Transposones
Descubrimiento de los transposones
Transposones en el maz
Transposones en procariotas
El opern gal
Tipos de transposones en procariotas
Las secuencias de insercin IS
Transposones simples
Transposones compuestos
Mecanismos de transposicin
Transposicin replicativa
Transposicin conservativa
Tipos de transposones en eucariotas
Retrotransposones
Tipos de retrotransposones
Retrotransposones virales
Demostracin del paso intermedio por RNA
Mecanismo molecular de la retrotransposicin
Retroposones: LINE y SINE
Transposones de ADN en eucariotas
Transposones de ADN en el maz
Disgnesis hbrida
El elemento P en Drosophila
Uso del elemento P para insertar genes
Anomalas cromosmicas producidas por recombinacin entre los ET
Mantenimiento de los transposones en los genomas: hiptesis
Refugio de los ET en los genomas: ej. D. melanogaster y humanos
Elementos transponibles en gramneas
Ciclos de vida de los ET en los genomas
Se denominan tambin elementos genticos transponibles, elementos
transponibles, elementos mviles o genes saltarines o genes saltadores
Son elementos, trozos o segmentos de ADN que pueden moverse o transponerse por
todo el genoma
Pueden insertarse en diversas localizaciones dentro de un mismo cromosoma o en
distintos cromosomas
Hay transposones en todos los organismos desde bacterias hasta humanos
No slo son ubicuos sino que, en algunos organismos eucariticos, comprenden
grandes porciones de sus genomas siendo, en otros, cuantitativamente, el
componente principal
Por ejemplo, la secuenciacin genmica reciente ha revelado que al menos el 45% del
genoma humano procede de elementos transponibles
En maz el 80%, en humanos el 45%, en Drosophila el 22%, en levaduras el 5%
Algunos organismos con genomas anormalmente grandes como las salamandras y la
cebada, contienen cientos de miles de copias de diversos tipos de elementos
transponibles: el ADN repetitivo
Se desconoce la funcin de estos elementos pero sera impensable que los genomas
eucariticos tolerasen tal cantidad de ADN si fuera intil o inservible
Los datos de la secuenciacin del genoma humano sugieren que algunos genes
pueden haber evolucionado de los transposones y que la actividad de los
transposones ayuda a modificar y reestructurar el genoma
Entonces, desde el punto de vista evolutivo, tendra una explicacin la presencia de
esta gran cantidad de ADN aparentemente inservible
Fueron descubiertos por Brbara McClintock en el maz, en los aos 40 del siglo XX
Sin embargo, el hallazgo no fue reconocido de inmediato por la comunidad cientfica
ya que, la idea de que la informacin gentica pudiera no tener una posicin fija en el
genoma, pareca insostenible
Esta idea de genes mviles no encajaba con la idea de los genes como loci discretos
inamovibles y de la herencia casi inalterable (salvo las mutaciones)
En realidad, no se acept su existencia hasta que fueron descubiertos en otros
organismos (sobre todo en bacterias, en los aos 70) y se descubri su base
molecular
A Brbara McClintock le concedieron el Premio Nbel de Medicina en 1983 por estos
descubrimientos de la existencia de transposones en el maz
TRANSPOSONES EN MAZ
El maz tiene 10 cromosomas numerados de mayor (1) a menor (10)
McClintock observ que en una lnea de maz, el cromosoma 9 se rompa con mucha
frecuencia y en un locus determinado
La rotura del cromosoma se deba a dos factores genticos, un elemento disociador
(Ds) situado en el punto de la rotura y otro elemento activador (Ac) no situado en ese
punto
La rotura provocada por Ds no se produca si no estaba presente en el genoma el
elemento Ac
OPERN GALACTOSA
En los aos 70 comenzaron a aparecer mutaciones en el opern de galactosa (gal -)
que no revierten con agentes mutagnicos
Por tanto, no son cambios de base ni mutaciones de pauta o marco de lectura
Podran ser deleciones, pero revierten espontneamente y, por ello, tambin se
descarta que lo sean
OPERN GALACTOSA
Estudiando el fago , que se inserta cerca del locus gal, se observ que, al escindirse,
a veces lleva consigo dicho locus
De esta manera, se obtienen fagos (gal -) y fagos (gal+)
Si se centrifugan, se pueden separar y se observa que los fagos (gal -) pesan ms
que los fagos (gal+)
Resulta, entonces, que llevan una insercin. La mutacin a (gal -) es consecuencia de
una insercin en el locus gal
MECANISMO DE TRANSPOSICIN
La transposasa reconoce una secuencia diana en el ADN y hace cortes escalonados
de manera parecida a las roturas producidas por las endonucleasas de restriccin
En el ejemplo, se muestra un corte escalonado con 5 pares de bases de separacin
(pueden ser entre 4 y 13 pares de bases)
El elemento transponible se inserta entre los extremos escalonados
MECANISMO DE TRANSPOSICIN
La maquinaria de reparacin del ADN de la bacteria llena los huecos utilizando como
molde las bases de los extremos que quedaron salientes
