El concepto bsico de la sistemtica filogentica es el uso de derivados de caracteres apomorficos para reconstruir las relaciones antepasados comunes y el agrupamiento

de taxones basada en la scendencia comn. Este concepto, primero formalizado por Hennig (1950, 1966), ha sido poco a poco, y no tan en silencio, el cambio de la naturaleza de la sistemtica. Por qu deberamos estar interesados en este enfoque? Qu pasa con filogentico sistemtica es diferente de la sistemtica tradicional? La respuesta es simple: las clasificaciones que son No se sabe que son posiblemente filogentico artificial y son, por lo tanto, til slo para la identificacin y no para hacer preguntas acerca de la evolucin. Existen otras dos formas de hacer declaraciones de la relacin: sistemtica y tradicionales fentica. Mtodos sistemticos tradicionales emplean intuicin. En trminos prcticos, la intuicin es el carcter ponderacin. El cientfico estudia un grupo de organismos, selecciona el personaje (s) que se consideran importantes (es decir, conservador), y delimita las especies y grupos de especies en base a estos personajes. Los desacuerdos suelen surgir cuando varios cientficos piensan diferentes personajes importante. Es difcil evaluar la significacin evolutiva de los grupos clasificados por intuicin porque no sabemos por qu se crearon o si representan nada real en la naturaleza. Debido a que estos grupos no pueden definirse en absoluto, o pueden ser definidos por caracteres que no tienen significado evolutivo, estos grupos puede ser artificial. Fentica es un intento de idear un mtodo emprico para determinar taxonomicrelationships. En la prctica, fentica no es mejor que la sistemtica tradicional en la determinacin de relaciones, porque los distintos algoritmos se centran en lo que refleja la similitud total del organismos en cuestin. Organismos que parecen ser ms similares se agrupan juntos, haciendo caso omiso de la resultados de la evolucin paralela o convergente y otra vez la creacin de grupos posiblemente artificiales. Filogeneticistas difieren de los sistemticos tradicionales en que empleamos los mtodos empricos para reconstruir filogenias y principios estrictamente evolutivos para formar clasificaciones en lugar de depender en la intuicin o la autoridad. Nos diferenciamos de feneticistas en que nuestros mtodos tratan de encontrar la genealgico relaciones entre los taxones que estudiamos en lugar de las relaciones de similitud fenticos o general. Lo que todo esto significa es que los grupos que descubrimos se cree que son naturales o monofiltico. Dada una serie de taxones, las cuales dos estn ms estrechamente relacionados entre s que cualquiera es cualquier otra taxn? Tratamos de descubrir las relaciones antepasados comunes indirectamente a travs de la bsqueda evidencia de un ancestro comn. Esta evidencia se presenta en forma de caracteres derivados compartidos (Sinapomorfias). Por ejemplo, entre las Aves (aves), Crocodylia (caimanes y cocodrilos), y Squamata (lagartos, serpientes y anfisbenas), Aves y Crocodylia se cree que son ms estrechamente relacionados, ya que comparten una serie de sinapomorfias cree que se origin en su ancestro comn, que apareci despus de (a ms tardar) el ancestro comn de los tres taxones. Este relacin se muestra en la forma de un rbol filogentico, una reconstruccin de la genealgico relaciones. Adems, filogenetistas ver el rbol reconstruido (con frecuencia denominado un cladograma) como la clasificacin, y al expresar en un esquema jerrquico, insistimos en mantener grupos monofilticos y relaciones hermana-grupo. El descubrimiento de los grupos monofilticos es la bsqueda bsica de filogenia. El ir a la molestia de encontrar los grupos y luego tirarlos de distancia, no tiene sentido para nosotros. Desde la teora general de la evolucin gan aceptacin, los sistemticos han buscado la una historia de la evolucin de los organismos y han tratado de adaptarse a esa historia en una estructura jerrquica.

