Anda di halaman 1dari 18

Jurnal RSC

Etika Profesi dan Kapita Selekta.

Dosen Drs. Edi Wahyu Sri Mulyono, MS, Apt., MT

Nadia Annisa Fajriana Nadya Mawartiani Riska Purwanti Rusydiana Abdullah Tanty Wahidin Yufi Mutia

121431017 121431018 1214310xx 121431023 121431026 1214310xx 1214310xx

PROGRAM STUDI D3-ANALIS KIMIA JURUSAN TEKNIK KIMIA POLITEKNIK NEGERI BANDUNG 2013

1.

Chemical Science

Impact factor : 8314 12 issues per year Paper : Organocatalytic CH hydroxylation with Oxone enabled by an aqueous fluoroalcohol solvent system Ashley M. Adams and J. Du Bois

Abstract : Selective hydroxylation of 3 and benzylic CH bonds is made possible using a nonmetal-based catalyst system, Oxone as the terminal oxidant, and an aqueous fluoroalcohol solvent mixture. The choice of solvent is uniquely effective for this process, but seemingly at odds with our finding that H2O promotes reduction of the oxaziridine intermediate. Our studies suggest that the hydroxylation reaction is occurring within a fluoroalcohol microdroplet, which both concentrates the reactants and mitigates the deleterious impact of H2O on oxaziridine stability. These discoveries have led to demonstrable improvements in the organocatalytic oxygenation of hydrocarbon substrates and, for the first time, the successful use of Oxone with this catalyst system. Reactions generally afford product and unreacted starting material in near quantitative amounts and display outstanding selectivity for 3 and benzylic CH bond oxidation.

Isi : Menjelaskan tentang Hidrokalbon selektif dari ikatan 3 and benzylic CH membuat menggunakan non logam berdasarkan system katalis menjadi mungkin, Oxone sebagai pangkal oksidan, dan campuran pelarut cairan fluoroalkohol . Pilihan pelarut benar benar efektif untuk proses ini, tetapi tampaknya aneh dengan kita menemukan bahwa H2O menaikkan reduksi dari oxaziridine . pembelajaran kita menyarankan bahwa reaksi hidroksilasi terjadi dalam fluoroalcohol microdroplet , dimana kedua konsentrat reaktan dan mengurangi dampak yang merusak H2O dalam stabilitas oxaziridine. Penemuan ini telah dipimpin untuk perbaikan nyata dalam oksigenasi organokatali pada substrat substrat hidrokarbon dan untuk yang pertama, kesuksesan mengggunakan oxone

dengan system katalis ini. Reaksi reaksi umum memberi produk dan tidak bereaksi mulai dari bahan yang mendekati jumlah kuantitatif dan menampilkan selektifitas yang luar biasa untukikatan oksidasi 3 and benzylic CH.

2.

Dalton Transaction

Impact factor : 3806 48 issues per year Paper : Structural rearrangements induced by acidbase reactions in metal carbonyl clusters: the case of [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 03) Iacopo Ciabatti,a Cristina Femoni,a Mattia Gaboardi,b Maria Carmela Iapalucci,a Giuliano Longoni,a Daniele Pontiroli,b Mauro Riccb and Stefano Zacchini*a

Abstract :

The new bimetallic [HCo15Pd9C3(CO)38]2 tri-carbide carbonyl cluster has been obtained from the reaction of [H2Co20Pd16C4(CO)48]4 with an excess of acid in CH2Cl2 solution. The mono-hydride di-anion can be reversibly protonated and deprotonated by means of acidbase reactions leading to closely related [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 03) clusters. The crystal structures of the three anionic and the neutral clusters have been determined as their H3Co15Pd9C3(CO)382thf, [NEt4][H2Co15Pd9C3(CO)38]0.5C6H14,