Como consecuencia de la insercin del elemento IS en un lugar del ADN y la
reparacin de la rotura, se crea un par de repeticiones directas, una a cada lado de la
insercin
Estas secuencias se denominan duplicaciones del sitio de insercin
Prcticamente todos los transposones estn flanqueados por una duplicacin del sitio
de insercin, lo que indica que todos utilizan un mecanismo de integracin similar
Lo que vara es la longitud de la duplicacin
TRANSPOSONES COMPUESTOS
Son transposones formados por un par de elementos IS flanqueando un segmento de
ADN que contiene uno o ms genes que, en general, codifican para resistencia a
antibiticos
Por ejemplo, el elemento Tn10 lleva un gen para la resistencia a tetraciclina y los Tn5 y
Tn903 llevan un gen para la resistencia a kanamicina
En este segmento central no llevan el gen de la transposasa porque ya va en una o las
dos IS
Algunos Tn llevan IS idnticas en cada extremo y otros, IS diferentes
En algunos casos las IS estn orientadas en posicin directa y en otros en posicin
invertida
Ambas IS pueden tener el gen de la transposasa, funcional o no
Estas variaciones no parecen afectar al mecanismo de transposicin que es
conservativo y catalizado por la transposasa de uno o ambos elementos IS
TRANSPOSICIN REPLICATIVA
En el transposn Tn3 aparecan dos clases de mutaciones, unas recesivas en trans y
otras dominantes en cis
El descubrimiento de estas mutaciones dio lugar a que apareciesen los intermediarios
y a entender as cmo se produca la transposicin replicativa
En condiciones normales, cuando no estn presentes estas mutaciones ni en cis ni en
trans, se forma el cointegrado, pero no se observa, porque se resuelve y aparece el
resultado final de dos plsmidos, ambos con el transposn
TRANSPOSICIN REPLICATIVA
Las mutaciones recesivas en trans, producen una mutacin en el gen de la
transposasa que impide la transposicin y no se forma el intermediario
El intermediario es un plsmido doble formado por la fusin de los plsmidos donante
y receptor, llamado cointegrado
Cuando la transposasa es normal y slo estn presentes las mutaciones dominantes
en cis, se produce la formacin del cointegrado, que se puede observar porque no se
resuelve
En condiciones normales (sin mutaciones), se forma y se resuelve el cointegrado
apareciendo dos plsmidos ms pequeos
Cada uno de ellos lleva una copia del transposn
La resolucin del cointegrado se produce por recombinacin
Para que esto se produzca es necesaria la presencia de una regin denominada sitio
interno de resolucin, IRS (internal resolution site)
Esas mutaciones dominantes en cis lo que producen es una delecin en el IRS que
impide la recombinacin y resolucin del cointegrado
TRANSPOSICIN CONSERVATIVA
Algunos transposones, como el Tn10, se escinden del lugar donde estn y se integran
en otro lugar del genoma
En estos casos, no se produce la replicacin del transposn sino que abandona el
lugar donde estaba insertado
Es la replicacin conservativa, en el sentido en que se conserva el nmero de copias
Esto se demostr mediante la construccin de heterodplices derivados del fago que
contenan el Tn10 con el opern lac Z de E. coli
Emplearon los derivados de Tn10-lacZ+ y Tn10-lacZ- que se diferencian en tres bases
Los heterodplices, por tanto, contienen una cadena con la regin lacZ+ y la otra con
la regin mutada lacZ-
Con los heterodplices se transforman bacterias que carecen del opern lac y se
seleccionan las clulas que incorporan el Tn10 (con el heterodplice) porque les
confiere resistencia a la tetraciclina
Una vez producida la transposicin se originar una disposicin distinta de colonias
azules y blancas segn que la transposicin sea replicativa o conservativa
Para ello, y utilizando el compuesto X-gal en el sustrato, se pueden distinguir colonias
azules o blancas
Si la transposicin es conservativa, el heterodplice se integrar completo en el
cromosoma bacteriano
Despus de la primera divisin de la clula original, se formarn dos clulas, una de la
cuales ser LacZ+ y la otra LacZPor tanto, la colonia que se forma a partir de la clula LacZ+ aparecer teida de azul
mientras que la colonia formada a partir de la clula LacZ- aparecer blanca
Si la transposicin es replicativa, en el cromosoma bacteriano se integrar o bien la
cadena con LacZ+ o bien la cadena con LacZLas clulas derivadas de la original que sufri dicha transposicin replicativa sern, por
tanto, LacZ+ LacZUtilizando el compuesto X-gal en el sustrato, se podran distinguir las colonias como
totalmente azules o totalmente blancas
TRANSPOSICIN CONSERVATIVA
Los resultados obtenidos presentan las placas como mitad azules y mitad blancas
Por tanto, la mitad azul revela la presencia del opern LacZ+ y la mitad blanca la
presencia del opern LacZ- en las colonias bacterianas
Estos resultados indican que la transposicin de Tn10 es conservativa
