A replicação do DNA é semiconservativa: Watson e Crick propuseram
que um dos filamentos de cada molécula filha de DNA e recém
sintetizado, enquanto o outro é passado inalterado vindo da molécula original de DNA. Esta distribuição de átomos parentais é chamada de semiconservativa. A replicação de DNA é feita por uma interação complexa e coordenada de mais de 20 proteínas: Polimerases importantes na replicação do DNA: DNA polimerase I ( eucariotos e procariotos) DNA polimerase II ( procariotos) DNA polimerase III ( procariotos) A molécula de DNA mantém sua forma circular enquanto está sendo replicada ( procarioto).A síntese do novo DNA está bem acoplada ao desenrolamento do DNA parental. Um local de desenrolamento e síntese simultânea é chamado de forquilha de replicação.Na forquilha de replicação, ambos os filamentos do DNA parental servem como moldes para a síntese do novo DNA. O sentido geral da reação para um filamento filho é 5'-3'e para o outro 3'-5'.As DNA polimerases sintetizam somente no sentido 5'-3'. Por isso uma uma significativa proporção de DNA recém sintetizado existe como pequenos fragmentos. São chamados de fragmentos de Okazaki no sentido 5'-3'. A medida que a replicação continua, estes fragmentos tornam-se covalentemente unidos pela DNA ligase para formar um dos fragmentos filhos.O filamento formado pelos fragmentos de Okazaki é chamado de filamento "laggin". Enquanto o sintezado sem interrupção é o filamento "leading".Tantos os fragmentos de Okazaki quanto os leadding são sintetizados no sentido 5'-3'. A reunião descontínua do filamento lagging possibilita a polimerização 5'-3' ao nível de nucleotídeo, originando um crescimento geral no sentido 3'-5'.A DNA polierase III se situa então na forquilha de replicação ondddde começa a síntese do filamento "leading" usando o primer re RNA formado pela primase.A helicase movida por ATP desenrola o dúplex de DNA a frente da polimerase.Até a replicação ser completada, o filamento leading é sintetizado continuamente pela DNA polimeraseIII, e só então depois de terminada é que o molde é liberado.O filamento lagging é sintetizado em fragmentos, de modo que a polimerização no sentido 5'-3'leva a um crescimento geral no sentido 3'-5'. Isto pode ser obtido por uma alça no filamento lagging.O molde do filamento lagging passaria então pelo centro de polimerase em uma subunidade de uma polimerase III dimérica no mesmo sentido que o molde do filamento leading na outra subunidade. Após cerca de 1000 nucleotídeos adicionados ao fragmento a DNA polimerase III deixa o molde de filamento lagging, assim repetidamente formando novas alças para formação de outros fragmentos de Okazaki.A DNA polimerase I preenche os espaços entre os filamentos lagging. Esta enzima também usa atividade de exonuclease 5'-3'para remover o primer de RNA que ficou a frente ddo centro de polimerase. Então a DNA ligase une os fragmentos.O lócus oriC tem 245 pb no cromossomo de E. coli . Possui 13 sequências quase idênticas em 3 blocos. Cada um começa com GATC, uma sequência que aparece 11 vezes em oriC . Esses 13 blocos são ricos em A-T, facilita a separação do dúplex para começar a síntese de DNA . A metilação da adenina em GATC pode ser importante no controle quando começa a replicação.A ligação da proteína dna A a quatro locais em oriC próximo a esses grupos de 13 inicia um intrincado processo de etapas que levam ao desenrolamento no molde de DNA e síntese de um primer ( precisa de superelicoidização negativa ) . Dna B e dna C se juntam à dna A e auxiliam na abertura da hélice. A parte desenrolada é estabilizadapor SSB (proteína). O alívio da superelicoidização positiva para que a síntese de DNA continue é fornecido pela DNA girase.A primase ( uma RNA polimerase especializada) junta-se ao pré- primer em uma montagem de mútiplas subunidades chamada primossomo. A primase sintetiza um filamento curto de RNA, que é complementar a um dos filamentos moldes de DNA.O primer de RNA é removido ao final da replicação pela atividade de exonuclease 5'-3'da DNA polimerase I.As RNA polimerases podem iniciar cadeias de novo porque não examinam o par de bases precedente. A síntese de DNA começa com um trecho de polinucleotídeos de baixa fidelidade, que é "temporário" pela adição de ribonucleotídeos a ele.