[NMe3(CH2Ph)]2[HCo15Pd9C3(CO)38]C6H14 and [NEt4]3[Co15Pd9C3(CO)38]thf salts. They are composed of a Pd9(3-CO)2 core stabilised by three Co5C(CO)12 organometallic fragments. The poly-hydride nature of these clusters has been indirectly inferred via chemical, electrochemical and magnetic measurements. Besides, cyclic voltammetry shows that the [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 13) anions are multivalent, since they undergo two or three reversible oxidations. SQUID measurements of [HCo15Pd9C3(CO)38]2 indicate that this even electron cluster is paramagnetic with two unpaired electrons, giving further support to its hydride nature. Finally, structural studies show that the Pd9 core of [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 0,1) is a tri-capped octahedron, which becomes a tri-capped trigonal prism in the more charged [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 2,3) anions. Such a significant structural rearrangement of the metal core of a large carbonyl cluster upon protonationdeprotonation reactions is unprecedented in cluster chemistry, and suggests that interstitial hydrides may have relevant stereochemical effects even in large carbonyl clusters.

Isi : Menjelaskan tentang Bimetal baru [HCo15Pd9C3(CO)38]2 gugus tiga- karbonil karbida telah diperoleh dari reaksi [H2Co20Pd16C4(CO)48]4 dengan kelebihan asam dalam larutan

CH2Cl2 .

mono-hydride

di-anion

dapat

terprotonasi

secara

reversible

dan

terdeprotonasinya oleh reaksi asam basa menyebabkan erat kaitannya gugus [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 03). Struktur Kristal dari tiga anionic dan gugus netral telah ditentukan,H3Co15Pd9C3(CO)382thf,[NEt4][H2Co15Pd9C3(CO)38]0.5C6H14,[NMe3(CH2Ph)]2[H Co15Pd9C3(CO)38]C6H14 dan [NEt4]3[Co15Pd9C3(CO)38] . Mereka tersusun dari inti stabil Pd9(3-CO)2 oleh tiga fragmen organometalik Co5C(CO)12. Polihidrid alam dari gugus gugus ini tidak langsung disimpulkan melalui kimia , elektrokimia dan pengukuran magnetic. Disamping itu voltametri siklik menunjukkan bahwa anion anion [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 13) adalah multivalent, sejak mereka menjalani dua atau tiga oksidasi reversible. Pengukuran pengukuran SQUID dari [HCo15Pd9C3(CO)38]2 mengindikasikan bahwa gugus electron ini adalah paramagnetic dengan dua electron tidank berpasangan, memberikan dukungan lebih lanjut untuk hidrid alamnya. Terakhir, mempelajari struktur menunjukkan bahwa inti Pd9 dari [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 0,1) adalah segidelapan, yang menjadi prisma segitiga lebih mengisi anion anion [H3nCo15Pd9C3(CO)38]n (n = 2,3). Seperti penataan ulang struktur yang signifikan inti logam dari gugus karbonil yang besar pada reaksi protonasi deprotonasi adalah belum pernah terjadi sebelumnya dalam gugus kimia, dan menunjukkan bahwa hidrida interstitial mungkin memiliki efek stereokimia relevan bahkan dalam gugus gugus karbonil yang besar.

3.

Chemical Communications

Impact factor : 6378 100 issues per year Paper : Zinc-mediated addition of diethyl bromomalonate to alkynes for the cascade reaction towards polysubstituted pyranones and tetracarbonyl derivatives Anne Miersch,a Klaus Harmsa and Gerhard Hilt*a

Abstract : The zinc-mediated regioselective addition reactions of diethyl bromomalonate and aromatic and aliphatic alkynes were investigated for the synthesis of vinyl malonates. When the vinyl organo-zinc intermediates were reacted with acid chlorides 2H-pyran-2ones were obtained while the application of oxalyl chloride and an amine led to tetracarbonyl derivatives in a one-pot multi-step reaction sequence.

Isi : Dalam jurnal ini menjelaskan tentang reaksi selain regioselective seng-dimediasi dietil bromomalonate dan alkuna aromatik dan alifatik juga digunakan untuk sintesis vinil malonat. Ketika vinyl organo-seng intermediet direaksikan dengan asam klorida 2Hpyran-2- yang diperoleh dari penerapan oksalil klorida dan amina yang menyebabkan turunannya tetracarbonyl dalam urutan reaksi multi-langkah satu-pot.

4.

