TEMA 1: Catlisis enzimtica y transporte de membrana

RELEVANCIA METABLICA DE LA CATLISIS

Existen dos condiciones fundamentales para la existencia de los seres vivos: capacidad de autorreplicacin y capacidad de catalizar reacciones qumicas de forma eficiente y selectiva. Los seres vivos obtienen la energa de los nutrientes mediante reacciones bioqumicas similares a otras reacciones qumicas, por ejemplo: oxidacin de la sacarosa (azcar de mesa): Sacarosa + O2 CO2 + H2O + Energa libre de Gibbs (G < 0) Se trata de una reaccin exergnica. Sin embargo, una bolsita de azcar almacenada durante aos, permanece en contacto con el oxgeno atmosfrico aparentemente sin oxidarse. Aunque la reaccin qumica de la oxidacin de la sacarosa est favorecida termodinmicamente, en el medio ambiente es muy lenta, la liberacin de energa no es significativa. Sorprendentemente, cuando un ser humano o una bacteria consumen sacarosa, la energa qumica se libera en segundos dentro de su organismo. La diferencia est en la catlisis tiempo eficaz Sacarosa + O2 + catalizador CO2 + H2O + Energa en tiempo eficaz Sin catlisis no habra vida ni mantenimiento de la misma. Recuerda Debes ser capaz de DEFINIR y en su caso EXPRESAR MATEMTICAMENTE: 1. 2. 3. 4. 5. Equilibrio de reaccin Velocidad de reaccin Estado de transicin Energa de activacin Catalizador

CONCEPTOS BSICOS SOBRE CATALIZADORES

NO son sustratos ni productos de la reaccin. Actan disminuyendo la G sin afectar a la energa libre.
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NO afectan al equilibrio de la reaccin. Aumentan la eficacia de los choques entre las molculas necesarios para que se produzca la reaccin Aumentan la velocidad de la reaccin.

Energa de activacin: barrera que hay que superar para que ocurra la reaccin. Energa de fijacin: sirve para disminuir la energa de activacin. Los catalizadores aumentan la eficacia de los choques y las interacciones dbiles entre sustrato y enzima que son necesarios para que se produzca la reaccin. Estos favorecen la eficacia de la reaccin y la velocidad de reaccin al reducir la energa de activacin. La catlisis aumenta la velocidad de reaccin disminuyendo la energa de activacin, sin alterar el equilibrio de reaccin.

HISTORIA

Los catalizadores biolgicos, como se denominaban los enzimas inicialmente, ya se conocan a finales del XVIII. La primera denominacin se realiz a partir de estudios de la digestin de carne.

1850-Pasteur tras diversos estudios de fermentaciones (azcar-> alcohol), descubri el catalizador biolgico de la reaccin que denomin FERMENTO. Esos fermentos tenan que estar en la levadura viva (teora del vitalismo) 1897-Buchner con extractos de levaduras (levaduras lisadas) realiz la fermentacin del azcar al alcohol -> catlisis en ausencia de la clula viva = fin del vitalismo e inicio de la bioqumica. A esos fermentos que descubri los llam ENZIMAS 1926-Sumner estudio de los enzimas. Purific la primera enzima, la cristaliz y vio que su naturaleza era proteica, generalizando acerca de todas las enzimas. No fue credo hasta que estudios posteriores lo confirmaron. Dcada de los 30: se admiti que la mayora de los enzimas eran protenas. 1930-Haldane escribi un tratado o ensayo sobre las enzimas; puntualiz y sugiri que haba interacciones dbiles enzima-sustrato que podan ser importantes para la catlisis de las reacciones (centro de todos los estudios enzimolgicos actuales).

LOS ENZIMAS SON CATALIZADORES CELULARES

Excepto los ribozimas, todos los catalizadores son protenas (enzimas). Cada enzima cataliza una reaccin especfica, y cada reaccin en la clula est catalizada por un enzima diferente (especificidad enzima-sustrato) Los enzimas son regulables. Cada enzima realiza una funcin y acta sobre un sustrato. Son muy especficos y capaces de actuar en soluciones acuosas a pHs suaves. Los enzimas posibilitan que las reacciones bioqumicas, especficas, procedan a velocidades significativas (tiempo eficaz) y as los enzimas determinan de qu modo se canalizan la materia y la energa en los procesos celulares. Estn presentes en todos los seres vivos, en el centro de todos los procesos bioqumicos.

IMPORTANCIA MDICA DE LOS ENZIMAS

Las enfermedades hereditarias con frecuencia estn causadas por deficiencias funcionales de uno o ms enzimas. Casi todas las enfermedades hereditarias se deben a la ausencia, disfuncin o sobreactividad de un enzima. La medida de la actividad de algunos enzimas en el plasma es de gran relevancia diagnstica. El anlisis de la actividad enzimtica sirve para obtener un diagnstico acerca de enfermedades.

Muchos frmacos ejercen sus efectos por interaccin con enzimas. Los enzimas son tambin herramientas necesarias en ingeniera qumica, biotecnologa, alimentacin, agricultura etc.

