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08/06/2014

Protenas Funciones y roles biolgicos

Estructura de las protenas: Existen 4 niveles de organizacin en la estructura de


las protenas (100 aminocidos o ms)

Catlisis enzimtica: catalizan (aumentan las veloc.) casi todas las reacciones biolgicas, reacciones
de distinta complejidad (hidrlisis vs replicacin de un cromosoma completo). Esas reacciones no
ocurren en ausencia de las enzimas.

Transporte y almacenamiento: Ej. O2 transportado por hemoglobina en sangre y por mioglobina en


msculo.

Movimiento coordinado: macroscpico (msculo, deslizamiento de 2 filamentos proteicos) o

Estructura primaria: est dada por la secuencia de


aminocidos y los puentes disulfuro.
Estructura secundaria: Est determinada por las
disposiciones regulares de aminocidos cercanos
en una cadena peptdica. Ciertas conformaciones
de pptidos son ms estables que otras.

microscpicos (cromosomas en la mitosis, propulsin del esperma por medio de flagelos)

Soporte mecnico: piel, huesos. Soportan tensin


Proteccin inmune: anticuerpos (protenas especficas que reconocen y se combinan c/ sustancias
extraas tales como virus, bacterias y clulas de otros organismos. Distinguir lo propio de lo ajeno

Generacin y transmisin de impulsos nerviosos: La respuesta de las clulas nerviosas a


estmulos especficos depende de la presencia de receptores proteicos. Ej: rodopsina es el receptor en
los bastoncitos del a retina.

Estructura terciaria: Originada por plegamientos


adicionales, enrollamientos y otras formas de
agregacin que se dan como consecuencia de la
relacin espacial entre aminocidos situados muy
distantes en la secuencia.
Estructura cuaternaria: determinada por la
asociacin de dos o ms cadenas proteicas que
originan un multmero de orden superior

Control del crecimiento y diferenciacin: mensajeros qumicos y hormonas

08/06/2014

Estructura secundaria
Est determinada por las disposiciones regulares de aminocidos cercanos en una
cadena peptdica. Ciertas conformaciones de pptidos son ms estables que otras.
HLICES ALFA

a-queratina (lana)

LMINAS BETA
Los electrones se
encuentran en un nico
orbital hbrido

Fibrona de seda (15 aa


diferentes, 46 % Gli, 38 % Ala
CH3 y Ser CH2OH)

VUELTAS INVERSAS
(o GIROS INVERSOS)

Todas estas conformaciones son mantenidas por enlaces hidrgeno entre residuos
que se encuentran prximos en la cadena

08/06/2014

Estructura secundaria de las protenas


Hlices

Hlices

La hlice alfa est estabilizada por


puentes de hidrgeno entre los grupos
amino y carbonilo del esqueleto del
polipptido. El grupo carbonilo de cada
residuo forma un puente de hidrgeno
con el grupo amino del aminocido
situado cuatro residuos ms adelante.
Es una hlice derecha!

08/06/2014

Hlices

Hlices
En teora, sentido de la hlice puede ser
dextrgira, en sentido de giro igual al de las
agujas del reloj, o levgira, sentido contrario al de
las agujas del reloj. Pero en la hlice levgira los
oxgenos de los grupos carbonilos y las cadenas
laterales de los residuos desestabilizan la hlice
por impedimentos estricos. Esto se debe a que
los aminocidos de las protenas son de la serie L-.
Como se aprecia en la figura las cadenas laterales
de cada residuo estn aproximadamente en
posicin trans respecto al oxgeno del carbonilo
adyacente. Si el aminocido fuese de la serie D-,
estos residuos estaran en conformacin cis, con
mayores posibilidades de conflictos estricos
dependiendo del tipo de cadena lateral.

Tambin puede pensarse la hlice


como una cadena enrollada alrededor
del eje longitudinal de la molcula.
Los grupos R sobresalen del esqueleto
helicoidal

Hlice a vista desde arriba

Las protenas que forman los


msculos (miosina) y la lana (
queratina) son hlices .

08/06/2014

Aminocidos incompatibles o que desestabilizan las hlices a:


Hay aminocidos incompatibles con esta estructura debido a las
propiedades de su cadena lateral.
-El asprtico tiene la cadena lateral cargada por lo que si hay
muchos juntos se repelen desestabilizando la molcula. Slo son
estables si no estn disociados.
- Hay aminocidos que son muy voluminosos en su carbono b
porque estn sustituidos y el residuo no puede extenderse. Son
la treonina y la isoleucina.
Hay otro aminocido que rompe la a-hlice: prolina. Como el
enlace no puede girar, la cadena da la vuelta. Ya que tiene el
grupo a-amino sustituido no puede formas puentes de hidrgeno.
Se puede tener a-hlice antes y despus de la prolina.

