CAPITULO 3: COMPARACIN DE DOS O M MUESTRAS

3.1 Introduccin
En este captulo se presenta las pruebas no paramtricas de comparacin de dos o
ms muestras independientes. Uso del Software SPSS y R
3.2 Pru!" Lo#R"n$
( ) ( ) t S t S H
2 1 0
:
(son idnticas)
( ) ( ) t S t S H
2 1 1
:
Sea
m
t t t < < <
2 1
los tiempos de falla distintos de la muestra formada por la
combinacin de las dos muestras indiiduales. Supon!a "ue en el tiempo j
t
#
m j . , 2 , 1
# acontece j
d
fallas# estando j
n
indiiduos ba$o ries!o en la muestra
combinada% tambin ocurren en la muestra i #
2 , 1 i
ij
d
fallas# estando ba$o ries!o
ij
n
# respectiamente. &ue!o# en cada tiempo de falla j
t
# los datos pueden ser
dispuestos en forma de una tabla de contin!encia 2 2 con ij
d
fallas y ij ij
d n

sobreiientes en la columna i . Esto se muestra en la si!uiente tabla'
(abla de contin!encia !enerada en el tiempo j
t
)rupos
* +
,alla
j
d
1 j
d
2 j
d
-o ,alla
j j
d n
1 1

j j
d n
2 2

j j
d n
j
n
1 j
n
2 j
n
.ondicionado a la e/periencia de falla y censura 0asta el tiempo j
t
(fi$ando las
mar!inales de columnas) y al n1mero de falla en el tiempo j
t
(fi$ando las mar!inales
de las lneas)# la distribucin de j
d
2 es entonces una 0iper!eomtrica

,
_

,
_

,
_

j
j
j
j
j
j
d
n
d
n
d
n
2
2
1
1
&a media de j
d
2 es
1
2 2

j j j j
n d n w
# lo "ue e"uiale a decir# "ue si no 0ubiera
diferencia las dos poblaciones en el tiempo j
t
# el n1mero total de falla
( )
j
d
puede
ser diidido entre las dos muestras de acuerdo con una ra2n entre el n1mero de
indiiduos ba$o ries!o en cada muestra y el n1mero total ba$o ries!o.
&a ariancia de j
d
2 a partir de la distribucin 0iper!eomtrica es
( ) ( ) ( ) ( )
1 2
2 2
2
1


j j j j j j j j j
n n d n d n n n V
Entonces la estadstica j j
w d
2 2

tiene media cero y ariancia
( )
2
j
V
. Si las
m
tablas
de contin!encia fueran independientes# una prueba apro/imada para la i!ualdad de
22
dos funciones de superiencia puede ser basada en la estadstica
( )
( )
2
2 2
1
1
2
m
j j
j
m
j
j
d w
T
V

&a cual tiene una distribucin asinttica .0i3cuadrado con * !rado de libertad para
muestras !randes.
)rupo Esteroide (*4 pacientes) *5# +5# 6# 6# 6 5# 45# 45# *75# *75#*75# *75# *75# *75#
*75# *75.
)rupo control (placebo) (*8 pacientes) *# *# *# *5# 85# 4# 9# :# *;# *;5# *+5# *75# *75#
*75.
Para el caso de 0epatitis
*# 6# 4# 9# :# *;
.uando 1
1
t
)rupos
* +
,alla ; 6 6
-o ,alla *4 ** +7
*4 *8 +<
( )( )( ) 1.448276 29 3 14
1 1
1 1 21 21


n d n w #
( ) ( ) ( ) ( )
( )( )( )( )
( ) ( )
0.6956005
1 29 29
3 29 3 14 29 14
1
2
1
1
2
1 1 1 1 21 1 21 2 1

n n d n d n n n V
.uando 3
2
t
)rupos
* +
,alla + ; +
-o ,alla ** *; +*
*6 *; +6
( )( )( ) 0.8695652 23 2 10
1 1
2 2 22 22


n d n w
( ) ( ) ( ) ( )
( )( )( )( )
( ) ( )
0.4691528
1 23 23
2 23 2 10 23 10
1
2
1
2
2
2 2 2 2 22 2 22 2 2

n n d n d n n n V
.uando
5
3
t
)rupos
* +
23
,alla ; * *
-o ,alla *; : *:
*; < *<
( )( )( ) 0.4736842 19 1 9
1 1
3 3 23 23


n d n w
( ) ( ) ( ) ( )
( )( )( )( )
( ) ( )
0.2493075
1 19 19
1 19 1 9 19 9
1
2
1
3
2
3 3 3 3 23 3 23 2 3