Tratamos de reflejar en nuestras clasificaciones de los grupos que encontramos en la naturaleza. Debido filogentico razonamiento delimita grupos basados en la ascendencia comn, podemos intentar reconstruir la evolucin historias y de que desarrollen un plan de clasificacin jerrquica. Grupos filogenticos son entonces reflejo del orden en la naturaleza. Por lo tanto, nuestras clasificaciones se pueden utilizar para el estudio de otra personajes y de nuevas investigaciones en biogeografa, coevolucin, evolucin molecular, las tasas de evolucin, ecologa, etc Si usted desea utilizar clasificaciones para estudiar la evolucin, que debe reflejar el genealoga de los taxa de que se trate. Los grupos que son potencialmente artificial no se pueden utilizar en tales investigaciones. Una de las mayores fortalezas del sistema filogentico es que el mtodo y los resultados son transparente, lo que significa que las decisiones, ya sea bueno o malo, se basan en datos que pueden ser examinado por cualquier y todas las personas dispuestas a comprender la naturaleza de los datos. La filogentica sistema no depende de un cierto conocimiento especial y misterioso acerca de los organismos que slo el "Experto" puede entender. Un crtico no puede afirmar que su idea de la historia filogentica de un grupo es mal slo porque l ha estudiado los grupos ms largos de lo que tiene. Por supuesto, no son vlidos desacuerdos, y no hay espacio para el cambio y la mejora. Sin embargo, estos desacuerdos son datos base, no la opinin basada. Phylogenetics, para decirlo crudamente, es una disciplina cientfica put-arriba-o-shut-up. Este libro presenta los fundamentos de la sistemtica filogentica que usamos hoy en da. Tambin citar referencias para aquellos interesados en el seguimiento de algunos de los debates actualmente en curso entre los defensores de la sistemtica filogentica. Esperamos que esta informacin le estimule y ilustrar la importancia de la sistemtica como la base de la biologa comparativa. Cuando haya terminado de este libro, usted debera ser capaz de volver a leer esta introduccin y entender lo que estamos tratando de lograr. Como una prueba de fuego, ve a leer Hennig (1966), es la forma en que se inici, y sigue siendo el clsico en el campo. Todas las nuevas ideas cientficas y los mtodos analticos vayan acompaados de un nuevo conjunto de trminos y conceptos, que puede ser perturbador para el principiante y an ms inquietante para los experimentados sistematizador que est llamado a abandonar los significados "tradicionales" de trminos y adoptar nuevas significados. La razn bsica para la adopcin de las definiciones y los conceptos presentados en este libro es doble. En primer lugar, es de vital importancia para la sistemtica y la taxonoma debe integrarse en el campo de la teora evolutiva. Mayor motivacin de Willi Hennig para la reforma sistemtica y taxonoma fue para que estn en consonancia con la revolucin darwiniana, por lo que los resultados obtenidos a travs de sistemtica filogentica directamente relacionados con estudios en otros campos de la investigacin evolutiva. En segundo lugar, es de vital importancia que los trminos utilizados en el campo emprico ser tan inequvoca como sea posible para que hiptesis son lo ms claro posible. Con estos fundamentos en mente, ofrecemos las siguientes definiciones de los trminos bsicos en nuestro campo. Ellos son en gran parte tomado de Hennig (1966) o Wiley (1980, 1981a). Otros trminos ms especializados sern introducidos en otros captulos. CONDICIONES PARA GRUPOS DE ORGANISMOS 1. Taxn -. Una especie es un grupo de organismos que se le da un nombre. El nombre es un nombre propio. La forma de muchos de estos nombres propios debe seguir las reglas establecidas en uno de los cdigos que regular el uso de los nombres. La posicin jerrquica relativa de un taxn en una clasificacin puede ser se indica en muchas maneras. En el sistema de Linneo, rango relativo se denota por el uso de las categoras. No hay que confundir el rango de un taxn con su realidad como grupo. Aves es un taxn que

incluye exactamente los mismos organismos si est clasificado como una clase, un objeto o una familia. 2. Taxn natural -. Un taxn natural es un grupo de organismos que existe en la naturaleza como resultado de la evolucin. Aunque hay muchas posibles agrupaciones de organismos, slo unas pocas agrupaciones comprenden taxones natural. En el sistema filogentico, hay dos tipos bsicos de taxones naturales: especies y grupos monofilticos. Una especie es un linaje. Se trata de un taxn que representa la unidad ms grande de taxic evolucin y se asocia con una serie de procesos de especiacin llamado. Un grupo monofiltico es un grupo de especies que incluye una especie ancestral y todos sus descendientes (Fig. 1.1a). Miembros de los grupos monofilticos comparten un conjunto de relaciones ancestro comn que no comparten con ningn otro especies colocan fuera del grupo. En otros trminos, un grupo monofiltico es una unidad de evolutiva historia. Los ejemplos incluyen Mammalia y angiospermas.

