BIENVENIDOS A la unidad didctica

Dr. MYNOR LEIVA E.

Como esta organizada la unidad didctica de bioqumica

Oficina 214. Coordinador: Dr. Estuardo Pacheco. 10 catedrticos. 2 tcnicos de laboratorio. (of 213). Durante el ao se realizan 4 rotaciones (rotan los catedrticos, no los alumnos). Se realizan 5 exmenes parciales de 8 puntos cada uno : total 40 puntos netos acumulados por parciales.

Como funcionan las rotaciones

Sem

Fecha

Contenido de Clases
Generalidades de Enzimas Vitaminas Liposolubles Vit. Hidrosolubles Carbohidrados D/Abs.

Actividad Prctica
Orientacin General Informacin General Lab. 1 Fotometria Lab.2 Hidrlisis almidn C Cl 1 A.Megaloblstica Lab. 3 Dieta/Nutricin Lab. 3 Dieta/Nutricin

Asistencia

Docente

1. 2. 3. 4. 5. 6-7. 8.

16-20 Ene. 23-27 Ene. 30-03 Feb. 06-10 Feb. 13-17 Feb.
20-24 Feb.

Las 2 rot. Las 2 rot. Las 2 rot. Las 2 rot. Las 2 rot. 1. Rot 2. Rot

Gluclisis y Gluconeognesis
Metabolismo de Glucgeno Va de la pentosa fosfato

27-03 Mar. 05-09 Mar. 12-16 Mar.

9.

PRIMER EXAMEN PARCIAL TEORIA (Semanas 1-7)

Lpidos D/Abs.

Lab. 4 Glicemia/Trab. 1. R.

Las 2 rot.

Como funcionan las rotaciones

LABORATORIO Y CASOS CLNICOS
hora lunes martes mircoles jueves

Saln 207 8:00 Saln 207 10:00

21 Y 27
31 Y 36

11 Y 16
01 Y 06

MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO Y CASOS CLNICOS

Obligatorio de 8. Edicin. Nueva edicin, nuevo contenido. Costo Q50.00 por manual. Hay examen de inicio y finalizacin de cada laboratorio o caso clnico: 1 punto examen inicial 1 punto examen final 2 puntos en cada actividad Total en ao 36 puntos (9 Prcticas, 9 Casos Clnicos) 1 trabajo de grupo: revisin de Caso Clnico: 2 puntos Elaboracin de mapa metablico (longitudinal), 2 puntos. ZONA QUE PUEDE ACUMULARSE DURANTE EL AO: 40 pts.

LIBROS OBLIGATORIOS

Congreso anual de Ciencias Bsicas

septiembre

2012

Generalidades de enzimas
Docencia de BIOQUIMICA UNIVERSIDAD DE SAN CARLOS DE GUATEMALA Facultad de Ciencias Mdicas 2,012. Dr. Mynor A. Leiva Enrquez

Qu son las enzimas?

ACELERADORES BIOLGICOS de Reacciones moleculares que ocurriran muy lentamente.

Desde los nutrientes hasta obtener energa o nuevos tejidos.

Nutriente *digestin elementos asimilables. Micronutrientes *absorcin *componentes del plasma. Glucosa *espacio celular A) **energa, agua, CO2 B) **nuevos componentes celulares
o **Crecimiento, **reparacin de tejidos

 Protenas sintetizadas por las clulas, en respuesta al requerimiento metablico. Es un catalizador biolgico que reduce el gasto de energa de una transicin molecular. Enzima + Sustrato(s) * Producto(s)

ENZIMAS
Impulsa directamente el acontecimiento cataltico * Vuelve a su estado original. Especificidad ptica (estereoespecfica) y Especificidad de Grupo.

Cul es la Naturaleza qumica de las enzimas? PROTEINAS RIBOZIMAS

PARTES DE UNA REACCIN MEDIADA POR ENZIMA

enzima

coenzima

sustrato

productos

papel de las enzimas en el metabolismo

Fuente: Bioqumica de Baynes, 3. Ed.