n n d n d n n n V
.uando 7
4
t
)rupos
* +
,alla ; * *
-o ,alla : 9 *4
: : *7
( )( )( ) 0.5 16 1 8
1 1
4 4 24 24


n d n w
( ) ( ) ( ) ( )
( )( )( )( )
( ) ( )
0.25
1 16 16
1 16 1 8 16 8
1
2
1
4
2
4 4 4 4 24 4 24 2 4

n n d n d n n n V
.uando
8
5
t
)rupos
* +
,alla ; * *
-o ,alla : 7 *8
: 9 *4
( )( )( ) 0.4666667 15 1 7
1 1
5 5 25 25


n d n w
( ) ( ) ( ) ( )
( )( )( )( )
( ) ( )
0.2488889
1 15 15
1 15 1 7 15 7
1
2
1
5
2
5 5 5 5 25 5 25 2 5

n n d n d n n n V
.uando
10
6
t
)rupos
* +
,alla ; * *
-o ,alla : 4 *6
: 7 *8
( )( )( ) 0.4285714 14 1 6
1 1
6 6 26 26


n d n w
( ) ( ) ( ) ( )
( )( )( )( )
( ) ( )
0.2448980
1 14 14
1 14 1 6 14 6
1
2
1
6
2
6 6 6 6 26 6 26 2 6

n n d n d n n n V
( )
( )
( ) ( ) ( )
2
2
2 2
1
1
2
3 1.448276 0 0.8695652 1 0.428514
3.667683
0.6956005 0.2448980
m
j j
j
m
j
j
d w
T
V

+ + + 1
] ]

+ +

3.3 Otr"% Pru!"%

(ambin otras pruebas no paramtricas fueron propuestos para comparar funciones
24
de superiencia. En el caso particular de la comparacin de dos funciones de
superiencia la si!uiente forma !eneral incluye las pruebas ms importantes de la
literatura y !enerali2a la estadstica ( dado anteriormente
( )
( )
2
2 2
1
2
1
2
m
j j j
j
m
j j
j
u d w
S
u V

=onde j
u
son pesos "ue especifican cada prueba. >a$o la 0iptesis nula de "ue las
funciones de superiencia son i!uales# la estadstica S tiene una distribucin
asinttica .0i3cuadrado con * !rado de libertad. &a prueba &o!Ran? se obtiene
cuando
1
j
u
# para
m j , , 1
. @tra prueba bastante utili2ado en la prctica es la
prueba de Ailco/on (>reslow) y se obtiene cuando j j
n u
# para
m j , , 1
. &a
prueba de (arone3Aare propone un peso j j
n u
# para
m j , , 1
. El cual "ueda
en el intermedio entre la prueba de &o!Ran? y Ailco/on. Usando el pa"uete SPSS se
tiene'
25
Surial Bnalysis for (CEDP@
,actor (RB( E *.;;
(ime Status .umulatie Standard .umulatie -umber
Surial Error Eents Remainin!
*.;; .;; ; *8
+.;; .;; ; *6
6.;; *.;; * *+
6.;; *.;; .:87+ .*;;* + **
6.;; .;; + *;
4.;; .;; + <
4.;; .;; + :
*7.;; .;; + 9
*7.;; .;; + 7
*7.;; .;; + 4
*7.;; .;; + 8
*7.;; .;; + 6
*7.;; .;; + +
*7.;; .;; + *
*7.;; .;; + ;
-umber of .ases' *4 .ensored' *6 ( :7.79F) Eents' +
Surial Standard <4F .onfidence Cnteral
(ime Error
Dean' *8.;; *.6; (**.84#*7.44 )
(&imited to *7.;; )
Dedian' . . (. # . )
Surial Bnalysis for (CEDP@
26
,actor (RB( E +.;;
(ime Status .umulatie Standard .umulatie -umber
Surial Error Eents Remainin!
*.;; *.;; * *6
*.;; *.;; + *+
*.;; *.;; .9:49 .*;<9 6 **
*.;; .;; 6 *;
8.;; .;; 6 <
4.;; *.;; .7<:8 .*+97 8 :
9.;; *.;; .7*** .*6:6 4 9
:.;; *.;; .4+6: .*864 7 7
*;.;; *.;; .8674 .*869 9 4
*;.;; .;; 9 8
*+.;; .;; 9 6
*7.;; .;; 9 +
*7.;; .;; 9 *
*7.;; .;; 9 ;
-umber of .ases' *8 .ensored' 9 ( 4;.;;F) Eents' 9
Surial Standard <4F .onfidence Cnteral
(ime Error
Dean' <.:+ *.7: (7.4+#*6.*+)
(&imited to *7.;; )
Dedian' *;.;; +.89 (4.*7#*8.:8)
27
Surial Bnalysis for (CEDP@
(otal -umber -umber Percent
Eents .ensored .ensored
(RB( *.;; *4 + *6 :7.79
(RB( +.;; *8 9 9 4;.;;
@erall +< < +; 7:.<9
(est Statistics for E"uality of Surial =istributions for (RB(
Statistic df Si!nificance
&o! Ran? 6.79 * .;444
>reslow 6.*< * .;98*
(arone3Aare 6.86 * .;76<
Surial ,unctions
(CEDP@
*: *7 *8 *+ *; : 7 8 + ;
.
u
m

