Anda di halaman 1dari 12

METABOLISME NUKLEOTIDA

Persyaratan untuk metabolisme nukleotida dan basis serumpun mereka dapat dipenuhi
dengan baik asupan makanan atau sintesis de novo dari molekul berat rendah prekursor.
Memang, kemampuan untuk menyelamatkan nukleotida dari sumber dalam tubuh dapat
mengurangi apapun kebutuhan gizi untuk nukleotida, sehingga purin dan basa pirimidin tidak
diperlukan dalam makanan. Jalur penyelamatan adalah sumber utama dari nukleotida untuk
sintesis DNA, RNA dan enzim co-faktor.
Ekstraselular hidrolisis asam nukleat ditelan terjadi melalui tindakan bersama dari
endonuklease, phosphodiesterases dan phosphorylases nukleosida. Endonuklease
mendegradasi DNA dan RNA di situs internal menyebabkan produksi oligonucleotides.
Oligonucleotides selanjutnya dicerna oleh phosphodiesterases bahwa tindakan dari ujung ke
dalam menghasilkan nukleosida bebas. Dasar yang terhidrolisis dari nukleosida oleh aksi
phosphorylases yang menghasilkan ribosa-1-fosfat dan bebas basa. Jika nukleosida dan / atau
basa tidak kembali memanfaatkan lebih lanjut basa purin menjadi asam urat terdegradasi dan
pirimidin untuk -aminoiosobutyrate, NH
3
dan CO
2.

Baik menyelamatkan dan jalur sintesis de novo dari purin dan memimpin biosintesis
pirimidin untuk produksi nukleosida-5-fosfat melalui pemanfaatan suatu gula diaktifkan
menengah dan kelas enzim yang disebut phosphoribosyltransferases. Gula aktif yang
digunakan adalah 5-phosphoribosyl-1- pirofosfat, PRPP. PRPP dihasilkan oleh tindakan
sintetase PRPP dan memerlukan energi dalam bentuk ATP seperti yang ditunjukkan:
Perhatikan bahwa reaksi ini melepaskan AMP. Oleh karena itu, 2 fosfat energi setara tinggi
dikonsumsi selama reaksi.
BIOSINTESIS NUKLEOTIDA PURIN
Terjadinya sintesis purin dalam hati. Sintesis dari nukleotida purin dimulai dengan PRPP dan
mengarah ke penuh pertama terbentuk nukleotida, inosine 5-monophosphate (IMP). jalur ini
adalah diagram di bawah ini. Basis purin tanpa terikat pada molekul ribosa terlampir adalah
Hipoxantina. Basis purin dibangun di atas ribosa dengan beberapa amidotransferase dan
reaksi transformylation. Sintesis IMP membutuhkan lima mol ATP, dua mol glutamin, satu
mol glisin, satu mol CO
2,
satu mol aspartate dan dua mol formate. Para moieties formil
dilakukan pada tetrahydrofolate (THF) dalam bentuk N
5,
N
10-methenyl-THF
dan N
10-formil-THF.

Sintesis AMP dan GMP dari IMP
Sintesis pertama terbentuk sepenuhnya nukleotida purin, monophosphate inosine, IMP
dimulai dengan 5-phospho--ribosyl-1-pirofosfat, PRPP. Melalui serangkaian reaksi
menggunakan ATP, tetrahydrofolate (THF) derivatif, glutamin, glisin dan aspartate ini
menghasilkan jalur IMP. Tingkat membatasi reaksi ini dikatalisis oleh glutamin
amidotransferase PRPP, enzim ditunjukkan oleh 1 pada Gambar tersebut. Struktur nucleobase
dari IMP (Hipoxantina) akan muncul.
IMP merupakan titik cabang untuk biosintesis purin, karena dapat dikonversi menjadi baik
AMP atau GMP melalui dua jalur reaksi yang berbeda. jalur yang mengarah ke AMP
memerlukan energi dalam bentuk GTP; yang mengarah ke GMP memerlukan energi dalam
bentuk ATP. Pemanfaatan GTP dalam jalur untuk sintesis AMP memungkinkan sel untuk
mengontrol proporsi AMP dan GMP untuk dekat kesetaraan. GTP akumulasi kelebihan akan
menyebabkan sintesis AMP dipercepat dari IMP sebaliknya, dengan mengorbankan sintesis
GMP. Sebaliknya, sejak konversi IMP untuk GMP memerlukan ATP, akumulasi kelebihan
ATP menyebabkan sintesis percepatan GMP atas yang AMP.
KATABOLISME DAN SALVAGE DARI NUKLEOTIDA PURIN
Katabolisme dari nukleotida purin akhirnya mengarah ke produksi asam urat yang larut dan
dikeluarkan dalam urin sebagai kristal natrium urat.
KATABOLISME NUKLEOTIDA PURIN
Sintesis nukleotida dari basa purin dan nukleosida purin terjadi dalam serangkaian langkah-
langkah yang dikenal sebagai jalur penyelamatan. Dasar bebas purin, adenin, guanin, dan
Hipoxantina, dapat dikonversi untuk nukleotida yang berhubungan dengan
phosphoribosylation. Dua enzim transferase kunci yang terlibat dalam sisa dari purin:
phosphoribosyltransferase adenosine (APRT), yang mengkatalisis reaksi berikut:
adenin + PRPP <-> AMP + PP
i