3. Clado -. Un clado es un grupo monofiltico, es decir, un taxn natural. 4. Taxn Ancestral -. Un taxn ancestral es una especie que dio lugar a por lo menos un nuevo especies hijas durante la especiacin, ya sea a travs de cladognesis o especiacin reticulada. Por cladognesis nos referimos a la especiacin que resulta en dos o ms ramas en el rbol filogentico donde slo haba una rama antes. Por especiacin reticulada nos referimos a la creacin de un nuevas especies a travs de un evento de hibridacin que implica dos especies diferentes. Una especie que surgieron de cladognesis tiene una especie ancestral, pero una especie que salen de la especiacin reticulada tiene dos especies ancestrales. En el sistema filogentico, slo las especies pueden ser taxones ancestrales. Grupos de especies estn especficamente excluidos de los ancestros a otros grupos de especies o solo especies. La razn biolgica de esta distincin es clara, hay una serie de procesos denominados especiacin que permiten una especie a dar lugar a otro (o dos especies para dar lugar a una especie de origen hbrido), pero no hay procesos conocidos que permiten un gnero o una familia para dar lugar a otros taxones que contiene dos o ms especies ("genusation" y "desfamilizacin" son biolgicamente desconocido). Por lo tanto, cada grupo monofiltico comienza como una sola especie. Esta especie es el ancestro de todos los miembros posteriores del grupo monofiltico. 5. Taxn artificial -. Un taxn artificial es uno que no se corresponde a una unidad implicada en la proceso evolutivo o a una unidad de la historia evolutiva. Usted se encontrar con dos tipos de artificial grupos. Grupos parafiltico son artificiales porque uno o ms descendientes de un antepasado son excluidos del grupo (Fig. 1.1b). Los ejemplos incluyen Dicotyledonae, Vermes, y Reptilia. Grupos polifiltico son artificiales porque el ancestro comn se coloca en otro taxn (Fig. 1.1c). Un ejemplo sera el Homeothermia, un grupo compuesto por las aves y los mamferos. Tenga en cuenta que el trmino "ancestro" se utiliza en su sentido lgico, es decir, el ancestro es desconocida, pero su inclusin o exclusin se deduce como una consecuencia lgica de la agrupacin. El contraste es importante entre los grupos monofilticos y grupos nonmonophyletic. Grupos parafiltico son tan artificiales como grupos polifiltico. Adems, no siempre es posible distinguir claramente el estado de un grupo como ya sea parafiltico o polifiltico.

