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INTRODUCCIN AL METABOLISMO: CONCEPTOS GENERALES.

Las clulas intercambian continuamente materia y energa con el entorno, introducen materia y la transforman con el objetivo de construir, renovar sus estructuras y conseguir la energa necesaria para sus funciones. Estas transformaciones que tienen lugar en la clula ocurren por medio de un conjunto de reacciones qumicas, catalizadas por enzimas, se denominan metabolismo. Los objetivos del metabolismo son: 1. btenci!n de energa "til #$%&' para la clula, a partir de la luz, de las sustancias inorg(nicas #quimiosntesis' de molculas org(nicas. ). *onvertir nutrientes e+!genos en precursores de macromolculas. ,. *onstrucci!n de macromolculas propias a partir de dic-os precursores. .. /ormaci!n y degradaci!n de las macromolculas de biomolculas, como -ormonas, neurotransmisores, protenas y lpidos de membrana, etc. *$0$*%E012%3*$2 4EL 5E%$6 L325 1) Es muy frecuente que el producto de una reacci!n metab!lica sea el sustrato de otra u otras, de talmanera que muc-as reacciones se encadenan y forman una secuencia ordenada, que se denomina va o ruta metabl !a, como por ejemplo la gluc!lisis, 7 o+idaci!n, ciclo de la ornitina, etc. 2ustrato $ 77778 sustrato 6 77778sustrato * 77778 sustrato 4 E1 E) E, "# *ada va metab!lica tiene una finalidad, por ejemplo, la gluc!lisis es la ruta de degradaci!n de la glucosa para obtener energa, el ciclo de *alvin sintetizar monosac(ridos en la fase oscura de la fotosntesis, etc. $# *ada una de las sustancias o molculas que intervienen en las reacciones metab!licas se denomina metab%l t%&, como el (cido pir"vico, glucosa797fosfato, gliceralde-do, etc. '# En el metabolismo tienen lugar muc-as reacciones #muc-as vas o rutas', que tienen lugar de forma simult(nea, y para evitar interferencias entre ellas cada una ocurre en un compartimento celular #en un org(nulo', es decir, las rutas est(n !%m(art me)tal *a+a&, y con ello la eficacia enzim(tica es m(s eficaz. &or ejemplo: *itoplasma: :luc!lisis, gluconeognesis, glucogenogenesis, triglicridos y de protenas #traducci!n'. 5itocondria: *iclo de ;rebs, 7o+idaci!n, fosforilaci!n o+idativa. 0etculo endoplasm(tico: sntesis de lpidos y de protenas. <"cleo: duplicaci!n y transcripci!n. sntesis de

,# El metabolismo est( re-ula+% (%r e)* ma&, que son especficas de cada metabolito o sustrato y act"an sobre cada reacci!n o etapa de cada ruta metab!lica. *ada reacci!n o etapa tiene una enzima especfica. $ veces varias enzimas se asocian para aumentar su

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eficacia y constituyen !%m(le.%& mult e)* m/t !%& como el de des-idrogenasa, que act"a sobre el pir"vico al entrar en la mitocondria.

la

piruvato

2i e+iste un mutaci!n en el gen que codifica dic-a enzima, esa ruta metab!lica queda afectada, y provoca alteraciones metab!licas #enfermedades metab!licas'. :arrod lo denomin! =errores congnitos del metabolismo>. 0# La energa desprendida en las reacciones e+otrmicas o e+oerg!nicas se utiliza en las endoerg!nicas, transport(ndoles a molculas especializadas, como el $%&. 1# Las rutas metab!licas pueden ser l )eale&, en las que se parte de un metabolito inicial que se va transformando y origina otro distinto, #$777867778*77784' como la gluc!lisis, -lice de Lynen, etc y ! r!ulare&, como el *iclo de ?rebs, el de la ornitina o el de *alvin, en las que se parte de un metabolito que sufre distintas transformaciones para originar distintos productos y regenerar el metabolito inicial. $dem(s unas rutas est(n relacionadas con otras #entrecruzadas' es decir, un metabolito puede intervenir en rutas distintas seg"n las necesidades de la clula, como el (cido alfa cetoglut(rico. Las cone+iones entre distintas vas metab!licas constituyen el metabolismo intermediario. 8) *asi todas las reacciones del metabolismo son reversibles, es decir, pueden transcurrir en ambos sentidos #reactivos productos'. *$%$6 L325 @ $<$6 L325

