin primordial el mantenimiento de la estructura9 si los telmeros estn ausentes, los e1tremos de los cromosomas tienden a fusionarse9 adems son importantes porque participan en la formacin de la estructura tridimensional de n!cleo y en el apareamiento de los cromosomas. &l +, de la regin telomrica de los cromosomas 'umanos consta de cientos de repeticiones del motivo (; HH ///D.

Lectura 4 Los genes en las clulas y los cromosomas.

Hodos los cromosomas de un organismo se pueden representar por medio de un cariotipo que ordena los cromosomas por su tamao, por la posicin de los centrmeros y por el #andeo o#tenido por ciertas tinciones> por ejemplo, los cromosomas teidos con el colorante /ienmsa despliegan estriaciones denominadas #andas / que permiten identificarlos y analizarlos, para reconocer cualquier tipo de alteracin como translocaciones o delecciones. &n la actualidad adems del anlisis de las fotografas de los cromosomas, se usa la computadora para 'acer un anlisis ms acucioso y la :pintura; de cromosomas con colorante fluorescentes. &l termino genoma descri#e el total de la informacin gentica que se encuentra en una especie y en cada una de sus clulas, en realidad el genoma comprende el +, del n!cleo y el de la mitocondria <y el del cloroplasto en el caso de plantas y otros grupos que presentan este organelo=. &l proyecto /enoma 6umano fue conce#ido para determinar la secuencia de los nucletidos que constituyen el +, de n!cleo pues la secuencia del +, mitocondria ya se conoca. +esde la mitad de la dcada de "2I3, se iniciaron los tra#ajos para secuencia tramos de +, , tra#ajo cuya primera fase termin en ?33", con pu#licacin de la primera versin de la secuencia en las revistas cientficas Nature y Science. &l anlisis de la secuencia parcial <apro1imadamente ? %33 millones de #ases=, revelo la composicin del genoma 'umano9 solo una pequea parte se transcri#e a -, mensajero9 el resto del +, est formado por intrones y fragmentos de genes, pseudogenes que son copias no funcionales de algunos genes9 secuencias moderada y altamente repetidas9 microsatlites y transposones <$ecuencias capaces de insertar en un nuevo sitio dentro del genoma=. +e acuerdo con lo anterior, !nicamente una pequea parte del +, de los eucariontes sigue el esquema del dogma central, al transcri#ir su informacin para formar protenas. dems, de acuerdo con las necesidades de cada celula particular solo algunas regiones del genoma, separadas por largos tramos de +, , no codificante, se comportan como unidades de transcripcin. &stas unidades o genes se encuentran dispersos en el +, de una manera irregular. La presencia de grandes espacios que se encuentran entres las regiones codificantes de los genes, impiden que el -, mensajero se forme directamente9 las enzimas que participan en el copiado de la informacin sintetizan una primera versin de -, que copia todo el tramo de +, , las regiones codificantes y las no codificantes <transcrito primario=, el cual se modifica posteriormente al eliminar las regiones no codificantes del transcrito primario.

Lectura 5 Transcripcin.
*omo se menciono anteriormente, a diferencia de los genes de los procariontes, los genes de los eucariontes no se corresponden directamente con el -, mensajero, de#ido a que entre los e1ones <regiones que codifican para el pptido= se encuentran los intrones que no tienen que ver con la secuencia de los aminocidos. La estructura tpica de un gen de eucariontes con tres e1ones consiste de> Bna regin promotora que es indispensa#le para que se inicie la transcripcin,. qu se encuentra la caja H H que es el sitio de unin de la enzima -, polimerasa que cataliza la polimerizacin de -, a partir de un molde de +, . $e encuentras tam#in otras regiones que intervienen en la regulacin de la transcripcin. &l e1n " presenta un sitio de inicio de la transcripcin, que es importante porque aqu se agrega un :capuc'o; de /H) metilado, que impedir la destruccin del -, . &ntre el sitio de iniciacin de la trascripcin y el sitio de inicio de la traduccin se encuentra una regin que no se traducir y que reci#e el nom#re de regin no traducida (; <(;BH-, (; untranslated regin=. &sta zona determina la velocidad de inicio de transcripcin. &l resto del e1n contiene los pares de #ases que codificarn para los primeros aminocidos del pptido. &l intrn " es seguido por el e1nD contiene los !ltimos pares de #ases que codificaran para el

resto de los aminocidos. dems este e1n presenta dos zonas importantes> el codn de terminacin que puede ser H que se convertir en B en el -, mensajero y la secuencia H , a la cual se agregar una cola de poli que tiene la misma funcin que el capuc'n inicial. &ntre el codn de terminacin y la secuencia H se encuentra la regin no traducida D;<D;BH-, D; untranslated region= La transcripcin contin!a mas all de la regin no traducida. La e1presin de los genes ocurre en dos partes> J La transcripcin genera una 'e#ra de -, mensajero idntica a la 'e#ra de +, orientada en direccin (; a D;. J $olo una de las 'e#ras de +, es transcrita a m-, . La 'e#ra que dirige la formacin de -, mensajero mediante el apareamiento de las #ases se denomina 'e#ra molde o 'e#ra antisentido y tiene una direccin de D; a (;. J La 'e#ra de +, posee la misma secuencia del m-, , aunque en lugar de uracilo tiene timina. &sta 'e#ra se denomina 'e#ra codificante y al igual que el m-, corre de (; a D; J La traduccin convierte una parte de la secuencia de m-, en una secuencia de aminocidos. La regin codificante consiste de una serie de codones, cada uno de los cuales representa un aminocido. +urante la dcada de "2%3 y "2I3, los anlisis de los genes #acterianos mostraron que e1ista una correspondencia uno a uno entre los codones del m-, y del +, . )or esta razn, el m-, que se forma#a so#re la 'e#ra codificante de +, no necesita#a ninguna modificacin posterior. $in em#argo, en el dcada de "2I3, se descu#ri que en los eucariontes no e1ista colinearidad entre el m-, y el +, . $e encontr que los genes eucariontes tenan tramos codificantes separados por tramos <en ocasiones muy largos de regiones no codificantes, por lo tanto, el procesos de transcripcin de los eucariontes de#a ser diferente del de los procariontes. l inicio del proceso, toda la secuencia del gen se transcri#e a -, . )osteriormente, los intrones se quitan y los e1ones quedan unidos. &ste proceso se denomina splicing, que es caracterstico de los genes eucariontes, aunque algunos procariontes tam#in lo tienen. &l -, sufre otras modificaciones adicionales, por ejemplo, se agrega la caperuza de metil guanosn en la regin (; y la cola del poli en la regin D;, que evita la degradacin del m-, por enzimas de tipo e1onucleasas.