dan Hipoxantina-guanin phosphoribosyltransferase (HGPRT), yang mengkatalisis reaksi
berikut:
Hipoxantina + PRPP <-> IMP + PP
i

guanin + PRPP <-> GMP + PP
i

Sebuah enzim penting kritis sisa barang purin dengan cepat membagi sel adalah adenosin
deaminase (ADA) yang mengkatalisis deaminasi untuk inosine disebut adenosin. Defisiensi
ADA dalam hasil dalam gangguan severe combined immunodeficiency, SCID (dan diuraikan
di bawah).
SIKLUS METABOLISME NUKLEOTIDE PURIN
Siklus nukleotida purin melayani fungsi penting dalam latihan otot. Generasi fumarat
menyediakan otot rangka hanya dengan sumbernya dari substrat anapleurotic untuk siklus
TCA . Dalam rangka untuk operasi lanjutan siklus selama latihan, protein otot harus
digunakan untuk memasok nitrogen amino bagi generasi aspartate. Generasi asparate terjadi
oleh reaksi transaminasi standar yang interconvert asam amino dengan -ketoglutarate untuk
membentuk glutamat dan glutamat dengan oxaloacetate untuk membentuk aspartat.
Myoadenylate deaminase adalah khusus isoenzyme AMP deaminase otot, dan kekurangan
dalam memimpin deaminase myoadenylate untuk pasca-latihan kelelahan, kram dan mialgia.
BIOSINTESIS NUKLEOTIDA PIRIMIDIN
Sintesis pirimidin kurang kompleks dibandingkan dengan purin, karena dasar jauh lebih
sederhana. . Basis menyelesaikan pertama adalah berasal dari 1 mol glutamin, satu mol ATP
dan satu mol CO
2
(yang merupakan karbamoilfosfat) dan satu mol aspartate. Sebuah mol
tambahan glutamin dan ATP diperlukan dalam konversi UTP untuk CTP. Jalur biosintesis
pirimidin adalah diagram di bawah ini.
Karbamoilfosfat digunakan untuk sintesis nukleotida pirimidin berasal dari glutamin dan
bikarbonat, dalam sitosol, yang bertentangan dengan siklus urea carbamoyl fosfat berasal dari
amonia dan bikarbonat dalam mitokondria. Reaksi siklus urea dikatalisis oleh sintetase
karbamoilfosfat I (CPS-I) sedangkan prekursor nukleotida pirimidin disintesis oleh CPS-II.
Carbamoyl phosphate is then condensed with aspartate in a reaction catalyzed by the rate
limiting enzyme of pyrimidine nucleotide biosynthesis, aspartate transcarbamoylase
(ATCase). karbamoilfosfat kemudian kental dengan aspartat dalam reaksi dikatalisis oleh
enzim rate limiting biosintesis nukleotida pirimidin, transcarbamoylase aspartate (ATCase).
Sintesis karbamoilfosfat oleh CPS II
Sintesis UMP dari karbamoilfosfat. Carbamoyl fosfat digunakan dalam sintesis nukleotida
pirimidin berbeda dari yang disintesis pada siklus urea, yang merupakan sintesis dari
glutamin bukan amonia dan disintesis dalam sitosol. Reaksi ini dikatalisis oleh fosfat II
carbamoyl sintetase (CPS-II). Selanjutnya karbamoilfosfat dimasukkan ke dalam jalur
biosintesis nukleotida pirimidin melalui aksi transcarbamoylase aspartate, ATCase (enzim #