Aay dos tipos de reacciones en el metabolismo: 2# 0eacciones catab!licas o *$%$6 L325 , en la que se transforman molculas org(nicas complejas #polisac(ridos, triglicridos, protenas, etc.' en otras m(s sencillas, org(nicas o inorg(nicas, #pir"vico, l(ctico, amonaco, * ), etc.'. En estas reacciones se libera energa contenida en los enlaces de estas macromolculas, y es almacenada en los enlaces fosfato de alta energa del $%&. Es decir se pasa de molculas con alto contenido energtico #muy reducidas' a otras con escaso contenido #muy o+idadas'. *atabolismo es sin!nimo de destrucci!n o de degradaci!n. B "# 0eacciones anab!licas o $<$6 L325 , es la sntesis de molculas org(nicas complejas a partir de otras m(s sencillas, es decir, se crean nuevos enlaces, para ello es necesario un aporte de energa, el $%&. Este $%& procede del catabolismo, de la fotosntesis o de las quimiosntesis. $nabolismo es sin!nimo de construcci!n o sntesis. Las nuevas molculas son almacenadas para luego ser utilizadas o formar parte de la clula.

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Aay ruta& metabl !a& a)3 bl !a&, es decir, funcionan como anab!licas o catab!licas seg"n las necesidades de la clula. El ejemplo tpico es el %*$. CATABOLISMO 0eacciones de degradaci!n o destrucci!n 0eacciones de o+idaci!n 4esprenden energa $ partir de muc-os sustratos distintos, se originan los mismos productos #rutas convergentes' ANABOLISMO 0eacciones de sntesis o construcci!n 0eacci!n de reducci!n *onsumen energa $ partir de pocos sustratos distintos, se originan muc-os productos distintos#rutas divergentes'

/$2E2 4EL *$%$6 L325

@ $<$6 L325

%anto el anabolismo como el catabolismo tienen lugar en tres fases: *$%$6 L325 /$2E 3: Las grandes macromolculas se degradan en sus mon!meros con enzimas especficos curre fuera de la clula, como en la digesti!n. /$2E 33: Los mon!meros son degradados por procesos especficos -asta $cetil7 *o$. 2e produce algo de $%&. :luc!lisis, 7o+idaci!n, transaminaci!n. /$2E 333: El $cetil7*o$ es o+idado -asta * ) y A) ,originando gran cantidad de <$4A #& 4E0 0E4C*% 0' y $%&. curre en la mitocondria . %ambin se genera $%& en la fosforilaci!n o+idativa.

2on rutas convergentes. Las principales rutas catab!licas son: $naer!bica #en el citoplasma': gluc!lisis, rotura de triglicridos, desaminaci!n y transaminaci!n. $naer!bica #en la mitocondria': transporte electr!nica y 7o+idaci!n. $er!bica #en la mitocondria': /osforilaci!n o+idativa.

$<$6 L325 *omienza en la fase 333 por los pequeDos compuestos originados en la fase 333 del catabolismo. En la fase 33 se forman los mon!meros y en la fase 3 se forman los polmeros. &or tanto son rutas divergentes. Las principales rutas anab!licas son: 4e 4e 4e 4e gl"cidos: gluconeogensis y glucogenogenesis. lpidos: sntesis de (cidos grasos, glicerina y triglicridos. protenas: traducci!n. (cidos nucleicos: replicaci!n y transcripci!n.

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El catabolismo y anabolismo son simult(neos y son interdependientes, pero < e+actamente las mismas reacciones en sentido contrario, debido a varios motivos:

2 <

5uc-as reacciones catab!licas son irreversibles, es decir, no -ay posibilidad de que ocurran en sentido contrario. Las rutas catab!licas y anab!licas pueden localizarse en distintos compartimentos La regulaci!n enzim(tica es distinta en casi todas los procesos.

