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Os genes interrompidos: o impacto da descoberta dos
ntrons sobre a definio de gene molecular clssico

The interrupted genes: The impact of the discovery of introns on the classical
molecular gene definition
RICARDO WAIZBORT
GUSTAVO CIRAUDO SOLHA
Programa de Ps-Graduao em Histria das Cincias da Sade | Casa de Oswaldo Cruz / Fundao Oswaldo Cruz
RESUMO: Durante o ano de 1977, equipes independentes de pesquisa como a do ingls Richard Roberts no Cold Spring
Harbor Laboratory, do norte-americano Phillip Sharp no Massachussetts Institute of Technology (MIT), do francs
Pierre Chambon no Centre Nacional de la Recherche Scientifique, entre outras, descobrem que ao contrrio do que era
sabido em bactrias, o gene no era um trecho de DNA ininterrupto pronto para ser traduzido em protenas. Em organismos
eucariontes o RNA mensageiro precisa ser montado para dar origem protena final. Todavia, essa montagem do RNA
mensageiro pode ocorrer de formas alternativas, gerando mais de uma protena por gene. Esse fenmeno chamado de
processamento alternativo do RNA mensageiro. A descoberta deste, e de outros processos moleculares, so motivo necessrio
para que certos autores postulem a necessidade de uma mudana conceitual das pesquisas biolgicas. Para outros autores,
essas descobertas no so anomalias, mas mantm o ncleo de um programa de pesquisa lakatosiano. O dogma central da
biologia molecular, tratado ou como paradigma kuhniano ou como ncleo lakatosiano debatido.
Palavras-chave: Histria; gene molecular; paradigma; programa de pesquisa; controvrsia.
ABSTRACT:During all the year of 1977 independent teams of research, such as the ones carried out by the British
Richard Roberts at Cold Spring Harbor Laboratory, the North American Phillip Sharp at the Massachusetts Institute of
Technology (MIT), and the Frenchman Pierre Chambon at the National Centre of la Recherche Scientifique among
others, discovered, despite what was known about bacteria, that the gene was not a piece of uninterrupted DNA ready to
be translated in proteins. In eukaryotic organisms the necessary messenger RNA needs to be mounted in order to give
origin to the final protein. However, this assembly of the messenger RNA can occur of alternative forms, generating more
than a protein for gene. This phenomenon is called alternative splicing of the messenger RNA. The discovery of this and
other molecular processes are the necessary reasons for some authors to claim a conceptual change of the biological research.
For other authors, these discoveries are not anomalies, but they keep the inner core of a lakatosian program of research. The
central dogma of molecular biology, treated or as kuhnian paradigm or as lakatosian inner core is debated.
Key-words: History; molecular gene; paradigm; research program; debate.
Introduo
O gene uma das entidades tericas mais bsicas da biologia em geral e, particularmente, da
biologia molecular1. notrio tambm que o conceito de gene, empregado por bilogos, goza igualmente
de popularidade mesmo entre um pblico mais amplo2. Freqentemente, tanto na imprensa
REVISTA DA SBHC, Rio de Janeiro, v. 5, n. 1, p. 63-84, jan | jul 2007
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especializada como na leiga, o gene apontado como promessa para a erradicao de males que afligem
a sociedade: da cura de doenas e distrbios, tais como tumores, esquizofrenia e sndrome bipolar, entre outros, soluo de problemas sociais e intertnicos, passando pela possibilidade de aperfeioar a
natureza de animais e plantas, resolver questes forenses, traar genealogias, explicar diferenas de
comportamento entre os gneros feminino e masculino e compreender conflitos entre geraes. At
no campo das artes plsticas o gene tem exercido sua influncia3.
Apesar da centralidade do termogenepara a biologia, sua definio permanece alvo de controvrsias e especulaes4. No livro Nature via nurture: genes, experience, and what makes us human5, Matt
Ridley, Ph.D. em Zoologia e professor visitante no Cold Spring Harbor Laboratory, lista nada menos que
sete significados degene. De acordo com Ridley, um gene pode ser definido como: 1) um arquivo hereditrio mendeliano para um determinado trao fsico ou comportamental; 2) um carreador de doena/
sade; 3) uma informao compartilhada entre diferentes espcies de seres vivos; 4) uma receita qumica
para sintetizar protenas; 5) um comutador molecular para ligar/desligar outros genes; 6) uma unidade
de seleo natural; e 7) um dispositivo para extrair informao do ambiente. Cada uma dessas definies
est relacionada a descobertas feitas ao longo do desenvolvimento da histria da gentica. Cada uma
dessas definies trilhou um caminho diferente, e nenhuma delas poderia responder sozinha pela
definio do gene. Dessa forma, no constitui surpresa o fato de que os diversos significados possveis
atribudos ao termo gene confundam o pblico leigo e mesmo alguns bilogos.
Para sermos precisos, desde que foi cunhado pelo bilogo dinamarqus Wilhelm Johannsen, em
1909, o significado do termogenejamais esteve ao abrigo de polmicas dentro da histria das cincias6.
Diferentes conceitos de gene so empregados em diferentes reas da biologia. No presente trabalho,
nosso objetivo investigar como um conceito especfico de gene, denominado de gene molecular
clssico7 foi desafiado pela descoberta, em 1977, dos chamados ntrons.
Segundo a definio de gene molecular clssico, o gene a stretch of DNA sequence that codes for
a particular protein that has a particular function8. Essa definio equivale ao quarto significado de gene
listado por Ridley9, em que um gene caracterizado como uma espcie de receita qumica para produzir
uma protena. Embora oriunda de pesquisas realizadas ainda da dcada de 1960, essa definio continua
sendo a mais utilizada em livros modernos de biologia celular e molecular10.
Todavia, durante o ano de 1977, pesquisadores anunciaram a descoberta de que a estrutura dos
genes em organismos eucariticos no contnua, mas apresenta interrupes que, a princpio, no
fariam nenhum sentido11. Como uma espcie de mosaico, os genes de organismos eucariontes so divididos em pores chamadas de ntrons, as regies sem sentido, e pelas regies da seqncia do DNA
que seriam responsveis pela especificao do produto gnico, os exons. Os genes que apresentam
essa estrutura so os chamados genes interrompidos. O objetivo central deste trabalho discutir o
impacto da descoberta dos genes interrompidos sobre o conceito de gene molecular clssico. Apresentaremos, de forma sucinta, dois lados de uma longa controvrsia sobre a definio de gene. Em um
plo, esto aqueles que entendem que o conceito de gene, com a descoberta dos ntrons e de outros
fenmenos moleculares, chegou ao limite de seu poder explicativo12; no outro plo, esto aqueles que
compreendem que as dificuldades em definir (unvoca e inequivocamente) o gene so intrnsecas natureza do prprio conhecimento cientfico13. Nossa concluso se encaminhar na direo de defender
que o conceito de gene e a teoria gentica no estariam passando por uma revoluo paradigmtica
kuhniana14. Estaramos, ao contrrio, em um perodo de tentativas de eliminao de anomalias que ocorrem durante a experimentao biolgica com os genes. O debate em torno do assunto poderia ser
entendido, ento, como uma passagem por uma fase progressiva de um programa de pesquisa lakatosiano.
Genes interrompidos
Engenharia gentica, clonagem, projetos genoma (humano e de outros animais, plantas e microrganismos) e projetos proteomas so apenas as partes mais visveis de um iceberg que ganhou corpo ao
longo do sculo XX, principalmente a partir da dcada de 1970, quando a descoberta de novas tecnologias
moleculares pressionou a sociedade a rever no s as velhas formas de conceber a sade, mas tambm
a reproduo humana e at mesmo projetos eugnicos.
Em 1968, Gunther Stent denominou de fase dogmtica15 da biologia molecular, o perodo representado pela emergncia dodogma central da biologia molecularde Francis Crick, ou seja, a partir de
195816. No dogma central, expresso mais tarde lamentada por seu prprio autor, Crick afirma que a
passagem das informaes genticas segue do DNA para o RNA e da para as protenas. Representadas
no dogma esto as duas funes primordiais da molcula de DNA, a base material da hereditariedade:
1) a auto-reproduo das informaes genticas; e 2) a induo da sntese de protenas que constituem
a estrutura fsica dos organismos e que regem as reaes qumicas enzimtico-catalticas sem as quais
a vida no seria possvel17. O conceito de gene molecular clssico que emerge dessa fase dogmtica
procura conciliar uma unidade estrutural de DNA (uma seqncia especfica de DNA) com uma unidade
funcional no organismo (uma protena particular responsvel por algum aspecto do funcionamento
do organismo)18.
Devido s dificuldades tcnicas para analisar a organizao mais complexa do genoma dos seres
eucariticos (animais, plantas e fungos) notadamente as ordens taxonmicas mais altas desses organismos , muito do conhecimento gentico estabelecido em relao aos processos de regulao e
estrutura do gene foi obtido em sistemas bacterianos, sobretudo na bactria Escherichia coli, e estendidos
para os demais organismos19. Convm enfatizar que a Escherichia coli um microorganismo importante
no s como modelo gentico, mas tambm como agente etiolgico de algumas importantes doenas
humanas e animais. Por exemplo, a colibacilose viria uma das principais doenas da avicultura industrial moderna e causa anualmente grandes prejuzos econmicos. Nos seres humanos, a causa de
colites hemorrgicas (inflamao da mucosa intestinal) e gastrenterites (diarrias), entre outras afeces,
sendo uma das maiores causas de mortalidade infantil por diarria bacteriana, em pases de terceiro
mundo. Entretanto, a partir da possibilidade de investigar mais diretamente a organizao do material
gentico dos organismos eucariontes, algumas suposies anteriores tiveram que ser revistas.
Intermezzo tcnico-histrico
A descoberta dos genes interrompidos apresenta relao direta com o aparecimento de novas
tcnicas de investigao no cenrio da biologia molecular, notadamente o advento da tecnologia do
DNA recombinante20. Os historiadores da cincia sempre souberam destacar a importncia do
desenvolvimento de novas tecnologias. Nesse sentido, exemplar a relao entre a biologia e as tcnicas
fsico-qumicas, que comeam a se tornar notrias por volta do final do sculo XIX, antes mesmo do
advento da gentica.
No final do sculo XIX, comeavam a minguar certas teorias associadas ao pensamento biolgico,
como o vitalismo21, para dar lugar ao desenvolvimento de uma cincia mais experimental, como a
bioqumica e a gentica22. A unio entre os mtodos de anlises fsico-qumicos e as questes biolgicas
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foi o esboo do que viria a ser a chamada biologia molecular23. Assim, a biologia molecular ocupa uma
regio fronteiria entre a biologia, a qumica e a fsica. Francis Crick, um dos descobridores da estrutura
da molcula de DNA, afirmou: I myself was forced to call myself a molecular biologist because when
inquiring clergymen asked me what I did, I got tired of explaining that I was a mixture of crystallographer,
biophysicist, biochemist and geneticist, an explanation which in any case they found too hard to grasp24.
Parafraseando Franois Jacob, a bioqumica e a fsica, a gentica e a fisiologia fundem-se numa s
prtica25. Isto quer dizer que a biologia molecular no pode ser realizada por indivduos isolados, cada
um preocupado com seu problema e seu organismo. Ela exige um esforo conjugado de tcnicas e pesquisadores com formaes as mais diversas. Em um mesmo instituto de pesquisa, em um mesmo
laboratrio passam a cooperar especialistas separados por sua formao de origem, mas unidos por
um mesmo tema de anlise e um mesmo material.
O desenvolvimento da tcnica de anlise de molculas por raios-X, em 1912, por dois fsicos
ingleses, William e Lawrence Bragg, pai e filho, considerado como o marco inicial da biologia molecular
propriamente dita26. O advento da tcnica de difrao por raios-X passou a permitir a anlise das
estruturas das molculas que compem os organismos, ao fornecer a posio exata de cada tomo27.
Contudo, devido especificidade da tcnica, esse perodo permaneceu reservado aos fsicos estruturais.
Pode-se dizer que a biologia molecular no nasceu exatamente do interesse de bilogos, mas,
principalmente, de uma legio de fsicos que acreditavam que podiam dar contribuies de suas reas
de pesquisa para a resoluo de algumas questes biolgicas. O acesso intimidade das estruturas
biolgicas s se tornou possvel porque os fsicos passaram a se interessar pela complexidade das
molculas de importncia biolgica, na medida em que eles acreditavam que somente a configurao
tridimensional destas molculas poderia desvendar as funes fisiolgicas da clula28.
O interesse nas estruturas das molculas que compem os organismos deu origem ao que se
convencionou chamar de escola estruturalista da biologia molecular. Essa escola dava nfase a
estruturas das protenas, molculas de predileo dos bioqumicos, devido a sua enorme importncia
nos mais diversos fenmenos biolgicos. A escola estruturalista se valeu, principalmente, dos extratos
celulares como fonte dos primeiros componentes passveis de anlise. A fsica e a qumica forneceram
as ferramentas que permitiram purificar, determinar a composio e organizao das macromolculas,
com as tcnicas da cromatografia (que permite purificar e isolar molculas e substncias qumicas); da
eletroforese (que permite determinar o tamanho e as propriedades eltricas das molculas); da centrifugao (que permite a anlise de extratos celulares por densidade); do uso de radioistopos (que
permite o estudo de elementos que emitem radiaes distinguveis e que possibilita o acompanhamento
da sua trajetria na clula e/ou no /organismo); de tcnicas de microscopia (novos mtodos de fixao
de vrios tipos de materiais biolgicos e corantes com afinidade altamente especfica em relao a
certos componentes celulares ou moleculares); de microscpios cada vez mais eficientes, como os eletrnicos que permitem observar organelas e certas macromolculas29. Essas tcnicas tambm foram
utilizadas na escola funcionalista, que mencionaremos a seguir.
Para Stent30, a influncia da escola estruturalista na biologia no foi em nada revolucionria. Todavia
uma outra escola, denominada de informacional ou funcionalista, foi motivada por uma noo
inovadora: a suposio de que a prpria biologia forneceria notveis contribuies fsica e, at mesmo,
a descoberta de novas leis da fsica31. Essa escola tinha seu foco, sobretudo, na informao gentica, a
saber, as bases fsicas do armazenamento da informao gentica. Considera-se que tal escola teve
incio em 1938, a partir do fsico alemo Max Delbrck, do California Institute of Technology (Caltech).
Delbrck estudava a gentica de bacterifagos (fagos), vrus que infectam bactrias, ou de forma literal,
comedores de bactrias. Para as dcadas de 1920, 1930 e at mesmo 1940, o termo comedores de
bactrias parece ser particularmente apropriado. De acordo com Lwoff32, no se sabia ao certo o que
eram os bacterifagos. Foi Hershey, em 1952, que demonstrou serem os vrus partculas organizadoras
de sua prpria reproduo a partir de seu prprio material gentico, mas usando a maquinaria celular
da clula hospedeira33. Stent34 afirma que nesse perodo se chegou ao consenso de que fagos so
realmente vrus que se multiplicam autonomamente dentro das clulas bacterianas hospedeiras, assunto
que estava sob debate por mais de dez anos.
Assim, Delbrck, Alfred Hershey (qumico e bacteriologista norte-americano, do Carnegie
Institution of Washington) e Salvatore Luria35 (microbiologista italiano naturalizado norte-americano,
do MIT, Massachusetts Institute of Technology) foram os fundadores do que ficou conhecido como o
grupo americano dos fagos36. Esse grupo acreditava que os fagos eram os objetos ideais para o estudo
da auto-replicao biolgica e das bases fsicas da hereditariedade, do gene. Dessa forma, pode-se
dizer que muitos dos pesquisadores envolvidos no estabelecimento da noo degene molecular clssico
so oriundos do grupo dos fagos37.
Esse perodo caracterizado por Stent38 comofase romnticada escola informacional da biologia
molecular. Isto porque, embora tenham contribudo em desenvolver o sistemafago hospedeirocomo
um modelo de organismo experimental para a gentica39, os pesquisadores dessa escola no resolveram
o problema principal a que se propuseram: a descoberta da estrutura responsvel pela hereditariedade.
A principal falha desses pesquisadores residiu no fato de terem acreditado que as protenas eram o
material gentico viral. Quando Hershey e Marta Chase concluem que o genoma do vrus (fago) o
seu DNA40, encerra-se essa fase para dar lugar fase dogmticada biologia molecular, em que estariam
envolvidos dois fsicos experientes em difrao por Raios-X: Francis Crick e Maurice Wilkins41; ambos
estaro envolvidos na descoberta da estrutura fsico-qumica do DNA, ao lado de James Watson e de
Rosalind Franklin. Cabe assinalar que a relao entre esses pesquisadores no foi nada tranqila,
especialmente a relao entre Franklin e Wilkins42.
Os genes interrompidos e o DNA recombinante

