Anda di halaman 1dari 11

Review sintesis protein

Sintesa protein merupakan proses penyusunan amino pada rantai polipeptida dengan
melibatkan DNA dan RNA. Sintesis protein terjadi pada kelompok partikel sitoplasmik yang
disebut ribosom (~20m). artikel ini adala! rakitan makromolekular RNA ribosom (rRNA)
dan protein. "iap ribosom terdiri dari dua subunit# makro dan mikro. Subunit mikro
mengandung satu molekul rRNA. Subunit makro pada ribosom eukariot mengandung satu
salinan dari setiap tiga molekul rRNA yang berlainan.
$ambar. erbandingan antara proses sintesis sel prokariotik dan sel eukariotik
%embatan antara DNA dan sintesis protein adala! RNA. RNA se&ara kimia'i serupa
dengan DNA terke&uali ba!'a RNA mengandung ribosa( bukan deoksiribosa( sebagai
gulanya dan memiliki basa nitrogen urasil dan bukan timin. Dengan demikian( setiap
nukleotida di sepanjang untai DNA memiliki deoksiribosa sebagai gulanya dan A( $( )( atau
" sebagai basanya. Setiap nukleotida sepanjang untai RNA memiliki ribosa sebagai gulanya
dan A( $( )( atau * sebagai basanya.
RNA diperlukan dalam proses sintesa protein untuk memba'a in+ormasi yang
diba'a ole! gen ke tempat sintesis protein dalam sitoplasma. elaksana sintesa protein
adala! #
,. RNA duta-RNA.messenger-RNA.m (pemba'a perinta!-in+ormasi genetis)/ merupakan
jenis RNA yang terbesar molekulnya dalam sel.
2. RNA.ribosom-RNA.r (RNA yang membina sebagian ribosom-mesin pabrik protein)
0. RNA.trans+er-RNA.t (pengantar asam amino ke ribosom)/ merupakan jenis RNA yang
terke&il molekulnya dalam sel.
Sintesis protein se&ara garis besar dibagi menjadi dua ta!apan utama( yaitu proses
pembuatan molekul mRNA pada inti sel (transkripsi) dan proses penerjema!an mRNA ole!
rRNA serta perangkaian asam amino di ribosom (translasi).
$ambar. roses Sintesis rotein# "ranskripsi dan "ranslasi.
Transkripsi
"ranskripsi adala! proses penyalinan kode.kode geneti& yang ada pada urutan DNA
menjadi molekul RNA. "ranskripsi adala! proses yang menga'ali ekspresi si+at.si+at geneti&
yang nantinya akan mun&ul sebagai +enotipe. *rutan nukleotida pada sala! satu untaian
molekul DNA digunakan sebagai &etakan (template) untuk sintesis molekul RNA yang
komplementer. 1olekul RNA yang disintesis dalam proses transkripsi pada garis besarnya
dapat dibedakan menjadi tiga kelompok molekul RNA(yaitu #
,. mRNA (messenger RNA)
2. tRNA (transfer RNA)
0. rRNA (ribosomal RNA)
1olekul mRNA adala! RNA yang merupakan salinan kode.kode geneti& pada DNA
yang dalam proses selanjutnya (yaitu proses translasi) akan diterjema!kan menjadi urutan
asam.asam amino yang menyusun suatu polipeptida atau protein tertentu. 1olekul tRNA
adala! RNA yang berperan memba'a asam.asam amino spesi+ik yang akan digabungkan
dalam proses sintesa protein (translasi). 1olekul rRNA dan RNA yang digunakan untuk
menyusun ribosom( yaitu suatu partikel di dalam sel yang digunakan sebagai tempat sintesis
protein. 1olekul tRNA dan rRNA tidak perna! ditranslasi karena molekul yang digunakan
adala! RNA.nya itu sendiri.


Sala! satu pita DNA tunggal men&etak mRNA. ita tersebut dinamakan pita sense(
sedangkan pita yang tidak men&etak mRNA disebut pita antisense. mRNA yang tela! di&etak
kemudian keluar dari inti sel melalui pori.pori nukleus masuk ke dalam sitoplasma (Susunan
tiga basa mRNA komplementer dengan susunan tiga bua! pita sense DNA. Sintesis RNA ini
selalu terjadi menurut ara! 23 ke 03. "ranskripsi akan berak!ir jika RNA polimerase
mentranskripsi urutan DNA terminator yang ber+ungsi sebagai sinyal terminasi.