ASPECTOS GENERALES DE LA ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LOS ENZIMAS

La actividad cataltica de los enzimas depende de la integridad de su configuracin proteica nativa: las estructuras primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria son esenciales para su actividad. Si un enzima se desnaturaliza o disgrega en sus subunidades perder su actividad cataltica con muchas probabilidades; si se degrada en sus aminocidos, lo har con toda seguridad. Algunos enzimas requieren adems un componente qumico adicional llamado cofactor. Los cofactores pueden ser: . Uno o varios iones (Fe2+, Mg2+, Mn2+ o Zn2+)

. Una molcula compleja denominada coenzima. Actan como transportadores de grupos funcionales

NOMENCLATURA
La parte proteica del enzima se denomina apoenzima o apoprotena. Si el cofactor (ion o coenzima) se encuentra unido fuertemente (covalentemente) a la apoprotena se denomina grupo prosttico. Un enzima completo y catalticamente activo (apoenzima + cofactor) se denomina holoenzima. REPASAR DE LA LECCIN 5 DE LA BURI: QU APORTA LA CINTICA AL CONOCIMIENTO DE LA BIOQUMICA? CINTICA DE LAS REACCIONES VELOCIDAD DE UNA REACCIN QUMICA CATALIZADORES ENZIMAS COMO CATALIZADORES COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO
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ENERGA DE FIJACIN

SITIO ACTIVO. ESPECIFICIDAD

La formacin del complejo enzima-sustrato determina la reaccin. La energa de formacin es la utilizada para formar el complejo (interacciones dbiles enzimasustrato). Determina la especificidad. Sustrato + Enzima E-S Producto + Enzima + Energa La reaccin enzimtica transcurre en 2 pasos: 1. Formacin del complejo enzima-sustrato, base del estudio matemtico de la catlisis. 2. Puede ir en ambas direcciones; normalmente, hacia la direccin de produccin de energa. El complejo [E-S] puede deshacerse sin que haya reaccin () o puede realizar la reaccin () liberndose el producto, el enzima inalterado y la energa. Los procesos biolgicos no ocurren en un tiempo til; todo depende, por tanto, de la catlisis: el enzima crea un ambiente especial de manera que se produzca la reaccin de modo eficaz y en un tiempo determinado, con orientacin adecuada y aislamiento o formacin de un microambiente mediante la creacin del complejo E-S a travs del sitio cataltico o sitio activo, una bolsa donde va a ir el sustrato, seleccionndose y orientando el sustrato, recubierta de grupos funcionales adecuados. El sitio de unin del sustrato al enzima se denomina sitio cataltico o sitio activo y es donde se produce la reaccin. El centro activo envuelve al sustrato y lo asla del medio externo. La unin del enzima al sustrato produce un cambio conformacional en el enzima que hace ms fuerte esa unin (recordar energa de fijacin). Esa adaptacin estructural del enzima al sustrato se denomina encaje inducido. La unin enzima-sustrato es especfica, en general slo un sustrato puede entrar en el sitio activo del enzima: prcticamente a cada enzima le corresponde un sustrato.

ENCAJE INDUCIDO
Cuando el enzima fija el sustrato, va a sufrir un cambio conformacional producido por las interacciones dbiles entre el enzima y el sustrato: se pueden modificar uno o varios dominios del enzima para organizar el centro activo y as exponer los grupos
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funcionales que interesan. El encaje inducido permite la correcta catlisis de la unin enzimtica.

NOMENCLATURA Y CLASIFICACIN
Inicialmente se utilizaba el nombre del sustrato + -asa. Haba enzimas con dos nombres, dos enzimas distintas con el mismo nombre... se quiso establecer un orden: 6 clases principales (se nombran con 4 dgitos) y subclases. Segn el Comit Internacional de Nomenclatura, los enzimas se clasifican en seis clases principales y cada una de ellas en diferentes subclases segn el tipo de reaccin catalizada. 1. Oxidorreductasas: transferencia de electrones, iones hidruro o tomos de hidrgeno. 2. Transferasas: catalizan la transferencia de grupos funcionales de un sustrato a otro. 3. Hidrolasas: catalizan las reacciones de hidrlisis (transferencia de grupos funcionales al agua) 4. Liasas: catalizan la adicin de grupos funcionales a molculas que poseen dobles enlaces, el cual desaparece al quedar unido el grupo a la molcula, o forman dobles enlaces por eliminacin de grupos funcionales. 5. Isomerasas: transfieren grupos dentro de una misma molcula para obtener ismeros. 6. Ligasas: forman enlaces C-C, C-S, C-O y C-N mediante reacciones de condensacin acopladas a la hidrlisis de ATP o a un cofactor similar.

Cada enzima tiene asignado un nmero de clasificacin, un nombre sistemtico y un nombre comn. Siguiendo este criterio, a cada enzima se le asigna un nmero clasificatorio que consta de cuatro partes. Ejemplo: enzima que cataliza la reaccin de fosforilacin de la glucosa ATP + D-Glucosa + enzima ADP + D-Glucosa + enzima + energa Nmero de clasificacin: 2.7.1.1. (2) corresponde a uno de las 6 clases principales: las transferasas (7) la subclase (grupo que se transfiere): grupo fosforilo fosfotransferasa (1) grupo aceptor: hidroxilo (1) molcula que acepta: D- glucosa Nombre sistemtico: ATP glucosa-fosfotransferasa (transfiere un grupo fosforilo del ATP a la glucosa) Nombre comn: hexoquinasa (las quinasas son enzimas que fosforilan utilizando ATP como donador del grupo fosforilo)

COENZIMAS
Los coenzimas son molculas complejas que actan como transportadores transitorios de grupos funcionales especficos o de equivalentes de reduccin. Hay diferentes coenzimas y cada uno transfiere un grupo distinto:

Provienen de las vitaminas hidrosolubles. Cada uno tiene un diferente precursor vitamnico.

VITAMINAS
Las vitaminas son nutrientes orgnicos que, siendo necesarios en pequea proporcin, no son sintetizables por el organismo humano y, por tanto, deben estar presentes en la dieta. Las dietas pobres en vitaminas son causa de enfermedades que pueden llevar a la muerte. Se clasifican en hidrosolubles y liposolubles.