CURSO INTERNACIONAL TERICO - PRCTICO DE BIOINFORMTICA

BIOINFORMTICA ESTRUCTURAL MOLECULAR: MTODOS TERICOS Y COMPUTACIONALES PARA EL ESTUDIO

DE MACROMOLCULAS BIOLGICAS Y DE SUS INTERACCIONES
l curso tiene como objetivo proporcionar una comprensin bsica de la bioinformtica de protenas, e incluir
sesiones prcticas para demostrar lo que se puede hacer con las tecnologas disponibles. Software libre.

Impartido por
DR. R. CHARBEL
MAROUN

Universit d'Evry,
Btiment Maupertuis
DRA. MAURA
TLLEZ

CIB - UAEM
DR. GERARDO
DAZ

Centro de
Investigacin en
Ciencias Biolgicas
UAT
DR. ALEXIS
RODRGUEZ

CEIB - UAEM
DRA. ELBA VILLEGAS

CEIB -UAEM

Del 13 al 17 de Octubre 2014
Horario de 9:00 - 13:00 y 15:00-19:00 horas, total de 54 horas presenciales
Nmero mximo de participantes 25 alumnos
Lugar: Sala de cmputo de la Facultad de Ciencias Biolgicas UAEM
Con validez de curso optativo para estudiantes de Maestra
Contacto: Dra, Elba C. Villegas Villarreal elbav@uaem.mx
CURSO INTERNACIONAL TERICO - PRCTICO DE BIOINFORMTICA
Impartido por:
Dr. Charbel Maroun, (Universit d'Evry, Btiment Maupertuis)
Dra. Maura Tllez (CIB-UAEM), Dr Gerardo Da, (UAT) Dr. Alexis Rodrguez (CEIB/UAEM),
Dra Elba Villegas (CEIB-UAEM)
CONTENIDO TEMTICO
Lunes 13 de Octubre BIOINFORMTICA LINEAL

1. Objetivos y limitaciones
2. Bancos y bases de datos biolgicos, crecimiento, caractersticas
3. Minera de datos
4. Servidores comnmente utilizados
5. Mtodos para el estudio de la estructura esttica y dinmica de las molculas
6. Mtodos para el estudio de las interacciones moleculares y del reconocimiento molecular
7. El dogma de la biologa molecular estructural
Martes 14 de Octubre ESTRUCTURA SECUNDARIA, TERCIARIA Y CUATERNARIA DE PROTENAS

1. Niveles jerrquicos de la estructura 3D de protenas y su clasificacin
2. Hlices alpha, hojas beta y asas
3. Prediccin de la estructura secundaria y terciaria de protenas
4. Mtodos empricos
5. Redes neuronales
6. Fuerzas que estabilizan la estructura de protenas
7. El problema del replegamiento de una cadena poli peptdica
Mircoles 15 de Octubre BIOINFORMTICA ESTRUCTURAL MOLECULAR
1. Expresin emprica de la energa o campo de fuerza
2. Interacciones covalentes y no covalentes
3. Relaciones entre secuencia, estructura 3D y funcin de macromolculas biolgicas
4. Simulacin molecular de la estructura tridimensional esttica de las protenas
5. Prediccin ab initio
6. Tcnicas de minimizacin de energa y de la Mecnica molecular
7. Modelaje por homologa de secuencia
Jueves16 de Octubre 1. Hilvanado, reconocimiento de la familia de replegamiento y alineamientos 1D-3D
2. Simulacin molecular de la estructura dinmica de las protenas
3. Tcnicas y usos de la Dinmica molecular
4. Modos normales de vibracin
5. Simulacin de la interaccin y del reconocimiento molecular
6. Amarraje molecular (docking)
Viernes 17 de Octubre TEMAS DE ACTUALIDAD
1. Protenas intrnsecamente desordenadas
2. Quimio informtica
3. Concepcin de drogas asistida por ordenador basada sobre el conocimiento de la estructura
del receptor (SBDD)
4. Concepcin de drogas asistida por ordenador basada sobre el conocimiento de la estructura
del ligando (QSAR/QSPR)

Del 13 al 17 de Octubre 2014
Horario de 9:00 - 13:00 y 15:00-19:00 horas, total de 54 horas presenciales
Nmero mximo de participantes 25 alumnos
Lugar: Sala de cmputo de la Facultad de Ciencias Biolgicas / UAEM
Con validez de curso optativo para estudiantes de Maestra
Contacto: Dra, Elba C. Villegas Villarreal elbav@uaem.mx