Ej: la sntesis de glucosa #gluconeognesis' no es la inversa de la gluc!lisis. %3& 2 4E 5E%$6 L325 %odos los seres vivos necesitan materia para crecer y desarrollarse, requiriendo todo tipo de elementos. El elemento m(s importante es el carbono, ya que es el componente fundamental de todas las biomolculas. 2i la fuente de carbono es el carbono inorg(nico #* )', que es la forma m(s o+idada del carbono, y lo convierten en materia org(nica, es decir, son capaces de convertir la 53 en 5 , el metabolismo de ese ser vivo es $C%E%0 / o L3% %0 / . 2i la fuente de carbono es materia org(nica #carbono m(s o menos reducido, como glucosas, grasa, etc', ya que no pueden transformar la 53 en 5 , el metabolismo es AE%E0E%0 / u 0:$< %0 / . Los seres vivos tambin necesitan energa. 2i la fuente de energa es la luz #energa luminosa' el metabolismo es / %E%0 / #fotosinttico' y el ser vivo -ace fotosntesisF si pueden utilizar la energa qumica, liberada en reacciones qumicas de o+idaci!n contenidas en molculas que toman del e+terior, el metabolismo es GC353 %0 / o quimiosintticos. En los quimiotrofos la fuente de carbono y energa es la misma sustancia. *ombinando estos criterios, tenemos esta clasificaci!n:

%3& 2 0:$<325 /otolit!trofo #fotoaut!trofo aut!trofo fotosinttico'

4E

03:E< 4E E<E0:1$ Luz

L$

03:E< *$06 < * )

4EL

/otoorganotrofos #foto-eterotrofo I-eter!trofo fotosinttico' Guimiolit!trofos #quimioaut!trofos I aut!trofo quimiosinttico' Guimioorganotrofos

Luz

rg(nico

EHE5&L 4E 0:$<325 2 &lantas superiores, algas, cianobacterias, bacterias purp"reas del azufre y bacterias verdes del azufre 6acterias purp"reas no azufradas

0eacciones qumicas

* )

0eacciones qumicas

rg(nico

6acterias nitrificantes, bacterias incoloras del azufre $nimales, -ongos,

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#quimio-eterotrofos o -eterotrofo tpico'

protozoos, bacterias

muc-as

&$&EL 4E L 2 <C*LEE%34 2 4E $4E< 23<$ #$%&' @ 4E &30343<$ #<$4A @ <$4&A' E< EL 5E%$6 L325 .

&$&EL 4EL $%& En el metabolismo -ay reacciones que liberan energa y otras que la consumen. La liberaci!n y el consumo no deben porqu ocurrir al mismo tiempo ni en el mismo lugar. En la clula e+iste un mecanismo que almacena y transporta la energa desde donde se produce -asta los que se consume. Este mecanismo consiste en la formaci!n #almacena energa' y la ruptura de enlaces qumicos #la libera'. 4ic-os enlaces son los e)la!e& 4&ter 3%&3r !%& +e alta e)er-a #ricos en energa' del & &tema ADP5ATP #o par $%&7$4&' entre el )J y ,J y 1J7)J fosfatos. Es decir, el $%& es un nuclotido que, aparte de su papel estructural como componente de los (cidos nucleicos, desempeDa un papel crucial en el metabolismo, ya que e& la ma)era m/& e3 !a* +e alma!e)ar 6 tra)&(%rtar e)er-a. &or ello se le denomina m%)e+a e)er-4t !a de la clula , aunque tambin se utilizan otros nucle!tidos como el :%&, C%&, *%&. Este papel lo -ace as: 1. 2uministra energa para reacciones no espont(neas #biosntesis, como la traducci!n, replicaci!n' o funciones celulares como la contracci!n muscular, movimiento de cilios o el transporte activo. Lo -ace -idrolizando el primer fosfato #rompiendo el primer enlace ster7 fosf!rico', y por tanto perdindole, es decir, el $%& se +e&3%&3%r la o se 7 +r%l *a. La energa liberada en esta -idr!lisis es utilizada en las reacciones anteriores. 2e dice que ambos procesos est(n acoplados. 2i lo necesita, de la misma manera el $4& tambin puede -idrolizar el segundo fosfato, y convertirse en $5&, liberando la misma cantidad de energa. $l -idrolizarse cada fosfato del $%& libera muc-a energa, unas 1) ;calKmol en las condiciones celulares, y en condiciones e+perimentales, unas L,, ;calKmol.