Lminas
Antiparalela

O
H2N CHC OH
CH 2
C O
OH

O
H2N CHC OH
CHOH
CH3

O
H2N CHC OH
CH CH 3
CH 2
CH 3

H
N
C

OH

-La glicina desestabiliza las estructuras en hlice alfa porque es


demasiado flexible.
Una protena puede tener a-hlice a lo largo de una porcin
porque los aminocidos son compatibles. La cadena se puede
estirar rompiendo puentes de hidrgeno y el lmite est en la
cadena polipeptdica.

O
H2N CH2C OH

En la hebra beta, la cadena polipeptdica


est generalmente estirada. Todos los
residuos presentan una rotacin de 180
respecto a los precedentes. La distancia
entre dos aminocidos adyacentes es de
0.35 nm, en lugar de los 0.15 nm de la
hlice alfa. La estructura se estabiliza
mediante la asociacin de hebras para
formar una lmina u hoja beta. Estos se
disponen casi perpendiculares a la
cadena polipeptdica extendida. La hoja
beta est estabilizada por puentes de
hidrgeno entre el grupo amida y el
grupo carboxilo de un filamento
adyacente. Los radicales se disponen
alternativamente a uno y otro lado de la
cadena polipetdica.

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Lminas

Lminas

Paralela

Estructura secundaria mantenida por puentes de hidrgeno entre elementos de la


cadena peptdica. Aspecto laminar.
Las cadenas adyacentes de una hoja beta
pueden orientarse en la misma direccin
(hojas beta paralelas), o en direcciones
opuestas (hojas beta antiparalelas). Cuando
la hojas beta son antiparalelas los puentes
de hidrgeno que estabilizan la estructura
son prcticamente perpendiculares a las
cadenas polipeptdicas y los grupos
carbonilo y amino de dos residuos forman
puentes de hidrgeno entre s. Esto no
ocurre en las hojas beta paralelas, donde los
puentes de hidrgeno no son
perpendiculares al esqueleto polipeptdico y
los grupos carbonilo y amino de un residuo
forman puentes de hidrgeno con dos
residuos diferentes.
Son ricas en aminocidos pequeos (gly, ala,
ser)

Diferencias con hlice a:


- La cadena polipeptdica est lo ms extendida posible.
- Distancia entre aminocidos: 3.5 angstroms.
- Estructura mantenida por puentes de hidrgeno, pero en lugar de formar puentes
entre elementos de la misma cadena es con elementos de cadenas distintas (o de la
misma que da la vuelta). Los puentes de hidrgeno se establecen perpendiculares al
eje de la lmina. Todos los carbonilo forman puentes de hidrgeno con los amino, por
lo que es igual de estable que la a-hlice.
Existen 2 arreglos posibles de lminas b:
- Si los 2 segmentos tienen direcciones distintas la hoja plegada es antiparalela. Como los
puentes de hidrgeno son enlaces direccionales es ms estable.
- Si los 2 segmentos tienen direcciones iguales la hoja plegada es paralela.
Las cadenas laterales van por encima y por debajo alternativamente porque la
configuracin del enlace es trans.
- Las cadenas laterales estn ms prximas que en la a-hlice, por lo que slo es
compatible con aminocidos de cadena lateral muy corta: glicina, alanina y serina (son los
ms pequeos). Los otros aminocidos sufren repulsiones de tipo estrico.

08/06/2014

Giros, vueltas , vueltas inversas, o giros reversos


Formado por 4 aminocidos, el
primero forma un enlace H con el
cuarto.

La fibrona de la seda es casi totalmente una lmina plegada y ms del 80%


de su estructura repite el motivo gly-ser-gly-ala-gly-ala

Lo esencial de este giro en horquilla


es que el carbonilo de un residuo n
se enlaza con el grupo amino del
residuo n+3. En consecuencia la
cadena puede cambiar bruscamente
de direccin.
Se conocen varios tipos de giros. En
los giros tipo I, podemos encontrar
cualquier tipo de residuos con
excepcin de la prolina en posicin
3. En los giros tipo II, la glicina debe
estar en posicin 2 y casi siempre
aparece una prolina en posicin 3.
Los giros tipo III no tienen
restricciones en cuanto a la
identidad de sus componentes.
A veces puede conseguirse un giro
completo de la cadena polipeptdica
con tan solo dos residuos como es el
caso de los giros tipo . En estos
residuo n debe ser una prolina.

