INTRODUCCIN

-Reglas y mecanismos que determinan que en cada cell slo se exprese

especficamente una seleccin de genes.
-Cells procedentes de una misma cell (cigoto) y conteniendo el mismo
DNAfunciones diferentes en cada rgano
-Proporcin genes expresados en cada tipo cell, una cell expresa en cada
momento un 10-20% del total de genes.
-Algunas protenas son abundantes en las cells especializadas en las que
actan pero no se detectan en otro tipo cell (hemoglobina slo en
eritrocitos)
-Las necesidades al algunos productos gnicos cambian a lo largo del
tiempo (Las necesidades de enzimas pueden aumentar o disminuir en la medida en que las
fuentes de alimentacin cambian o se reducen).
-Influencia sobre la expresin de cada gen en el desarrollo, necesidades
metablicas, respuesta a agentes externos, etc (cell higado en presencia
de glucocorticoides)
-Se han identificado miles de secuencias de DNA, cada una de las cuales
es reconocida por una protena reguladora o por una serie de protenas
muy relacionadas entre s.
Funciones de las protenas codificadas por los genes humanos
Flexibilidad en la expresin gnica es la aparicin en cada tipo cell de protenas en proporciones diversas
Expresi n gni ca consti tuti vaGenes que se requi eren en todo el ti empo, se expresan
a un ni vel ctegenes consti tuti vos
Expresi n gni ca regul adaproductos gni cos cuyos ni vel es aumentan o di smi nuyen
en respuesta a seal es mol ecul ares:
-Productos gni cos que aumentan de concentraci ni nduci bl es
-Productos gni cos que di smi nuyen de concentraci nrepresi bl es
NIVELES DE REGULACIN DE LA
EXPRESIN GNICA EN EUCARIOTAS
2- CONTROL PRETRANSCRIPCIONAL
a) Posicin precisa de
los nucleosomas
b) Retirada de los
nucleosomas
c) Avance
compatible con
la presencia de
nucleosomas
La transcripcin no puede tener lugar sobre DNA en estados de condensacin
superiores a la fibra de 10 nm
Descondensacin previa del cromosoma durante la interfase,
combinacin de 3 mecanismos:
Un factor importante en los mecanismos b y c anteriores es la acetilacin de las
histonas de la partcula ncleo
Los genes activos corresponden a regiones con histonas acetiladas
3- REGULACIN GENTICA DE LA
TRANSCRIPCIN: control de cundo y
cmo un gen se transcribe
a) Promotor Factores cis (misma molcula de DNA cuya expresin regulan)
b) Factores de transcripcin (TF) Factores trans (sus genes
estn en posicin alejada y no relacionada con aquella que regulan)
A cada promotor se pueden unir un nmero variable de factores de
transcripcin, que actan favoreciendo o dificultando la unin y la
actividad de la RNA pol, determinando la posicin y eficacia del
inicio de la transcripcin
Genes de la clase II transcritos por la RNA pol IISntesis de
mRNA sntesis de protenas
- La expresin de la mayora de los genes se controla en el inicio de la transcripcin
Secuencias o elementos basales del promotor: pto inicio
5 TATANAA NYYANT/AYY 3
Secuencia TATA Secuencia Inr
-15 a -25 -3 +1 +5
Secuencias o elementos proximales del promotor: frec.
5 3 GGGCGG CCAAT GGGCGG
-120 -90 -60 -30
Secuencia CAAT. Son ms vari adas que l as basal es
Varios miles de pb, genes inducibles (aquel l os que no se
expresan conti nuamente en l a cel l , regul aci n como respuesta a seal es)
(promotores activadores o inhibidores). Eficacia.sec
variadas y especficas para cada gen.