Faraday Discussions

Impact factor : 3821 Paper : Corresponding states for mesostructure and dynamics of supercooled water

David T. Limmera and David Chandler*a

Abstract : Water famously expands upon freezing, foreshadowed by a negative coefficient of expansion of the liquid at temperatures close to its freezing temperature. These behaviors, and many others, reflect the energetic preference for local tetrahedral arrangements of water molecules and entropic effects that oppose it. Here, we provide theoretical analysis of mesoscopic implications of this competition, both equilibrium and non-equilibrium, including mediation by interfaces. With general scaling arguments bolstered by simulation results, and with reduced units that elucidate corresponding states, we derive a phase diagram for bulk and confined water and water-like materials. For water itself, the corresponding states cover the temperature range of 150 K to 300 K and the pressure range of 1 bar to 2 kbar. In this regime, there are two reversible condensed phases ice and liquid. Out of equilibrium, there is irreversible polyamorphism, i.e., more than one glass phase, reflecting dynamical arrest of coarsening ice. Temperaturetime plots are derived to characterize time scales of the different phases and explain contrasting dynamical behaviors of different water-like systems. Translated : Jurnal ini membahas mengenai air sebagai Air yang dikenal atas perluasan titik bekunya,
meramalkan dengan koefisien negatif ekspansi cairan pada suhu mendekati suhu beku . Perilaku ini dan lainnya yang dimiliki air , mencerminkan preferensi energik untuk pengaturan tetrahedral dari molekul air dan efek entropis yang menentangnya . Dengan argumen skala umum didukung oleh hasil simulasi , dan dengan unit berkurang yang menjelaskan negara-negara yang sesuai , kita memperoleh suatu diagram fase untuk curah dan air terbatas dan bahan-bahan seperti air . Untuk air sendiri , bentuk-bentuk yang sesuai mencakup rentang pada suhu 150 K sampai 300 K dan berbagai tekanan 1 bar sampai 2 kbar . sehingga dalam air memiliki dua fase terkondensasi reversibel - es dan cair. Keluar dari keseimbangan , ada polyamorphism ireversibel , yaitu , lebih

dari satu fase gelas , mencerminkan dinamika penangkapan es pengkasaran . Plot suhu - waktu diturunkan untuk mengkarakterisasi skala waktu dari fase yang berbeda dan menjelaskan kontras perilaku dinamis dari sistem air - seperti yang berbeda .

5.

Green Chemistry 6828 12 issues per day O

Impact factor :

Paper : Cu(OAc)2-catalyzed remote benzylic C(sp3)H oxyfunctionalization for C

formation directed by the hindered para-hydroxyl group with ambient air as the terminal oxidant under ligand- and additive-free conditions Jian-An Jiang,a Cheng Chen,a Jian-Gang Huang,a Hong-Wei Liu,a Song Caoa and Ya-Fei Ji*a

Abstract : A hindered para-hydroxyl group-directed remote benzylic C(sp3)H oxyfunctionalization has been developed for the straightforward transformation of 2,6-disubstituted 4cresols, 4-alkylphenols, 4-hydroxybenzyl alcohols and 4-hydroxybenzyl alkyl ethers into various aromatic carbonyl compounds. The ligand- and additive-free Cu(OAc)2-catalyzed atmospheric oxidation mediated by ethylene glycol unlocks a facile, atom-economical, and environmentally benign C O formation for the functionalization of primary and secondary benzyl groups. Due to the pharmaceutical importance of 4-

hydroxybenzaldehydes and 4-hydroxyphenones, the methodology is expected to be of significant value for both fundamental research and practical applications.

Isi : Menjelaskan tentang , yang menghambat para- gugus hidroksil diarahkan menjauhi benzilik C ( sp3 ) - H oxyfunctionalization telah dikembangkan untuk transformasi langsung dari 2,6- disubstitusi 4 - kresol , 4 - alkilfenol , alkohol 4 - hydroxybenzyl dan eter alkil 4 - hydroxybenzyl ke dalam berbagai senyawa karbonil aromatik . Ligan - dan aditif bebas Cu ( OAc ) oksidasi atmosfer 2 -katalis dimediasi oleh etilena glikol membuka sebuah lancar , atom - ekonomis , dan ramah lingkungan pembentukan CO untuk fungsionalisasi kelompok benzil primer dan sekunder . Karena pentingnya farmasi dari 4 - hydroxybenzaldehydes dan 4 - hydroxyphenones , metodologi ini diharapkan menjadi nilai yang signifikan bagi penelitian fundamental dan aplikasi praktis.