Da decifrao do cdigo gentico, no incio da dcada de 1960 at 1977, as molculas de RNA que
transportam a informao gentica para os ribossomos (estruturas celulares onde as clulas sintetizam
as protenas) eram consideradas cpias fiis do DNA, na qual cada molcula de RNA alinhava-se
exatamente com a fita de DNA codificante. A seqncia de bases nitrogenadas do gene apresentava
uma correspondncia direta em relao seqncia de aminocidos a qual especificava. Esse princpio
de colinearidade em bactrias foi assumido, tacitamente, para os demais organismos43.
De acordo com a biologia evolutiva e a bioqumica comparativa, certos processos biolgicos so
conservados durante o curso evolutivo e se tornam praticamente universais para todos os organismos.
Isto permite inferir que esses processos sejam quase os mesmos tanto em organismos mais simples
como nos mais complexos. Pode-se dizer que cada indivduo traz consigo a experincia evolutiva de
seus antepassados. Embora a diversidade de espcies do mundo vivo seja evidentemente estonteante,
subjacentes a essa diversidade existem notveis semelhanas entre as espcies. Tanto assim, que
possvel construir organismos to heterogneos fisicamente, como ornitorrincos e flamingos, moscas,
polvos e macacos, sequias, carvalhos e musgos (a lista poderia continuar quase indefinidamente), a
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partir de um conjunto no muito dessemelhante de protenas, lipdeos e carboidratos, valendo-se de

