DEPARTAMENTO DE BIOQUMICA Clase 1 Febrero 2014 Sustancias polimricas constituidas por nucletidos unidos en una secuencia especfica a travs de enlaces 3 5 fosfodister, que cubren un amplio espectro de pesos moleculares, amplio espectro de pesos moleculares, representados por el ADN y el ARN. ADN: ACIDO DESOXIRIBONUCLEICO ARN: ACIDO RIBONUCLEICO UBICACIN DE LOS CIDOS NUCLEICOS ADN Presente principalmente en el ncleo de la clula. Tambin se localiza en las mitocondrias, siendo ste de origen materno. ARN La mayor cantidad se localiza en el citoplasma y una pequea parte en el ncleo. EL ADN DE UN INDIVIDUO ES EL MISMO EN TODAS LAS CLULAS QUE LO FORMAN Primeros estudios qumicos, sistemticos del ncleo celular Aislamiento de una sustancia que contena fsforo (nuclena) a partir del pus de vendajes quirrgicos, la nuclena tena una porcin acdica (actualmente DNA) y una proteica. Friedrich Miescher acdica (actualmente DNA) y una proteica. Nuclena presente en las cabezas de espermatozoides de salmn. Sospechaba que la nuclena estaba asociada con la herencia celular. UNIDADES MONOMRICAS DE LOS CIDOS NUCLEICOS Nucletidos AZCAR NUCLESIDOS Adenosina ARN Ribosa COMPOSICIN: 1) Azcar 2) Base nitrogenada Ribosa Desoxirribosa NO POSEE GRUPO FOSFATO ADN BASES NITROGENADAS PURNICAS PURINAS ADENINA (A) GUANINA(G) 6-aminopurina 2-amino-6oxopurina Sistema de numeracin (IUB) de los tomos de purinas; anillo pirimidina en sentido antihorario, anillo imidazol sentido horario BASES NITROGENADAS PIRIMIDNICAS PIRIMIDINAS Sistema de numeracin (IUB) de los tomos de pirimidina; en sentido horario. URACILO (U) TIMINA (T) CITOSINA (C) 2,4 dioxopirimidina 2,4dioxo-5-metilpirimidina 2-oxo-4-aminopirimidina NUCLETIDO ABREVIATURA A G U T C BASE adenina guanina uracilo timina citosina NUCLESIDO adenosina guanosina uridina timidina citidina NUCLETIDO adenilato, guanilato, uridilato, timidilato, citidilato, NUCLEOSIDO MONOFOSFATO, NMP adenosina 5`monofosfato (AMP) guanisina 5`monofosfato (GMP) uridina 5`monofofato (UMP) timidina 5`monofosfato (TMP) citidina 5`monofosfato (CMP) NUCLETIDOS DE IMPORTANCIA BIOLGICA Principal transductor intracelular de energa libre. ATP AMPc Participa en diversas funciones reguladoras de las clulas. Necesario para la activacin de la adenilato ciclasa por algunas hormonas, acta como regulador alostrico, etc. GTP CTP Se requiere en la biosntesis de algunos fosfoglicridos en los tejidos animales. FAD y NAD Coenzimas derivadas de nucletidos que actan como donadores de equivalentes reductores ANTIVIRALES Anlogos de nuclesidos Compuesto dideoxinucleosdico en el cual el grupo hidroxilo 3' de la molcula de azcar ha sido reemplazado por un hidrgeno. Esta modificacin impide la formacin de enlaces fosfodister necesarios para terminar las cadenas de cido nucleico. El compuesto es un potente inhibidor de la replicacin del Zalcitabina 2',3'-Didesoxicitidina compuesto es un potente inhibidor de la replicacin del VIH a bajas concentraciones, actuando como terminador de la cadena del ADN viral al unirse a la transcriptasa inversa. Aciclovir Base sinttica modificada, utilizada en el tratamiento del herpes simple. 