L,, ;calKmol
4efosforilaci!n del

L,, ;calKmol

$%& M A)

$4&

$%&

M &i

$5& M &i

4efosforilaci!n del $4&

L,, ;calKmol

L,, ;calKmol

tra funci!n del $%& es la activaci!n de un metabolito para que pueda reaccionar en una va metab!lica, se -ace con la fosforilaci!n de dic-a molcula, que consiste en la adici!n de un grupo fosfato a dic-a molcula., como ocurre en el paso de la glucosa a glucosa79.fosfato para iniciar la gluc!lisis.

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). $cumula energa, formando enlaces de alta energa. 2e produce una sntesis de $%& por fosforilaci!n del $4&, proceso no espont(neo que est( acoplado a otros que sean muy e+oerg!nicos, es decir, que liberan muc-a energa, como la fosforilaci!n o+idativa o fotofosforilaci!n. Aay tres procesos en los que se sintetiza $%& a partir de $4&:

1.

8%&3%r la! ) a ) vel +e &u&trat% . En este caso un sustrato rompe alg"n enlace rico en energa, esta se libera y se aprovec-a para fosforilar el $4&. 3nterviene las quinasas. Esto ocurre en la gluc!lisis y en el ciclo de ?rebs.

). /osforilaci!n o+idativa, acoplada al transporte electr!nico en la membrana interna de la mitocondria. ,. /osforilaci!n fotosinttica o fotosfoforilaci!n electr!nico en los tilacoides de cloroplasto. acoplada al transporte

En los dos "ltimos casos intervienen una protenas de membrana denominadas $%&7 sintasa, o tambin partculas /o #mitocondria' o */ #cloroplasto'. /osfoforilan el $4& al aprovec-ar una corriente de protones que las atraviesa. 2e e+plica con la -ip!tesis quimiosm!tica de 5itc-ell.

&$&EL 4EL <$4A @ <$4&A #<C*LEE%34 2 4E &30343<$'. & 4E0 0E4C*% 0 5uc-as reacciones del metabolismo son procesos redo+ u o+idorreducci!n, es decir, una molcula se o+ida y otra se reduce. *omo un (tomo de -idr!geno est( formado por un electr!n, perder un electr!n equivale a perder un (tomo de -idr!geno, y reducirse a ganarlo. Aay una relaci!n entre el contenido de -idr!genos de una molcula y la cantidad de energa que se puede obtener de ella. *uanto mayor sea el contenido en -idr!geno de un compuesto #cu(nto m(s reducido est' mayor es su contenido energtico y m(s energa se puede sacar de l. *uanto m(s o+idada est una sustancia menos energa contiene. La energa de una molcula est( en sus enlaces. $s, los (cidos grasos #*A,7#*A)'1.7* A suministran muc-o m(s energa que la glucosa #*9A1)O9' y sta muc-o m(s que el * ) #sin -idr!genos, es la forma m(s o+idada del carbono'. Los electrones arrancados a una molcula $ debe ganarlos otra molcula 6, y de una a otra son transportados por dos compuestos especializados en ello: <$4 y /$4. Estos dos nucle!tidos act"an como coenzimas de enzimas des-idrogenasas u o+idasas y participan en el metabolismo como molculas transportadoras de -idr!genos #electrones' en reacciones redo+. *uando un sustrato se o+ida, captan los electrones y se reducen, cuando un sustrato se reduce, se los ceden y se o+idan. *uando estos coenzimas se reducen los ceden a otras

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molculas aceptoras de -idr!genos # o electrones'. En el caso de la respiraci!n aer!bica el aceptor final de electrones es el o+geno, en el caso de la fermentaci!n es el pir"vico.