6. Grado -. Un grado es un taxn artificial. Taxones de grado con frecuencia son paraphyletic y veces polifiltico, pero se supone que representan un cierto nivel de progreso evolutivo, el nivel de organizacin o nivel de adaptacin (por ejemplo, Reptilia o Vermes). 7. Endogrupal -. El grupo interno es el grupo en realidad estudiada por el investigador (Fig. 1.2a). Es decir, es el grupo de inters. 8. Grupo de la hermana -. Un grupo hermano es el taxn que se genealgicamente ms estrechamente relacionada con la endogrupo (Fig. 1.2a). El antepasado del grupo interno no puede ser su hermana porque el ancestro es un miembro del grupo. 9. Afuera -. Un grupo externo es cualquier grupo usado en un anlisis que no est incluida en el taxn en estudio. Se utiliza para los propsitos comparativos, por lo general en argumentos sobre la relacin polaridad de un par (o serie) de caracteres homlogos. El grupo externo ms importante es el grupo hermano, y una considerable investigacin filogentica puede ser necesaria para encontrar el grupo de la hermana. en general se necesita ms de un grupo afuera en un anlisis. Esto se pondr de manifiesto en el captulo 3. Examen rpido ---- Grupos Examinar la figura. 1.1 y responda lo siguiente: 1. Por qu decimos que el grupo A + B + C y el grupo M + N son monofiltico? 2. Qu taxones tendra que ser incluidos o excluidos para cambiar el grupos paraphyletic en grupos monofilticos? 3. Pueden los grupos polifiltico nunca contener grupos monofilticos dentro de ellos? 4. Dnde estn los antepasados de estos diagramas? CONDICIONES PARA LAS RELACIONES DE TAXA 1. Relacin -. En el sistema filogentico, la relacin se refiere a la genealgico o Relacin de "sangre" que existe entre padres e hijos o entre hermanos. En otra sistemas, la relacin tambin puede hacer referencia a la similitud, con la implicacin evolutiva que taxones que son ms similares entre s, estn ms estrechamente relacionados. Este significado est especficamente excluida de la sistema filogentico. 2. Genealoga y ascendencia genealgica -. Una genealoga es una representacin grfica de la descendientes de los hijos de los padres. Genealgico descenso en el nivel de taxn (es decir, entre los grupos reconocidos como taxones) se basa en la proposicin de que las especies dan lugar a especies hijas a travs una serie de mecanismos denomina especiacin. 3. Tree -. Un rbol es una estructura ramificada y, en nuestro sentido, podra contener reticulaciones as como ramas. Un rbol puede tener sus races (Fig. 1.2a) o sin raz (fig. 1.2b) y se compone de varios partes. Una rama es una lnea que une un punto de ramificacin de un taxn terminal. A punto de ramificacin, o nodo, representa un evento de especiacin. Esto es cierto incluso si los taxones une el punto de ramificacin son taxones superiores como familias o phyla, porque taxa superiores se origin como especie. Puntos de ramificacin son a veces representado por crculos. Un entrenudo es una lnea que conecta dos eventos de especiacin y representa a menos una especie ancestral.

(Decimos al menos una, ya que se hizo la declaracin en relacin con el especies y grupos que realmente conocemos. Siempre es posible encontrar una nueva especie o grupo de especies que pertenecen a esta parte de la filogenia. Para hacer esta adicin, que atravesara la Canuto y crear la posibilidad de que una especie ancestral adicionales.) El entrenudo en la parte inferior del rbol se da la raz especial plazo. El trmino intervalo es un sinnimo de entrenudo y se utiliza en el algoritmo de Wagner (vase el Captulo 4). Un barrio es una zona de un rbol con respecto a una determinada taxn o de los taxa. En la figura. 1.2b, taxn B es el vecino ms cercano de taxa A y C. Tenga en cuenta que A puede o puede no ser la hermana de un grupo monofiltico B + C. Esta relacin no puede establecerse hasta que el se especifica raz. 4. rbol filogentico -. Un rbol filogentico es una representacin grfica de la genealgico relaciones entre los taxones que estas relaciones son entendidas por un investigador particular. En otras palabras, un rbol filogentico es una hiptesis de las relaciones genealgicas sobre el nivel de taxn. Aunque es posible que un investigador para nombrar realidad antepasados y asociarlos con entrenudos especficos, la mayora de los rboles filogenticos son rboles comunes ascendencia. Adems, los rboles filogenticos son hiptesis, no hechos. Nuestras ideas sobre las relaciones entre los organismos cambian con el aumentar la comprensin. 