S
u
r

a
l
*.*
*.;
.<
.:
.9
.7
.4
.8
(RB(
+.;;
+.;;3censored
*.;;
*.;;3censored
3.3 Pru!"% d co&'"r"cin d cur("% d %u'r(i(nci"
( ) ( ) ( ) t S t S t S H
p1 2 1 0
:
contra la alternatia
:
1
H -o todos los
( ) t S
j son i!uales
&ue!o# se asume "ue para cada tiempo de muerte se tiene la si!uiente tabla de
contin!encia
p 2
)rupo
(otales * + ... p
28
,alla
1
d
2
d ...
p
d d
-o falla
1
a
2
a ...
p
a a
(otales
1
n
2
n ...
p
n N
Si no 0ay empate entonces 1 d para cada tabla. (ratando esta tabla como un
simple e/perimento con d eentos en N pruebas# el n1mero esperado de fallas en cada
!rupo es
N dn E
i i
/
# con una matri2 ariancia de una multinomial estndar
i
V
.
Si se asume "ue cada tabla es independiente# entonces se puede sumar sobre las
tablas para obtener el n1mero obserado y el n1mero esperado de fallas para cada
!rupo. =e esta operacin d se obtiene un ector @bserado menos esperado E O
"ue tiene una matri2 de ariancia
k
V
. Esto puede ser !enerali2ado cuando se
incluye ponderaciones
k
u
para cada tiempo de falla. El ector promedio ponderado es
dado por
( )

k k k
E O u U
# donde
k
O
es el ector formado por los elementos de la
fila de falla en la k 3sima tabla#
k
E
es el ector esperado de falla en la k 3sima
tabla y la matri2 ariancia est dado por

k k
u V V
2
. &os alores ms usados para
las ponderaciones
k
u
son'
Si
1
k
u
# da ori!en a la prueba de &o!ran?.
Si
k k
n u
# da ori!en a la prueba de Ailco/on3)e0an (o de >reslow)
Si
k k
n u
# da ori!en a la prueba de (arone3Aare.
&a estadstica de prueba est dado por'
U V U
1

2
cal

(iene una distribucin asinttica .0i3cuadrado con

( ) 1 p
!rados de libertad. Se
rec0a2a
0
H
a un niel de si!nificacin

# si
( )
2
1 , 1
2

>
p cal

.
&a seleccin de los pesos en la estadstica S y
2
cal
depende del tipo de diferencia
"ue desea detectarse en las funciones de superiencia. &a prueba de Ailco/on# "ue
utili2a pesos i!uales al n1mero de indiiduo ba$o ries!o# coloca ms peso en la porcin
inicial del e$e del tiempo# debido a "ue al inicio del estudio todos los indiiduos estn
ba$o ries!o y salen de este estado (Gba$o ries!oH) a medida "ue fallan o cuando se
produce la censura. &a prueba &o!Ran?# por otro lado coloca el mismo peso para todo
el e$e del tiempo# esto le da mayor peso a los tiempos mayores cuando se compara
con la prueba de Ailco/on. &a prueba de (arone3Aare se locali2a en una situacin
intermedia.
3.).* Otr"% 'ondr"cion%
Peto y Peto (*<9+) y Prentice (*<9:) su!iere utili2ar una funcin de pesos o
ponderaciones "ue depende directamente de la e/periencia pasada de superiencia
obserada de las muestras combinadas. &a funcin de peso es una modificacin del
estimador de Iaplan Deier y se define de tal forma "ue su alor es conocido antes de
"ue la falla ocurra. El estimador modificado de la funcin de superiencia# conocido
29
con el nombre de estimador de Peto3Prentice# es
( )

