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Metabolismo dos nucleotdeos purinas e pirimidinas

Prof. Sbastien Charneau 1

Fluxo da informao gentica

Clula eucaritica

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o DNA: cido DesoxirriboNuclico

Via de informao surgiu na bioqumica moderna parr da descoberta de J. Watson e F. Crick, em 1953

Prmio Nobel de Medicina 1962

O DNA consiste de duas cadeias helicoidais de desoxirriboses, enroladas ao longo de um mesmo eixo, formando uma dupla hlice de sendo rotacional direita. suporte da informao genca hereditria
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O gene Suporte, transmisso e expresso da informao gentica (resumo) gene

replicao
xon ntron Fita molde

DNA duplicado

multiplicao celular

transcrio

aminocido pr-mRNA
maturao do RNA

tRNA
ativao dos aa

ATP

protena

mRNA

Aminoacil tRNA
traduo 4

ncleo

citoplasma

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Nucleotdeos

As subunidades dos cidos nuclicos Consiste em: - Base nitrogenada - Pentose (acar de 5 carbonos) - Fosfato (1 ou mais)

Nucleosdeo = Base nitrogenada +Pentose

As bases dos cidos nuclicos

As bases so compostas com anis que contm nitrognio

Bases Pirimidinas

Bases purinas

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Estrutura dos nucleotdeos

Fosfato

O grupo fosfato unido por uma ligao ster ao grupo 5-OH da pentose

Ligao -N-glicosdica

Pentose
Aqui um ribose e no desoxirribose

Pirimidina

Purina

Sequncia linear de nucleotdeos = uma cadeia de cido nuclico

Os nucleotdeos esto unidos por uma ligao fosfodister entre a hidroxila do carbono-3 e grupo fosfato ligado a hidroxila do carbono-5.
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cido Desoxirribonuclico (DNA)

A proximidade das bases possibilita a formao de pontes de hidrognio. A adenina com a timina formam duas pontes de hidrognio, a citosina com a guanina formam trs pontes.
H H3C H O N N H H N N N N N PENTOSE Adenina adenina

O PENTOSE Timina timina

H H H N PENTOSE Citidina citosina N N O H H H O N N N H

N N PENTOSE

Guanina guanina

A dupla hlice mantida tambm por interaes hidrofbicas, que foram as bases a se "esconderem" dentro da dupla hlice. 9

Estrutura qumica da cadeia de DNA e seus componentes os nucleotdeos

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Estrutura do DNA

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Nucleotdeos

Base nitrogenada + Pentose + Fosfato Nucleosdeo = Base nitrogenada + Pentose

Nucleosdeo

Nucleotdeo

Nucleotdeos = ribonucleosdeos e desoxirribonucleotdeos fosfato. precursores do DNA e RNA Componentes de cofatores e coenzimas (CoA, FAD, NAD e NADP) ATP, GTP, etc. transportador de energia qumica I ntermedirios biossintticos ativados ex. UDP-galactose Mensageiros celulares secundrios cAMP e cGMP
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metabolismo

dieta

vias de recuperao/SALVAO que permitem a reutilizao das bases prformadas

Bases pricas e pirimdicas

Sntese de novo
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Metabolismo de nucleotdeos de purina e de pirimidina

A maioria das partes constituintes dos cidos nuclicos so sintetizadas pelo nosso organismo.

A coenzima tetrahidrofolato tem um papel de destaque na sntese de nucleotdeos

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Biossntese de nucleotdeos de purina

2 nucleotdeos purnicos: Adenosina 5-monofosfato (AMP; adenilato) Guanosina 5-monofosfato (GMP; guanilato) As bases pricas so construdas em cima da molcula de ribose-5-fosfato
O O P O CH2 H C H O H C H OH
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OH

OH

Esquema geral da via das pentoses-fosfato

Fase oxidava Inicia como a gliclise com o glicose-6-fosfato Fornece 2 precursores para vias anablicas: - 2 NADPH Para biossntese de AGs Para produzir GSH - 1 Ribose 5-P biossntese de cidos nuclicos e 1 CO2. OXIDAO E DESCARBOXILAO Fase no oxidava = fase regenerava dos hexose-6-fosfato (6 pentose-5-P em 5 glicose-6-P) Objevo: NADPH Ou gliclise
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OXIDAO

ISOMERISAO

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A ribose-5-fosfato proveniente da via das pentoses

O O

CH2 H C H

+ ATP
O H C C H OH O

O O

CH2 H C H

O H C

H O

+ AMP
O O P O O O O

Ribose-5-fosfato

OH

OH

ribose fosfato pirofosfoquinase

5-fosforibosil 1-pirofosfato (PRPP)