9[(2-hidroxietoxi)-metil] guanina POLINUCLETIDOS Enlace fosfodister Erwin Chargaff POSTULADOS: La composicin de las bases de ADN vara de una especie a otra. ADN de tejidos diferentes de un mismo organismo tiene la misma composicin de bases. La composicin de las bases no vara con la La composicin de las bases no vara con la edad, estado nutricional ni el ambiente. Independientemente de la especie: A+G (Purinas) = T+C (Pirimidina) %A = %T %G = %C Maurice Wilkins Rosalind Franklin Estudiaban la estructura del ADN con difraccin de rayos X Obtuvieron esta imagen clave para dilucidar la estructura del ADN James Watson y Francis Crick Postulan un modelo tridimensional para la estructura del ADN Premios Nobel de Medicina en 1962 junto a Wilkins por dilucidar la estructura secundaria del ADN. MODELO DE ADN DE WATSON Y CRICK 0,34 3,4 Dos cadenas helicoidales de ADN, enrolladas alrededor del mismo eje hacia la derecha. Cadenas antiparalelas y complementarias. 10 pares de bases o 3,4 nmpor vuelta de la hlice. Separacin de 0,34 nmentre cada base apilada. El esqueleto de desoxirribosa fosfato se localiza hacia el El esqueleto de desoxirribosa fosfato se localiza hacia el exterior de la estructura, en contacto con el medio acuoso. Las bases nitrogenadas se orientan hacia el interior de la doble hlice. Formacin de puentes de hidrgeno entre GC y A=T FUERZAS ESTABILIZADORAS: Puentes de hidrgeno entre bases complementarias e interacciones hidrfobas entre bases apiladas. MECANISMO DE TRANSMISIN DE LA INFORMACIN GENTICA: Semiconservativa. NIVELES ESTRUCTURALES DE LOS CIDOS NUCLEICOS Se refiere a la secuencia de nucletidos. Enlace responsable: fosfodister. Importancia: almacena la informacin gentica. PRIMARIO SECUNDARIO Se refiere a la estructura tridimensional repetitiva y regular. Enlace responsable: no covalentes. Tipos: TERCIARIO Tipos: Forma A Forma B Forma Z Forma H Horquillas y Cruces Ovillo aleatorio Se refiere al plegado de orden superior de los elementos de una estructura secundaria regular (Superenrrollamiento). B ADN A Z H A ARN Z Horquillas y cruces ESTRUCTURA PRIMARIA Una hebra de ADN es un polmero lineal con direccionalidad de un extremo a otro. Por convenio se leen las secuencias en direccin 5 3 Apareamiento de bases nitrogenadas A = T G = C ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL DNA G = C Hebras de ADN en direccin antiparalela Bases internas Azcar centro Fosfato exterior Variacin de la estructura secundaria FORMA B Estructura de Watson y Crick, es la ms estable que adopta el ADN en condiciones fisiolgicas. FORMA A Predomina en soluciones deshidratadas, dextrgira, ms ancha y corta que la forma B y ancha y corta que la forma B y tiene 11 pares de base por vuelta. FORMA Z La rotacin de la hlice es levgira (a la izquierda). Contiene 12 pares de base por vuelta y la estructura es ms estrecha y larga. No se ha encontrado la forma A a nivel celular pero s la forma Z La estructura terciaria es lo suficientemente compacta para acomodar el ADN dentro del ncleo. ESTRUCTURA TERCIARIA O DE ORDEN SUPERIOR DEL DNA La estructura terciaria adopta una configuracin de orden superior, dando lugar a los cromosomas acomodar el ADN dentro del ncleo. Si en un organismo diploide, todo el ADN de un cromosoma se extendiese, se obtendra una longitud de 2 m. COMPACTACIN DEL DNA EN UN CROMOSOMA EUCARITICO EUCARITICO Cmo se alivia la tensin que se produce in vivo cuando se desenrolla una parte del ADN y se incrementa el superenrollamiento? MEDIANTE ENZIMAS DENOMINADAS TOPOISOMERASAS