Condiciones para que se d una reaccin enzimtica

Temperatura
Mamferos 37

Bacterias y algas
Bacterias rticas

aprox. 100
aprox.

pH
Factor Q10

Otros: sustratos, productos, molculas intermedias, y las molculas reguladoras.

Especificidad de la enzima
Especificidad de la reaccin
Determinada quimicamente por los aa del centro cataltico de la enzima.

Vista en 3D de la conformacin de la trada cataltica His-Asp-Ser en la serina proteasa : quimotripsina. Las lneas discontnuas representan enlaces de hidrgeno.

Especificidad de la enzima
Especificidad al sustrato:
o Depende de: Tamao Estructura Cargas Polaridad Carcter hidrfobo del lugar de fijacin.

AJUSTE INDUCIDO

Fuente: Bioqumica de Baynes, 3. Ed.

Especificidad del sustrato

La fuerzas NO covalentes de unin entre enzimas y sustrato involucran: o Interacciones de Vander Waals o Electrostticas o Puentes de hidrgeno o hidrfobas

Complejo Enzima Sustrato La complementariedad geomtrica y electrnica entre la enzima y el sustrato, dependen de fuerzas no covalentes. Los grupos hidrfobos estn representados por una letra h en crculo caf. Las lneas punteadas representan puentes de hidrgeno.
Fuente: Bioqumica de VOET, 2. Ed.

Fuente: Bioqumica de Baynes, 3. Ed.

especificidad de la enzima

Estereoespecificidad
Una reaccin es estereoespecfica si reactivos que difieren slo en su estereoisomera son transformados preferentemente o exclusivamente en productos que se diferencian tambin slo en su estereoisomera. Esto es, la estereoqumica de los reactivos de partida condiciona la estereoqumica de los productos resultantes.
Fuente: Bioqumica de VOET, 2. Ed.

Secuencia de una reaccin enzimtica:

1)La enzima est disponible, con su sitio activo libre.
2) El sustrato se une a la enzima. 3) El sustrato es procesado (hidrlisis en este ejemplo). 4) Los productos de la reaccin son liberados.

DEFINICIONES

Apoenzima Coenzima Holoenzima

Las Coenzimas
Funcionan como lanzaderas de grupos desde el lugar donde se generan hacia el lugar donde se utilizan. Pueden trasladar Hidrgenos. Pueden trasladar grupos diferentes del hidrgeno como metilo, acilo, oligosacridos.

Cofactores
Inorgnico: Fe2+, Mn2+, Zn2+, Cu2+, etc.

Iones metlicos Su requerimiento Explica los efectos txicos de ciertos metales pesados como Cd2+, y Hg2+.

Los Cofactores
Se enlazan de manera transitoria y disociable a la enzima o al sustrato. Ejemplos: el ATP, los iones metlicos libres. Dan lugar a las enzimas activadas por metales.

Grupos prostticos
Estan asociados permanentemente a la protena, a menudo con enlaces covalentes. (GRUPO HEM DE Hemoglobina y Citocromos).

Grupos prostticos
Los grupos prostticos forman parte estructural (estable) de las enzimas. Ejemplos: FAD, FMN, PPT, Biotina. Los metales Co, Cu, Mg, Se y Zn. forman metaloenzimas.

coenzimas

Molculas orgnicas Algunas actan como co-sustratos (segundo sustrato).

coenzimas

Molculas orgnicas Algunas actan como co-sustratos (segundo sustrato).

coenzimas

Molculas orgnicas Algunas actan como co-sustratos (segundo sustrato).

coenzimas

Molculas orgnicas Algunas actan como co-sustratos (segundo sustrato).

isoenzimas
FORMAS FISICAMENTE DIFERENTES CON UNA MISMA ACTIVIDAD ENZIMTICA. Ejemplo:
o o o o o

Lactato Deshidrogenasa.
LDH1: M M M M (abundante en el corazon, el cerebro y los eritrocitos; alrededor del 33 % de la LDH en el suero humano es de este tipo)

