Tratamiento de Datos y Seales Ingeniera Fsica, Universidad del Cauca Noviembre de 2010

Manuel J. Castrilln-Fernndez, Harold J. Bolaos, Jaime E. Enrquez, Leonairo Pencue-Fierro.

Aqu
Colocar un Ttulo Descriptivo del Trabajo
Realizado en el Laboratorio
II.PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL

Resumen(Todo lo que van a ver aqu es la forma como se

escribe este tipo de informe, slo cambiar el contenido de los
ttulos y los prrafos, los formatos deben permanecer tal cual)
En este trabajo se presenta la implementacin de un sistema
asistido de visin artificial que analiza las imgenes de
glomrulos de biopsias renales, obtenidas mediante tcnicas de
microscopia ptica. El sistema considera la segmentacin del
glomrulo en sus partes ms representativas: penacho
glomerular, cpsula de Bowman, clulas mesangiales,
endoteliales y podocitos. Como clasificador se emplea el
algoritmo de k-means alimentado con el vector de caractersticas
extradas de las imgenes, tales como tamao, forma y nivel de
gris.
Palabras claveAlgoritmo de k-means, Anlisis de imgenes
renales, Glomrulo, Procesamiento digital de imgenes.

I. INTRODUCCIN

A nefrologa corresponde al estudio de los riones, sus

componentes y sus patologas. La unidad funcional renal
es el nefrn, el cual est constituido por: el corpsculo renal o
malpighiano (glomrulo y cpsula de Bowman) y los tbulos
proximal y distal. El corpsculo renal est compuesto, como
se muestra en la figura 1, de un sistema capilar lineado por
una capa delgada de clulas endoteliales; una regin central
de clulas mesangiales; las clulas epiteliales viscerales
(podocitos) y la membrana basal asociada; y las clulas
epiteliales parietales de la cpsula de Bowman.
El glomrulo tiene entre sus funciones el proceso de
ultrafiltrado de la sangre desde los capilares glomerulares y
los podocitos hacia el espacio de Bowman. Existen dos tipos
de nefrones reconocibles dentro del rin: los corticales, que
se encuentran en la superficie, y los yuxtamedulares, que se
encuentran en la mdula o parte interna del rin. El
dimetro promedio de un glomrulo es de aproximadamente
200m. El dimetro de los glomrulos yuxtamedulares es un
20% ms grande que los glomrulos de la zona superficial
[1].
La tcnica presentada en este trabajo posee la ventaja de
almacenar la imagen, sus datos y presenta un primer
diagnstico de la biopsia renal analizada, teniendo la
posibilidad de constituir un archivo para posteriores
revisiones de dicho paciente.

M. J. Castrilln-Fernndez, Grupo de ptica Lser, Departamento de

Fsica,
Universidad
del
Cauca,
Popayn,
Colombia.
(e-mail:
mcastrillon@unicauca.edu.co).
H. Bolaos, Departamento de Patologa, Universidad del Cauca, Popayn,
Colombia.
J. Enrquez, Grupo de Enfermedades Renales, Departamento de Medicina
Interna, Universidad del Cauca, Popayn, Colombia.
L. Pencue-Fierro, Grupo de ptica Lser, Departamento de Fsica,
Universidad del Cauca, Popayn, Colombia.

A. Coleccin de muestras
Las biopsias renales utilizadas para estandarizar los
patrones morfolgicos normales del glomrulo fueron
extradas de autopsias de 10 individuos con edades
comprendidas entre los 15 y 40 aos que no presentaban
patologas.
B. Descripcin del sistema
El sistema implementado est constituido por un
microscopio ptico marca Nikon que tiene acoplada una
cmara CCD marca JVC de 640x480 pixeles, la seal
analgica de salida de la cmara es digitalizada mediante una
tarjeta de adquisicin conectada al computador, obteniendo de
esta forma las imgenes digitales para el estudio. El
computador utilizado es una estacin de procesamiento y
anlisis de imgenes LEICA Q550IW. El software se
desarroll en QUIPS y QWIN, los cuales son
macroprogramas interactivos ejecutados en una plataforma
PC.
C. Segmentacin
La segmentacin consiste en dividir la imagen en regiones
que son de inters, denominadas objetos, y el fondo,
constituido como la regin que no presenta inters particular.
Dentro de las segmentaciones realizadas: la primera separa
la cpsula de Bowman del resto del glomrulo, mientras que
la segunda asla las clulas glomerulares para su posterior
clasificacin.
Para separar las clulas glomerulares se realiz una
segmentacin por color, aprovechando que el color del
ncleo es diferente al del citoplasma y al del tejido del
penacho glomerular.