Dalam proses transkripsi( beberapa komponen utama yang terlibat adala! #
,. *rutan DNA yang akan ditranskripsi (cetakan/template)
2. 4n5im RNA polymerase
0. 6a&tor.+aktor transkripsi
7. re&ursor untuk sintesis RNA
*rutan DNA yang ditranskripsi adala! gen yang diekspresikan. Se&ara garis besar gen
dapat diberi batasan sebagai suatu urutan DNA yang mengkode urutan lengkap asam amino
suatu polipeptida atau molekul RNA tertentu. $en yang lengkap terdiri atas tiga bagian
utama( yaitu (,) daera! pengendali (regulatory region) yang se&ara umum disebut promoter(
(2) bagian stru&tural( dan (0) terminator. promoter adala! bagian gen yang berperanan dalam
mengendalikan proses transkripsi dan terletak pada ujung 23. Bagian structural adala!
bagian gen yang terletak di sebela! !ilir (downstream) dari promoter. 8agian inila! yang
mengandung urutan DNA spesi+ik (kode-kode genetic) yang akan ditranskripsi. Terminator
adala! bagian gen yang terletak di sebela! !ilir dari bagian stru&tural yang berperanan dalam
pengak!iran (terminasi) proses transkripsi.
Model transkripsi ada prokariota transkripsi berlangsung se&ara polisistronik. (poli =
banyak ) artinya bisa terjadi lebi! dari satu tempat kodon start (memulai transkripsi ) dan
tentu tempat kodon mengak!iri transkripsi (kodon stop =kodon terminal). Model transkripsi
eukariota ada 4ukariota transkripsi berlangsung se&ara 1onosistronik (mono=satu) Sistim
menga&u pada satu tempat (site ) start atau kodon memulai (A*$) dan satu kodon terminasi
(*$A (*A$ atau *AA).
"ranskripsi (sintesis RNA) dilakukan melalui beberapa ta!apan yaitu #
,. 6aktor.+aktor yang mengendalikan transkripsi menempel pada bagian promoter.
2. enempelan +a&tor.+aktor pengendali transkripsi menyebabkan terbentuknya kompleks
promoter yang terbuka (open promoter &omple9).
0. RNA polymerase memba&a &etakan (DNA template) dan mulai melakukan pengikatan
nukleotida yang komplementer dengan &etakannya.
7. Setela! terjadi proses pemanjangan untaian RNA !asil sintesis( selanjutnya diikuti
dengan proses pengak!iran (terminasi) transkripsi yang ditandai dengan pelepasan RNA
polymerase dari DNA yang ditranskripsi.
embentukan RNA dilakukan ole! en5im RNA polymerase. roses transkripsi terdiri dari 0
ta!ap yaitu #
1) :nisiasi
4n5im RNA polymerase menyalin gen( se!ingga pengikatan RNA polymerase terjadi
pada tempat tertentu yaitu tepat didepan gen yang akan ditranskripsi. "empat pertemuan
antara gen (DNA) dengan RNA polymerase disebut promoter. ;emudian RNA polymerase
membuka double !eliks DNA. Sala! satu utas DNA ber+ungsi sebagai &etakan.
Nukleotida promoter pada eukariot adala! 2<.$NN)AA")".0< dan 2<. "A"AAA".0<.
Simbul N menunjukkan nukleotida (bisa berupa
A( "( $( )). ada prokariot( urutan
promotornya adala! 2<.""$A)A.0< dan 2<.
"A"AA".0<.
2) 4longasi
4n5im RNA polymerase bergerak
sepanjang molekul DNA( membuka double
!eliks dan merangkai ribonukleotida ke ujung 0<
dari RNA yang sedang tumbu!.
0) "erminasi
"erjadi pada tempat tertentu. roses
terminasi transkripsi ditandai dengan
terdisosiasinya en5im RNA polymerase dari
DNA dan RNA dilepaskan.
mRNA pada eukariota mengalami
modi+ikasi sebelum ditranslasi( sedangkan pada
prokariota misalnya pada bakteri( mRNA
merupakan transkripsi ak!ir gen. mRNA yang
baru ditranskrip ujung 2<nya adala! pppNpN( dimana N adala! komponen basa.gula
nukleotida( p adala! +os+at. mRNA yang masak memiliki struktur =m$pppNpN( dimana =m$
adala! nukleotida yang memba'a = metil guanine yang ditamba!kan setela! transkripsi.
ada ujung 0< terdapat pNpNpA(pA)npA. 4kor poli A ini ditamba!kan berkat bantuan
polymerase poli (A). tetapi mRNA yang menyandikan !iston( tidak memiliki poli A.
>asil transkripsi merupakan !asil yang memiliki intron (segmen DNA yang tidak
menyandikan in+ormasi biologi) dan !arus di!ilangkan( serta memiliki ekson yaitu ruas yang
memba'a in+ormasi biologis. :ntron di!ilangkan melalui proses yang disebut spli&ing.
roses spli&ing terjadi di nukleus.