Promotores de los genes de clase II
Secuencias o elementos distales del promotor:
(secuencias promotoras basales ms comunes)
Factores de transcripcin de
la clase II:
Factores de transcripcin generales
Factores de transcripcin proximales
Factores de transcripcin inducibles
FACTORES DE
TRANSCRIPCIN
GENERALES
(reconocen el promotor basal)
Definen el pto de inicio de la transcripcin. Se unen a
todos los promotores usados por la RNA pol II, son
diferentes de las protenas reguladoras de la expresin
gnica que slo actan en determinados genes
Reconoce TATA
Helicasa y quinasa
FACTORES DE TRANSCRIPCIN PROXIMALES E INDUCIBLES
Reconocen promotor proxi mal
Aumentan l a efi ci enci a de formaci n del compl ej o de i ni ci o o favorecen su acti vi dad
sobre l a pol i merasa
Expresi n basal - Genes consti tuti vos: expresan de
manera constante, housekeepi ng genes
Expresi n regul ada- Genes i nduci bl es: expresan en
momentos especfi cos o en tej i dos parti cul ares
Faci l i tan l a formaci n y
acti vi dad del compl ej o de
i ni ci o , o por el contrari o l a
di fi cul tan
Los receptores nucl eares para hormonas esteroi des o ti roi deas: l a uni n de l a hormona
cambi a l a conformaci n del R, que acta como factor de transcri pci n al aumentar su
afi ni dad por ci ertos promotores di stal es (HRE). Como consecuenci a se acti va o se
bl oquea, segn l os casos, l a transcri pci n de genes especfi cos
INTERACCIN DE LOS FACTORES DE TRANSCRIPCIN CON LA
POLIMERASA
Fl exi bi lidad de l a
cadena de DNA,
permi te aproxi maci n
fsi ca a pesar de l a
l ej ana en l a sec. l i neal
Regi n de control de un gen:
-promotor: factores general es+RNA pol
-Secuenci as regul adoras: protenas
regul adoras (acti vadores o represores)
-Baj o n de factores de transcri pci n
general es
-Mi l es de protenas regul adoras (30000
genes5-10% codi fi can prot.regul adoras
Una sl a protena puede control ar l a expresi n de un conj unto de genes: efecto combi natori o
Uno de los ejempl os mejor conoci dos de regi n regul adora compleja en
mamferos es el del gen de -globi na humano, que se expresa
excl usi vamente en eritroci tos y en un momento determinado de su
desarrollo
La expresi n del gen est control ada por un conj unto compl ej o de protenas
regul adoras, al gunas de l as cual es actan como acti vadores y otras como represores
Las concentraci ones de muchas de estas protenas cambi an durante el desarrol l o, y que
sl o una combi naci n parti cul ar de todas el l as i nduce l a transcri pci n del gen.
Cada uno de l os genes de l a gl obi na ti ene su propi o grupo de protenas regul adoras
necesari as para acti var el gen en el momento y tej i do apropi ado.
En cel l s donde no se expresa l os genes de gl obi na, todo el grupo de genes se encuentra
estrechamente empaquetado en forma de cromati na, en cambi o en eri troci tos, todo el
grupo se encuentra empaquetado en nucl eosomas
REGULACIN EPIGENTICA: METILACIN DEL DNA
Y CONTROL DE LA EXPRESIN
CANCER: El evada expresi n de
meti l asa y desmeti l asa
-hi pometi l aci n: expresi n
genes que habi tual mente estn
si l enci ados
-hi permeti l acin: no expresi n
de genes supresores de
tumores
Los genes que se
transcri ben acti vamente en
ci ertos tej i dos poseen
i sl otes CpG si n meti l ar,
mi entras que en l os tej i dos
donde el gen no se expresa
si estn meti l ados
Impidiendo la unin de TF
La metilacin es reconocida por
protenas bloqueando el avance
Explica la diversidad morfolgica y funcional de cells con un mismo genoma, residuos de C metiladas 3%
Las sec metiladas
impiden la unin de
los TF
La metilacin es reconocida por protenas
4- Regulacin
postranscripcional
y pretraduccional
de la expresin
gnica
REGULACIN DE LA MADURACIN DEL RNA
Spl i ci ng alternati vo. Puede produci r di sti ntas formas de 1 protena a partir de un mi smo
gen
Exi ste una ambi guedad en el i ntrn: el mecani smo estrdar de spli ceosoma que eli mi na
l os i ntrones es i ncapaz de di ferenci ar cl aramente entre 2 o + apareami entos al ternati vos
de ptos de maduraci n 5y 3de tal modo que en ocasi ones di stintas toma deci si ones
di sti ntas de forma fortui tamaduraci n al ternati va consti tuti va se producen vari as
versi ones de protenas codifi cadas por el gen en todas l as cells en las que ste se
expresa.
Maduraci n al ternati va regul ada:
negati va: protena regul adora que evi ta que l a maqui nari a acceda a l a secuenci a de
maduraci n en el RNA,
posi ti va: protenas regul adoras que di ri ge l a maqui nari a hacia una secuenci a de
procesami ento que de otra forma quedara ocul ta.
El bl oqueo de un l ugar fuerte de procesami ento expone a menudo un l ugar dbil y da
l ugar a un patrn di sti nto de procesami ento
Gen de la troponina T
Isoforma en mscul o l i so (no exn 4)
Isoforma en otros tej i dos (no exn 3)
Gen de la cadena
pesada de la IgM
IgM membrana (protena con C termi nal hi drofbi co)
IgM secretada (protena si n C termi nal hi drofbi co)
Un cambio en el punto de rotura del transcrito de RNA y la adicin
de polyA puede cambiar el extremo carboxilo de una protena
Ejemplo: sntesis de molculas de anticuerpo unidas a la membrana y las
secretadas (linfocitos estimulados) durante el desarrollo de los linfocitos B
La protena de membrana tiene en su extremo C-terminal una larga cadena de
aas hidrofbicos cambio en el lugar de corte.
El primer lugar de corte es subptimo y normalmente es ignorado en linfocitos
B no estimulados, lo cual da lugar al transcrito ms largo. Cuando el estmulo
del Ab da lugar a un aumento en la concentracin de CStF, entonces el corte se
produce en el lugar subptimo y se origina el transcrito ms corto.