um cdigo gentico praticamente universal e uma maquinaria de traduo quase idntica. O repertrio
qumico e a funo das estruturas biolgicas so basicamente os mesmos, no importando tratar-se de
clulas bacterianas, clulas de leveduras ou das diferentes clulas animais e plantas. Nesse sentido, os
processos fundamentais da vida, como a maior parte das reaes centrais do metabolismo, permanecem
aproximadamente os mesmos, das bactrias ao homem44.
Assumindo isso, o bilogo francs Jacques Monod, Nobel em 1965 pela pesquisa sobre o
funcionamento gentico em bactrias, conjuntamente com Franois Jacob e Andr Lwoff, resume esse
pensamento com a declarao de que o que verdade para a bactria Escherichia coli tambm verdadeiro
para os elefantes. Admitir isso como verdade evidencia as vantagens de estudar processos biolgicos
em organismos experimentais menos complexos.
Apesar do sucesso das pesquisas microbiolgicas em desvendar os mecanismos de controle e
regulao da atividade celular45, durante o ano de 1977, uma srie de trabalhos independentes demonstrou que a organizao dos genes em organismos eucariontes e em vrus fundamentalmente
diferente daquela encontrada em bactrias. As seqncias de DNA que especificam a produo de um
determinado polipeptdio (cadeia de aminocidos) no so totalmente colineares a esses polipeptdeos.
De fato, os genes no so contnuos, mas uma espcie de mosaico em que uma matriz de leitura
intercalada por seqncias silenciosas, no codificantes46 (Figura 1).
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Figura 1: Estrutura do gene e fluxo da informao gentica em bactrias (A) e em organismos superiores (B). Em
bactrias a informao gentica armazenada em segmentos contnuos de DNA e o RNA mensageiro tem
correspondncia direta com a protena final. Muitos genes de organismos eucariontes e virais apresentam-se
interrompidos, divididos. A seqncia primria do RNA mensageiro precisa passar por um processo de corte e reunio
antes de sua traduo em protenas (adaptao a partir da figura encontrada no stio eletrnico do Nobel e-Museum,
http://nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/1993/press.html).
A descoberta dos genes interrompidos est diretamente relacionada ao desenvolvimento das novas
tcnicas de investigao molecular do incio da dcada de 1970, como a descoberta das enzimas de
restrio e a tecnologia do DNA recombinante47. Estas so duas das ferramentas mais representativas
de uma nova era da biologia molecular, a pesquisa genmica48. No final da dcada de 1960, as primeiras
enzimas de restrio comeam a ser descritas em Escherichia coli 49 e isoladas e caracterizadas na
bactria Hemophilus influezae50. O nome dessas enzimas advm do fenmeno de restrio ao
hospedeiro. Esse fenmeno foi observado em algumas linhagens bacterianas que apresentavam
imunidade ao ataque de vrus invasores. Averiguou-se que essas espcies bacterianas possuam enzimas
(de restrio) que destruam o DNA invasor, reconhecendo e cortando seqncias especficas de DNA.
Dessa forma, pode-se dizer que essas enzimas atuam como uma espcie de tesoura molecular.
A partir do advento da tecnologia do DNA recombinante, torna-se possvel cortar genes de uma
espcie e inseri-los (recombin-los) em vetores. Os vetores podem ser pequenas molculas de DNA
circular existentes em bactrias, chamados de plasmdios. Aps a recombinao entre os vetores e os
fragmentos de DNA de interesse, os vetores podem ser introduzidos e propagados em organismos
hospedeiros, como bactrias e leveduras. Dentro dos organismos hospedeiros, um fragmento especfico
da molcula de DNA pode ser clonado indefinidamente. O objetivo dessa tecnologia obter em grande
quantidade uma seqncia de DNA desejada, para posteriores estudos moleculares, com fins mais
precisos e especficos.
As primeiras molculas de DNA recombinante foram criadas em 197251 e em 197352. O trabalho
de 1972 rendeu ao bioqumico Paul Berg, da Stanford University School of Medicine, Califrnia, o Nobel
em qumica de 1980. Em 1974, Paul Berg, em conjunto com mais dez pesquisadores, redige uma carta
onde solicita que o NIH (National Institutes of Health) regule o uso da tecnologia do DNA recombinante.
E at que se tenha um melhor entendimento quanto segurana dessa nova tcnica, alguns experimentos
envolvendo essa nova tecnologia deveriam ser interrompidos53. Em fevereiro de 1975, decorrente da
proposta de moratria nas pesquisas que envolvessem a manipulao gentica a partir da tecnologia
do DNA recombinante, realizou-se o que ficou conhecido como Conferncia de Asilomar. Essa
conferncia reuniu cerca de 140 cientistas de diversas nacionalidades no Centro de Convenes de
Asilomar, em Pacific Grove, Califrnia. Nessa reunio cientfica discutiu-se a segurana da manipulao
do DNA de diferentes espcies de seres vivos, sugerindo que se distinguisse e classificasse os
experimentos com a tecnologia do DNA recombinante de acordo com o nvel de risco imaginado. A
conferncia de Asilomar um marco na histria da preocupao tica aplicada pesquisa. Foi a primeira
vez que se discutiram aspectos de proteo aos prprios pesquisadores e demais profissionais envolvidos
nas reas em que se realiza o projeto de pesquisa, sem nenhum tipo de presso pblica provavelmente
pelo fato de que nessa poca as pesquisas genticas no eram um assunto de domnio pblico, como o
so nos dias de hoje. Dois pioneiros na pesquisa com DNA recombinante, Stanley Cohen da Stanford
e Herbert Boyer da U.C. San Francisco, pediram, e lhes foi concedida, a patente sobre a tecnologia do
DNA recombinante. Isto garantiu, para a Stanford e para a U.C.S.F., royalties de empresas de
biotecnologia e companhias farmacuticas. Estima-se que a patente Cohen-Boyer j tenha gerado
cerca de 200 milhes de dlares para essas universidades54.
Com a tecnologia do DNA recombinante possvel, por exemplo, estudar os mecanismos de
expresso dos genes55 e a produo de animais e plantas transgnicos56. Alm disso, a tecnologia
do DNA recombinante teve um profundo impacto na indstria de frmacos. A insero de genes
de interesse em bactrias e outros microorganismos faz desses seres verdadeiras fbricas em miniatura, permitindo a clonagem e expresso gentica de protenas e de hormnios humanos de interesse mdico, como a insulina humana e fatores de coagulao sangunea, substncias de considervel
valor econmico57.
Trata-se, em suma, da possibilidade de cortar, manipular, analisar e reproduzir pedaos do material
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gentico. Embora no possuam muitas das propriedades biolgicas complexas de outros organismos,
as bactrias e as leveduras tornam-se verdadeiros tubos de ensaio vivos, em que possvel reconstituir reaes qumicas e biolgicas complexas e, com isso, saber mais sobre os processos de regulao e organizao do gene das clulas eucariticas que j eram relativamente bem estabelecidos nas
clulas procariticas.
Todavia, to logo se tornou possvel pesquisar e intervir mais diretamente nos genes, averiguouse que a estrutura dos genes em organismos eucariontes, e em vrus, apresentava caractersticas at
ento insuspeitadas. Os bioqumicos norte-americanos, David Glover e David Hogness da Stanford
University School of Medicine na Califrnia, em fevereiro de 1977, foram os primeiros a documentar
que os genes eucariticos so interrompidos58. Essa descoberta se deu em genes codificadores de RNAs
ribossomais e parece no ter chamado muita ateno. Contudo, quando, nos meses de agosto e setembro de 1977, as equipes de pesquisa do ingls Richard John Roberts, do Cold Spring Harbor Laboratory59,
e do americano Phillip Allen Sharp60, do Center for Cancer Research no Massachusetts Institute of
Technology (MIT), descobrem que as seqncias de genes virais codificadores de protenas estruturais
tambm contm interrupes (mais tarde denominadas por Walter Gilbert61, em 1978, de ntrons),
esse achado parece no ter passado desapercebido. Isso indicava que, se os genes codificadores de
protenas dos vrus contm seqncias intercalares, o mesmo poderia acontecer para os organismos
eucariontes hospedeiros.
Embora as instituies s quais pertenciam estivessem envolvidas em pesquisas sobre cnceres,
Phillip Sharp e Richard Roberts no investigavam propriamente vrus tumorais, mas a expresso gnica
em adenovrus 2 (Ad2). O Ad2 um vrus de DNA que infecta as clulas humanas e que um dos
causadores do resfriado comum. Em vista do maior conhecimento desse processo em clulas
procariticas, mas do quase desconhecimento em clulas eucariticas, Robert e Sharp almejavam saber
mais sobre os processos de transcrio em clulas eucariticas. Devido s maiores complexidades dos
organismos eucariticos, escolheram estudar esse processo em um sistema hospedeiro-vrus, valendose das semelhanas existentes entre a estrutura do material gentico desses organismos. No h dvida
de que o desenvolvimento dessa pesquisa contribuiria tambm para o programa sobre cnceres62. A
escolha do mesmo organismo modelo por essas duas equipes no parece ser exatamente uma
coincidncia, pois, em 1972, Phillip Sharp e Richard Roberts estiveram pesquisando juntos esse mesmo
organismo (o Ad2) no Cold Spring Harbor Laboratory63.
O processamento alternativo
Segundo Mayr64, quando Niremberg e Matthaei, em 1961, conseguiram desvendar o cdigo
gentico, acreditava-se amplamente que o ltimo grande problema da biologia molecular acabava de
ser solucionado65. Acumularam-se, desde ento, muitas descobertas totalmente inesperadas, cujo
significado maior, at agora, se relaciona com os aspectos da fisiologia do gene, mas que, evidentemente,
tambm tem importncia evolutiva, como acabou por ficar demonstrado quando foram mais bem
conhecidos os processos moleculares envolvidos na evoluo.
A descoberta dos genes interrompidos indica a existncia de mecanismos genticos que fazem a
clula mais dinmica e complexa do que se suspeitava antes66. Como foi exposto, a regio do DNA
contendo o gene transcrita numa longa molcula de RNA precursora, que processada para dar lugar molcula de RNA mensageiro maduro. Esse mensageiro mais curto que traduzido em protena.
Todos os organismos eucariontes contm ntrons em pelo menos alguns de seus genes, embora
esse nmero varie consideravelmente de organismo para organismo. Por exemplo, estima-se que apenas
250 dos cerca de 6.000 genes do genoma da levedura Saccharomyces cerevisiae contenha ntrons (cerca
de 4%), enquanto a maioria dos aproximadamente 35.000 genes do genoma humano composta por
genes interrompidos.
Walter Gilbert67 conjeturou que uma conseqncia do modelo ntrnico que o dogmaum gene,
uma cadeia polipeptdicadesaparece. O gene, como uma regio de DNA, corresponderia agora a uma
unidade de transcrio. Todavia essa unidade de transcrio pode corresponder a no apenas um, mas
tambm a diferentes cadeias polipeptdicas. E essas cadeias polipeptdicas podem tanto possuir funes
celulares semelhantes como no possuir68. Embora previsto por Walter Gilbert j em 1978, s em 1987
a existncia do processamento alternativo foi verificada experimentalmente69.
O processamento alternativo, ou emenda alternativa, apenas um entre diversos eventos que
ocorrem entre a transcrio do DNA e o produto gnico final. Apenas em termos de modificaes aps
a traduo, j so conhecidos cerca de duzentos tipos diferentes de processos70. Contudo o processamento alternativo considerado como um dos mais notveis componentes da complexidade funcional do genoma humano71.
Estimativas recentes apontam que cerca de 40 a 60% dos genes humanos so processados alternativamente. E esse nmero tende a crescer, medida que se promova uma anlise mais acurada do
genoma72. De uma forma geral, os eventos de emenda alternativa so bastante especficos. Na maior
parte das vezes, ocorrem em tecidos particulares e em momentos precisos do desenvolvimento do
organismo e/ou somente sob certas condies fisiolgicas. Esta uma das dificuldades de se estimar a
proporo desses eventos no organismo73.
A ovalbumina, por exemplo, a principal protena presente no ovo de galinhas. Foi estudando
essa protena que a equipe de pesquisa liderada por Pierre Chambon fez a sua descoberta particular
dos genes interrompidos74. O tamanho total do gene da ovalbumina (isto , estamos considerando a
regio do DNA contendo toda a seqncia que codifica o RNA mensageiro, incluindo os oito ntrons
que no tm contraparte no mensageiro final) de cerca de 7.700 pares de bases nitrogenadas. O RNA
mensageiro maduro contm cerca de 1.872 nucleotdeos. Desses 1872 nucleotdeos, 64 pertencem a
uma regio que antecede a regio codante75, que denominada de seqncia lder no traduzida. Uma
outra regio que tambm no traduzida se encontra no final do mensageiro. Essa regio tem cerca de
650 nucleotdeos. No final das contas, de toda a regio do DNA transcrita, apenas 1.158 nucleotdeos
so responsveis pelos 386 aminocidos da protena. Em suma, a parte do mensageiro que realmente
traduzida em protena quase sete vezes menor que a seqncia do gene no DNA76.
Provavelmente, o mais famoso e citado exemplo de processamento alternativo aquele que tem
implicaes na determinao das caractersticas sexuais na mosca-de-frutas Drosophila melanogaster77.
O produto do processamento diferencial do gene sxl dispara vias alternativas de genes em cascatas
(Figura 2). Um efeito de cascata um processo que ocorre quando os genes esto ligados de tal modo
que a ativao ou desativao de um acarreta na ativao ou desativao do outro, que, por sua vez,
tem efeito no gene seguinte. Os diferentes genes disparados pelo produto diferencial do gene sxl resultam
no estabelecimento das caractersticas sexuais femininas ou masculinas78. Desse modo, a determinao
sexual em drosfilas controlada pela regulao do processamento do mensageiro de RNA79.
71
Figura 2: Processamento alternativo: A molcula de RNA precursora pode dar origem a RNAs mensageiros com
estruturas alternativas. A mosca-de-frutas Drosophila melanogaster um exemplo em que o processamento alternativo
tem conseqncias dramticas para o seu desenvolvimento. Note que a seleo dos exons d origem a protenas com
seqncias ligeiramente diferentes. Todavia, esta pequena diferena tem profundos comprometimentos para o organismo.
Nesse caso, o processamento alternativo define a funcionalidade da protena Sxl. Esta protena regula uma cascata de
eventos que determina o sexo desses organismos. Note que a protena Sxl no contm o exon 2.80.
72
No exemplo anterior, observamos a gerao de apenas duas emendas alternativas a partir de um