1) yang merupakan rate limiting langkah dalam biosintesis pirimidin Setelah selesai sintesis
UMP dapat terfosforilasi untuk UTP dan digunakan sebagai substrat untuk synthase CTP
untuk sintesis nukleotida CTP uridina. Juga merupakan prekursor untuk sintesis de novo dari
nukleotida timin.
Sintesis pirimidin berbeda dalam dua cara yang signifikan dari tahun purinPertama, struktur
cincin dipasang sebagai basa bebas, tidak dibangun di atas PRPP. PRPP akan ditambahkan ke
base pertama terbentuk sepenuhnya pirimidin (asam orotic), membentuk monophosphate
orotate (OMP), yang kemudian dekarboksilasi menjadi UMP. Kedua, tidak ada cabang di
jalur sintesis pirimidin. UMP adalah fosforilasi dua kali untuk menghasilkan UTP (ATP
merupakan donor fosfat). Yang pertama adalah fosforilasi dikatalisis oleh kinase uridylate
dan yang kedua oleh nukleosida difosfat kinase mana-mana. Akhirnya UTP adalah aminated
oleh aksi synthase CTP, menghasilkan CTP. Para nukleotida timin yang pada gilirannya
diturunkan oleh sintesis de novo dari Dump atau dengan jalur selamatkan dari deoxyuridine
atau deoxythymidine.
Sintesis CTP dari UTP
SINTESIS NUKLEOTIDA TIMIN
De novo jalan menuju dTTP sintesis pertama yang membutuhkan penggunaan Dump dari
metabolisme baik UDP atau CDP. tempat pembuangan sampah diubah menjadi dTMP oleh
aksi synthase timidilat. Kelompok metil (ingat timin yang 5-metil urasil) adalah
disumbangkan oleh N
5, 10-metilen
THF N, mirip dengan sumbangan dari kelompok metil selama
biosintesis dari purin. Sifat unik dari tindakan synthase timidilat adalah bahwa THF
dikonversi menjadi dihydrofolate (DBD), yang hanya menghasilkan reaksi seperti DBD dari
THF. Agar reaksi synthase timidilat untuk melanjutkan, THF harus dibuat ulang dari DBD.
Hal ini dilakukan melalui aksi reduktase dihydrofolate (DHFR). . THF kemudian dikonversi
menjadi N
5,
N
10-THF
melalui tindakan transferase hidroksimetil serin. Peran penting dalam
biosintesis nukleotida DHFR timidin membuat target yang ideal untuk agen kemoterapi (lihat
di bawah).

Sintesis dTMP dari Dump
Jalur penyelamatan untuk dTTP melibatkan sintesis enzim kinase timidin yang dapat
menggunakan salah satu atau deoxyuridine timidin sebagai substrat:
timidin + ATP <-> TMP + ADP
deoxyuridine + ATP <-> ADP + Dump
Aktivitas timidin kinase (salah satu dari berbagai deoxyribonucleotide kinase) adalah unik
karena berfluktuasi dengan siklus sel, naik ke puncak aktivitas selama fase sintesis DNA; itu
dihambat oleh dTTP.
KATABOLISME DAN SALVAGE DARI NUKLEOTIDA PIRIMIDIN
Katabolisme dari nukleotida pirimidin akhirnya menyebabkan -alanin (ketika CMP dan
UMP yang rusak) atau -aminoisobutyrate (ketika dTMP diturunkan) dan NH
3
dan CO
2.

