y
Orn
Resumen
Los libros de texto son cada vez ms material relacionado con la importancia del
agua, pero este tema es tratado a menudo sobre-simplista con atencin ent
insuffici est dando a la posicin central del agua en los procesos vitales. En este
artculo, las ideas modernas sobre el papel fundamental que desempea el agua
en funcin bioqumica y el proceso se resumen. Se explica la importancia del
agua en las estructuras de los identificadores de ac nucleicos y protenas. 2001
IUBMB. Publicado por Elsevier Science Ltd. Todos los derechos reservados.
Palabras clave: agua; Estructura; El enlace de hidrgeno; Las protenas; Los
cidos nucleicos
1 Introduccin
Aunque a menudo se percibe como bastante normal, el agua es la sustancia ms
notable. Lavamos en l, pescado en ella, nadar en ella, beber y cocinar con ella,
aunque probablemente no todos al mismo tiempo. Estamos a unos dos tercios de
agua y el agua es necesaria para vivir. La vida como la conocemos, no podra
haber evolucionado sin agua y muere sin ella. La sequa provoca hambrunas e
inundaciones causan la muerte y la enfermedad .Debido a su evidente
importancia, el agua es el material ms estudiado en la Tierra. Viene como una
sorpresa, tanto, para encontrar que es tan mal entendida, no slo por la gente en
general, sino tambin por los cientficos que trabajan con l todos los das.
Los libros de texto estn incluyendo cada vez ms cantidades de mater ial con
respecto al agua. Sin embargo, este material suele concentrarse en un solo
captulo y su importancia es raramente empha tamao en otras partes. Captulos
sobre las protenas y cidos nucleicos, por ejemplo, a menudo discuten los
detalles estructurales y funcionales de estas macromolculas con poca
importancia que se da a los efectos generalizados de las aguas circundantes.
Otras reas, como el metabolismo, que a menudo ignoran las muchas funciones
del agua por completo. Esta falta de nfasis, evidenciado en parte de los ndices
de los libros de texto ", resulta de la naturaleza multidisciplinaria de la literatura
agua y la dificultad para reunir la informacin amplia pero a menudo finamentepropagacin disponibles.
El agua parece, a primera vista, se trata de un muy simple molecu-le, que consta
de dos tomos de hidrgeno unidos a un tomo de oxgeno y, de hecho, pocas
molculas son ms pequeas. Su tamao, sin embargo, contrasta con la
complejidad de sus propiedades, y estas propiedades parecen encajar
perfectamente en los requisitos para la vida basada en el carbono al igual que
ninguna otra molcula.
Los organismos se componen principalmente de agua lquida, que por formas
muchas funciones y nunca deben ser considerados simplemente como un
diluyente inerte. Sin embargo, a pesar del mucho trabajo muchas de las
propiedades del agua son desconcertantes. A menudo se ha dicho que la vida
depende de las propiedades anmalas del agua. En particular, la gran capacidad
de calor y alto contenido de agua en los organismos contribuyen a que exista
regulacin mal y prevenciones fluctu temperatura locales.
4 Agrupacin Agua
Vidas de los bonos de hidrgeno son 1-20 ps mientras que los bonos vidas rotas
son alrededor de 0,1 ps .Bonos romper si se prob reformar hbilmente para dar el
enlace de hidrgeno original, sobre todo si los otros enlaces de hidrgeno
circundantes estn en su lugar. Si no, la rotura por lo general conduce a la
rotacin alrededor restante enlace (s) de hidrgeno, y no a la traduccin de
distancia. Rotura de Bond en el lado covalente de la hidroelctrica generacin de
bonos (disociacin) es un evento raro, ocurre slo dos veces al da; es decir, slo
una vez por cada 10 -16 veces se rompe el enlace de hidrgeno.
El enlace de hidrgeno lleva informacin sobre los solutos y superficies en
distancias significativas en agua lquida. El efecto es sinrgico, directiva y
extensa, est reforzada por los efectos de polarizacin adicionales y las res
transferencia intermolecular onant de O - H de energa vibracional
[10]. Reorientacin de una molcula induce corresponden movimientos ING en
los vecinos .Por lo tanto, las molculas de soluto pueden 'sentido' (por ejemplo,
afectar a la solubilidad cada otros) entre s a distancias de varios nanmetros y
superficies pueden tener efectos que se extiende a decenas de nanmetros [11].
Las molculas de agua forman una red de enlaces de hidrgeno con infinita
localizada y estructurada Ering CLUST.Se ha sugerido que los pequeos grupos
de cuatro agua molecules pueden unirse para formar octmeros agua
relativamente estables que se pueden agrupar an ms para formar grupos de
agua mucho ms grandes que son capaces de interrelacionar y tessellate a travs
del espacio (. Fig 1).Esa agrupacin puede formar de forma dinmica tanto de
baja densidad abierto y trabajos netos condensados. Los grupos formados pueden
interconvertir entre inferior (- 0,94 g / ml) y superior (1 g / ml o ms) formas de
densidad por flexin, pero no necesariamente romper, algunos de los enlaces de
hidrgeno.Como la temperatura
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Fig. 1:Grupos de agua. (A) Un pequeo pero relativamente estable octmero (H 2
0) 8, (b) veinte octmeros pueden juntarse para formar una estructura abierta
centrada en un dodecaedro agua, (c) estructura (b) se puede expandir
adicionalmente para contener 280 molculas de agua la formacin de un clster
icosadrica [12].
Fig. 2: Una cadena de molculas de ter wa 10, que une el extremo de uno a-hlice
(hlice 9,211-227) a la mitad de otro (hlice 11,272-285) se encuentra a partir de
los datos de difraccin de rayos X de glucoamilasa-471, un profesional naturales
fragmento proteoltica de Aspergillus awamori glucoamilasa (datos del
Brookhaven Protein Data Bank, la estructura 1 GAH).
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MI Heggie, CD Latham, SCP Maynard, R. Jones, Chem Phys..Lett.249
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