mesmo mensageiro, ou um mesmo gene. Mas quantas formas alternativas podem ser geradas a partir
de uma nica regio de transcrio, a partir de um nico gene? Esto sendo descobertos diversos
genes que so responsveis no por apenas duas ou trs emendas alternativas, mas por centenas e
talvez at milhares de diferentes RNAs mensageiros.
At o momento, talvez o exemplo mais notvel de gerao de diversidade atravs do processamento
alternativo est relacionado com o gene Dscam. O Drosophila Dscam o equivalente em Drosfilas
(homlogo) ao gene humano Dscam (Down syndrome cell adhesion molecule)81. Um dos eventos mais
complexos durante o desenvolvimento a migrao e a conexo entre os neurnios. Esse processo
necessita de um sistema preciso para que o axnio o prolongamento ou opescoodo corpo de uma
clula neuronal, por onde conduzido o impulso nervoso em desenvolvimento se dirija corretamente
ao seu alvo. As molculas de adeso celular so uma espcie de protenas-guias. Elas so necessrias
para que os neurnios encontrem seus alvos durante a formao do crebro82.
O processamento alternativo no RNA mensageiro do gene Drosophila Dscam pode, potencialmente,
gerar 38.016 protenas alternativas83. possvel que essa diversidade molecular contribua para a
especificidade da conectividade dos neurnios. A estrutura do gene Dscam parece fornecer uma base
molecular para o reconhecimento celular e, assim como a de outras protenas relacionadas com o
reconhecimento e formao das conexes nervosas, essa estrutura parecida com a das imunoglobulinas,
as protenas altamente variveis do sistema imune84.
O processamento alternativo parece ter uma notvel importncia em organismos mais complexos.
Os dados indicam que o processamento alternativo parece aumentar em razo da maior complexidade
dos organismos. Nos organismos multicelulares mais complexos, a informao precisa ser processada
diferentemente em distintas situaes ou em situaes em que requerido um alto nvel de diversidade,
como em sistemas de reconhecimento e sinalizao celular85. O nmero de genes no necessariamente
uma medida confivel da complexidade dos organismos, mas sim o modo como eles so combinados.
O processamento alternativo permite que vrios tipos de tecido possam trabalhar com um nmero
limitado de genes, pois a informao armazenada nos genes de organismos complexos pode ser editada
de vrias formas.
Assim, quando se pesa a importncia da descoberta dos genes interrompidos e de alguns outros
processos moleculares, surgem vises conflitantes sobre a que se refere o termo gene. A seguir,
apresentaremos, sucintamente, o que acreditamos serem os dois plos desses conflitos a respeito da
definio do gene. De acordo com Evelyn Fox Keller86, professora de histria e filosofia da cincia no
Massachusetts Institute of Technology (MIT) e Ph.D. em fsica, os genes tiveram uma vida gloriosa no sculo XX, mas o gene, como um conceito explicativo central para a biologia, uma entidade do sculo passado, que dificilmente se sustentar no sculo XXI. Por outro lado, para o geneticista Raphael Falk87, do
Departamento de Gentica, da Hebrew University of Jerusalem, Israel, a flexibilidade desse conceito um
componente essencial para que ele acomode todo o recente desenvolvimento da pesquisa experimental.
Para acompanhar esse debate, estaremos armados, entre outros trabalhos, de uma minuta que
antecedeu um workshop sobre o conceito de gene realizado no ano de 2003, na Universidade de
Pittsburgh. O encontro foi inteiramente voltado para a discusso dos problemas relativos ao conceito
de gene. A minuta pode ser encontrada no seguinte endereo eletrnico: http://www.pitt.edu/~kstotz/
genes/minutes.html88. Aps a realizao desse workshop em 2003, parece ter se organizado formalmente,
um grupo de pesquisa sobre o tema. Assim sendo, no ano de 2005 se realizou outro workshop, com a
produo de alguns artigos importantes para o tema em pauta. Em um ensaio que pretendemos publicar
mais adiante, apresentaremos com mais detalhes os trabalhos oriundos desses workshops.
O livro de Keller, The century of the gene, teve repercusso tanto negativa quanto positiva no meio
acadmico, porm , sobretudo, um trabalho de popularizao cientfica. O artigo de Raphael Falk89,
What is a gene?, segundo a minuta do workshop (VARIOUS) anteriormente referido (http://
www.pitt.edu/~kstotz/genes/minutes.html)90, tambm o mais antigo dentre os estudados por esses
pesquisadores, que consideram que apesar da data de publicao, tal trabalho ainda pode ser lido
como o estado da arte, ou seja, se mantm a par do nvel de desenvolvimento atual das pesquisas
biolgicas. Embora Keller enfatize o Projeto Genoma Humano como centro de sua discusso, a autora
parece discutir as mesmas questes colocadas por Falk. Apesar disso, esses dois autores chegam a
concluses bastante distintas.
Discusso: revoluo kuhniana ou progresso lakatosiana?

Em The century of the gene, Evelyn Fox Keller afirma categoricamente que o conceito de gene
molecular est se tornando um obstculo para a compreenso dos fenmenos biolgicos e evolutivos.
Para Keller, o responsvel por desencadear tal crise teria sido o Projeto Genoma Humano. Keller defende
a tese de que o gene isoladamente no pode ser o nico responsvel por funes biolgicas, tais como
a constncia da herana (a passagem das caractersticas ao longo das geraes), a variabilidade necessria
ao processo evolutivo e a conduo dos processos do desenvolvimento e do metabolismo. Segundo
ela, no se deve esquecer a importncia da clula como um todo para a determinao de sua prpria
atividade. Para a autora, um dos principais sinais dessa dificuldade reside no fato de que j no to
fcil definir e localizar um gene, na medida em que as seqncias do DNA sofrem diversos
processamentos que acarretam a divergncia do produto gnico final.
Keller argumenta que existem lacunas entre a informao gentica contida nas seqncias de
DNA e o seu significado biolgico. Para suprir essas fendas, haveria a necessidade da introduo de
um novo paradigma que conduzisse as pesquisas genticas, na medida em que o dogma DNA-RNAPROTENAS no seria mais suficiente para suportar uma explicao satisfatria. Nesse sentido, os
genes, a molcula de DNA, devem ser entendidos apenas como parte da explicao e no a prpria
explicao para os fenmenos biolgicos. Nas palavras de Keller: [...] o gene no pode mais estar
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74
acima e afastado dos processos que especificam a organizao celular e intercelular. Esse gene , ele
prprio, parte e parcela de processos definidos e criados pela ao de um sistema complexo, dinmico
e auto-regulatrio no qual, e para qual, o DNA herdado fornece a matria prima crucial e absolutamente
indispensvel, mas no mais que isso90.
Comeando pela ltima frase da citao: em termos lgicos, alguma coisa no pode ser ao mesmo
tempo matria-prima crucial e indispensvel e ser diminuda retoricamente pela expresso mas no
mais que isso91. Qual o significado dessa contradio? A nosso ver, trata-se da reedio das tentativas
de Lewontin92, Gould93 e outros autores de destruir uma viso de evoluo centrada no gene, mais conhecida como teoria do gene egosta, sobretudo quando se trata de compreender o comportamento humano.
Assim, segundo Keller, haveria uma revoluo kuhniana em curso na biologia: a necessidade de
mudar o paradigma atual, centrado nos genes, e promover transformaes no modelo que guia as
pesquisas cientficas. Odogma central da biologia molecularse encontraria abalado por uma avalanche
e um acmulo de novos dados genticos e moleculares que se mostram desarticulados. Em vez de
genes, a ateno deve agora ser deslocada para a interao entre os vrios componentes da clula. Isto
porque se observa que a suposta estabilidade da molcula de DNA muito mais complexa do que se
supunha. A estratgia de Keller parece sempre ser uma comparao entre o que se sabe hoje e as
expectativas anteriores: a evidente distncia crescente entre as suposies iniciais da dcada de 1960 e
os dados efetivos que novas ferramentas moleculares permitem obter.
Hoje, a estabilidade da molcula de DNA percebida no como algo intrnseco, mas como parte
de um processo dinmico celular muito mais complexo. O pareamento especfico das bases, por si s,
no garante que a replicao ocorra de modo eficiente, sem erros. A fidelidade da replicao depende
da ao das polimerases e de outras enzimas (sistema de reparo do DNA) que conferem e consertam
os erros de pareamento dos nucleotdeos. Para a estabilidade da molcula de DNA durante a replicao
e transcrio, necessrio um sofisticado sistema enzimtico, uma maquinaria celular muito especfica,
de reparo e reviso, que diminui drasticamente a possibilidade de erros tanto na replicao quanto na
transcrio. Naturalmente, entretanto, tal sistema enzimtico est codificado nos genes, assim como
outras estruturas celulares que garantem certa estabilidade do prprio DNA.
Alm disso, para Keller, com a descoberta dos genes interrompidos, uma pedra ainda maior foi
atirada nas engrenagens do conceito de gene94. Para que o evento de montagem dos RNAs mensageiros
ocorra de forma precisa, necessrio um complexo dispositivo de processamento constitudo de
protenas e outros RNAs95. As leituras variveis de um mesmo transcrito (processamento alternativo)
so necessariamente frutos de uma cuidadosa regulao que depende do tipo de clula em que ocorre
e em que estado ambiental se encontra. Se diferentes protenas podem ser geradas, quais dos diferentes
transcritos correspondem ao que deveramos chamar de gene, questiona Keller? A autora entende
que, se o termogenepretende se referir ao trecho original de DNA, isso equivale a abandonar a noo
de que um gene faz uma protena, pois, nesse sentido, um gene gera transcritos que podem gerar
muitas protenas. Isso significaria que o gene, alm de perder o seu poder de especificidade, tambm
perderia o seu poder de agncia, pois a prerrogativa de escolher que protenas devem ser feitas e sob
quais circunstncias no mais residiria no gene, e sim na complexa dinmica reguladora da prpria
clula como um todo.
Outra, no entanto, a abordagem de Raphael Falk, geneticista e professor emrito da Universidade Hebraica de Jerusalm, em Israel. A linha de pesquisa atual de Falk abrange a histria e a filosofia da biologia, especialmente no que tange o significado dos conceitos em gentica. Falk argumenta
que h pelo menos dezenove anos os genes estodesorientados96. Essa uma traduo nossa para o
termothe bewildering geneutilizado por Falk (outras tradues possveis so: desconcertante, desorientado, confuso, perplexo). Assim como Ridley, em 2003, mas dezessete anos antes, Falk listou sete
situaes histricas envolvendo controvrsias acerca da definio de gene. Segundo a cronologia de
Falk, antes dosbewildering genesvieram osDNA genes(genes de DNA): o gene de Watson e Crick,
ou o gene molecular clssico. A desorientao comearia em 1968, portanto, no mesmo ano em que
Gunther Stent afirmava que o trabalho restante era o depolir os detalhes: com a descoberta de Britten e Kohne97 de que seqncias repetitivas do DNA, e portanto seqncias no codificantes de protenas,
poderiam estar envolvidas na regulao dos genes. Entre uma srie de outros achados, a descoberta,
em 1977, dos ntrons culminaria o processo de desorientao dos genes nesse perodo.
Durante todo o trabalho, Falk relaciona inmeras dicotomias, como construtos hipotticos (conceitos hipotticos)/variveis intervenientes (conceitos abstratos), reducionismo/holismo, contextualizado/descontextualizado, gene molecular/gene evolutivo, gentipo/fentipo, entre outros (http://
www.pitt.edu/~kstotz/genes/minutes.html). Para responder perguntao que um gene?, acreditamos
que a questo crucial a distino entre gentipo e fentipo. A distino entre gentipo e fentipo,
equivale ao primeiro significado de gene de Ridley98, mencionado no incio da introduo desse trabalho:
o gene como um arquivo hereditrio mendeliano para um determinado trao fsico ou comportamental.
O termo gene, criado por Johanssen em 190999, pretendia distinguir o que visvel no organismo (o
carter, o fentipo) e a entidade na clula que produz o carter (o gene, o gentipo). Desde ento,
como sabemos, o trabalho da gentica tem sido tentar unir o que falta entre o gene e as caractersticas
hereditrias, entre um elemento que existiria no interior das clulas e sua expresso em termos de traos fsicos, como a cor da pele, a dureza das garras, o nmero dedos etc. At os dias de hoje, essa questo ainda no foi completamente resolvida. Para alguns autores, como Keller, h uma brecha entre o
gene e o trao. A nosso ver, entre o gentipo (o conjunto de todos os genes) e o fentipo como um todo, h um verdadeiro abismo, apesar de todos os progressos das cincias que estudam o desenvolvimento, a embriologia.
O que se segue, ento, um verdadeiro conflito, como Keller argumentou, entre a estrutura
especfica do gene e sua funo. A tentativa de conciliao entre a estrutura do gene e sua funo tem
levado a desdobramentos sucessivos na histria da gentica. Falk chamou essa situao de processo
das bonecas russas, numa analogia com o tradicional brinquedo em que uma boneca se encaixa
dentro da outra. Abrindo uma, encontra-se outra que, por sua vez, possui uma outra dentro e, assim
sucessivamente. Tentativas de descobrir a funo do gene tm levado a uma anlise mais profunda de
sua estrutura, que, por sua vez, leva a uma anlise mais atenta de sua funo e assim sucessivamente.
No devemos esquecer que Mendel reduziu ao mnimo sua especulao sobre a natureza do
material gentico100. Do mesmo modo, Johannsen no se preocupou em especular qual seria a base
material do gene. Pelo contrrio, como j mencionamos, seu receio era que recasse sobre o seu conceito
de gene algum tipo de pensamento pr-formacionista101. O gene inicia sua vida como o que Falk
denominou de uma varivel interveniente, um conceito abstrato. Segundo o autor, no importava
sua estrutura fsica, e sim que o conceito respondesse aos dados formulados pela teoria mendeliana de
hereditariedade (funo).
As pesquisas caminharam para elucidar que estrutura da clula poderia responder pela transmisso
das caractersticas hereditrias. A resposta para essa pergunta veio com o desenvolvimento da teoria
cromossmica da hereditariedade, segundo a qual, os genes estariam arranjados linearmente nos
cromossomos (estrutura)102. Note que, de certa forma, parece haver uma contradio aqui. Para Morgan,
o desenvolvimento da teoria cromossmica da herana no precisava especificar em que consiste
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materialmente o gene. No entanto a histria da gentica, em sua quase insondvel complexidade,