,
_

+
+

t t i i
i i
i
n
d n
t S
/
1
1
#
y los pesos utili2ados son'
( )
1 +

j
j
j
n
n
t S u

@tra clase de pesos para las estadsticas de estas pruebas# fue propuesta por
Jarrin!ton3,lemin! (*<:+)
( ) [ ]

j j
t S u
Si
0
se obtiene "ue
1
j
u
y se tiene la prueba &o!Ran?. B0ora# si
1
#
entonces el peso es el estimador de Iaplan Deier en el tiempo de falla anterior# "ue es
una prueba similar al de Peto3Prentice.
&a principal enta$a de las pruebas de Peto3Prentice y de Jarrin!ton3,lemin! es "ue
usa la ponderacin relatia a la e/periencia de superiencia anterior. Esto no sucede
con las pruebas de &o!Ran? y Ailco/on. En particular la prueba de Ailco/on pondera
por el n1mero de indiiduo ba$o ries!o "ue depende de la e/periencia de
superiencia as como de la censura. Si el patrn de censuras es ntidamente
diferente# por e$emplo para el caso de dos !rupos# entonces la prueba se puede
rec0a2ar o aceptar# no solamente con base en las diferencia de las superiencia
entre los dos !rupos sino tambin debido al patrn de censuras.
E+&',o d -'"tit%
K 0epatL3read.table(Md'NdatosN0epatitis.t/tM#0eaderE()
K 0epat
tiempo censura trat
* * ; *
+ + ; *
6 6 * *
8 6 * *
4 6 ; *
30
7 4 ; *
9 4 ; *
: *7 ; *
< *7 ; *
*; *7 ; *
** *7 ; *
*+ *7 ; *
*6 *7 ; *
*8 *7 ; *
*4 *7 ; *
*7 * * +
*9 * * +
*: * * +
*< * ; +
+; 8 ; +
+* 4 * +
++ 9 * +
+6 : * +
+8 *; * +
+4 *; ; +
+7 *+ ; +
+9 *7 ; +
+: *7 ; +
+< *7 ; +
tiempoL30epatO#*P
censuraL30epatO#+P
tratL30epatO#6P
.omando en R
K library(surial)
K ?apL3surfit(Sur(tiempo#censura)Qtrat)
K plot(?ap#/labEMtiempoM#ylabEMS(t)M#ltyE+'6)
K le!end(*#.+4#c(MEsteroideM#MPlaceboM)#ltyE+'6)
K title(G(iempo de muerte de pacientes con 0epatitisH)
31
; 4 *; *4
;
.
;
;
.
+
;
.
8
;
.
7
;
.
:
*
.
;
tiempo
S
(
t
)
Esteroide
Placebo
Ti&'o d &urt d '"cint% con .'"titi%
K surdiff(Sur(tiempo#censura)Qtrat)
.all'
surdiff(formula E Sur(tiempo# censura) Q trat)
- @bsered E/pected (@3E)R+NE (@3E)R+NS
tratE* *4 + 8.:* *.78 6.79
tratE+ *8 9 8.*< *.:< 6.79
.0is"E 6.9 on * de!rees of freedom# pE ;.;444
K surdiff(Sur(tiempo#censura)Qtrat#r0oE*)
.all'
surdiff(formula E Sur(tiempo# censura) Q trat# r0o E *)
- @bsered E/pected (@3E)R+NE (@3E)R+NS
tratE* *4 *.9< 8.*7 *.64 6.86
tratE+ *8 7.;; 6.76 *.48 6.86
.0is"E 6.8 on * de!rees of freedom# pE ;.;78+
/i!,io#r"01"
*.3 Josmer =. T &emes0ow S .(*<<<). Bpplied Surial Bnalysis# Uo0n Ailey V Sons#
Cnc.
+.3 Diller R. ).# )on! ). y DuWo2 B (*<:*). Survival Anlisis. Uo0n Ailey V sons# -ew Tor?.
6.3 .olosimo Enrico (+;;8). Anlisis de Sobrevivencia. .urso Cnternacional @r!ani2ado por
la ,acultad de .iencias Datemtica de U-DSD.
8.3 StatSci (*<<6). S-plus Guide to Statistical and Mathematical Analysis. Dassac0usetts
Cnstitute of (ec0nolo!y.
E+rcicio%
.on los datos de los e$ercicios * y + del captulo +# realice la pruebas de comparacin
32
usando los software SPSS y R.
33