TIPOS DE TRANSPOSONES
RETROTRANSPOSONES
Hay un tipo de transposicin replicativa que implica un RNA intermediario, es la
retrotransposicin
Este proceso comienza con la transcripcin normal de un RNA que se copia del ADN
del transposn
A partir de este RNA se genera un ADN de doble cadena mediante un proceso de
transcripcin inversa mediado por una transcriptasa inversa o retrotranscriptasa
Esta molcula de ADN permanece, en principio, fuera del genoma pero despus se
integra en l constituyendo as un transposn
Puede integrarse en el mismo cromosoma del transposn original o en uno distinto
Sin embargo, el elemento Ty1/copia carece del equivalente del gen env viral que
codifica las protenas de la cubierta viral
Por tanto, estos elementos Ty1/copia no pueden formar partcula virales infecciosas y,
debido a ello, no pueden escapar de la clula husped
En cambio, los miembros de la familia de retroelementos Ty3/gypsy s tienen un
equivalente del gen env y, al menos algunos de ellos, s pueden formar virus
infectantes
Aunque las versiones infecciosas no deben considerarse propiamente
retrotransposones sino retroelementos virales
RETROPOSONES
Hay retrotransposones que no tienen elementos LTR, son los retroposones
Los retroposones ms importantes en mamferos son los elementos nucleares largos
dispersos, LINE (large interspersed nuclear elements) y elementos nucleares cortos
dispersos, SINE (small interspersed nuclear elements)
Los SINE presentan ms de 1,7 millones de copias en el genoma humano que llegan a
ser el 14% del mismo, la mxima cantidad de copias para cualquier tipo de ADN
repetitivo disperso
Los LINE son menos frecuentes, con apenas ms de un milln de copias, pero al ser
ms largos, representan una mayor fraccin del genoma: ms del 20%
RETROPOSONES: LINE
El genoma humano contiene tres familias de LINE
El grupo de LINE-1 es el ms frecuente y el nico con capacidad de transposicin
Las familias de LINE-2 y LINE-3 estn formadas por vestigios inactivos
Un elemento LINE-1 de longitud completa tiene 6,1 kb y dos genes, uno de los cuales
codifica una poliprotena similar al producto del gen viral pol
No hay LTR, pero el extremo 3 del LINE est marcado por una serie de pares de
bases A-T que forman lo que se suele llamar secuencia de poli (A)
No todas las copias de LINE-1 son de longitud completa porque la transcriptasa
inversa codificada por LINE no siempre hace una copia completa de ADN a partir del
transcrito de RNA inicial
Esto conduce a que se pueda perder parte del extremo 3 de LINE
La prdida es tan frecuente que slo el 1% de los elementos LINE-1 del genoma
humano son versiones de longitud completa y el tamao promedio de las copias es de
slo 900 pb
RETROPOSONES: LINE
RETROPOSONES: SINE
Los SINE son mucho ms cortos que los LINE midiendo slo de 100 a 400 pb y no
contienen ningn gen
Debido a ello, no fabrican sus propia transcriptasa inversa y utilizan la que est
codificada por los LINE
El SINE ms comn en los primates es la secuencia Alu que tiene alrededor de 1.2
millones de copias en humanos
Un elemento Alu tiene dos mitades de unos 120 pb cada una y con una similitud de
alrededor del 85%
La mitad derecha lleva una insercin de 31-32 pb y una cola de poli (A) en el extremo
3
SECUENCIAS ALU
TRANSPOSONES DE ADN
Los retrotransposones son ms abundantes en los organismos eucariticos mientras
que los transposones de ADN son ms comunes en los procariotas
An as, el genoma humano contiene unos 350000 transposones de ADN de varios
tipos aunque todos tienen repeticiones terminales invertidas y todos contienen un gen
para la enzima transposasa que cataliza el fenmeno de la transposicin
No obstante, la inmensa mayora de estos elementos son inactivos a causa de que el
gen de la transposasa es no funcional o de que las secuencias de los extremos, que
son esenciales para la transposicin, estn mutadas o tienen deleciones
TRANSPOSONES EN HUMANOS
TRANSPOSONES DE ADN
DISGENESIS HIBRIDA
La disgnesis hbrida es un fenmeno que se produce cuando hembras de cepas
antiguas de laboratorio de D. melanogaster se cruzan con machos derivados de
poblaciones naturales recientes
Los linajes de laboratorio poseen un citotipo M y los linajes naturales un citotipo P
Cuando se cruza una hembra M con un macho P, la descendencia muestra una gran
variedad de fenotipos sorprendentes
Esta variedad de fenotipos incluye fecundidad reducida, alta tasa de mutacin (10-2) y
una elevada frecuencia de aberraciones y no disyunciones cromosmicas
La baja fecundidad se transforma en esterilidad a altas temperaturas (29 C)
Relacin ETs-hospedador
Dos hiptesis no excluyentes explican su amplia distribucin en los genomas de los
organismos
Hiptesis del ADN egosta: parsitos
que se perpetan en el genoma
- Ventaja replicativa respecto al
hospedador
heterocromatina
ELEMENTOS TRANSPONIBLES