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Gentica - CMA

Aplicaes do Equilbrio de H&W


Carolina Lemos
1
Gentica das Populaes
2. Aplicaes do equilibrio de Hardy e
Weinberg
2
Gentica das Populaes:
aplicaes da lei de H&W
Gentica - CMA
Aplicaes do Equilbrio de H&W
Carolina Lemos
2
Aplicaes da Lei de H&W
1. Teste do equilbrio de H&W
2. Clculo de frequncias allicas (no caso
de dominncia completa)
3. Teste de modelos genticos (ex. ABO)
3
Exerccio - Aplicaes da lei de H&W:
testar o equilbrio numa populao
Considere uma populao com a seguinte
distribuio genotpica
a) Calcule as frequncias allicas da populao
b) Verifique se esta populao se encontra em
equilbrio de Hardy-Weinberg
4
A
1
A
1
A
1
A
2
A
2
A
2

225 540 235
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5
Teste para equilbrio de H & W
Hiptese nula: frequncias observadas no
so significativamente diferentes das
esperadas, em caso de equilbrio
p para cada classe
genotpica
Calcula-se a partir dos valores observados (O)
e esperados (E) [em nmero, no em percentagem]
Compara-se com distribuio qui-quadrado
com 1 grau de liberdade


=
E
E O
2
2
1
) (

Consequncias do equilbrio de Hardy


e Weinberg
No equilbrio, a estrutura gentica relativa a um locus
autossmico com 2 alelos pode ser definida por um nico
parmetro p. Isto porque q = 1-p e as frequncias
genotpicas so derivadas das frequncias allicas.
apenas 1 grau de liberdade
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Tabela de
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g.l.
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Graus de
liberdade
0.10 0.05 0.025 0.01 0.005 0.001
1 2.706 3.841 5.024 6.635 7.879 10.828
2 4.605 5.991 7.378 9.210 10.597 13.816
3 6.251 7.815 9.348 11.345 12.838 16.266
4 7.779 9.488 11.143 13.277 14.860 18.467
5 9.236 11.070 12.833 15.086 16.750 20.515
6 10.645 12.592 14.449 16.812 18.548 22.458
7 12.017 14.067 16.013 18.475 20.278 24.322
8 13.362 15.507 17.535 20.090 21.955 26.124
9 14.684 16.919 19.025 21.666 23.589 27.877
10 15.987 18.307 20.483 23.209 25.188 29.588

Dominncia completa
P + H Q
Gentipo: AA Aa aa
Fentipo: A a
p=P+1/2H
q=Q+1/2H
Como calcular frequncias allicas numa situao de
dominncia completa, ou seja, quando no se
distinguem os homozigotos AA dos heterozigotos (no
sabemos quais os valores de P e de H) ?
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Exerccio 1 - Aplicaes da lei de H&W
Clculo de frequncias allicas
no caso de dominncia completa:
Sabendo que cerca de 4% dos noruegueses so ruivos
(caracterstica autossmica recessiva), como poderemos
calcular as frequncias dos alelos para cabelo ruivo (r) e no-
ruivo (R)?
a) Qual a frequncia de heterozigotos?
b) Que proporo de todos os acasalamentos poderia
potencialmente dar origem a uma criana com cabelo ruivo?
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Exerccio 1 - Aplicaes da lei de H&W
Se assumirmos que a populao da Noruega
se encontra em equilbrio de H&W, no que diz
respeito cor do cabelo (ruivo e no-ruivo)
Q = q
2
a frequncia homozigotos rr
Q= 0.04 q = Q = 0.2 e p = 1-q = 0.8
a) H = 2x0.2x0.8 = 0.32 a frequncia dos
heterozigotos (portadores do alelo r)
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Exerccio 1 - Aplicaes da lei de H&W
b) Acasalamentos que podem dar origem a uma
criana com cabelo ruivo:
R/r x R/r 0.32 x 0.32 = 0.1024
R/r x r/r 0.32 x 0.04 x 2 = 0.0256
r/r x r/r 0.04 x 0.04 = 0.0016
TOTAL 0.1296
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Exerccio 2 - Aplicaes da lei de H&W
Clculo de frequncias allicas no caso de dominncia
completa:
Se numa dada populao a frequncia do albinismo (AR)
1/20000, como calcular a proporo de portadores (=
heterozigticos) para esta caracterstica
No albinismo (AR), os gentipos AA e Aa no se distinguem
(fenotipicamente); por isso no podemos calcular as frequncias
allicas directamente a partir das genotpicas.
Contudo, se assumirmos que a populao est em equilbrio de
H&W, podemos dizer que:
Q = q
2
, ou seja, calculamos a frequncia allica q a partir da
frequncia da doena na populao!
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Exerccio 2 - Aplicaes da lei de H&W
Clculo de frequncias allicas
no caso de dominncia completa e alelos raros:
Caractersticas recessivas de baixa frequncia
Homozigotos raros Heterozigotos
q
2
muito pequeno => q 0 => 2pq 2q
p 1
Albinismo: Q = 1/20.000 q = Q = 1/141
H = 2 x 1/141 x 140/141 1/70 2q
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Aplicaes aos estudos familiares
Estamos agora em condies de demonstrar que
a) Em relao a uma doena recessiva rara, um
indivduo no-afectado tem maior probabilidade de
ser homozigoto dominante do que portador
b) Em relao a uma doena dominante rara, um
indivduo afectado tem maior probabilidade de ser
heterozigoto do que de ser homozigoto para o alelo
mutado
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Aplicao da lei de H&W para
teste de modelos: exemplo do
locus ABO
H&W polialelismo (alelos mltiplos)
1. Frequncias allicas iniciais:
A
1
: p A
2
: q A
3
: r
p + q + r = 1
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H&W Acasalamentos ao acaso
2. Unio dos gmetas:
A
1
A
1
- p
2
A
1
A
2
- 2pq A
1
A
3
- 2pr A
2
A
2
- q
2
A
2
A
3
- 2qr A
3
A
3
- r
2