The -alanin dan -aminoisobutyrate berfungsi sebagai donor-NH
2
di transaminasi dari -
ketoglutarate untuk glutamat.Reaksi selanjutnya mengubah produk untuk malonyl-KoA
(yang dapat dialihkan ke sintesis asam lemak) atau methylmalonyl-KoA (yang dikonversikan
ke succinyl-KoA dan dapat didorong dengan siklus TCA).
Sisa barang dari basa pirimidin memiliki signifikansi klinis kurang daripada purin, karena
kelarutan dengan-produk katabolisme pirimidin. Namun, seperti yang ditunjukkan di atas,
jalur penyelamatan untuk sintesis nukleotida timidin sangat penting dalam persiapan untuk
pembelahan sel. Urasil dapat diselamatkan untuk membentuk UMP melalui tindakan bersama
dari fosforilase uridina dan uridina kinase, seperti ditunjukkan:
urasil fosfat + ribosa-1-<-> uridina + P
i

uridina + ATP -> ADP + UMP
. Deoxyuridine juga merupakan substrat untuk fosforilase uridina. Pembentukan dTMP,
dengan menyelamatkan dari dTMP membutuhkan fosforilase timin dan sebelumnya dihadapi
kinase timidin:
timin <+ deoksiribosa-1-fosfat -> timidin + P
i

timidin + ATP -> ADP + dTMP
Sisa barang dari deoxycytidine ini dikatalisis oleh kinase deoxycytidine:
deoxycytidine + ATP <-> dCMP + ADP
Deoxyguanosine Deoxyadenosine dan juga substrat untuk kinase deoxycytidine, meskipun
m

K untuk substrat ini jauh lebih tinggi daripada deoxycytidine.
Fungsi utama dari kinase pirimidin nukleosida adalah untuk menjaga keseimbangan selular
antara tingkat pirimidin nukleosida dan monophosphates pirimidin nukleosida. Namun,
karena keseluruhan selular dan konsentrasi plasma dari pirimidin nukleosida, serta mereka
yang ribosa-1-fosfat, rendah, sisa barang dari pirimidin oleh kinase ini relatif tidak efisien.
DIAMBIL DARI :
Michael W. Michael W. King, Ph.D / IU School of Medicine / miking at iupui.edu Raja,
Ph.D / IU School of Medicine / miking di iupui.edu
METABOLISME NUKLEOTIDA

perannya diantaranya membentuk DNA dan RNA. Membentuk UDP glukosa membentuk
ATP dan GTP membentuk NAD, FAD dan membentuk cAMP. Nukleosida diantaranya
adalah purin atau pirimidin yang terikat dengan pentosa. Sedangkan nukleotida adalah ester
fosfat dari nukleosida. Basa purin pertama yaitu adenin dan guanin. Cincin purin diantaranya
adalah glycin glutamin aspartat. Cincin pirimidin diantarany adalah aspartat dan
carbomoilfosfat.

dalam biosintesis nukleotida ada 2 jalur. Yaitu
a. jalur de novo
Nukleus fosfat yang menyusun purin dan pirimidin berasal dari PRPP. Nah PRPP ini sendiri
dari Ribosa 5 fosfat + ATP. Ribosa 5 fosfat berasal dari HMP shunt. PRPP ini sendiri akan
diubah menjadi fosfo ribosil 1 amin. Dengan enzim amidofosforibosil transferase dengan
bantuan glutamin sebagai pendonor NH3. Lalu melewati 10 rangakaian reaksi akan
membentuk IMP. IMP ini sendiri akan membentuk adenilosuksinat dan xantilat. Nah
adenilosuksinat akan membentuk AMP sedangkan xantilat akan membentuk GMP.
b. jalur salvage pathway (recycling)
nah disini PRPP akan diubah menjadi purin-ribonukleotida.
Contohnya Adenin + PRPP jadi adenilat + Ppi.

BIOSINTESIS NUKLEOTIDA

Pirimidin
dibentuk dari glutamin dengan bantuan ATP dan HCO3 menjadi carbamoylphospat.
Selanjutnya carbamoylphospat ditambah dengan aspartat menghasilkan N-
Carbamoylaspartat. Dan akhirnya terbentuk UMP. Selanjutnya akan terbentuk CMP, yaitu
dengan proses aminasi terhadap UMP.