apresenta vrios caminhos que se entrelaam. Apenas estamos traando um desenvolvimento
simultneo e paralelo s pesquisas de Morgan. Esse desenvolvimento levou necessidade de perguntar,
novamente, qual a funo dos genes como estruturas alinhadas nos cromossomos. Em 1940, veio a
resposta com Beadle e Tatum. O gene responde pela especificao de uma protena no metabolismo da
clula (funo).
Mas que estrutura seria responsvel por armazenar a informao hereditria das protenas de
nossos organismos e as de incontveis outras espcies de seres vivos? A descoberta da estrutura do
DNA, em 1953, levou a um aprofundamento das pesquisas sobre a organizao do material gentico
nos nveis fsicos e qumicos. Verificou-se, ento, que uma simples seqncia do DNA no responde
pela codificao, pura e simplesmente, de protenas. A funo do gene em regular a atividade biolgica dependente de um sistema bem mais complexo e dinmico que as seqncias de DNA no
poderiam por si s exercer103. Logo, novamente essa estrutura no responsvel por todas suas funes.
Segundo Keller, a chave do processo a funo do gene deveria ser procurada em outro lugar, no
apenas no DNA.
Para Keller, os problemas para se conceituar o gene vm da dificuldade em conciliar sob uma
mesma entidade a responsabilidade pela estrutura e funo dos genes. Dada a funo do gene, no
podemos antever imediatamente sua estrutura. Ao mesmo tempo, a seqncia do DNA no suficiente
para responder por qual funo ela responsvel. Enquanto Keller v nisso um empecilho para o gene
como um conceito explicativo, Falk tem uma viso oposta. Para Falk, o gene estaria apenas voltando s
suas origens: o gene mendeliano. O gene nada mais que um conceito instrumental/operacional para
os bilogos. A reside sua importncia, pois ele til para a organizao dos dados fornecidos pela
pesquisas genticas. Ontologicamente o gene talvez no possa ser conhecido nunca, como tantos
outros objetos, mas epistemologicamente ele tem um valor inestimvel. O que liga os gentipos aos
fentipos a teoria gentica e no uma garantida materialidade dos genes.
A parece residir o poder do gene de Watson e Crick, o gene molecular clssico. Pela primeira
vez pareceu possvel conciliar a estrutura do gene com uma funo inequvoca. Desde ento, uma
espcie de zelo toma conta desse conceito. Gostaramos de deixar claro que esta uma opinio nossa
e no de Falk. Contudo, segundo a minuta anteriormente citada, outro trabalho de Falk, publicado em
2000, descreve a tenso fundamental entre duas diferentes perspectivas de gene: a biolgica e a
molecular. O gene como uma entidade que corresponde a um certo trao fsico ou comportamental,
codificado em uma ou vrias seqncias de DNA, uma funo que esteja entalhada nas seqncias de
DNA (biolgica) e o gene que automaticamente e universalmente identificado como uma seqncia
particular de DNA, molecular104. Falk v de forma otimista e positiva as tenses que existem entre os
diferentes conceitos de gene, porque embora elas sejam aparentemente incomensurveis, a comunicao
entre diferentes reas das cincias biolgicas pode ser possvel. Permanece, assim, a possibilidade de
se estabelecer essa ponte entre o epistemolgico e o ontolgico. A existncia de diferentes conceitos
no um problema, sendo mesmo desejvel. Para Falk, o conceito de gene evoluiu, principalmente, em
dois nveis tericos: um baseado numa entidade reducionista experimental, sendo o gene mendeliano
o exemplo clssico, e o outro um modelo realista em que os genes se baseiam numa entidade fsica,
como na estrutura fsico-qumica da molcula de DNA. Ao examinar as causas e conseqncias da
evoluo do conceito de gene, Falk conjectura que, com base no atual desenvolvimento da gentica
molecular, o gene nada mais do que um dispositivo intelectual bastante valioso na organizao de
dados. Nesse sentido, a resposta para o que um gene? parece que teria sido encontrada em 1912.
How far may we carry this conceptual notation? My answer is: just as far as the notation interprets the facts
of breeding and is helpful105. Contudo esses diferentes modos de interpretar os mesmos dados no
parecem ser uma novidade na histria do conceito de gene. Segundo Falk,every experimental observation
which was presented as evidence for the existence of genes, whether as hypothetical constructs or particulate
material entities, was interpreted differently, and sometimes even more elegantly106.
Dessa forma, para os historiadores da biologia moderna, o conceito de gene nunca foi nem unvoco,
nem estvel. Contudo, para Keller, as dificuldades do passado sempre puderam ser contidas,o que
diferente hoje que o progresso na biologia molecular tornou possvel a quebra desse silncio histrico107. Mas como a biologia molecular quebrou esse silncio histrico? Que silncio histrico
esse? Qual distino fundamental que faz com que as dificuldades do passado possam ser contidas e
as de hoje no? Isso Keller no explica.
Para Keller, o conceito de gene seria um conceito em risco, beira de um colapso. A confiana da
realidade fsica do gene sempre foi acompanhada pela suposio de que sua composio material
(estrutura) e sua funo eram todas propriedades de um nico e mesmo fenmeno as seqncias de
bases no DNA responsveis pela codificao de uma protena. Hoje, contudo, essa auto-identidade se
encontraria desfeita. Ser que Keller queria dizer com isso que as seqncias de base no DNA no
codificam mais protenas em hiptese alguma? Para Keller, a funo do gene no poderia mais ser
compreendida pela sua estrutura. Sua existncia transitria, contingente, dependendo crucialmente
da dinmica funcional do organismo inteiro. Nesse sentido, Keller estaria vendo uma revoluo kuhniana
na gentica. Por outro lado, Falk v outra coisa:
Nas ltimas dcadas [1986], os desdobramentos das pesquisas genticas tem sido perturbadores. Muitos deles
parecem absolutamente estranhos ou mesmo contraditrios para a estrutura conceitual conceptual da teoria
gentica, mas que no parece super-la. O conceito de gene [...] pode ser considerado como parte do ncleo duro
de um programa de pesquisa gentica em termos lakatosianos ou como parte integral do paradigma gentico em
termos kuhnianos. O confronto entre diferentes perspectivas dentro da teoria gentica fornece a flexibilidade que
tem sido essencial para a acomodao dos desenvolvimentos estimulantes e explosivos na pesquisa experimental108.
Alguns historiadores e cientistas tm perguntado se existiriam, nas cincias biolgicas, revolues

cientficas nos termos propostos por Kuhn109. A revoluo darwiniana com a publicao, em 1859, de A
origem das espcies; a revoluo mendeliana de 1900 com a redescoberta de seus trabalhos; e a revoluo
na biologia molecular com a descoberta da estrutura fsico-qumica da molcula de DNA, em 1953,
so os trs exemplos imediatos. Contudo, segundo Wilkins110, nenhum dos trs parece encaixar-se
perfeitamente no modelo de Kuhn.
Em 1953, a descoberta da estrutura da molcula de DNA seria um caso de revoluo kuhniana
devido ao seu efeito e sua receptividade dentro da comunidade cientfica. Rapidamente, e de forma
universal, ocorreu uma aceitao geral de que o modelo de Watson e Crick poderia explicar o que era o
gene111. No entanto, at ento no havia idias claras sobre a estrutura do gene e de seu modo de ao.
E porque no havia modelo paradigmtico prvio a ser destitudo, no teria havido uma disputa entre
cientistas proeminentes de algum velho paradigma lutando contra a instituio do novo. Dessa forma,
como no teria ocorrido nenhuma transio entre um velho e um novo paradigma, isso descaracterizaria
a descoberta da estrutura do DNA como uma fase revolucionria da cincia.
Para Robert Olby112, o modelo de Watson e Crick de fato transformou conceitualmente o
pensamento sobre a transferncia da informao gentica. Segundo Olby, a estrutura do DNA proposta
por Watson e Crick, em 1953, pode ser legitimamente considerada como um momento de crise, de
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revoluo paradigmtica, pois substitui as idias prvias dos bioqumicos e dos virologistas de que as
protenas eram no somente as molculas responsveis pela catlise das reaes qumicas nas clulas,
como tambm a prpria substncia da hereditariedade. A indicao das protenas como a substncia
responsvel pela transmisso das caractersticas hereditrias foi arduamente defendida como legtima
representante do paradigma prvio113.
Todavia Wilkins114 considera que revolues biolgicas certamente tambm ocorreram nas cincias
biolgicas, mas devido s caractersticas diferentes entre as cincias fsicas e as biolgicas, as revolues
ocorridas nessas ltimas no poderiam se ajustar perfeitamente nos termos propostos por Kuhn.
Segundo Richard Strohman115, como paradigma da biologia molecular, odogma DNA protena,
ou teoria do gene, promete o diagnstico molecular e terapia para toda e qualquer manifestao
biolgica: desde o problema do nascimento prematuro at a cura de doenas genticas que levam
morte nas idades mais diversas e das mais diversas formas. Em razo dessas promessas exageradas, os
programas de investigao da biologia molecular captariam, segundo Strohman, os maiores fundos de
pesquisas dentro das cincias da vida. Porm, como a biologia molecular est mais preocupada em
produzir substncias moleculares de importncia econmica, ela se descura de uma compreenso
mais epistemolgica da vida116. Nesse sentido, Strohman acredita que os bilogos moleculares precisam
redescobrir a profunda complexidade da relao gentipo/fentipo. O paradigma atual, o dogma
central, incapaz de equacionar essa situao porque algo est faltando.
Para Strohman, todos os aspectos de praxe do paradigma kuhniano, desde sua ascenso sua
queda, esto presentes no paradigma atual (DNA protena): 1) criado um consenso no qual a cincia normal fornece explicaes para os mecanismos genticos moleculares da vida; 2) ocorre uma
mudana na percepo do mundo das espcies e dos organismos, que passam a ser entendidos como
mquinas genticas, ou seja, uma nfase maior sobre mecanismos 3) h um rpido recrutamento de
novos cientistas para a articulao do novo paradigma; 4) so desenvolvidas novas tecnologias e nessas
tecnologias so treinadas as novas geraes de cientistas e, por ltimo; 5) com o prosseguimento inexorvel da cincia normal, surgem anomalias com uma freqncia cada vez maior, que expem as
fraquezas do paradigma vigente. Dessa forma, o paradigma original cai e substitudo por um novo.
Contudo, como o prprio Strohman afirma, o mais importante atributo das revolues cientficas est
ausente, j que parece ainda no haver um novo paradigma pronto que substitua o velho, a saber, o
dogma DNA protenas.
Ainda de acordo com Strohman, o paradigma cientfico atual omite em grande medida os sistemas
dinmicos:There is a growing recognition that information for function may be not located solely in genomic
databases. That is, it is becoming clear that sequence information in DNA, by itself, contains insufficient
information for determining how gene products (proteins) interact to produce a mechanism of any kind117.
Mesmo que ainda no haja um novo paradigma, todos os indicadores apontariam para a queda do
paradigma atual, numa espcie de revoluo incipiente. Nesse sentido, os danos sofridos pelo velho
modelo, em algum momento, no podero mais ser cientificamente corroborados118.
De forma oposta a essa viso, o presente momento parece reunir todos os atributos de uma fase
progressiva em um programa de pesquisa lakatosiano. O bilogo evolutivo Maynard-Smith afirmou
que:The dogma is perhaps the only statement in biology that is at the same time general, important, and so
far as we know true119. Se tomarmos como referncia a afirmao de Maynard-Smith, parece que
podemos considerar o dogma central como o ncleo lakatosiano da biologia molecular.
Para tentar resolver as anomalias, as inadequaes entre as previses tericas e as observaes
dos experimentos, modificam-se as hipteses auxiliares (o cinto de proteo, que protege o ncleo
contra refutaes). No entanto, se houver mudanas no ncleo, estaremos, automaticamente, diante