08/06/2014

Giros, vueltas , vueltas inversas, o giros reversos

Estructura terciaria
Originada por plegamientos adicionales, enrollamientos y otras formas de
agregacin. Son consecuencia de la interaccin de aminocidos situados muy
distantes en la secuencia. Muy importantes para el mantenimiento de la estructura
terciaria son los puentes disulfuro entre residuos de cistena distantes.

En general conectan sucesivamente lminas antiparalelas.


Cambian la direccin de la cadena, contribuyen a su forma compacta.
Generalmente en la superficie de la protena y poseen residuos cargados.
Estn formados por 4 aminocidos.

En la tabla aparecen las principales interacciones no covalentes que son importantes en el


mantenimiento de la estructura de las protenas.
La menor energa de estas interacciones las hacen importantes dado que pueden
romperse y volverse a formar durante las interacciones moleculares. Las interacciones
moleculares dependen de un rpido recambio de parejas moleculares que podra no
producirse si las interacciones fuesen ms fuertes.
Adems estas interacciones tambin estabilizan la estructura cuaternaria de las protenas,
nivel de organizacin que aparece en las protenas compuestas por ms de una cadena
polipeptdica.
La estructura cuaternaria se refiere a como las distintas cadenas polipeptdicas se asocian
entre s y se disponen espacialmente.

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Tipos de enlace que estabilizan la estructura terciaria de una protena

08/06/2014

Clasificacin de protenas de acuerdo a su


estructura terciaria

Protenas fibrosas

Haces de filamentos alargados


Resultan insolubles en agua

Fibrosas:
Adoptan una conformacin lineal con mltiples puntos de interaccin
entre las diferentes cadenas.
Interactan poco con los solventes, siendo insolubles en agua
Estn vinculadas a funciones estructurales, como la fibrona de la seda (bqueratina), las a-queratinas en uas, pelo, cuerno, piel y plumas y el
colgeno, en tejido conectivo.

Espiral enrollada formada por 2 hlices

Globulares:
Las cadenas estn enrolladas en el espacio (pte. disulfuro)
Adoptan formas esfricas o elipsoidales, colocando los grupos
hidrofbicos hacia su interior
A pH fisiolgico y por lo tanto son solubles en agua.
Asociadas a funciones biolgicas (transporte, defensa, enzimtica, etc).

Protofilamentos: formado por


2 espirales enrolladas

4 Protofilamentos
forman un filamento

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08/06/2014

Protenas fibrosas la queratina

Protenas fibrosas la queratina


Las queratinas son las protenas ms
abundantes del pelo y las uas y forman
parte de la piel de los animales. Las alfaqueratinas son miembros de las
protenas filalentosas intermedias, que
realizan un funcin estructural muy
importante en el ncleo, citoplasma y
superficie de muchos tipos celulares. La
estructura tpica de las queratinas es la
siguiente: las molculas individuales
poseen largos fragmentos (aprox. 300
residuos) estructurados en forma de
alfa-hlice. Un par de hlices se
enrollan entre si para formar la
estructura de ovillo enrollado a
izquierdas; dos ovillos enrollados
vuelven a unirse para formar una
protofibrilla de cuatro molculas;
finalmente, ocho protofibrillas se unen
para formar una microfibrilla, que es la
base de la estructura del pelo. Las
microfibrillas son elsticas y flexibles.

Las alfa-queratinas presentan un mayor porcentaje de cistenas que otras protenas, con
lo que se pueden establecer puentes disulfuros entre las distintas estructuras
helicoidales, lo que da mayor rigidez a las microfibrillas.
Mediante la aplicacin de agentes reductores y de calor hmedo se puede cambiar el
patrn de enlaces disulfuro entre las distintas cadenas polipeptdicas. Aplicando agentes
oxidantes, una vez que el cabello se ha moldeado segn la forma deseada, se consigue
que se establezca un patrn de puentes disulfuro diferente y el cabello queda ondulado
de modo "permanente".