Sistema Asistido de Visin Artificial para la Estandarizacin de los Anlisis de Biopsias Renales mediante Microscopa ptica.
de biopsias renales es una herramienta poderosa para extraer
la informacin de la morfologa que caracteriza al glomrulo,
la cual es valiosa para determinar un diagnstico, mantener la
evolucin clnica de un paciente y realizar un seguimiento
frente al progreso de un medicamento o tratamiento ante una
enfermedad renal.
AGRADECIMIENTOS
Los autores agradecen al personal tcnico

alexjimenez@unicauca.edu.co,

ccdelgado@unicauca.edu.co,

jemartinezm@unicauca.edu.co, mhtobar@unicauca.edu.co, juancollazos@unicauca.edu.co, normalopez@unicauca.edu.co, yubely@unicauca.edu.co, ricardoconstain@unicauca.edu.co, dalegria@unicauca.edu.co, lfajardo@unicauca.edu.co, ljalvarez@unicauca.edu.co, pwzuniga@unicauca.edu.co,
miguelplay82@hotmail.com, oskar0720@hotmail.com, ricaldo2431@hotmail.com, vanem018@hotmail.com, alexrx666@gmail.com

REFERENCIAS
Fig. 3. Ejemplo de segmentacin. Cpsula de Bowman.

[1]
[2]

D. Extraccin de caractersticas
Con las imgenes segmentadas se realiza la medicin de
las caractersticas de cada uno de los objetos. Se mide el rea,
permetro, largo y ancho del glomrulo, el rea del penacho
glomerular y el rea de la cpsula de Bowman, adems se
utilizan los descriptores de rea, redondez, factor de forma y
nivel de gris promedio, medidos a cada uno de los ncleos
celulares. A continuacin se describe cada uno de los
descriptores con mayor detalle [7].

El rea del ncleo est definida como la cantidad de

pixeles en total que corresponden al ncleo.

E. Clasificacin
Una vez extradas las caractersticas para cada uno de los
ncleos, estas son almacenadas como elementos de un vector
de caractersticas que identifica cada ncleo y entra al
clasificador por algoritmo de k-means, para ser comparado
con los tres centroides que definen las clases ( k 3 ) de
clulas glomerulares: mesangiales, endoteliales y podocitos.
Se utiliz el software SPSS 10.0 para obtener los centroides
finales a los cuales se agrupan las clulas correspondientes.
Los centroides finales de los tres clusters de clulas fueron
implementados en QUIPS.
III. RESULTADOS Y DISCUSIN
Para la obtencin de los centroides finales y los rangos de
las mediciones morfolgicas se utiliz un conjunto de 108
imgenes de glomrulos.
La tabla 1 muestra los resultados estadsticos obtenidos
para todo el conjunto de imgenes. Los valores observados
estn sujetos a los diferentes tipos de imgenes que se
utilizaron, ya que los glomrulos varan sus caractersticas
dependiendo de la edad de la persona y zona a la que
pertenecen dentro del rin (cortical o yuxtamedular) debido
a esto se presenta un rango dentro del que se abarcan los
parmetros morfolgicos normales del glomrulo.
IV. CONCLUSIONES
El procesamiento digital de imgenes aplicado al anlisis

[3]

B.M. Brenner, The Kidney. Volume I, W. B. Saunders Company,

Philadelphia, Pennsylvania, 1996, pp. 960.
J. D. Carpio-Paniagua, La biopsia renal: importancia clnica, Sociedad
mdica de Valdivia, Vol. 17-2003, pp. 112-114.
J. P. Marques de S, Pattern Recognition, concepts, methods and
applications, Springer, pp. 70-76.
TABLA I
RESULTADOS ESTADISTICOS DEL CONJUNTO DE IMGENES

NUMERO DE
CELULAS
AREA
GLOMERULO
(m2)
LONGITUD
GLOMERULO
(m)
ANCHO
GLOMERULO
(m)
PERIMETRO
GLOMERULO
(m)
AREA PENACHO
GLOMERULAR
(m2)
AREA CAPSULA
DE BOWMAN
(m2)
No.
MESANGIALES
No. PODOCITOS
No.
ENDOTELIALES

RANGO

MINIMO

MAXIMO

MEDIA

DESVIACION
ESTANDAR

121

68

189

118

24

45654

42714

88369

61296

9237

90

189

279

236

20

91

133

224

181

19

465

622

1086

792

82

36704

30106

66810

42432

6711

39809

5278

45087

17144

6752

10

5,3

2,1

61

22

83

40

12

87

33

120

71

19