MMMM HMMM HHMM HHHM HHHH

LDH2: M M M H (abundante en el corazon, el cerebro y los eritrocitos; alrededor del 45 % de la LDH en el suero humano es de este tipo)
LDH3: M M H H (abundante en el cerebro, los rinones y los pulmones; constituye alrededor del 18 % de la LDH en suero humano)

LDH4: M H H H ((abundante en el higado, musculo esqueletico y el tejido renal; constituye alrededor del 3 % de la LDH serica)
LDH5: H H H H ((abundante en el tejido hepatico, musculo esqueletico y el ileum; apenas hasta 1 % de la LDH del suero humano es LDH5)

isoenzimas
FORMAS FISICAMENTE DIFERENTES CON UNA MISMA ACTIVIDAD ENZIMTICA. Ejemplo:
o o o o o

Lactato Deshidrogenasa.

LDH1: M M M M (abundante en el corazon, el cerebro y los MMMM eritrocitos; alrededor del 33 % de la LDH en el suero humano es de HMMM este tipo) HHMM LDH2: M M M H (abundante en el corazon, el cerebro y los eritrocitos; HHHM alrededor del 45 % de la LDH en el suero humano es de este tipo) HHHH LDH3: M M H H (abundante en el cerebro, los rinones y los pulmones; constituye alrededor del 18 % de la LDH en suero humano)

LDH4: M H H H ((abundante en el higado, musculo esqueletico y el tejido renal; constituye alrededor del 3 % de la LDH serica)
LDH5: H H H H ((abundante en el tejido hepatico, musculo esqueletico y el ileum; apenas hasta 1 % de la LDH del suero humano es LDH5)
Fuente: Bioqumica de Baynes, 3. Ed.

MECANISMO DE ACCIN
Catlisis cido-base Catlisis covalente Catlisis de iones metlicos Efectos de proximidad y orientacin Unin preferencial del complejo de transicin.

Mecanismos de accin
Catlisis cido-base: reaccin por transferencia o aceptacin de protones. Sensible a pH. Catlisis covalente: acelera la velocidad de reaccin mediante la formacin transitoria de un enlace covalente entre la enzima y el sustrato.

Mecanismo de Accin
Catlisis por iones metlicos: -Se une al Sustrato orientndolo. - mediacin de reacciones O-R - proteccin de cargas negativas. Catlisis por proximidad y orientacin: o los reactivos deben acercarse con la correcta relacin espacial para que se de la reaccin.

Mecanismo de Accin
Catlisis por fijacin de estado de transicin: cuando la enzima se une al estado de transicin con ms facilidad que al sustrato o producto, lo que aumenta su concentracin. En consecuencia la velocidad de reaccin.

Clasificacin Enzimtica
NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS
1- Oxidorreductasas: reacciones oxido-reduccin
2- Transferasas: transfieren grupos funcionales 3- Hidrolasas 4- Liasas hidrlisis adicin de dobles enlaces

5- Isomerasas
6- Ligasas

forman ismeros
forman enlaces (acoplado a hidrlisis de ATP)

Fuente: Bioqumica de Baynes, 3. Ed.

1. OXIDORREDUCTASAS
catalizan reacciones de oxidacin-reduccin:

1. Oxidorreductasas
Oxidacin con NAD+ EC 1.1.1.1
Alcohol Deshidrogenasa

NAD+

NADH + H+

Etanol
Acetaldehdo

2. TRANSFERASAS
Catalizan la transferencia de grupos que contienen C, N, o P

2. Transferasas
Transferencia de Grupo Fosfrico
GLUCOCINASA

EC 2.7.1.2

HEXOCINASA

ATP
a- D- GLUCOSA

ADP a- D- GLUCOSA-6-P

3. HIDROLASAS
Catalizan la ruptura de enlaces por la adicin de una molcula de agua

3. Hidrolasas
Ruptura de enlace peptdico R-CN-R
EC 3,4,17,1

CARBOXIPEPTIDASA - A

Extremo C del pptido

Pptido recortado

Aminocido libre

4. Liasas
EC. 4,1,1,1 DESCARBOXILACIN

PIRUVATO DESCARBOXILASA

PIRUVATO

ACETALDEHDO

5. ISOMERASAS
catalizan la racemizacin de ismeros pticos o geomtricos: Catalizan cambios
geomtricos o estructurales dentro de una molcula dando formas isomricas. 5.1 racemasas 5.2 cis-trans isomerasas Usan coenzimas.