REGULASI SINTESIS NUKLEOTIDA

1. feedback inhibition dari sintesis purin nukleotida merupakan kontrol dari biosintesis purin
sintesis purin nukleotida dapat dihambat feedback pada beberapa tempat. Yang pertama
enzim PRPP sintetase yang diinhibisi oleh AMP GMP IMP yang mengatur konsentrasi
PRPP.
2. Reaksi kunci untuk dimulainya biosintesis purin oleh enzim glutamin PRPP
amidotransferase dihambat oleh purin ribonukleotida.
3. AMP menghambat sintesis adenilosuksinat dari inosinat, sedang GMP menghambat
perubahan inosinat menjadi xantilat.
4. GTP merupakan substrat dari sintesis GMP, dan ATP merupakan substrat dari sintesis
AMP.


Hubungan timbal balik substrat ini atau resiprok memelihara produksi yang seimbang dari
adenin dan guanin ribonukleotida. Nah untuk selanjutnya katabolisme purin dapat dilihat
pada gambar dibawah ini



asam urat dalam serum yang ada digambar nantinya akan menumpuk menjadi kristal natrium
urat disendi ini akan menyebabkan penyakit yang disebut gouty arthritis. Namun asam urat
memiliki fungsi sebagai antioksidan. Katabolisme dari pirimidin dapat dilihat dari gambar
berikut.

Diposkan oleh kitaanakfk.blogspot.com di 06.32


METABOLISME ASAM AMINO part 1
J enis Asam Amino
Non esensial: alanin, aspartat, asparagines, cysteine, glutamate, glutamine, glycine,
proline, serine, tyrosine.
Esensial: arginine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, phenylalanine, threonine,
tryptophan, valine, methionine.

Reaksi yang Umum Terjadi pada Metabolisme Asam Amino
Transaminasi.
Deaminasi.
Pembentukan urea.

Transaminasi
Katalis: enzim aminotransferase.
Mentransfer gugus amino ke -ketoglutarate hasilnya: asam keto + glutarate.
Enzim aminotransferase.
o Koenzim: piridoksal fosfat.
o Yg ada pada seluruh jaringan:
1. Alanin transaminase
Piruvat + asam -amino jadinya: L-alanin + Asam -keto.
2. Glutamate transaminase
-ketoglutarat + asam -amino jadinya: L-glutamat + asam -keto.
Lysine, threonine, proline, dan hidroksiproline tidak mengalami transaminasi.

Deaminasi
Pemindahan gugus amino dan ion H.
Hasilnya ammonia (NH3).
Rangka karbonnya mengalami:
o Dioksidasi pada siklus krebs.
o Digunakan untuk glukoneogenesis.
o Diubah menjadi asam lemak.
Enzimnya glutamate dehidrogenase:
o Reversibel.
o Sebagai enzim pengendali.
o Inhibitor alosterik: ATP, GTP, NADH.
o Aktivator alosterik: ADP, GDP.
o Didapat di berbagai jaringan dalam sitoplasma dan mitokondria.
Enzimnya glutamate dehidrogenase:

Siklus Urea
Ammonia yang toxic (NH3) diubah menjadi ammonium ion (NH4+).
NH4+ diubah di liver jadi urea.
Urea terdiri dari 2 NH2:
o 1 dari NH4+.
o 1 dari aspartate.
Urea diekskresikan ke urin
Jika asam amino berlebihan:
Untuk sintesis protein.
Untuk sintesis produk khusus.
Kalau masih sisa, dikatabolisme:
o N untuk urea.
o Kerangka karbon untuk senyawa amfibolik (bisa dipecah jadi energi atau
sintesis glukosa).
o Senyawa amfibolik yang terbentuk dapat digunakan untuk sintesis lemak dan
glikogen.
keseimbangan Nitrogen
(+) bila N masuk > N keluar tubuh, terjadi pada masa pertumbuhan, penyembuhan,
dan kehamilan.
(-) bila N masuk < N keluar tubuh, terjadi misalnya pada saat kelaparan dan sakit.
Seimbang, bila N masuk = n keluar tubuh, terdapat pada orang dewasa normal dan
sehat
METABOLISME ASAM AMINO
Asam amino merupakan suatu senyawa organik yang memiliki gugus fungsional karboksil (-
COOH) dan amina (biasanya -NH
2
). Kira-kira 75% asam amino digunakan untuk sintesis
protein. Asam-asam amino dapat diperoleh dari protein yang kita makan atau dari hasil
degradasi protein di dalam tubuh kita. Degradasi ini merupakan proses kontinu.
Struktur asam amino
Struktur asam amino secara umum adalah satu atom C yang mengikat empat gugus,yaitu
gugus amina (NH
2
), gugus karboksil (COOH), atom hidrogen (H), dan satu gugus sisa (R,
dari residue) atau disebut juga gugus atau rantai samping yang membedakan satu asam amino
dengan asam amino lainnya. Atom C pusat dinamakan atom C