Spli&ing dimulai dengan terjadinya pemutusan pada ujung 2<( selanjutnya ujung 2< yang
bebas menempelkan diri pada suatu tempat pada intron dan membentuk struktur seperti laso
Gambar. Tahap Transkripsi
yang terjadi karena ikatan 2<.2<+os+odiester. Selanjutnya tempat pemotongan pada ujung 0
terputus se!ingga dua bua! ekson menjadi bersatu. rRNA dan tRNA merupakan !asil ak!ir
dari proses transkrips( sedangkan mRNA akan mengalami translasi. tRNA adala! molekul
adaptor yang memba&a urutan nukleotida pada mRNA dan menguba!nya menjadi asam
amino. Struktur molekul tRNA adala! seperti daun semanggi yang terdiri dari 2 komponen
yaitu #
,. ?engan aseptor # merupakan tempat menempelnya asam amino(
2. ?engan D atau D>* # terdapat di!idrourasil pirimidin(
0. ?engan antikodon # memiliki antikodon yang basanya komplementer dengan basa pada
mRNA
7. ?engan tamba!an
2. ?engan "** # mengandung "( * dan )
$ambar. "a!ap Spli&ing
Translasi
"ranslasi merupakan peminda!an in+ormasi genetik dari RNA dan membentuk protein
yang sesuai. ada proses ini terjadi penerjema!an in+ormasi genetik yang berupa serangkaian
kodon di sepanjang molekul mRNA ole! tRNA menjadi asam amino. Setiap molekul tRNA
meng!ubungkan kodon tRNA tertentu dengan asam amino tertentu. tRNA akan terus datang
memba'a asam amino ke ribosom dan menyatukan asam aminonya se!ingga terbentuk
polipeptida yang makin panjang. Setiap molekul tRNA akan dilepaskan dari ribosom setela!
memberikan asam aminonya. eristi'a ini berlanjut !ingga kodon stop men&apai ribosom.
;odon stop ber+ungsi sebagai sinyal untuk meng!entikan translasi. Selanjutnya protein
dan ribosom akan pisa! dari mRNA. erlu dipa!ami ba!'a !anya molekul mRNA yang
ditranslasi( sedangkan rRNA dan tRNA tidak di translasi.
1olekul mRNA merupakan transkripsi (salinan) urutan DNA yang menyusun suatu gen
dalam bentuk @R6 (open reading +rameAkerangka ba&a terbuka). 1olekul rRNA adala! sala!
satu molekul penyusun ribosom( yakni organel tempat berlangsungnya sintesis protein(
Phe
Leu
Ser
Tyr
Nonsense
Cys
Nonsense
Trp
sedangkan tRNA adala! pemba'a asam.asam amino yang akan disambungkan menjadi rantai
polipeptida. Suatu @R6 di&irikan ole! #
,. ;odon inisiasi translasi( yaitu urutan A"$ (pada DNA) atau A*$ (pada mRNA)
2. Serangkaian urutan nukleotida yang menyusun banyak kodon
0. ;odon terminasi translasi( yaitu "AA (*AA pada mRNA)( "A$ (*A$ pada mRNA)(
atau "$A (*$A pada mRNA).
;odon (kode geneti&) adala! urutan nukleotida yang terdiri atas tiga nukleotida
berurutan (seingga sering disebut sebagai triplet codon) yang menyandi suatu asam amino
tertentu( misalnya urutan A"$ (A*$ pada mRNA) mengkode asam amino metionin. ;odon
inisiasi translasi merupakan kodon untuk asam amino metionin yang menga'ali struktur
suatu polipeptida (protein). ada prokaryot ( asam amino a'al tidak berupa metionin tetapi
+ormil metionin (+1et). ;odon pertama (kodon inisiasi) pada 4 &oli dapat berupa A*$ (B0 C
kemungkinan)( $*$ (DC)( atau **$ (,C). 1eskipun demikian( pada bagian transkripsi
sebela! dalam (setela! kodon inisiasi)( kodon $*$ dan **$ masing.masing mengkode
Ealin dan leusin. Dalam proses translasi( rangkaian nukleotida pada mRNA akan diba&a tiap
nukleotida sebagai satu kodon untuk satu asam amino( dan pemba&aan dimulai dari urutan
kodon metionin (A"$ pada DNA atau A*$ pada mRNA).
>uru+ kedua
* ) A $
*
***
**)
**A
**$
*)*
*))
*)A
*)$
A*A
A*)
*AA
*A$
*$*
*$)
*$A
*$$
*
)
A
$
Leu
Ile
Met
Val
Pro
Thr
Ala
Gln
is
Asn
Lys
Asp
Glu
Ar!