5. Isomerasas
Cis Trans Isomerizacin Fumarato Isomerasa

FUMARATO (cis)

FUMARATO (trans)

6. LIGASAS
catalizan la formacin de enlaces entre C y O, S, N. Esta reaccin slo es posible mediante el aprovechamiento de fosfatos ricos en energa como el del fosfato de la molcula de ATP

6. Ligasas
EC 6,4,1,1

CARBOXILACIN
PIRUVATO CARBOXILASA
BIOTINA

6.1 c-o

6.2 c-s

6.3 c-n

6.4 c-c

REGULACION
Concentracin Enzimtica

induccin (DNA) represin (DNA) Vida media enzimtica

Modificacin covalente (fosforilacin y defosforilacin, ruptura o escisin). Modificacin alostrica (positiva y negativa)

Inhibidores
Reactivos qumicos especficos que pueden inhibir a la mayor parte de las enzimas.

Irreversibles INHIBIDORES Reversibles

Inhibidor Irreversible
Inhibicin permanente
Unin irreversible por medio de enlaces covalentes.

Modificaciones qumicas de los grupos catalticos.

Modificada la enzima, est siempre inhibida. Para distinguirlo de los reversible se someten a dilisis y si no se separan enzima e inhibidor, ste es permanente.

Inhibidor Irreversible
Fluorofosfato de diisopropilo (DFP)

Acetilcolina
Acetilcolinesterasa

Acetato + Colina

Inhibidor Irreversible
Fluorofosfato de diisopropilo

(DFP)

Acetilcolinesterasa

Tripsina
Elastasa Fosfoglucomutasa Cocoonasa (larvas de gusanos de seda
Malatin

Fluorofosfato de diisopropilo (DFP)

Serina

Iodoacetamida

Cistena

Histidina

Inhibidor Reversible
La unin del inhibidor y la enzima es reversible.
Al quitar el inhibidor del medio, se recupera la actividad. Hay 3 tipos:

Competitiva
No Competitivag

Inhibicin por producto

Un producto que puede unirse al sitio cataltico de la enzima al acumularse, por lo que puede regular la accin de la enzima

Inhibicin Competitiva

Inhibicin No Competitiva
El inhibidor NO se une al sitio activo

NO se puede revertir con un exceso de sustrato

Fuente: Bioqumica de Baynes, 3. Ed.

Enzimas Plasmticas
FUNCIONALES: ejercen su actividad en la circulacin sangunea, como los componentes de la coagulacin y del sistema de Complemento (es normal que
estn en el plasma haciendo un trabajo correcto en la circulacin).

NO FUNCIONALES: (no debieran estar en la

circulacin sangunea sino dentro de clulas) se asocian al dao de membranas de clulas

o tejidos:

o Citoplasmticas o Mitocondriales

dao tisular dao celular

Fuente: Bioqumica de Baynes, 3. Ed.

Enzimas sricas en Diagnstico

Aspartato Aminotransferasa AST Alanina Aminotransferasa ALT Amilasa Ceruloplasmina Creatincinasa Infarto del Miocardio Hepatitis Pancreatitis
(degeneracin hepatolenticular)

Enf. De Wilson

Trastornos musculares e infarto del miocardio

Enzimas sricas en Diagnstico

g-Glutamil Transferasa Lactato deshidrogenasa Lipasa Varias enfermedades hepticas Infarto de Miocardio Pancreatitis Aguda Carcinoma metastsico de la prstata Varios trastornos seos Enfermedades hepticas y obstruccin de vas biliares

Fosfatasa cida

Fosfatasa Alcalina

GRACIAS .