Robert Brown: 1773-1858 En 1831, mientras realizaba un estudio microscpico de la epidermis de orqudeas, not la existencia de un punto opaco en el interior de las clulas. Esto se haba observado antes por otras personas, pero Brown fue el primero en reconocerlo como parte componente de la clula vegetal. A esta estructura la llam ncleo. 1844-1895 Friedrich Miescher: Aisl una sustancia cida rica en fosfatos a partir de clulas blancas de la sangre (1871). La llam nuclena. Despus (1872) aisl de las cabezas de los espermatozoides de salmn una sustancia que llam protamina con un componente cido y otro bsico La palabra cido nucleico deriva de la nuclena usada por Miescher. Contenido del ncleo Protenas RNA DNA DNA RNA Composicin de los cidos nucleicos Bases nitrogenadas Composicin de los cidos nucleicos Cadenas polinucleotdicas Composicin de los cidos nucleicos C N O H Enlaces Composicin de los cidos nucleicos Bases nitrogenadas por qu uracilo en RNA y timina en DNA? ATP GTP CTP UTP deshidroxilacin dATP dGTP dCTP dUTP metilacin durante la sntesis de nucletidos: dATP dGTP dCTP dTTP para qu metilar U y convertirlo en T antes de formar el DNA? Composicin de los cidos nucleicos Bases nitrogenadas Metilacin: proteccin del DNA frente a nucleasas metilacin de dATP y dCTP hidrofobicidad emparejamiento con todas las bases otorga una conformacin precisa en la doble hlice que obliga a emparejar con A. Composicin de los cidos nucleicos proteccin especificidad de unin Bases nitrogenadas desaminacin Si U en DNA: mutaciones C > U inadvertidas se distingue metil-U de U y se corrige Composicin de los cidos nucleicos reconocimiento normal/mutado Resumen DNA RNA Funcin del DNA Cul es la funcin del DNA? Funcin del DNA Friedrich Grifith demuestra la tranformacin bacteriana 1928 Avery, OT; MacLeod, CM and McCarty, M (1944). Studies on the chemical nature of the substance inducing transformation of Pneumococcal types. J. Exp. Med. 79, 137-158. Avery, MacLeod y McCarty demuestran que el material transformante es el DNA 1944 Funcin del DNA Martha Chase y Alfred Hershey demuestran que el DNA es el material gentico 1952 Hershey, AD. Chase, M (1952). Independent functions of viral protein and nucleic acid in growth of bacteriophage. J. Gen. Physiol. 36(1): 39-56. 1908-1997 1928-2003 Funcin del DNA Resumen Friedrich Grifith demuestra la tranformacin bacteriana 1928 Avery, MacLeod y McCarty demuestran que el material transformante es el DNA 1944 Martha Chase y Alfred Hershey demuestran que el DNA es el material gentico 1952 1905-2002 REGLAS DE CHARGAFF PARA DNA DOBLE HLICE (1950) Estructura del DNA 1.- A=T A/T= 1 2.- G=C G/C= 1 3.- (A+G)=(C+T) (A+G)/(C+T)=1 4.- (A+G)/(C+T) vara para cada organismo Estructura del DNA 1953 1920-1958 1916-2004 Estructura del DNA dor sal es de azucar - fosfato exteriores bases enfrentadas al interior. api l adas en pl anos paralelos 5 3 5 3 Estructura del DNA Estructura del DNA Aceptor de enlace de hidrgeno A Donador de enlace de hidrgeno D Hidrgeno no polar H Grupo metilo M Estructura del DNA Cada vuelta de hlice: 3,4 nm Cada vuelta de hlice: 10 pares de bases Estructura del DNA humedad baja 65-75% RNA/DNA RNA/RNA molculas pequeas y repeticiones G/C Estructura del DNA Flexibilidad: puentes de H transversales y no longitudinales Empaquetamiento Resumen REGLAS DE CHARGAFF PARA DNA DOBLE HLICE (1950) 1953 Factores que alteran la estructura Temperatura: al aumentarla experimentalmente se induce la desnaturalizacin de una solucin de DNA. ruptura de los enlaces de hidrgeno repulsin de las hebras por las cargas (-) de las dorsales de azcar-fosfato hay un cambio en la absorcin de luz UV cerca de la T de desnaturalizacin El DNA de