de um novo programa de pesquisa, com um outro conjunto de teorias, previses e de testes120. Mas no
parece ser esse o caso, pois a biologia molecular parece continuar se desenvolvendo sem a maioria das
aflies que afetam alguns historiadores e filsofos da biologia, como Keller e Strohman.
Consideraes finais
Em agosto de 1926, o botnico da Universidade de Harvard, E. M. East, apresentou no International
Congress of Plant Sciences, em Nova Iorque, o trabalho intituladoThe concept of the gene. East121 acreditava
que os genes eram apenas uma notao til para os experimentos de cruzamentos de animais e plantas,
sem realidade biolgica. O gene era meramente um termo descritivo.The argument was an elaboration
of the proposition that the germ-cell unit of heredity, the gene, was an abstract, formless, characterless concept
used for convenience in describing the results of breeding experiments. It was the ghost of an entity which
might later be clothed with flesh, but its usefulness at the time was due to its adaptability to mathematical
treatment122. Seu principal adversrio era o geneticista W.E. Castle. Para Castle,before this theory could
be accepted unreservedly, it has seemed desirable to know whether all observed inheritance phenomena can
be expressed satisfactorily in terms of genes, which are supposed to be to heredity what atoms are to chemistry,
the ultimate, indivisible units, which constitute gametes much as atoms in combination constitute
compounds123.
Por essa perspectiva histrica que remete dcada de 1920, o conceito de gene nunca foi desprovido
de controvrsias. O debate atual parece envolver duas situaes:
1) A acumulao de uma srie de dados a respeito do funcionamento e organizao molecular
dos genes, que no mais se encaixam nos parmetros anteriormente aceitos para a definio de gene
do incio dos anos 1960. De acordo com Gelbart124, essa definio que, fundamentalmente, ainda
hoje utilizada e que deve ser modificada para acompanhar a viso atual do genoma. O acmulo no
crtico de novos dados moleculares parece expandir os limites do conceito de gene para alm da noo
de gene implicitamente aceita, ou seja, a noo que indica o gene como segmentos de DNA especficos
nos cromossomos responsveis pela codificao de uma protena. Novos dados moleculares, proporcionados por novas tcnicas de investigao molecular, afetam o entendimento do que um gene
nos termos do gene molecular clssico.
2) O conceito de gene apropriado com diferentes significados, em diferentes reas da biologia,
o que aumenta a confuso em torno de seu significado. Para alguns autores, isto no representa um
problema, e sim algo mesmo desejvel125. No entanto, necessrio que esses conceitos sejam claramente
distinguidos e usados dentro de suas respectivas reas126, sendo isto desejvel para que seja permitida
a avaliao crtica dos resultados e observaes experimentais, e somente depois, finalmente, tentar-se
uma sntese entre os conceitos diferentes de gene127.
Aproximadamente a metade da vida do complexo de idias que atende pelo nome de gene
transcorreu sem que se identificasse a base material de sua existncia, quer dizer, a estrutura fsicoqumica do DNA. A descoberta dessa estrutura concedeu ao gene sua materialidade e a idia de que a
gentica parecia ter resolvido quase todos os seus problemas. O conceito degene molecular clssico,
que se estabeleceu durante esse perodo, tornou-se um dos conceitos mais influentes da histria da
gentica. A descoberta dos ntrons, em 1977, um dos processos que contribuem para que no se
79
80
possa aceitar mais esse conceito de uma forma irrestrita. A chave de alguns princpios biolgicos verdadeiramente fundamentais pode estar na resoluo de como os genes so montados pelo processamento do RNA e de como as diversas espcies de RNAs se comportam na clula.
Como alguns autores postulam128, essas novas descobertas moleculares estariam demolindo o
paradigma da biologia molecular contempornea, o seudogma central, e, inevitavelmente, o prprio
conceito de gene. Para esses autores, a imensa quantidade de trabalho em correlacionar a seqncia de
DNA primria com funo gentica essencial para compreender o fluxo de dados produzido pelos
projetos de seqenciamento do material gentico de organismos. Somente um novo paradigma poderia
resolver essa situao. Contudo um dos principais atributos para uma revoluo kuhniana parece ainda
no existir, a saber, um novo paradigma que substitua o antigo129. Nesse sentido, perguntamos, no
seria o prprio projeto proteoma a resoluo para esse problema?
A nosso ver, os ntrons no podem ser vistos como um dos elementos provocadores de uma
mudana paradigmtica. A descoberta dos ntrons seria mais um dos diversos elementos importantes
surgidos recentemente que servem como uma espcie de aviso de que os genomas eucariticos so
bem mais complexos. Baleias e rinocerontes no so Escherichia coli. A descoberta dos ntrons, uma
das conseqncias da revoluo do DNA recombinante, parece representar um marco dessa passagem
de organismos menos complexos para organismos notadamente mais complexos.
No centro dessa discusso est o conceito de gene. Jacob130 afirma que os conceitos tm a funo
de servir como operadores para o estudo do mundo vivo, e, dessa forma, a importncia de um conceito
se mede pelo seu valor operatrio, pelo papel que desempenha dirigindo a observao e a experincia.
Ao mesmo tempo em que se discute a materialidade dos genes, ou at mesmo a sua existncia,
parece no mnimo paradoxal que a insero de genes em organismos de laboratrios nos fornea
provas suficientes de que eles de fato existem. Podemos no conhecer em detalhes sua estrutura e seu
funcionamento, mas a insero de um gene e a conseqente produo de uma protena associada a ele
em um construto biolgico parecem confirmar o gene ontologicamente.
O conceito de gene parece ter evoludo, principalmente, em dois nveis tericos, como uma entidade
reducionista instrumental e como uma entidade material. Esses dois conceitos podem at competir
entre si, mas no so necessariamente incomensurveis. A evoluo do conceito de gene pode refletir
um conflito entre diferentes interpretaes dos resultados experimentais. Esse confronto levaria ao
modelo de desdobramentos (bonecas russas) assinalado por Falk.
Hoje, o gene no mais a unidade material ou unidade instrumental de herana, mas uma unidade,
um segmento que corresponde a uma unidade de funo, definido de acordo com as necessidades
experimentais. No contnuo, pois existem os ntrons; no tem uma localizao fixa, pois existem
transposons; no tem uma funo definida, pois existem os pseudogenes; e nem mesmo possui
seqncias precisas, devido ao processamento alternativo. O gene se assemelha situao dos eltrons,
como um termotrans-terico, ou seja, um conceito que se comporta de maneira distinta em diferentes
teorias. E, embora o sonho de uma unificao continue, mais importante ainda o prprio processo
aberto de debate e conflito, que permite pensar no avano do nosso conhecimento acerca dessas
entidades que so os genes, e as teorias que se estruturam para explic-las e integr-las no complexo
fenmeno da vida e de sua evoluo.
NOTAS E REFERNCIAS BIBLIOGRFICAS

Ricardo Waizbort pesquisador associado do Departamento de Pesquisa do Programa
de Ps-graduao em Histria das Cincias da Sade da Casa de Oswaldo Cruz FIOCRUZ
e-mail: ricardowaizbort@yahoo.com.br
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herana. Traduo de: The growth of biological thought. Braslia, DF: Editora
Universidade de Braslia, 1998. FALK, Raphael. What is a gene?. Studies in history
and philosophy of science. vol. 17, n 2, p. 133-173, 1986.
2 EYCK, Toby A.; WILLIMENT, Melissa. The national media and things genetic: Coverage
in the New York Times (1971-2001) and the Washington Post (1977-2001). Science
communication, vol. 25, p. 129-152, 2003. EPP, Christopher D. Definition of a gene.
Nature, vol. 389, p. 537, 1997. RIDLEY, Matt. Nature via Nurture: Genes, experience,
and what makes us human. New York: HarperCollins Publishers Inc., 2003.
3 KEMP, Martin. The Mona Lisa of modern science. Science, vol. 421, p. 416-420, 2003.
4 GRIFFITHS, Paul E.; NEUMANN-HELD, Eva M. The many faces of the gene. BioScience,
vol. 49, p. 656-662, 1999.
5 RIDLEY, Matt. op. cit.
6 KELLER, Evelyn Fox. The century of the gene. Cambridge, Massachusetts, and London:
Harvard University Press, 2000. MAYR, Ernst. op. cit. FALK. Raphael. op. cit. EAST, E.
M. The concept of the gene. In: Proceedings of the International Congress of Plant
Sciences, Ithaca New York, August 16-23, 1926, vol. 1 Menasha, WI: George Banta
Publishing Co. 1929, p. 889895.
7 GRIFFITHS, Paul E. Lost: One gene concept. Reward to finder. Biology and philosophy,
vol. 17, p. 271-283, 2002. GRIFFITHS, Paul E.; NEUMANN-HELD, Eva M. op. cit.
FALK, Raphael. op. cit.
14 KUHN, Thomas S. A estrutura das revolues cientficas. Traduo de: The structure
of scientic revolutions. 7 edio, So Paulo: Editora Perspectiva, 1994.
15 STENT, Gunther S. That was the molecular biology that was. Science, vol. 160, p.
390-395, 1968.
16 OLBY, Robert. The protein version of the central dogma: A crisis for biologists. Genetics,
vol. 79, p. 3-14, 1975.
17 Ibid.
18 GRIFFITHS, Paul E. op. cit.
19 OSAWA, Syozo; JUKES, Thomas H.; WATANABE, Kimitsuna; MUTO, Akira. Recent
evidence for evolution of the genetic code. Microbiological Reviews, vol. 56, p. 229264, 1992. BERG, Paul.; BALTIMORE, D.; BOYER, H.W.; COHEN, S.N.; DAVIS, R.W.;
HOGNESS, D.S.; NATHANS, D.; ROBLIN, R.; WATSON, J.D.; WEISSMAN, S.; ZINDER,
N.D. Potentials biohazards of recombinant DNA molecules. [Letter] Science, vol. 185,
p. 303, 1974.
20 CHAMBON, Pierre. op. cit.
21 O vitalismo foi uma doutrina formulada entre meados do sculo XVIII e meados do
sculo XIX. Defendia que fenmenos referentes aos seres vivos seriam controlados
por uma fora exterior alheia ao domnio das leis fsico-qumicas. Desse modo, o
vitalismo se opunha s idias mecanicistas e cartesianas.
22 JACOB, Franois. A lgica da vida: umahistria da hereditariedade. Traduo de: La
logique du vivant. Rio de Janeiro: Edies Graal, 1983.
23 MAYR, Ernst. op. cit.
8 COLLINS, F. Glossary of genetic terms: gene, [Website]. National Human Genome