OH

OH

O PRPP participa em vrias outras reaes de ribosilao:

biosntese de histidina sntese de NAD+ Converso de guanina em GMP sntese de nucleotdeos pirimdicos
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A sntese de novo das purinas comea depois do fosforribosilpirofosfato

tomos derivados de aminocidos (cf capitulo biossntese dos AAs e derivados) e do bicarbonato e do formato Como para os AAs, o principal doador de nitrognio a glutamina

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A via de novo para a sntese de nucleotdeos pricos, levando a inosina 5-monofosfato (IMP), consiste de 10 passos metablicos. A hidrlise de ATP necessria para direcionar vrias reaes nesta via. Envolve: Grandes complexos multienzimticos

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A amidofosforribosil transferase desloca o

-OOC

O CH CH2 CH2 C NH2

grupo pirofosfato com o nitrognio amida da glutamina em C1.

H3N

Glicinamida ribonucleotdeo sintetase

NH2 Condensao

CH2

COO-

Fosforribosil pirofosfato (PRPP) ativador da Enzima da etapa (1) AMP, ADP, ATP, XMP, GMP, GDP e GTP atuam como inibidores
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No prximo passo um grupo formil ser tranferido do formil tetraidrofolato para o grupo amina da glicina
H N C OH C C N

H2N C N

H C C

H H CH2 O N C C H

H C C H

H C C C H

O C

H N

COO C CH2 CH2 COO H

N H

N10-formil H4 folato Formilao

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Doao de nitrognio pela glutamina FGAR amidotransferase

-OOC

O CH CH2 CH2 C NH2

H3N

Desidratao e fechamento do anel imidazol do ncleo purina FGAM ciclase (sintetase)

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Carboxilao (sem biotina) sintetase

Transferncia Carboxilato para posio 4 mutase Doao do grupo amino do aspartato

1 passo (ligao amida)

sintetase

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Doao do grupo amino do aspartato

2 passo (eliminao do esqueleto carbonico)

HOOC - CH = CH - COOH

Formilao transformilase

Desidratao e fechamento do anel imidazol do ncleo purina sintase

1 intermedirio a ter um anel purnico completo

Inosinato (IMP)

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Sntese de AMP e GMP a partir IMP

Insero do grupo amino do Aspartato por meio de 2 reaes

Adenilsuccinatoliase

Adenilato (AMP)

uc nils Ade tase e sint

cina

to-

Inosinato (IMP)

Guanilato (GMP)
se

IMP-

desid

rogen a

Oxidao do IMP e adio do grupo amino da glutamina

XMP-glutamina amidotransferase
Insero grupo amino (glutamina)
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Resumo da sntese de novo de nucleotdeos pricos

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Regulao por retroalimentao negativa da sntese dos nucleotdeos pricos

Enzimas alostricas

Ribose fosfato pirofosfoquinase (PRPP sintetase) Glutamina-PRPP amidotransferase

adenilossucinato -sintetase

IMPdesidrogenaserase

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Metabolismo de nucleotdeos de pirimidina

2 nucleotdeos pirimdicos: Citidina 5-monofosfato (CMP; citidilato) Uridina 5-monofosfato (UMP; uridilato)
Os nucleotdeos pirimidnicos so sintetizados a partir de aspartato, PRPP e carbamoil-fosfato
Carbamoil-fosfato tambm um intermedirio no ciclo da Ureia
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NH2 C N O C N C C O HN C

O C C C N Uracila O HN C

O C C C N Timina CH3

Citosina

Fontes de tomos de carbono e nitrognios das pirimidinas

Glutamina

O C HN O C N C C

Aspartato N5,N10, metileno tetrahidrofolato

HCO3

CH3
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O anel pirimidnico formado em primeiro e depois ligado ao ribose-5-fosfato

Relembrando 1 passo do ciclo da Ureia

bicarbonato

Anidrido do cido carbnico fosfrico

Carbamoil-fosfato-sintetase I
(mitocndrial) Enzima reguladora carbamato

Entra no ciclo da ureia com doador ativo do grupo carbamoil

Carbamoilfosfato
Mas para o sntese de pirimidinas: o carbamoil-fosfato produzido no CITOSOL
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Sntese de novo do (UMP), UTP e CTP

No vem da mitocndria mas do citosol Enzima diferente: Aspartato transcarbamoilase (ATCase) carbamoil-fosfato

Carbamoil-fosfatosintetase II

diidroorotase

ciclizao

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Receptor de eltrons Diidroorotato desidrogenase