Ser
Ar!
Gly
>uru+
pertama
>uru+
ketiga
)
)**
)*)
)*A
)*$
))*
)))
))A
))$
)A*
)A)
)AA
)A$
)$*
)$)
)$A
)$$
*
)
A
$
A
A**
A*)
A*A
A*$
A)*
A))
A)A
A)$
AA*
AA)
AAA
AA$
A$*
A$)
A$A
A$$
*
)
A
$
$
$**
$*)
$*A
$*$
$)*
$))
$)A
$)$
$A*
$A)
$AA
$A$
$$*
$$)
$$A
$$$
*
)
A
$
"abel ;odon triplet RNA
"ranslasi berlangsung di dalam ribosom. Ribosom disusun ole! molekul.molekul rRNA
dan beberapa ma&am protein. Ribosom tersusun atas dua subunit( yaitu subunit ke&il dan
subunit besar. ada jasad prokaryot( subunit ke&il mempunyai koo+isien sedimentasi sebesar
00S (unit SEedberg) sedangkan subunit besar
berukuran 20S( tetapi pada saat kedua unit
tersebut bergabung( koo+isien sedimentasinya
adala! =0S.pada jasad eukaryote( subunit ke&il
berukuran 70S( sedangkan subunit besar
berukuran F0S( tetapi sebagai suatu kesatuan(
ribosom eukaryote mempinyai koo+isien
sedimentasi sebesar D0S.
roses translasi terdiri dari tiga ta!ap yaitu #
1) Inisiasi.
roses ini dimulai dari menempelnya
ribosom sub unit ke&il ke mRNA. enempelan
terjadi pada tempat tertentu yaitu pada 2<.
A$$A$$*.0<( sedang pada eukariot terjadi pada
struktur tudung (=m$pppNpN). Selanjutnya ribosom bergeser ke ara! 0< sampai bertemu
dengan kodon A*$. ;odon ini menjadi kodon a'al. Asam amino yang diba'a ole! tRNA
a'al adala! metionin. 1etionin adala! asam amino yang disandi ole! A*$. pada bakteri(
metionin diuba! menjadi N+ormil metionin. Struktur gabungan antara mRNA( ribosom sub
unit ke&il dan tRNA.N+ormil metionin disebut kompleks inisiasi. ada eukariot( kompleks
inisiasi terbentuk dengan &ara yang lebi! rumit yang melibatkan banyak protein initiation
+a&tor.
$ambar. ;onsep Dasar "ranslasi
$ambar. roses :nisiasi pada "ranslasi
2) Elongation.
"a!ap selanjutnya adala! penempelan sub unit besar pada sub unit ke&il meng!asilkan
dua tempat yang terpisa! . "empat pertama adala! tempat (peptidil) yang ditempati ole!
tRNA.N+ormil metionin. "empat kedua adala! tempat A (aminoasil) yang terletak pada
kodon ke dua dan kosong. roses elongasi terjadi saat tRNA dengan antikodon dan asam
amino yang tepat masuk ke tempat A. Akibatnya kedua tempat di ribosom terisi( lalu terjadi
ikatan peptide antara kedua asam amino. :katan tRNA dengan N+ormil metionin lalu lepas(
se!ingga kedua asam amino yang berangkai berada pada tempat A. Ribosom kemudian
bergeser se!ingga asam amino.asam amino.tRNA berada pada tempat dan tempat A
menjadi kosong. Selanjutnya tRNA dengan antikodon yang tepat dengan kodon ketiga akan
masuk ke tempat A( dan proses berlanjut seperti sebelumnya.
$ambar. "a!ap proses elongasi.
3) Terminasi.
"a!ap terak!ir proses translasi adala! terminasi. 4longasi berlanjut !ingga kodon stop
men&apai tempat A di ribosom. 8egitu juga dengan proses translasi akan ber!enti bila tempat
A bertemu kodon ak!ir yaitu *AA( *A$( *$A. ;odon.kodon ini tidak memiliki tRNA yang
memba'a antikodon yang sesuai. Suatu protein yang disebut sebagai pelepas +aktor pelepas
(release factor) langsung mengikatkan diri pada kodon stop di tempat A. 6aktor pelepas ini
menyebabkan penamba!an molekul air( bukan asam amino pada rantai polipeptida.
Selanjutnya masukla! release +a&tor (R6) ke tempat A dan melepaska rantai polipeptida yang
terbentuk dari tRNA yang terak!ir. ;emudian ribosom beruba! menjadi sub unit ke&il dan
besar.
$ambar. "a!ap "erminasi