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Algunas protenas globulares

Mioglobina: nica
cadena de 153
residuos. 8 segmentos
rectos e hlice a
conectados por giros o
lazos. 70% de los
residuos en regiones
helicoidales

Citocromo c: nica
cadena de 100
residuos. 40% de los
residuos en regiones
helicoidales. El resto en
lazos, giros y
segmentos extendidos.

Lisozima: nica cadena


de 120 residuos. 40%
de los residuos en
regiones helicoidales
pero en distinta
distribucin. Tambin
posee conformacin b.

Algunas protenas globulares

Las protenas fibrosas tienen misiones estructurales en los organismos y por tanto son muy abundantes y
esenciales para el mismo. Sin embargo, la gran mayora de las funciones celulares las llevan a cabo protenas
globulares. Su nombre se debe a que sus cadenas polipptdicas se pliegan sobre si misma de manera
compacta. La gran variedad de plegamientos diferentes que encontramos en las protenas globulares refleja
la variedad de funciones que realizan estas protenas. A pesar de esta enorme variedad de plegamientos
podemos encontrar una serie de motivos y principios comunes.
La estructura terciaria de una protena es el modo en el cual se pliega la cadena polipetdica. La complejidad
que presenta la estructura terciaria de las protenas hace que se distingan subestructuras dentro de sta. En
la imagen vemos diferentes representaciones de la estructura terciaria de la mioglobina.

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Estructura cuaternaria de las protenas

Disposicin de protenas y subunidades proteicas en complejos tridimensionales.


Subunidades diferentes pueden llevar a cabo funciones separadas y las
interacciones entre subunidades pueden modificar la actividad enzimtica.
Conjugacin con grupos prostticos, cofactores, coenzimas, iones inorgnicos,
mollucas simples (H. de C), etc.

Grupo Hemo
(grupo prosttico)

Hemoglobina: Transporta el O2 en la sangre de los pulmones a las clulas. 4 grupos prostticos


hemo y 4 cadenas polipeptdicas.
- Proteica (globina): 2 cadenas a (141 residuos c/u) y 2 cadenas b (146 residuos c/u).
- Las cadenas a y b contienen varios segmentos de hlice a separados por lazos peptdicos.
- Cada cadena tiene un grupo hemo.
-Anemia falciforme: reemplazo del aa146 (Val por Glu) de la cadena b.
-Anemias: desplazamiento del Fe2+ por H2O

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La triple hlice del colgeno


resiste la tensin y el
estiramiento

Cuando el colgeno se
desnaturaliza (pierde su estructura
terciaria/cuaternaria), se
transforma en gelatina: las hebras
se separan en cadenas pseudo
globulares irregulares

Gly X- Y muy frecuentemente Gly Pro Hpro


Cadenas que forman hlices izquierdas!
La Hpro no est codificada
por el ADN y se biosintetiza
por hidroxilacin de la Pro.

El alto contenido de Pro e Hpro trae como


consecuencia la formacin de hlices izquierdas de
manera espontnea

3 cadenas de colgeno se asocian entre s y forman un


arreglo que determina su estructura cuaternaria

El colgeno es una protena fibrosa componente de la piel, los huesos, los tendones y los dientes. La
unidad bsica de la fibra de colgeno es una triple hlice denominada tropocolgeno. Cada cadena del
tropocolgeno, de unos 1000 residuos de longitud, est formado por una hlice a izquierda con 3,3
residuos por vuelta y 0,29 nm de elevacin. Las tres cadenas que forman el tropocolgeno se enrollan
entre s a derechas. La secuencia de aminocidos del colgeno es extraordinariamente regular.
Prcticamente cada tres residuos contiene una glicina, tambin presenta una mayor proporcion de
prolina que el resto de las protenas. Otra caracterstica es la presencia de residuos de 4-hidroxiprolina,
aminocidos que raramente se encuentra en otras protenas. Los residuos de glicina se sitan en la zona
del tropocolgeno donde las tres hlices se encuentran ms cerca, lo que hace que sea este aminocido
el nico que no presente impedimentos estricos en dicha posicin.

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Factores que modifican la estructura de las


protenas. Desnaturalizacin
La desnaturalizacin es la prdida de la estructura terciaria de la
protena, de forma reversible o irreversible. La protena cambia sus
propiedades fsicas y suele perder o cambiar su actividad biolgica.

pH
Temperatura
Fuerza inica
Complejacin con metales
Oxidacin o reduccin (formacin o ruptura de
puentes disulfuro)

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