5. Cladograma -. Cladogramas son rboles filogenticos. Ellos tienen connotaciones especficas de implcita ascendencia y un eje de tiempo relativo. Por lo tanto, un cladograma es un tipo de rbol filogentico, una rbol de ascendencia comn. En algunas modificaciones del sistema filogentico, especficamente lo que algunos han transformado denomina Cladistics, el cladograma es la unidad bsica de anlisis y es considerada fundamentalmente diferente de un rbol filogentico. En concreto, es meramente una representacin de la derivada caracteres compartidos por grupos taxonmicos sin connotacin necesaria de ascendencia comn o eje de tiempo relativo. 6. Diagrama de Venn -. Un diagrama de Venn es una representacin grfica de las relaciones entr e los taxones utilizando internested crculos y elipses. Las elipses toman el lugar de las conexiones de los entrenudos. El diagrama de Venn tpica se contrasta con un rbol filogentico en la figura. 1.3. Examen rpido ---- Relaciones Examinar la figura. 1.2a y responda lo siguiente: I. Cul es el grupo hermano del clado N? 2. Cul es el grupo hermano del clado M? 3. Cul es el grupo hermano de un grupo compuesto por M + N? 4. Dnde est el hipottico antepasado del grupo interno en el rbol? 5. Cuntos padres puede tener un grupo? 6. Dibuje un diagrama de Venn de la figura. 1.2a. TRMINOS DE CLASIFICACIONES 1. Clasificacin Natural -. Una clasificacin que contiene slo los grupos monofilticos y / o especie es una clasificacin natural. Una clasificacin natural es lgicamente consistente con las relaciones filogenticas de los organismos clasificados como son entendidos por el

investigador la construccin de la clasificacin. Eso es, el conocimiento afirma inherente a una clasificacin natural de hacer no entre en conflicto con ninguna de las afirmaciones de conocimiento inherente en el rbol filogentico. Los protocolos para la determinar si la clasificacin es lgicamente consistente con un rbol filogentico se dan en el captulo 6. 2. Clasificacin artificial -. Una clasificacin artificial es una clasificacin que contiene uno o grupos ms artificiales (es decir, uno o ms grupos parafilia o polifiltico). Una artificial clasificacin es lgicamente inconsistente con las relaciones filogenticas de los organismos como se entiende por el investigador hacer la clasificacin. Es decir, algunos de los conocimientos reclamaciones inherentes en el conflicto de clasificacin con las afirmaciones de conocimiento en el rbol filogentico. 3. Disposicin -. Un arreglo es una clasificacin de un grupo cuyo filogentico relaciones no son conocidos porque ningn investigador ha intentado nunca para reconstruir la historia de la evolucin del grupo. La gran mayora de las clasificaciones actuales son disposiciones. La disposicin particular puede llegar a ser una natural o artificial de una clasificacin. Arreglos sirven como vehculos intermedios y completamente necesario para la clasificacin de los organismos hasta las relaciones filogenticas de estos organismos pueden ser resueltos. 4. Categora -. La categora de un taxn indica su posicin con respecto a la jerarqua de la clasificacin. La jerarqua de Linneo es la jerarqua taxonmica ms comunes y sus categoras incluyen clase, orden, familia, gnero y especie. La formacin de los nombres de los taxones que ocupan ciertos lugares en la jerarqua se rigen por las normas contenidas en diversos cdigos de la nomenclatura. Por ejemplo, las especies de fauna clasificado en el nivel de la familia categora tienen nombres que terminan en-IDAE, mientras que los taxones vegetales clasificados en este nivel tienen nombres que terminan en-aceae. Es importante recordar que la clasificacin de un taxn no afecta a su situacin en el sistema filogentico. Al phylogeneticist, todos los taxones monofilticos son igualmente importantes y todos parafiltico y polifiletico taxones son igualmente engaosos.

Clasificaciones y arreglos suelen presentarse como jerarquas de nombres, con relativa posicin en la jerarqua (rank) sealado por categoras. Sin embargo, estas clasificaciones pueden ser retratadas como diagramas de rbol y, como diagramas de Venn. El uso de estos mtodos de clasificaciones es que presentan discutido en el captulo 6.