TRANSPORTE DEL mRNA A TRAVS DEL PORO NUCLEAR
AL CITOSOL: control del transporte del mRNA y localizacin
Virus HIV: RNADNA, 30 especies distintas de mRNA, varios de estos mRNAs sufren splicing
alternativo y contienen intrones, la cell huesped bloquea la salida de mRNAs mal procesados y los
degrada por el exosoma (RNA exonucleasas, degradan intrones y extremos 3, y RNA mal procesados)
Solucin: virus codifica para una protena Rev que se une a una secuencia de RNA situada en el intrn
vrico, Rev interacciona con el R de exportacin nuclear y dirige el desplazamiento de los RNAs a
travs de los poros hacia el citosol.
Algunos mRNAs son dirigidos como tales a lugares especficos dentro de la cell antes de que se inicie
la traduccinseales en el extremo 3.
VIDA MEDIA Y DEGRADACIN DEL mRNA:
control en la degradacin del mRNA
-Tiempo de permanencia mRNA en la cell cantidad de protena
sintetizada
-Velocidad de sntesis, maduracin, transporte y degradacin
-Degradacin intracell mRNA ribonucleasas. Vida media> cola-poliA
mayor.
-Eucariotas vida media de mRNA 10 veces > procariotas (modificacin
postranscripcional retarda degradacin en eucariotas)
-Estabilidad:
-tRNA y rRNA de eucariotas y procariotas: muy estables (gran
procesamiento postranscripcional y est.secundaria)
-mRNA de eucariotas: estables (gran procesamiento postranscripcional y no
est. secundaria)
-mRNA de procariotas: poco estables (no procesamiento postranscripcional
y no est. secundaria)
La expresin gnica puede controlarse mediante
cambios en la estabilidad del mRNA
Estabilidad del mRNA10 h o 30 min.
Los mRNAs inestables codifican protenas reguladoras, tales como factores
de crecimiento y protenas de regulacin gnica, cuyos niveles han de
cambiar rapidamente en las cells.
La via principal de degradacin:
Acortamiento gradual de la cola de poli-A. Una vez en el citosol, las colas de
poli-A (200A) se acortan gradualmente debido a una exonucleasa que va
acortando la cola en direccin 3a 5. Al llegar a un cierto grado crtico de
acortamiento (30A), la caperuza 5es eliminada y el RNA es rapidamente
degradada.
Todos los mRNAs estn sujetos al acortamiento de la cola, a la prdida de
caperuza y a su degradacin, pero la velocidad es distinta.
REGULACIN DE LA SNTESIS PROTEICA
La fosfori l aci n de un factor de i ni ci aci n regul a gl obal mente l a sntesi s de protenas:
Las cel l s eucari otas reducen su vel oci dad de sntesi s de protenas en respuesta a
muchas si tuaci ones, que i ncl uyen l a carenci a de factores de creci mi ento, i nfecci n por
vi rus y choque trmi co. Se cree que en su mayor parte esto se debe a l a fosfori l aci n del
factor de i ni ci o de l a traducci n eIF-2 por protenas qui nasas especfi cas que responden
a cambi os en el entorno. La reuti l i zacin del eIF-2 no es posi bl e cuando est fosfori l ado
La i ni ci aci n en codones AUG si tuados en di recci n 5respecto al punto de comi ento de
l a traducci n puede regul ar el i ni ci o de l a traducci n. La traducci n suel e i ni ci arse en el
1 AUG que se encuentra en di recci n 3. NO obstante l os nt que i nmedi atamente rodean
el l ugar de i ni ci o de l a traducci n tambi n i nfl uyen en l a efi ci enci a con l a que el codn
AUG ser reconoci do durante el escaneado. Si este l ugar de reconoci mi ento es
sufi ci entemente dbi l , l a subuni dades ri bosmi cas i gnorarn el 1codn y podrn
escoger el 2. Ej empl o: protenas que di fi eren en su N termi nal , mi sma protena con y si n
ppti do l der, de forma que l a mi sma protena pueda i r a dos comparti mentos di sti ntosEn
una cel l un aumento especfi co de l a abundanci a del factor de i ni ci aci n eIF-4F favorece
l a uti l i zaci n del 1 AUG.
2- Control de la capacidad y frecuencia de traduccin de
los mRNAs (control de la traduccin se ejerce en la iniciacin, se regula la formacin del
complejo de preiniciacin 80S, la actividad de inicio de los factores eIF-2 y eIF-4E)
a) Ejemplo: control de la sntesis de ferritina por bloqueo del mRNA (la
ferritina almacena Fe como reserva para la biosntesis de otras protenas, y protege a la cell
contra la toxicidada del Fe libre)
Video final de transcripcin y traduccin MCB0401N
Iron-regulatory proteins
La cel l se adapta a l a escasez
de Fe, evi tando l a sntesi s de
una protena que no es
necesari a