Orotato fosforribosil transferase

Fornece mas uma vez a cadeia lateral da ribose-5-fosfato

Orotidina-5-monofosfato

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Orotodilato descarboxilase
ATP

descarboxilao

Uridina-5-difosfato (UDP) ATP

cinase

Uridina-5-monofosfato

Glutamina, doador de nitrognio Citidilato sintetase

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Regulao por retroalimentao negativa da biossntese dos nucleotdeos pirimdicos

Aspartato transcarboxilase (ATCase), catalisa a 1 reao dessa via inibida por CTP, o produto final dessa via

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Regulao alostrica da aspartato transcarbamilase

- CTP inibidor alostrico

K = afinidade para o substrato aspartato - ATP indutor Impede mudanas induzidas pelo CTP

Ativa

Inativa

ATCase= 6 subunidades catalticas unem-se ao substrato e 6 SU reguladores unem-se ao inibidor alostrico CTP

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Ribonucleotdeos, precursores dos desoxirribonucleotdeos

Reduo da poro D-ribose para 2-desoxi-D-ribose

Reduo do C 2 da ribose dos ribonucleotdeos a desoxirribonucleotdeos pela:

Ribonucleotdeo-redutase
Setas azuis reduo
Transmisso dos e- do NADPH para a enzima por meio da glutarredoxina ou tiorredoxina
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Ribonucleotdeo-redutase
Dmero com 2 S/U R1 e R2
radical tirosila

No stio ativo (na interface R1 R2): - 2 grupos tiis do R1 - um radical tirosila do R2 1 co-fator ferro: Fe3+ do R2
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ribonucleotdeo redutase
Mecanismo proposto do envolvimento de um radical livre em transformao bioqumica

(1) Formao de um radical 3ribonucleotdeo (2) e (3) Formao de um cation depois da perda de H 2O (4) Oxidao do ditiol reduz o radical catinico e regenera o radical 3ribonucleotdeo (5) regenera o radical tirosil (inverso do (1)) (6) O ditiol oxidado reduzido
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ribonucleotdeo redutase (E. coli)

Regulaes pelos desoxirribonucleosdeos trifosfato

No stio principal regulador

No stio substratoespecfico de regulao

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O timidilato (dTMP) derivado do dCTP e do dUMP DNA contem timina

ao invs da uracila

Tem que ser eficiente para manter [dUTP] baixa para prevenir a incorporao de uridilato no DNA. (= timidilato)
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Converso de dUMP para dTMP pela timidilato sintase e diidrofolato redutase

timidilato sintase

Oxidao do (H)4folato em diidrofolato

Serine hidroximetil transferase

diidrofolato redutase

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Resumo da sntese de novo de nucleotdeos derivados da pirimidina

anel pirimidnico formado PRPP

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A degradao das bases purnicas e pirimidnicas produz cido rico e ureia respectivamente

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Catabolismo dos nucleotdeos purnicos: GMP e AMP

Produto de excreo final do catabolismo das purinas nos primatas, nos pssaros e alguns outros animais Secreo normal no homem 0,6g/24h

Xantina oxidase

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Urato oxidase

Produtos de excreo final do catabolismo das purinas

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Catabolismo de uma pirimidina Degradao da timina

Succinil-CoA (intermedirio do Ciclo do cido citrico)

Metilmalonil-CoA

Ciclo da ureia

Propionil-CoA

Intermedirio do catabolismo da valina

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As bases purnicas e pirimidnicas so recicladas por vias de recuperao/salvao

Purinas livres recuperadas e empregadas na sntese Via bastante diferente e mais simples que a biossntese de novo das purinas
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Purinas livres recuperadas e empregadas na sntese

Recuperao adenosina livre Adenina + PRPP AMP + PPi

Adenosina fosforribosil transferase

Recuperao da guanina livre e da hipoxantina (o produto de desaminao da adenina)

Hipoxantina-guanina fosforribosil transferase

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Via similar de recuperao para as bases pirimdicas existe nos micro-organismos e provavelmente nos mamferos

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A gota
- [cido rico] elevado no sangue e tecidos - cido rico se transforma em urato de sdio - Devido a um deposito anormal de cristais de urato de sdio as articulaes se inflamam dor e artrtica - Os rins tambm infetados Provavelmente deficiente gentica

Inibidor da xantina oxidase

Xantina oxidase

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Agentes quimioterpicos atuam em enzimas das vias biossintticas de nucleotdeos

Clulas cancerosas apresentam maiores necessidades de nucleotdeos Clulas cancerosas mais sensveis aos inibidores da biossntese de nucleotdeos

Anlogos do grande doador de nitrognio= a glutamina. E inibidores da glutamina amidotransferase

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