dobl e hebra se comporta como monohebra en cuanto a la absorcin de UV. Porcentaje de pares GC: A mayor porcentaje GC en una molcula, mayor ser la T de desnaturalizacin. Se puede conocer el %GC de una molcula segn su Tm Factores que alteran la estructura Factores que alteran la estructura Concentracin de iones: los grupos P con carga (-) estn protegidos por iones con carga (+) Agentes qumicos: Formamida y Urea interfieren con puentes de H. Disminuyen la Tm. pH: pH cido: bases protonadas. Carga (+) pH bsico: bases pierden protones. Carga (-) Otras estructuras del DNA DNA circular DNA bacteriano, plsmidos y... Topoisomerasa I y II Resumen Temperatura Concentracin de iones Agentes qumicos pH Conformacin del RNA RNA difiere del DNA en: grupo reactivo medio alcalino: ruptura del RNA en mononucletidos RNA:RNA; RNA:DNA hebra sencilla o doble lineal o circular Conformacin del RNA Estructura 3D define funcin Ribozimas: splicing y self-splicing Formacin de enlace peptdico (rRNA) Estructura gnica Gen: Secuencia de DNA completa necesaria para la sntesis de un producto gnico funcional (RNA o polipptido). Estructura gnica genes monocistrnicos genes policistrnicos Estructura gnica intrones: en genes eucariotas salvo levaduras se eliminan durante el procesamiento del RNAm protenas grandes presentan repeticiones de exones que forman dominios Estructura gnica Unidades de transcripcin: distinto de genes en procariotas igual que genes en eucariotas salto de exn Sitios de poliadenilacin alternativos Uso de promotores alternativos Resumen Gen: genes policistrnicos genes monocistrnicos Unidades de transcripcin: cmo se organizan las molculas de DNA en una clula eucariota? Empaquetamiento del DNA Cromosoma: Genoma humano: 24 cromosomas diferentes Una molcula de DNA asociada a protenas que la empaquetan DNA interfase: cromatina metafase: DNA condensado en cromosomas Empaquetamiento del DNA Cromosomas homlogos Humanos: 22 pares de cromosomas comunes a ambos sexos 1 par de cromosomas sexuales X Y X X cariotipo Empaquetamiento del DNA cromosoma: DNA y protenas histonas y no histonas cromatina nivel de organizacin cromosmica ms bsico nucleosoma nucleo interfsico tratamiento de desplegado Empaquetamiento del DNA Histonas: 4 tipos diferentes Nucleosomas: separados por 80 nucletidos app. DNA linker Formacin de nucleosomas: reduce la longitud de la molcula de DNA a un tercio Primer nivel de empaquetamiento del DNA Empaquetamiento del DNA Segundo nivel de empaquetamiento del DNA Fibra de 30 nm Modelos: 1.- Zig-zag Empaquetamiento del DNA 2.- Irregularidades: Generadas por protenas de unin a DNA Secuencias no plegables en nucleosomas Mecanismos que actan juntos para conseguir la fibra de 30 nm Empaquetamiento del DNA Histona H1: Colas de histonas nucleosmicas Empaquetamiento del DNA Los nucleosomas son estticos? Qu pasa con la expresin gnica, la replicacin del DNA y la reparacin? Complejos de remodelacin de cromatina Mquinas proteicas que usan ATP para cambiar la estructura de los nucleosomas temporalmente Empaquetamiento del DNA Ejemplos de Complejos de remodelacin de cromatina Empaquetamiento del DNA Modificaciones de las colas de las histonas Efecto en la fibra de 30 nm. Poco en el nucleosoma Mayor efecto: atraccin de protenas al fragmento modificado. Segn la modificacin estas protenas plegarn ms o permitirn el acceso al DNA Empaquetamiento del DNA Regiones ms compactas son inaccesibles a enzimas Empaquetamiento del DNA Otras protenas no histonas conforman el andamio al cual se unen los lazos de DNA de la fibra de 30 nm. LECTURA FUERTEMENTE RECOMENDADA: CAPTULO 4 ALBERTS CAPTULO 4 DARNELL y CAPTULO 10 DARNELL CAPTULO 6 WATSON, J y CAPTULO 7 WATSON, J