("C-alfa") sesuai dengan


penamaan senyawa bergugus karboksil, yaitu atom C yang berikatan langsung dengan gugus
karboksil. Oleh karena gugus amina juga terikat pada atom C

ini, senyawa tersebut


merupakan asam -amino.
Asam amino biasanya diklasifikasikan berdasarkan sifat kimia rantai samping tersebut
menjadi empat kelompok. Rantai samping dapat membuat asam amino bersifat asam lemah,
basa lemah, hidrofilik jika polar, dan hidrofobik jika nonpolar.
Fungsi biologi asam amino:
1. Penyusun protein, termasuk enzim.
2. Kerangka dasar sejumlah senyawa penting dalam metabolisme (terutama vitamin,
hormon dan asam nukleat).
3. Pengikat ion logam penting yang diperlukan dalam dalam reaksi enzimatik (kofaktor).
Metablisme Asam Amino
Asam amino yang terbentuk di usus akan diabsorpsi dan dibawa oleh peredaran darah
ke dalam sel-sel tubuh.
Ammonia bersifat toksik, jadi tidak diangkut dalam bentuk bebas dari jaringan
ekstrahepatik.
Mekanisme utama: Terjadi pada kebanyakan jaringan :Glutamin sintetase akan mengubah
ammonia menjadi glutamin yang nontoksik.
Glu + nh4+ + atp gln +h2o+adp+pi
Glutamin sintetase
glu didapat dari -ketoglutarat (tca cycle)
Melalui reaksi transaminasi dgn a.a lain.
gln diangkut dlm darah kehati, ginjal dan gut
(usus)
dalam hati gln dihidrolisis untuk melepas
Ammonia yg akan masuk siklus urea
Gln +h2o glu + nh4+
Glutaminase
Siklus Urea
- Terjadi di hati
-Produk akhirnya yaitu urea akan masuk Sirkulasi darah dan dibuang lewat ginjal (urin)
- Enzim yang berperan:
reaksi 1 : karbamoil fosfat sintase i
reaksi 2 : ornitin transkarbamoilase
reaksi 3 : asam argininosuksinat sintetase
reaksi 4 : argininosuksinase
reaksi 5 : arginase
reaksi 1 dan 2 terjadi di dalam matrix mitokondria hati
reaksi 3, 4, 5 terjadi di dalam sitosol hati
Jalur metabolik utama dari asam amino
Jalur metabolik utama dari asam-asam amino terdiri atas pertama, produksi asam
amino dari pembongkaran protein tubuh, digesti protein diet serta sintesis asam amino di hati.
Kedua, pengambilan nitrogen dari asam amino. Sedangkan ketiga adalah katabolisme asam
amino menjadi energi melalui siklus asam serta siklus urea sebagai proses pengolahan hasil
sampingan pemecahan asam amino. Keempat adalah sintesis protein dari asam-asam amino.
Matabolisme asam amino
Asam-asam amino tidak dapat disimpan oleh tubuh. Jika jumlah asam amino berlebihan atau
terjadi kekurangan sumber energi lain (karbohidrat dan protein), tubuh akan menggunakan
asam amino sebagai sumber energi. Tidak seperti karbohidrat dan lipid, asam amino
memerlukan pelepasan gugus amin. Gugus amin ini kemudian dibuang karena bersifat toksik
bagi tubuh.
Ada 2 tahap pelepasan gugus amin dari asam amino, yaitu:
1. Transaminasi
Enzim aminotransferase memindahkan amin kepada -ketoglutarat menghasilkan glutamat
atau kepada oksaloasetat menghasilkan aspartat
2. Deaminasi oksidatif
Pelepasan amin dari glutamat menghasilkan ion ammonium.
Dari 20 jenis asam amino, ada yang tidak dapat disintesis oleh tubuh kita sehingga harus ada
di dalam makanan yang kita makan. Asam amino ini dinamakan asam amino esensial.
Selebihnya adalah asam amino yang dapat disintesis dari asam amino lain. Asam amino ini
dinamakan asam amino non-esensial.