6.

Integrative Biology

Impact factor: 4321 12 issues per year

Paper : Local control of hepatic phenotype with growth factor-encoded surfaces Dipali Patel,a Amranul Haque,a Caroline N. Jones,a Nazgul Tuleouva,a Elena

Foster,a Tam Vu,a A. Hari Reddib and Alexander Revzin*a

Abstract : The goal of the present study was to modulate the phenotype expression of hepatocytes in vitroon surfaces imprinted with growth factors (GFs). Hepatocyte growth factor (HGF) or transforming-growth factor-1 (TGF-1) were mixed with collagen (I) and robotically printed onto standard glass slides to create arrays of 300 m or 500 m diameter spots. Primary rat hepatocytes were seeded on top of the arrays, forming clusters corresponding in size to the underlying protein spots. The TGF-1 spots appeared to downregulate markers of hepatic (epithelial) phenotype while upregulating expression of mesenchymal markers. Conversely, hepatocytes cultured on HGF spots maintained high level of epithelial markers. When hepatocytes were seeded onto alternating spots of HGF and TGF-1, their phenotype was found to depend on centerto-center distance between the spots. At shorter distances cross-expression of epithelial and mesenchymal markers was observed while at distances exceeding 1.25 mm divergence of phenotypes, epithelial on HGF and mesenchymal on TGF- was seen. Overall, our results demonstrate that GF-encoded surfaces can modulate phenotype within groups of cells cultured on the same surface. Given the importance of phenotype switching in development, fibrosis and cancer, this platform may be used to gain useful insights into the mechanisms of processes such as epithelial-to-mesenchymal transition or stem cell fate selections.

7.

Lab on a Chip

Impact factor :5697 24 issues per day Paper : Biosensor design based on Marangoni flow in an evaporating drop Joshua R. Trantum,a Mark L. Baglia,a Zachary E. Eagleton,a Raymond L.

Mernaughb and Frederick R. Haselton*a

Abstract : Effective point-of-care diagnostics require a biomarker detection strategy that is low-cost and simple-to-use while achieving a clinically relevant limit of detection. Here we report a biosensor that uses secondary flows arising from surface Marangoni stresses in an evaporating drop to concentrate target-mediated particle aggregates in a visually detectable spot. The spot size increases with increasing target concentration within the dynamic range of the assay. The particle deposition patterns are visually detectable and easily measured with simple optical techniques. We use optical coherence tomography to characterize the effect of cross-sectional flow fields on the motion of particles in the presence and absence of target (aggregated and non-aggregated particles, respectively). We show that choice of substrate material and the presence of salts and glycerol in solution promote the Marangoni-induced flows that are necessary to produce signal in the proposed design. These evaporation-driven flows generate signal in the assay on a

PDMS substrate but not substrates with greater thermal conductivity like indium tin oxide-coated glass. In this proof-of-concept design we use the M13K07 bacteriophage as a model target and 1 m-diameter particles surface functionalized with anti-M13 monoclonal antibodies. Using standard microscopy-based techniques to measure the final spot size, the assay has a calculated limit-of-detection of approximately 100 fM. Approximately 80% of the maximum signal is generated within 10 minutes of depositing a 1 L drop of reacted sample on PDMS enabling a relatively quick time -to-result.

Isi : Menjelaskan tentang titik efektif dalam perawatan diagnostik itu memerlukan strategi deteksi biomarker yang murah dan sederhana, digunakan sementara mencapai batas klinis yang relevan mendeteksi. Dengan melaporkan biosensor yang menggunakan arus sekunder yang timbul dari permukaan Marangoni menekankan pada penurunan penguapan untuk berkonsentrasi pada sasaran, dimediasi keseluruhan partikel di tempat visual terdeteksi. Ukuran tempat akan meningkat dengan meningkatnya konsentrasi target dalam jangkauan dinamis dari pengujian tersebut. Pola pengendapan partikel secara visual terdeteksi dan mudah diukur dengan teknik optik sederhana. Menggunakan tomografi koherensi optik untuk mengkarakterisasi efek lintas medan aliran sectional pada gerakan partikel yang dihadapan dan tidak adanya target (agregat dan non-agregat partikel, masing-masing). Menunjukkan bahwa pilihan bahan substrat dan adanya garam dan gliserol dalam larutan mempromosikan arus Marangoni yang

