A pesar de que tomo significa indivisible, en realidad est formado por varias partculas subatmicas.

El tomo contiene protones, neutrones y electrones, con la excepcin del hidrgeno1, que no contiene neutrones, y del catin hidrgeno o hidrn, que no contiene electrones. Los protones y neutrones del tomo se denominan nucleones, por formar parte del ncleo atmico. El electrn es la partcula ms ligera de cuantas componen el tomo, con una masa de 9,11 1031 kg. Tiene una carga elctrica negativa, cuya magnitud se define como la carga elctrica elemental, y se ignora si posee subestructura, por lo que se lo considera una partcula elemental. Los protones tienen una masa de 1,67 1027 kg, 1836 veces la del electrn, y una carga positiva opuesta a la de este. Los neutrones tienen un masa de 1,69 1027 kg, 1839 veces la del electrn, y no poseen carga elctrica. Las masas de ambos nucleones son ligeramente inferiores dentro del ncleo, debido a la energa potencial del mismo; y sus tamaos son similares, con un radio del orden de 8 10-16 m o 0,8 femtmetros (fm).4 El protn y el neutrn no son partculas elementales, sino que constituyen un estado ligado de quarks u y d, partculas fundamentales recogidas en el modelo estndar de la fsica de partculas, con cargas elctricas iguales a +2/3 y 1/3 respectivamente, respecto de la carga elemental. Un protn contiene dos quarks u y un quark d, mientras que el neutrn contiene dos d y un u, en consonancia con la carga de ambos. Los quarks se mantienen unidos mediante la fuerza nuclear fuerte, mediada por gluones del mismo modo que la fuerza electromagntica est mediada por fotones. Adems de estas, existen otras partculas subatmicas en el modelo estndar: ms tipos de quarks, leptones cargados (similares al electrn), etc.

El tomo es un constituyente de la materia ordinaria, con propiedades qumicas bien definidas, formado a su vez por constituyentes ms elementales sin propiedades qumicas bien definidas. Cada elemento qumico est formado por tomos del mismo tipo (con la misma estructura electrnica bsica), y que no es posible dividir mediante procesos qumicos. Actualmente se conoce que el tomo est compuesto por un ncleo atmico, en el que se concentra casi toda su masa, rodeado de una nube de electrones. Esto fue descubierto a principios del siglo XX, ya que durante el siglo XIX se haba pensado que los tomos eran indivisibles, de ah su nombre a-tmo- 'sin partes'. Poco despus se descubri que tambin el ncleo est formado por partes, como los protones, con carga positiva, y neutrones, elctricamente neutros.nota 1 Los electrones, cargados negativamente, permanecen ligados a este mediante la fuerza electromagntica. Los tomos se clasifican de acuerdo al nmero de protones y neutrones que contenga su ncleo. El nmero de protones o nmero atmico determina su elemento qumico, y el nmero de neutrones determina su istopo. Un tomo con el mismo nmero de protones que de electrones es elctricamente neutro. Si por el contrario posee un exceso de protones o de electrones, su carga neta es positiva o negativa, y se denomina ion.