Research Institute. Disponvel em: http://www.nhgri.nih.gov/DIR/VIP/Glossary. 2001.
24 CRICK, Francis apud STENT, Gunther S. op. cit., p. 390.
9 RIDLEY, Matt. op. cit.
25 JACOB, Franois. op. cit., p. 253.
10 Griffiths, op. cit. Falk, Raphael. op. cit.
26 MAYR, Ernst. op. cit. PAULING, Linus; PAULING, Peter. Chemistry. San Francisco: W.H.
Freeman and Company, 1975. DOTY, Paul. Protenas. In: Artigos da Scientific American.
A base molecular da vida. So Paulo: Polgono, 1971. STENT, Gunther S. op. cit.
11 GLOVER, David M.; HOGNESS, David S. A novel arrangement of the 18s and 28s
sequences in a repeating unit of Drosophila melanogaster rDNA. Cell, vol. 10, p.
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12 LEITE, Marcelo. Hegemonia e crise da noo de gene nos 50 anos do DNA.
Comunicao no 49 Congresso Nacional de Gentica, guas de Lindia, 16 de
Setembro de 2003. KELLER, Evelyn Fox. op. cit. STROHMAN, Richard C. The coming
kuhnian revolution in biology. Nature Biotechnology, vol. 15, p. 194-200, 1997.
13 DOWNES, Stephen M. Alternative splicing, the gene concept, and evolution. History
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development and evolution. Cambridge: Cambridge University Press, 2000.
GRIFFITHS, Paul E.; NEUMANN-HELD, Eva M. op. cit.
27 DOTY, Paul. op. cit.

28 STENT, Gunther S. op. cit.
29 MAYR, Ernst. op. cit. REZNIK, Tnia. O desenvolvimento do conceito de gene e a sua
apropriao nos livros didticos de biologia. Tese, Mestrado em Educao/UFF/Niteri,
1995, 182 p.
31 LWOFF, Andr Michel. Interactions among virus, cell, and organism. 1965. In: Nobel
Lectures, Physiology or medicine 1963-1970. Amsterdan: Elsevier Publishing
Company, 1972. Disponvel em: http://nobelprize.org/medicine/laureates/1965/lwofflecture.html.
32 Ibid.
33 Ibid.
35 Luria foi orientador de James Watson, um dos descobridores da estrutura fsicoqumica do DNA.
81
37 Griffiths, Paul E. op. cit.
DNA in Escherichia coli. Proceedings of the Natural Academy of Sciences USA, vol.
71, p. 1743-1747, 1974.

39 Por suas descobertas em relao ao mecanismo de replicao e estrutura gentica
dos vrus, Delbrck, Hershey e Chase foram laureados com o Nobel em medicina ou
fisiologia de 1969. Cf. www.nobel.se.
40 HERSHEY, A.D.; CHASE, M. Independent functions of viral protein and nucleic acid in
growth of bacteriophage. J. Gen. Physiol, vol. 36, p. 39-56, 1952.
42 WATSON, James Dewey. The double helix: A personal account of the discovery of the
structure of DNA. Touchstone Books, 2001. FRIEDMAN, Meyer; FRIEDLAND, Gerald
D. Maurice Wilkins e o DNA. In: FRIEDMAN, Meyer; FRIEDLAND, Gerald D. As dez
maiores descobertas da medicina. So Paulo: Companhia das Letras, 2000. JUDSON,
HoraceFreeland. The eighth day of creation: Makers of the revolution in biology.
New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1996.
44 JACOB, Franois. Genetics of the bacterial cell. 1965. In: Nobel lectures, physiology
or medicine 1963-1970. Amsterdan: Elsevier Publishing Company, 1972. Disponvel
em: http://nobelprize.org/medicine/laureates/1965/jacob-lecture.html.
82
56 Em 1981 e 1982, foram produzidos os primeiros animais transgnicos: 1) Introduo

de um gene de coelho em camundongos, Cf. COSTANTINI, F.; LACY, E. Introduction
of a rabbit beta-globin gene into the mouse germ line. Nature, vol. 294, p. 92-94,
1981; e 2) Introduo de um gene que conferiu a colorao rsea aos olhos de drosfilas, Cf. RUBIN, G. M.; SPRADLING, A. C. Genetic transformation of Drosophila
with transposable element vector. Science, vol. 218, p. 348-353, 1982.
57 Em 1976, foi fundada a primeira companhia de biotecnologia (engenharia gentica),
a Genentech. Ela tinha a experincia tcnica de Herbert Boyer e o capital privado de
Robert Swanson. Cf. ZWEIGER, Gary. op. cit. WILMUT, Ian; CAMPBELL, Keith; TUDGE,
Colin. Dolly, a segunda criao. Traduo de: The second creation. Rio de Janeiro:
Editora Objetiva, 2000.
58 GLOVER, David M.; HOGNESS, David S. op. cit.
59 CHOW, Louise T. et al. op. cit.
60 BERGET, Susan M.; MOORE, Claire; SHARP, Phillip A. Spliced segments at the 5
terminus of Adenovirus 2 Late mRNA. Proceedings f the Natural Academy of Sciences
USA, vol. 74, p. 3171-3175, 1977.
61 GILBERT, Walter. op. cit.
45 SHAPIRO, James A. Views about evolution are evolving. ASM News. volume 65, p.
201-207, 1999. STRAUSS, Bernard S. Molecular pathologies. Science, vol. 270, p.
1511-1512, 1995.
62 CHOW, Louise T. et al. op. cit.
46 SAMBROOK, J. op. cit. GILBERT, Walter. op. cit.
65 O livro de Mayr (1998) foi originalmente publicado em 1982.
48 O termo genomics (genmica) foi cunhado em 1986 por Thomas Roderick para descrever a disciplina cientfica de mapeamento, seqenciamento e anlise de genomas.
Cf. HIETER, Philip; BOGUSKI, Mark. Functional genomics: Its all how you read it.
Science, vol. 278, p. 601-602, 1997.
49 MESELSON, M.; YUAN, R. DNA restriction enzyme from E. coli. Nature, vol. 217, p.
1110-1114, 1968.
50 SMITH, H. O.; WILCOX, K. W. A restriction enzyme from Hemophilus influezae.
Purification and general properties. Journal of Molecular Biology, vol. 51, p. 379391, 1970.
51 JACKSON, D. A.; Symons R. H.; BERG, P. Biochemical method for inserting new genetic
information into DNA of Simian Virus 40: Circular SV 40 DNA molecules containing
Lambda phage genes and the galactose Operon of Escherichia coli. Proceedings of
the Natural Academy of Sciences USA, vol. 10, p. 2904-2909, 1972.
52 COHEN, S. N.; CHANG, A. C.; BOYER, H. W.; HELLING, R. B. Construction of biologically
functional bacterial plasmids in vitro. Proceedings of the Natural Academy of Sciences
USA, vol. 70, p. 3240-32944, 1973.
53 BERG, Paul. Dissections and reconstructions of genes and chromosomes. 1980. In:
Nobel lectures, chemistry 1971-1980. Singapore: Editor-in-Charge Tore Frngsmyr,
Editor Sture Forsn, World Scientific Publishing Co., 1993. Disponvel em: http://
nobelprize.org/chemistry/laureates/1980/berg-lecture.html.
63 Disponvel em: www.cshl.org/History/history.html.
67 GILBERT, Walter. op. cit.

68 Ibid.
69 CROFT, Larry; SCHANDORFF, Soeren; CLARK, Francis; BURRAGE, Kevin; ARCTANDER,
Peter; MATTICK, John S. ISIS, the intron information system, reveals the high frequency
of alternative splicing in the human genome. Nature genetics, vol. 24, p. 340-341,
2000.
70 BRETT, David; POSPISIL, Heike; VALCREL, Juan; BORK, Peer. Alternative splicing
and genome complexity. Nature genetics, vol. 30, p. 29-30, 2002.
71 MODREK, Barmak; LEE, Christopher. A genomic view of alternative splicing. Nature
genetics, vol. 30, p. 13-19, 2002. GRAVELEY, Brenton R. Alternative splicing: increasing
diversity in the proteomic world. Trends in genetics, vol. 17, p. 100-107, 2001. BRETT,
David. et al. op. cit.
72 MODREK, Barmak; LEE, Christopher. op. cit.
73 Graveley, Brenton R. op. cit.
74 Breathnach, R. et al. op. cit.
54 ZWEIGER, Gary. Human genome history. In: ZWEIGER, Gary. Transducing the genome:
Information, anarchy, and revolution in the biomedical sciences. McGraw-Hill
Companies, 2001.
75 Regio da molcula do RNA mensageiro que especifica os aminocidos na protena.
55 Em 1973, pesquisadores da Stanford e UCFS fundiram um segmento de DNA contendo um gene de r do gnero Xenopus e inseriram em Eschericha coli. O DNA da
r foi replicado e, medida que a bactria se replicava, o gene que dirige a sntese
de uma protena especfica da r foi expresso. Esse foi o primeiro gene animal clonado,
ou seja, isolado e propagado. Cf. MORROW, J. F.; COHEN, S. N.; CHANG, A. C.; BOYER,
H. W.; GOODMAN, H. M.; HELLING, R. B. Replication and transcripition of eukariotic
77 Graveley, Brenton R. op. cit. BAKER, Bruce S. Sex in flies: The splice of life. Nature,
vol. 340, p.521-524, 1989.
78 Baker, Bruce S. op. cit.