La DESNATURALIZACIN del ADN es la prdida de la conformacin nativa. (No se produce la rotura de ningn enlace covalente). PROPIEDADES FISICOQUIMICAS DE LOS ACIDOS NUCLEICOS ADN de doble cadena Desnaturalizacin Hibridacin Inductores de la desnaturalizacin: ADN parcialmente desnaturalizado Separacin de la hebras Asociacin de las hebras por apareamiento de bases Hebras separadas de ADN en ovillo esttico Inductores de la desnaturalizacin: Valores extremos de pH. Accin de sustancias como: urea, formamida, formaldehdo. Temperatura superior a 80 C GC Pto de fusin aumenta A=T Pto de fusin disminuye Al restablecerse los valores de temperatura y pH el ADN se renaturaliza La radiacin UV Produce la condensacin de dos grupos etileno para formar un anillo de ciclobutano Formacin de dmeros de pirimidina inducida por la luz UV Hidrlisis qumica HIDRLISIS CIDA cidos fuertes rompen tanto los enlaces fosfodister como N- glicosidicos. Por lo tanto, sirve para determinar la composicin HIDRLISIS ALCALINA Rompe los enlaces fosfodister del ARN pero no del ADN y respecta los enlaces N-glicosidico, por lo que se utiliza para aislar y para determinar la composicin de bases pero no la secuencia. cidos dbiles respectan los enlaces fosfodister pero rompe los N-glicosidicos. por lo que se utiliza para aislar y purificar ADN METABOLISMO DE LOS NUCLETIDOS RUTA DE NOVO Y DE SALVAMENTO Sntesis de novo Sntesis de nucletidos de purinas y pirimidinas a partir de precursores de bajo peso molecular (aminocidos, ribosa-5-fosfato, CO 2 y NH 3 ) Rutas de recuperacin o de salvamento Sntesis de nucletidos a partir de bases o nuclesidos que se dispone por haberlos obtenidos tras la digestin extracelular de A.N ingeridos en el alimento o por degradacin de A.N. por muerte celular. PRPP METABOLITO CENTRAL EN LAS RUTAS DE NOVO Y DE SALVAMENTO DE LOS ANILLOS DE PURINAS Y PIRIMIDINAS DEGRADACIN DE LOS CIDOS NUCLEICOS E IMPORTANCIA DEL SALVAMENTO DE NUCLETIDOS ORIGEN DE LOS COMPONENTES DE LOS ANILLOS DE PURINA Y PIRIMIDINA PURINAS PIRIMIDINAS COMPARACIN DE LAS RUTAS DE BIOSNTESIS CATABOLISMO DE RIBONUCLETIDOS RIBONUCLETIDOS PIRIMIDNICOS CATABOLISMO DE CATABOLISMO DE RIBONUCLETIDOS PRICOS GOTA Acumulacin excesiva de cido rico 3 de cada 1000 individuo la padecen. El acido rico precipita en urato que se acumula en el organismo principalmente liquido sinovial. ETIOLOGIA: ETIOLOGIA: Actividad elevada de la PRPP sintetasa prdida de la sensibilidad a la retroinhibicin ejercida por los nucleotidos de purina Mutaciones de la PRPP amidotransferasa perdida del control por retroalimentacin Disminucin de la enzima hipoxantina guanina fosforribosiltransferasa (HGPRT) Deterioro en la excrecin renal de cido rico Consecuencia de la quimioterapia del cncer. TRATAMIENTO: Dieta baja en purinas. Puede tratarse con xito con el alopurinol, el cual, es un anlogo estructural de la hipoxantina que inhibe a la xantina oxidasa. Esto hace que se acumule xantina que al ser soluble puede excretarse mas fcilmente por rin. SNDROME DE LESCH-NYHAN Dficit grave de hipoxantina guanina fosforribosil transferasa (HGPRT ). Artritis gotosa grave. Disfuncin dramtica del S.N. que se manifiesta con: Trastornos de conducta. Discapacidad para el aprendizaje. Comportamientos agresivos. Automutilaciones graves. La persona rara vez sobrevive por encima de los 20 aos de edad.