La porcin anterior de la uretra en ambos sexos contiene un pequeo numero
del mismo tipo de microorganismos encontrados en la piel y perineo. La orina de la miccin normal contiene aproximadamente 100 a 10000/ml de estos microorganismos. Microbiota normal de la vagina La flora vaginal normal esta constituida en un 96% por especies de lactobacillus y nicamente el 4% por bacterias arobicas potencialmente patgenas (Staphylococcus aureus, Streptococci grupo B y Escherichia coli) y micoplasmas. Poco despus del nacimiento, aparecen lactobacilos aerobios en la vagina y persisten siempre y cuando el ph permanezca cido(varias semanas). Cuando el ph se neutraliza (permanece hasta la pubertad) la flora es mixta a base de cocos y bacilos. Durante la pubertad , reaparecen los lactobacilos aerobios y anaerobios en gran cantidad y contribuyen a mantener el ph cido al producir cido a partir de carbohidratos , en especial glucgeno. Aparentemente este es un mecanismo importante para prevenir el establecimeinto de otros microorganismos potencialmente nocivos en la vagina. Algunos lactobacilos producen perxido de hidrogeno (H2O2) en cantidades que exceden la capacidad del organismo para degradarlo. Este compuesto puede inhibir o eliminar otros microorganismos , particularmente aquellos que carecen o tienen bajos niveles de peroxidasas o catalasas, enzimas responsables de su degradacin. Cuando los lactobacilos se suprimen por la administracin de antimicrobianos , aumenta el numero de levaduras u otras bacterias causando irritacin en inflamacin. Despus de la menopausia , el numero de lactobacilos disminuye de nuevo y se restablece una flora mixta. La flora vaginal normal comprende estreptococo del grupo B hasta en 25% de las mujeres en edad reproductiva. Durante el parto, el producto adquiere al estreptococo del grupo B, que posteriormente genera septicemia neonatal y meningitis. La flora vaginal normal tambin comprende con frecuencia estreptococo alfa hemoltico , estreptococos anaerobios ( peptoestreptococs), especies de Prevotella , clostridioss , Gardnerella vaginalis , Ureaplasma urealyticum y en ocasiones especies de Listeria o Mobiluncus. El moco cervica posee actividad antibacteriana y contiene lisozimas. En algunas mujeres , el introito vaginal perineal. Quiz ste es un factor predisponente en las infecciones urinarias recurrentes. Los microorganismos vaginales en el momento del parto infectan en ocasiones al recin nacido ( por ejemplo: estreptococo del grupo B).
Microbiota normal de la conjutiva Los microorganismos que predominan en la conjuntiva son difteroides S.epidermidis y estreptococos no hemolticos. Con frecuencia tambin existen Neisseria y bacilos gramnegativos similares a Haemophilus ( especies de Moraxella). La flora conjuntival normalmente es regulada por la circulacin de lgrimas, que contienen lisozima antibacteriana.