diinduksi diperlukan untuk menghasilkan sinyal dalam desain yang diusulkan. Pilihan bahan substrat dan adanya garam dan gliserol dalam larutan mempromosikan Marangoni - arus induksi yang diperlukan untuk menghasilkan sinyal dalam desain yang diusulkan. Dalam bukti, konsep desainnya menggunakan bakteriofag M13K07 sebagai target Model dan 1 partikel pM diameter permukaan difungsikan dengan anti - M13 antibodi monoklonal. Menggunakan teknik berbasis mikroskop standar untuk mengukur ukuran tempat terakhir, assay memiliki batas dalam deteksi dihitung sekitar 100 FM. Sekitar 80 % dari sinyal maksimum yang dihasilkan dalam waktu 10 menit menyetorkan penurunan 1 uL sampel bereaksi pada PDMS memungkinkan waktu yg dihasilkan relatif cepat .

8.

Materials Horizons 6 issues per year

Impact factor :

Review article : Taking orders from light: progress in photochromic bio-materials Junji Zhang,a Jiaxing Wanga and He Tian*a

Abtract : Photochromic materials are a family of compounds which undergo photo-reversible transformations between two different isomers with distinct physical and chemical properties. Most smart photochromic materials have been exploited in research areas such as electro-optical functional materials, while recently their applications have extended to novel bio-materials. Biological systems, such as tissue/cellular imaging, nucleotides, peptides, ion channels, etc., have emerged as a revolutionary research frontier for photochromic materials since both covalent coupling and non-covalent interactions with bio-molecules have been achieved. This review commences with a brief description of exciting progress in this field, and describes strategies for using

photochromic functional molecules from bio-sensing and cell imaging to optical manipulation of bio-macromolecules (nucleotides, peptides, ion channels, GFP, etc.). Further development of these photo-switches as well as remaining challenges are also discussed and put in prospect.

Isi : Bahan Photochromic adalah keluarga senyawa yang mengalami transformasi foto reversibel antara dua isomer berbeda dengan sifat fisik dan kimia yang berbeda . Kebanyakan bahan smart photochromic telah dimanfaatkan dalam penelitian seperti bahan fungsional elektro - optik , sementara baru-baru ini aplikasi mereka telah diperluas untuk novel bio - materials . Sistem biologi , seperti jaringan / sel pencitraan , nukleotida , peptida , saluran ion , dll , telah muncul sebagai perbatasan penelitian revolusioner untuk bahan photochromic karena keduanya kopling kovalen dan interaksi non - kovalen dengan bio - molekul telah dicapai . Ulasan ini dimulai dengan penjelasan singkat kemajuan yang menarik di bidang ini , dan menjelaskan strategi untuk menggunakan molekul fungsional photochromic dari bio -sensing dan pencitraan sel manipulasi optik bio - makromolekul ( nukleotida , peptida , saluran ion , GFP , dll ) . Pengembangan lebih lanjut dari foto switch ini serta misteri yang tersisa juga dibahas dan dimasukkan ke dalam prospek.

9.

Nanoscale

Impact factor : 6233 24 issues per year Paper : Bio-inspired formation of functional calcite/metal oxide nanoparticle composites Yi-Yeoun Kim,*a Anna S. Schenk,a Dominic Walsh,b Alexander N. Kulak,a Oscar Cespedesc and Fiona C. Meldrum*a

Abstract : Biominerals are invariably composite materials, where occlusion of organic macromolecules within single crystals can significantly modify their properties. In this article, we take inspiration from this biogenic strategy to generate composite crystals in which magnetite (Fe3O4) and zincite (ZnO) nanoparticles are embedded within a calcite single crystal host, thereby endowing it with new magnetic or optical properties. While growth of crystals in the presence of small molecules, macromolecules and particles can lead to their occlusion within the crystal host, this approach requires particles with specific surface chemistries. Overcoming this limitation, we here precipitate crystals within a nanoparticle-functionalised xyloglucan gel, where gels can also be incorporated within single crystals, according to their rigidity. This method is independent of the nanoparticle surface chemistry and as the gel maintains its overall structure when occluded within the crystal, the nanoparticles are maintained throughout the crystal, preventing, for example, their movement and accumulation at the crystal surface during crystal growth. This methodology is expected to be quite general, and could be used to endow a wide range of crystals with new functionalities.