79 O determinante principal do sexo em drosfilas a taxa X:A, ou seja, a relao
entre o nmero de cromossomos X e o conjunto de autossomos (A) (cromossomos
no sexuais). Se essa taxa for igual a 1 originam-se as fmeas, se for igual a 0,5,
machos. Por exemplo, moscas com um cromossomo X e dois conjuntos de autossomos
so machos. No se sabe exatamente como essa taxa X:A ativa o gene Sxl, mas
provvel que os fatores de ativao estejam presentes na clula-ovo produzida por
genes maternos e por genes do prprio zigoto. Cf. Baker, Bruce S. op. cit.
80 Baker, Bruce S. op. cit. A figura foi obtida e modificada a partir do endereo eletrnico:
www.nobel.se.
81 SCHMUCKER, Dietmar; CLEMENS, James C.; SHU, Huidy; WORBY, Carolyn A.; XIAO,
Jian; MUDA, Marco; DIXON, Jack E.; ZIPURSKY S. Lawrence. Drosophila Dscam is an
axon guidance receptor exhibiting extraordinary molecular diversity. Cell, vol. 101,
p. 671-684, 2000. O Dscam causa alguns dos sintomas da sndrome de Down por
um mecanismo ainda desconhecido. Cf. Ridley, Matt. op. cit.
82 Ridley, Matt. op. cit. WANG, Xiaozhong; SU, Hong; BRADLEY, Allan. Molecular
mechanisms governing Pcdh-gene expression: Evidence for a multiple promoter and
cis-alternative splicing model. Genes and development, vol. 16, p.1890-1905, 2002.
Schmucker, Dietmar. et al. op. cit. SERAFINI, Tito. Finding a partner in a crowd:
Neuronal diversity and synaptogenesis. Cell, vol. 98, p. 133-136, 1999. WU, Qiang;
MANIATIS, Tom.. A striking organization of a large family of human neural cadherinlike cell adhesion genes. Cell, vol. 97, p. 779-790, 1999.
83 Schmucker, Dietmar. et al. op. cit.
84 Wang, Xiaozhong. op. cit. Schmucker, Dietmar et al. op. cit. Serafini, Tito. op. cit. Wu,
Qiang; Maniatis, Tom. op. cit
85 Brett, David et al. op. cit. Modrek, Barmak; Lee, Christopher. op. cit.
86 Keller, Evelyn Fox. op. cit.
87 Falk, Raphael. op. cit.
88 VARIOUS
89 Raphael Falk um dos organizadores de um livro, recentemente publicado, sobre o
conceito de gene: FALK, Raphael. The concept of the gene in development and
evolution. Cambridge: Cambridge University Press. 2001.
98 Ridley, Matt. op. cit.

100 Mayr, Ernst. op. cit. CANGUILHEM, G. Ideologia e racionalidade nas cincias da
vida. So Paulo: Edies 70, 1977. DOBZHANSKY, Theodosius. Looking back at
Mendels discovery. Science, vol. 156, p. 1588-1589, 1967. FISHER, R.A. Has Mendels
work been rediscovered? In: STERN, C.; SHERWOOD, E.R. (Orgs.). The origin of
genetics: AMendelsourcebook. S. Francisco: W.H. Freeman & Company, 1966. WRIGHT,
S. Mendels ratio. In: STERN, C.; SHERWOOD, E.R. (Orgs.). op. cit.
101Mayr, Ernst. op. cit. Em meados do sculo XVII, os pr-formacionistas postulavam
que todos os organismos preexistem nas linhagens germinais de seus pais. Ou seja,
dentro de cada indivduo, homemou baleia, j estaria pr-formada sua prole e assim
por diante, exatamente do mesmo modo que bonecas russas. A mais conhecida expresso do pensamento pr-formacionista representada pela figura do homnculo,
um ser em miniatura que j existiria pr-formado em uma das clulas germinais, a
saber, no espermatozide. Cf. PINTO-CORREIA, Clara. O ovrio de Eva: A origem da
vida. Traduo de: The ovary of Eve. Rio de Janeiro: Editora Campus, 1999. ROE,
S.A.John Turbeville Needhamand the generation of living organisms.. Isis, vol. 74, p.
159-184, 1983. Posteriormente, surgiriam os epigeneticistas como escola rival aos
pr-formacionistas. Para os defensores da epignese, o desenvolvimento do embrio
fruto de uma elaborao progressiva. A estrutura de um ser vivo se organiza pouco
a pouco por uma srie de dobras atravs de uma seqncia, no tempo e no espao,
sujeitas a operaes mecnicas devido interao com as foras fsicas do ambiente.
Cf. JACOB, Franois. op. cit.
102Mayr, Ernst. op. cit.
103Keller, Evelyn Fox.. op. cit.
104Disponvel em: http://www.pitt.edu/~kstotz/genes/minutes.html.
105East, E. M. apud Falk, op. cit., p. 145.
106Falk, Raphael. op. cit., p. 155.
107Keller, Evelyn Fox. op. cit., 2002, p. 82.
108Falk, Raphael. op. cit.
90 KELLER, Evelyn Fox.. O sculo do gene. Traduo de: The century of the gene. Belo
Horizonte: Editora Crislida, 2002, p. 83-84.
91 Devido a afirmao, a nosso ver contraditria, de Keller, reproduzimos a verso
original em ingls para evitar qualquer especulao sobre erros de traduo na
verso emportugus. [...] the gene can no longer be set above and apart from de
process that specify cellular and intercellular organization. That gene is itself part
and parcel of a complex self-regulating dynamical system in which, and for which,
the inherited DNA provides the crucial and absolutely indispensable raw material,
but no more than that. Cf. Keller, Evelyn Fox. op. cit., p. 71.
92 LEWONTIN, Richard C. Biologia como ideologia: a doutrina do DNA. Traduo de:
Biology as ideology. Ribeiro Preto: FUNPEC-PR, 2000. Esse livro foi publicado
originalmente em lngua inglesa no ano de 1992.
93 GOULD, Stephen Jay. Darwin e os grandes enigmas da vida. So Paulo: Martins
Fontes, 1987.
109STROHMAN, Richard C. op. cit. WILKINS, Adam S. Are there kuhnian revolutions in
biology?. BioEssays, vol. 18, p. 695-696, 1996.. MAYR, Ernst. As revolues cientficas
de Thomas Khun acontecem mesmo? IN: MAYR, Ernst.. Biologia, cincia nica. So
Paulo: Cia das Letras, 2005, p 174-184.
110Wilkins, Adam S. op. cit.
111Ibid. Para Mayr, no houve essa aceitao imediata. Cf. Mayr, Ernst. op. cit., 1998.
112OLBY, Robert. op. cit.
113Ibid.
114Wilkins, Adam S. op. cit.
115Strohman, Richard C. op. cit.
94 Keller, op. cit., p. 72.

116Ibid.
95 Um complexo de protenas e SnRNAs, small nuclear RNAs, uma classe de ncRNAs.
Cf. MATTICK, John S. Challenging the dogma: The hidden layer of non-protein-coding
RNAs in complex organisms. BioEssays, vol.25, p. 930-939, 2003. EDDY, Sean R.
Non-coding RNA genes and the modern RNA world. Nature Reviews/Genetics, vol.
2, p.10-20, 2001.
117Ibid., p.195.
118Ibid.
119MAYNARD-SMITH, John. Reconciling Marx and Darwin. Evolution, vol. 55, 14961498, 2001, p 1496.
97 BRITTEN, R. J.; KOHNE, D. E. Repeated sequences in DNA. Science, vol. 161, p. 529540, 1968.
120ALVES-MAZZOTTI, Alda Judith; GEWANDSZNAJER, Fernando O mtodo nas cincias

naturais e sociais: Pesquisa quantitativa e qualitativa. So Paulo: Editora Pioneira.
Rio de Janeiro, v. 5, n. 1, p. 63-84, jan | jul 2007, jan | jul 2007
83
1998. LAKATOS, Imre. O falseamento e a metodologia dos programas de pesquisa

cientfica.. In: LAKATOS, Imre; MUSGRAVE, Alan. A crtica e o desenvolvimento do
conhecimento. 4 volume das atas do colquio internacional sobre filosofia das
cincias, realizado em Londres, em 1965. So Paulo: Cultrix/EDUSP, 1979.
121East, E. M. op. cit.
122 EAST, E. M. op. cit., p. 889.
123 Castle apud Falk, op. cit.
124 GELBART, William M. Databases in genomic research. Science, vol. 282, p. 659-661,
1998.
125 Griffiths, Paul E.; Neumann-Held, Eva M. op. cit. FALK, Raphael. op. cit.
126 Griffiths, Paul E.; Neumann-Held, Eva M. op. cit.
128 Keller, Evelyn Fox. op. cit. STROHMAN, Richard C. op. cit.
129 STROHMAN, Richard C. op. cit.
130 JACOB, op. cit.
84
Artigo recebido para publicao em 08/2006.

Aprovado para publicao em 04/2007.

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Os genes interrompidos: o impacto da descoberta dos

ntrons sobre a definio de gene molecular clssico

REVISTA DA SBHC, Rio de Janeiro, v. 5, n. 1, p. 63-84, jan | jul 2007

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Os genes interrompidos e o DNA recombinante

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partir de um conjunto no muito dessemelhante de protenas, lipdeos e carboidratos, valendo-se de

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No exemplo anterior, observamos a gerao de apenas duas emendas alternativas a partir de um

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Discusso: revoluo kuhniana ou progresso lakatosiana?

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materialmente o gene. No entanto a histria da gentica, em sua quase insondvel complexidade,

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Alguns historiadores e cientistas tm perguntado se existiriam, nas cincias biolgicas, revolues

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contra refutaes). No entanto, se houver mudanas no ncleo, estaremos, automaticamente, diante

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NOTAS E REFERNCIAS BIBLIOGRFICAS

8 COLLINS, F. Glossary of genetic terms: gene, [Website]. National Human Genome

24 CRICK, Francis apud STENT, Gunther S. op. cit., p. 390.

9 RIDLEY, Matt. op. cit.

25 JACOB, Franois. op. cit., p. 253.

10 Griffiths, op. cit. Falk, Raphael. op. cit.

27 DOTY, Paul. op. cit.

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37 Griffiths, Paul E. op. cit.

38 STENT, Gunther S. op. cit.

56 Em 1981 e 1982, foram produzidos os primeiros animais transgnicos: 1) Introduo

62 CHOW, Louise T. et al. op. cit.

46 SAMBROOK, J. op. cit. GILBERT, Walter. op. cit.

64 MAYR, Ernst. op. cit.

47 CHAMBON, Pierre. op. cit.

65 O livro de Mayr (1998) foi originalmente publicado em 1982.

66 CHAMBON, Pierre. op. cit.

63 Disponvel em: www.cshl.org/History/history.html.

67 GILBERT, Walter. op. cit.

75 Regio da molcula do RNA mensageiro que especifica os aminocidos na protena.

76 CHAMBON, Pierre. op. cit.

78 Baker, Bruce S. op. cit.

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98 Ridley, Matt. op. cit.

94 Keller, op. cit., p. 72.

96 Falk, Raphael. op. cit.

120ALVES-MAZZOTTI, Alda Judith; GEWANDSZNAJER, Fernando O mtodo nas cincias

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1998. LAKATOS, Imre. O falseamento e a metodologia dos programas de pesquisa

Artigo recebido para publicao em 08/2006.

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