A
1
p
A
2
q
A
3
r
A
1
p A
1
A
1
p
2
A
1
A
2
pq
A
1
A
3
pr
A
2
q A
1
A
2
pq
A
2
A
2
q
2
A
2
A
3
qr
A
3
r
A
1
A
3
pr
A
2
A
3
qr
A
3
A
3
r
2
H&W polialelismo
(p+q+r)
2
= p
2
+ 2pq + 2pr + q
2
+ 2qr + r
2
= 1
3. Frequncias allicas resultantes ...
A
1
: p' = p
2
+pq+pr = p (p+q+r) = p
A
2
: q' = q
2
+pq+qr = q (p+q+r) = q
A
3
: r' = r
2
+pr+qr = r (p+q+r) = r
... aps uma gerao de acasalamento ao acaso!
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Gentica do sistema ABO
O sistema ABO foi descrito em 1900 por Landsteiner. A
primeira tentativa de explicao para os quatro fentipos
encontrados (A, B, O e AB) foi a da existncia de dois pares
de alelos independentes (dois loci portanto: A, O; e B, O,
com dominncia total de A e de B sobre O).
Felix Bernstein utilizou pela primeira vez a lei de H&W para
calcular estimativas das frequncias gnicas, demonstrando
que aquela interpretao estava errada e propondo o
modelo gentico de trs alelos (A, B, O) num nico locus,
com dominncia de A e B sobre O, produzindo seis
gentipos e os quatro fentipos conhecidos.
Como testar as duas hipteses?
Progenitores Descendentes esperados
2 loci Alelos mltiplos
O x O O O
O x A O, A O, A
O x B O, B O, B
A x A O, A O, A
A x B O, A, B, AB O, A, B, AB
B x B O, B O, B
O x AB O, A, B, AB A, B
A x AB O, A, B, AB A, B, AB
B x AB O, A, B, AB A, B, AB
AB x AB O, A, B, AB A, B, AB
No estudo dos vrios tipos de acasalamentos, no foram encontrados os
tipos de descendentes esperados para modelo de 2 loci
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Como testar as duas hipteses?
Bernstein analisou um nmero grande de
populaes em que as propores
fenotpicas se desviavam sitematicamente
das propores previstas para o modelo de 2
loci, mas estavam de acordo com o modelo
de um locus com trs alelos
Frequncias esperadas para o modelo de
alelos mltiplos
. No caso do sistema ABO (trs alelos), fazemos p a
frequncia do gene A, q a do gene B e r a do gene O.
Segundo a lei de H&W, se o modelo proposto estivesse
correcto, deveramos encontrar ento frequncias
genotpicas que seriam o simples produto das
respectivas frequncias allicas individuais, ou seja:
AA=p
2
, AB=2pq, AO=2pr, BB=q
2
, BO=2qr, OO=r
2
p+q+r=1 e p
2
+2pq+2pr+q
2
+2qr+r
2
= (p+q+r)
2
= 1
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Frequncias esperadas para o modelo de
alelos mltiplos
Frequncias esperadas no modelo de alelos mltiplos
Assim, temos que a proporo de
sujeitos em cada fentipo seria o
seguinte:
O=(OO)=r
2
B=(BO+BB)=2qr+q
2
A=(AO+AA)=2pr+p
2
AB=(AB)=2pq
Comentrio a estas frmulas
Enquanto que as frmulas de equilbrio de H&W para um
locus com 3 alelos mltiplos so gerais
as frmulas anteriores (referentes ao locus ABO) so
especficas, pois dependem da relao de dominncia (A
sobre O e B sobre O) ou codominncia (de A e B)
A
1
A
1
- p
2
A
1
A
2
- 2pq A
1
A
3
- 2pr A
2
A
2
- q
2
A
2
A
3
- 2qr A
3
A
3
- r
2