Biosinthesis Asam Amino non esensial.
Semua asam amino non esensial kecuali tyrosin disinthesis melalui jalur sederhana dari jalur
metabolism umum seperti piruvat, oksaloasetat, a ketoglutarat dan 3 phosphogliserat. Tyrisin
dibentuk dari asam amino esensial phenilalanin melalui 1 langkah hidroksilasi. Jadi
kebutuhan diet akan phenilalanin menggambarkan juga kebutuhan akan tyrosin. Oleh karena
itu adanya tyrosin alam diet akan mengurangi keutuhan terhadap phenilalanin.
Biosinthesis Asam Amino Esensial
Asam amino esensial, tidak seperti asam amino non esensial, disintesis dari prekursor
metabolit yang umum. Jalur sintesisnya hanya terdapat pada tanaman ataupun
mikroorganisma dan biasanya melibatkan lebih banyak tahapan dibandingkan dengan asam
amino non esensial. Lisin, methionin, dan threonin misalnya,semuanya disintesis dari aspartat
dalam jalur yang diawali oleh enzim aspartokinase, enzim yang hanya terdapat pada tanaman
dan mikroorganisma.Valin dan leusin disintesis dari piruvat dan a ketoglutarat, sedang
triptofan, phenilalanin dan tyrosin disintesis dari PEP (phosphoenolpiruvat) dan erythrosa-4
phosphat.
Bioenergetik dan Metabolisme
Alanin, Asparagin, Aspartat, Glutamat dan Glutamin dibentuk dari piruvat, oksaloasetat dan a
ketoglutarat.Sintesis dari masing-masing asam amino tersebut hanya 1 tahapan transaminasi.
Asparagin disintesis dari aspartat oleh asparagin synthetase, sedang glutamin dari glutamat
dengan reaksi amidasi yang dikatalisis
oleh glutamin synthetase. Glutamin synthetase merupakan titik pusat kontril metbolisma
nitrogen. Glutamin adalah donor gugus amino dalam pembentukan banyak senyawa
biosinthetik maupin bentuk cadangan bagi ammonia. Sebagai konsekuensinya, glutamin
synthetase mempunyai peran sentral dalam metabolisma nitrogen dan menjadikan enzim
tersebut sebagai kandidat yang sangat baik dalam mengatur
aliran metabolisma dari senyawa nitrogen. Glutamin synthetase pada mammalia diaktifkan
oleh a ketoglutarat yang merupakan hasil deaminasi oksidatif dari glutamat. Hal ini diduga
mencegah akumulasi amonia yang dihasilkan oleh reaksi deaminasi tersebut.
Asam amino dasar (standar)
Protein tersusun dari berbagai asam amino yang masing-masing dihubungkan dengan ikatan
peptida. Meskipun demikian, pada awal pembentukannya protein hanya tersusun dari 20
asam amino yang dikenal sebagai asam amino dasar atau asam amino baku atau asam amino
penyusun protein (proteinogenik). Asam-asam amino inilah yang disandi oleh DNA/RNA
sebagai kode genetik.
Asam amino alifatik sederhana
Glisina (Gly, G)
Alanina (Ala, A)
Valina (Val, V)
Leusina (Leu, L)
Isoleusina (Ile, I)
Asam amino hidroksi-alifatik
Serina (Ser, S)
Treonina (Thr, T)
Asam amino dikarboksilat (asam)
Asam aspartat (Asp, D)
Asam glutamat (Glu, E)
Amida
Asparagina (Asn, N)
Glutamina (Gln, Q)
Asam amino basa
Lisina (Lys, K)
Arginina (Arg, R)
Histidina (His, H) (memiliki gugus siklik)
Asam amino dengan sulfur
Sisteina (Cys, C)
Metionina (Met, M)
Prolin
Prolina (Pro, P) (memiliki gugus siklik)
Asam amino aromatik
Fenilalanina (Phe, F)
Tirosina (Tyr, Y)
Triptofan (Trp, W)
Kelompok ini memiliki cincin benzena dan menjadi bahan baku metabolit sekunder aromatik.