Lectura

Traduccin.

&n los procariontes de#ido a la ausencia de una envoltura nuclear, la transcripcin y la traduccin ocurren smultneamente, de tal manera que conforme se va sintetizando el m-, , los ri#osomas se ad'ieren a el para efectuar la sntesis de la protena. )ero en los eucariontes, despus de que se 'a formado el m-, , ste sale del n!cleo y se dirige 'acia el citosol donde se encuentra con la su#unidad pequea y grande de los ri#osomas. Los ri#osomas constituidos por -, ri#osmico y diversas protenas, se unen a la regin (K del m-, y se mueven 'acia la regin DK traduciendo a su paso los codones del mensajero. &l proceso de traduccin consta de tres partes> iniciacin, elongacin y terminacin. +urante la primera fase se forma un complejo de iniciacin integrado por las su#unidades grande y pequea del ri#osoma que se unen en el sitio del codn de inicio del m-, 9 y por el -, de transferencia que se encuentra unido por medio de su anticodn al codn de inicio del m-, 9 este -, de transferencia lleva el aminocido metionina y se coloca en el sitio p <por la pala#ra pptidos= del ri#osoma. +espus de que se 'a integrado el complejo de iniciacin, el ri#osoma se desliza 'acia el e1tremo DK del m-, . &n cada desplazamiento, el ri#osoma se desplaza un codn permitiendo que el pptidos en crecimiento quede colocado en la posicin ), mientras que el sitio <por la pala#ra aminocido= es ocupado por un -, de transferencia cuyo anticodn de#e corresponder al codn colocado en esta posicin. *ada vez que un -, de transferencia se coloca en el sitio , su aminocido se une al pptidos situado en el sitio ), mediante un enlace peptdico que es catalizado por una molcula de -, ri#osmico

de la su#unidad grande del ri#osoma <ri#ozima=. &n seguida, el -, de transferencia del sitio ) se desprende del ri#osoma y sale de l a travs del sitio & <del ingles e1it> salida= se dirige al citosol para cargarse nuevamente con el aminocido que le corresponde. l llegar al codn de terminacin, ciertas protenas denominadas factores de terminacin se unen a este codn provocando la li#eracin del pptido. *uando lo sitios ) y del ri#osoma no tienen ya -, de transferencia, las dos su#unidades del ri#osoma se separan. La traduccin en procariontes y eucariontes se lleva a ca#o simultneamente por muc'os ri#osomas formndose una estructura llamada polirri#osoma que est formada por los ri#osomas !nicos por el m-, . *ada ri#osoma se une al e1tremo (L del m-, y se mueve 'acia la regin DL de tal modo que conforme se desplaza, el pptido que sintetiza va creciendo progresivamente.

daptado de Mimnez, Luis .elipe, et al. *onocimientos .undamentales de 8iologa Col. " )& -$N, &+B* *OP,, 71ico, ?33%, "2? pginas.

http://mx.youtube.com/watch?v=J2EDOx-EvI4&feature=relate

MODELO EN PAPEL
Objetivos. l estudiante: !onstruir" un #oli#$#tido, a #artir de una secuencia de nucle%tidos conocida, mediante el uso del c%digo gen$tico. ,traducci%n-. Procedimiento. 1. l material #ara im#rimir recortar se encuentra a.u. 2. !olorear los nucle%tidos, recortarlos ) reali/ar la siguiente secuencia de nucle%tidos de &'(, corres#ondiente a la banda i/.uierda. Pegar los nucle%tidos en una 0oja de #a#el blanco. 5122 & 3 4 3 4 3 4 ! 3 4 & & 4 3 3 3 ! 3 3 4 5 4 ! 3 3 3 & 671 7. *eali/ar el com#lemento de esta banda con los nucle%tidos de &'( .ue corres#ondan ,banda derec0a-. 4. !onstruir una banda de &*( mensajero a #artir de la #rimera banda de &'(. laborar" una mol$cula de &'( ) una de &*( mensajero. +#licar" los #rocesos de transcri#ci%n ) sntesis de #oli#$#tidos

5.

laborar los &*( de trans8erencia necesaria, con sus anticodones ) sus amino"cidos res#ectivos.

6. 9e sugiere la elaboraci%n de un ribosoma de cart%n o #a#el de colores, a 8in de e+#licar el #roceso de la sntesis de #rotenas. :. 5n ejem#lo de c%mo .ueda un 8ragmento de &'( ) &*(, ) los &*(t con sus anticodones. 8. 5nir los amino"cidos .ue se van 8ormando, mediante lneas .ue re#resenten los enlaces #e#tdicos.

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