+idaci!n del sustrato <$4 M $A) <$4A M $ 0educci!n del sustrato <$4 : nicotin7adenin7dinucle!tido <$4& nicotin7adenin7dinucle!tido fosfato /$4 flavin7adenin7dincule!tido
M

&eden estar o+idados o reducidos. 2e indican as: Estado o+idado correctamente <$4M, <$4&M, /$4, incorrectamente <$4, <$4&. Estado reducido correctamente <$4A M A M, <$4&A M AM , /$4A), incorrectamente <$4A), <$4&A),

El <$4 y /$4 se utilizan en procesos respiratorios, y el <$4& en la biosntesis de molculas org(nicas. EL *$%$6 L325 Es la fase degradativa del metabolismo y su objetivo principal es la obtenci!n de energa para la clula. En l las molculas org(nicas son transformadas en otras m(s sencillas como * ), agua, amonaco, urea, (cido "rico, #residuos metab!licos' que son eliminados como productos de e+creci!n. En esta degradaci!n, la energa contendida en los enlaces covalentes de estas molculas es liberada y almacenado en los enlaces fosfato del $%&. Este $%& es utilizado posteriormente para el anabolismo o para realizar funciones celulares.

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Molculas orgnicas reducidas Glcidos, lpidos, protenas

Molculas orgnicas co"ple#as $olsacridos, cidos nucleicos, protenas

%&$ N%'H N%'$H

Residuos catablicos oxidados CO2, NH , H2O

%'$ N%'( N%'$(

Molulas orgnicas sencillas !cidos grasos, "onosacridos, a"inocidos

Las reacciones catab!licas son reacciones de o+idaci!n, es decir, de prdida de electrones. Las molculas org(nicas #formadas sobre todo por * e A' se o+idan de dos formas: perdiendo -idr!genos #des-idrogenaci!n' o incorporando o+genos #o+igenaci!n'. %ipos de catabolismo 1' 2eg"n sea la molcula aceptora final de los electrones: a' /ermentaci!n, si es una molcula org(nica, como el (cido pir"vico b' 0espiraci!n, si es inorg(nico #si es el o+geno y se convierte en agua se llama aer!bica o anaer!bica #si es el nitrato #se convierte en nitrito', el sulfato #se convierte en sulfito' )' 2eg"n el grado de o+idaci!n de la molcula inicial a' /ermentaci!n, si la o+idaci!n es parcial o incompleta b' 0espiraci!n, si la o+idaci!n es total o completa En realidad estos dos criterios son equivalentes 2e puede degradar en el catabolismo los gl"cidos, los lpidos y las protenas *$%$6 L325 4E :LP*34 2

El gl"cido m(s utilizado e importante para las clulas como fuente de energa es la glucosa. La glucosa tiene distintos procedencias#ver fotocopia':

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:luc!lisis *iclo de ?rebs &or respiraci!n 0espiraci!n *adena de transporte electr!nico :lucosa :luc!lisis &or fermentaci!n /ermentaci!n
6$L$<*E E<E0:R%3* 4E L$ /E05E<%$*3E< A' M ) $%&M ) <$4AM M AM

*9A1) 9 777 ) #*A,7* 7* 6$L$<*E E<E0:R%3* *9A1) 9 M 9

/3<$L 4E L$ 0E2&30$*3E<

) 777 9 * ) M 9 A)O M ,Q $%&

4e los ,Q $%&, ) se forman en el citoplasma por gluc!lisis y ,9 en la mitocondria por fosforilaci!n. 4e los ,Q $%&, . se forman por fosforilaci!n en el (mbito de sustrato y ,. por fosforilaci!n S34$%3T$ %0 6$L$<*E: ) $%&

*itoplasma 777777gluc!lisis777777

5itocondria #matriz' 5embrana interna ) <$4A ) #de la gluc!lisis' 77777777 ) <$4A) I 9 $%& ) (cido pir"vico #acetil *o$' ...7777 ) <$4A) I 9 $%& ?rebs 9 <$4A) I 1Q $%& 5etabolismo U

) /$4A) I . $%& ) :%& I ) $%& % %$L I ,Q $%& La respiraci!n es similar a una combusti!n porque es la reacci!n entre una sustancia con el o+geno, pero tiene dos diferencias: La combusti!n es un proceso incontrolado, esto origina una enorme prdida de energa "til. La respiraci!n est( controlada por enzimas, por lo que la energa se libera gradualmente y apenas se pierde. En la combusti!n la energa se pierde en forma de calor y luz. En la respiraci!n se pierde en forma de calor #poco' y nula en luz, casi toda se aprovec-a y se almacena como energa qumica #$%&'.

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1O

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