Isi : Biominerals adalah bahan yang selalu komposit, dimana oklusi makromolekul organik dalam kristal tunggal secara signifikan dapat memodifikasi sifat-sifatnya. Pada artikel ini, diambil inspirasi dari strategi biogenik untuk menghasilkan kristal komposit dimana magnetit ( Fe3O4 ) dan zincite ( ZnO ) nanopartikel yang tertanam dalam kalsit tunggal tuan kristal, sehingga endowing dengan sifat magnetik atau optik baru. Sementara pertumbuhan kristal di hadapan molekul kecil, makromolekul dan partikel dapat menyebabkan oklusinya dalam sejumlah besar kristal, pendekatan ini membutuhkan partikel dengan permukaan kimia spesifik. Mengatasi keterbatasan ini, dengan mengendapkan kristal dalam gel xyloglucan nanopartikel - functionalised , dimana gel juga dapat dimasukkan dalam kristal tunggal, menurut kekakuannya. Metode ini tidak tergantung pada permukaan kimia nanopartikel dan sebagai gel mempertahankan struktur secara keseluruhan ketika tersumbat dalam kristal, nanopartikel

diselenggarakan diseluruh kristal, mencegah, misalnya gerakan dan akumulasi pada permukaan kristal selama pertumbuhan kristal. Metodologi ini diharapkan menjadi cukup umum, dan dapat digunakan untuk memberkati berbagai kristal dengan fungsionalitas baru.
10.

Nanoscale 24 issues per year

Impact factor : 6233

Paper : Programmed assembly of polymerDNA conjugate nanoparticles with optical readout and sequence-specific activation of biorecognition.

Abstract : Soft micellar nanoparticles can be prepared from DNA conjugates designed to assemble viabase pairing such that strands containing a polymer corona and a cholesterol tail generate controlled supramolecular architecture. Functionalization of one DNA conjugate strand with a biorecognition ligand results in shielding of the ligand when in the micelle, while encoding of the DNA sequences with overhangs allows supramolecular unpacking by addition of a complementary strand and sequence-specific unshielding of the ligand. The molecular assembly/disassembly and onoff switch of the recognition signal is visualized by FRET pair signalling, PAGE and a facile turbidimetric binding assay, allowing direct and amplified readout of nucleic acid sequence recognition.

Isi : Menjelaskan tentan perakitan diprogram konjugasi polimer nanopartikel-DNA dengan pembacaan optik dan aktivasi-urutan tertentu dari biorecognition, yang dibuat dari konjugasi DNA yang dirancang hanya untuk meyerupai, melalui perpasangan basa sehingga untai mengandung korona polimer dan ekor kolesterol dan menghasilkan arsitektur supramolekul. Fungsi dari satu DNA untai konjugat dengan hasil biorecognition

ligan dilihat dalam perisai ligan ketika di misel, sedangkan pengkodean urutan DNA memungkinkan supramolekul membuka dengan penambahan untai komplementer dan unshielding-urutan spesifik ligan. Molekul perakitan / pembukaan 'on-off' ini beralih dari sinyal pengakuan oleh pasangan fret sinyal, PAGE dan uji turbidimetri, yang memungkinkan pembacaan langsung dan juga diperkuat pengakuan urutan asam nukleat. Biorecognition disini adalah ikatan2 dalam protein Tersusun dari ikatan nonkovalen seperti ikatan ion Selain itu tersusun oleh ikatan hidrogen, ikatan hidrofobik (Mempelajari aspek interaksi antara protein-protein, protein-ligan, proten-DNA).