14/06/2015

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Estructura y estereoqumica de los a-Aminocidos

Los aminocidos (AA) obtenidos por hidrlisis de las protenas difieren en la cadena
lateral R.
Las propiedades de los AA varan de acuerdo a la cadena R.

Aminocidos inusuales
Hidroxiprolina

+
NH3
cido 1-aminociclopropanocarboxilico:

CO2

+
H3NCH2CH2CO2

H3NCH2CH2CH2CO2
g

cido 3-aminopropanoico (-alanina)

cido 4-aminobutanoico

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Estructura y estereoqumica de los a-Aminocidos

Glicina
(Gly o G)

+
H3 N

H
La glicina es el AA mas simple donde R = H.
Es el nico que es aquiral.

Neutros

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Neutros

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Aminocidos esenciales
Esenciales

No esenciales

Isoleucina

Alanina

Leucina

Tirosina

Lisina

Aspartamo

Metionina

Cisteina

Fenilalanina

Glutamato

Treonina

Glutamina

Triptofano

Glicina

Valina

Prolina

Histidina

Serina

Arginina

Asparganina

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Abreviaturas

Estructura y estereoqumica de los a-Aminocidos

Casi todos los aminocidos naturales tienen configuracin (S), con estereoqumica semejante
al L-(-)-gliceraldehdo, por lo que se denominan L-aminocidos.
Excepto la glicina, todos los -aminocidos son quirales.

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Estructura y estereoqumica de los a-Aminocidos

L-Isoleucina

D-Alloisoleucina

L-Isoleucina (2S,3S) y D-Isoleucina (2R, 3R)

L-allo-isoleucina (2S,3R) y D-allo-isoleucina (2R, 3S)

Propiedades
Tienen puntos de fusin elevado.
Descomponen por encima de los 200 C.
Son solubles en agua.
Soluciones con alta constante dielctrica.
Alto momento dipolar .

Ion dipolar
Zwitterion

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Propiedades cido-base

No tiene carga neta, no se mueve en un campo elctrico .

Es el punto de menor solubilidad del aminocido.
La concentracin del catin es igual a la concentracin del anin y
ambas son muy bajas con respecto a la del zwitterion.

Punto isoelctrico

Propiedades cido-base

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Propiedades cido-base

glicina

Un aminocido neutro tiene un pI cercano a 6.0

cido aspartico
Si pH > pI,
tiene carga -

Si pH < pI,
tiene carga +
Equivalentes de OHUn aminocido cido tiene un pI cido

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Arginina

Si pH > pI,
tiene carga -

Si pH < pI,
tiene carga +

Equivalentes de OHUn aminocido bsico tiene un pI bsico

Lisina

La movilidad de un aminocido en un campo elctrico

depende del pH al cual se realice el experimento

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Electroforesis

Representacin simplificada
de la separacin
electrofortica de la alanina,
lisina y cido asprtico a pH
= 6.

La lisina catinica es
atrada hacia el ctodo, el
cido asprtico aninico
es atrado hacia el nodo
y la alanina se encuentra
en su punto isoelctrico,
por lo que no se mueve

Reacciones de los -Aminocidos

Esterificacin del cido carboxlico

inestable

Acilacin de la amina

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Reaccin con ninhidrina

ninhidrina

ninhidrina

Producto color
prpura

Acoplamiento oxidativo

Cistena

Cistina

Pptido

Un enlace peptdico tiene seis tomos en un plano: el C y el O del carbonilo, el N y su H, y

los dos tomos de carbono asociados.

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Pptido

Pptido
Un pptido es un polmero de aminocidos unidos por enlaces amido entre el grupo amino de cada
aminocido y el grupo carboxilo del aminocido vecino.

Hormona humana bradiquinina es un nonapptido con un grupo -NH3+ en el extremo N terminal y un -COOlibre en el extremo C terminal.

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Alanilglicina

+
H3N
N-terminal

CH3

O
C-terminal

AlaGly
AG

H
+
H3 N

CH3

+
H3 N

O
N

O
C

CH3

Alanilglicina
AlaGly
AG

Glicilalanina
GlyAla
GA

Alanilglicina y glicilalanina son ismeros constitucionales

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Bradiquinina
arginilprolilprolilglicilfenilalanilserilprolilfenilalanilarginina

Arg-Pro-Pro-Gly-Phe-Ser-Pro-Phe-Arg

RPPGFSPFR

Enlaces disulfuro
La cistina, dmero de la cistena, se obtiene cuando dos residuos de cistena se oxidan y forman un puente disulfuro.

La oxidacin suave enlaza dos molculas de un tiol para formar un puente disulfuro.

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N-terminal

C-terminal

La oxitocina es un nonapptido con dos residuos de cistena (en las posiciones 1 y 6) que unen parte de la molcula
formando un gran anillo

Determinando la estructura peptdica

Estructura primaria
La estructura primaria de una protena es la secuencia de aminocidos
y de adicionales puentes disulfuros.
Estrategia clsica (Sanger)
1. Determinar que aminocidos estn presentes y sus relaciones
molares.
2. Ruptura del pptido en fragmentos menores, y determinar la
composicin de los aminocidos presentes en esos fragmentos.
3. Identificar las N- y C-terminales en el pptido original y en cada
fragmento.
4. Organizar la informacin de las secuencias de los fragmentos
menores que pueden revelar la secuencia entera.

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Determinando la estructura peptdica

Ruptura de los enlaces disulfuro

Los puentes de cistena, cuando

se reducen a la forma tiol, tienen
tendencia a reoxidarse y volver a
formar puentes disulfuro.
La oxidacin de una protena
mediante la ruptura de todas las
uniones disulfuro por el cido
peroxifrmico, oxida la cistena a
cido cisteico.

1. Determinacin de la composicin de los aminocidos

diferencias en el pI de los
distintos aminocidos.

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1. Determinacin de la composicin de los aminocidos

Composicin de la bradiquinina humana

2. Hidrlisis parcial de pptidos y protenas

La hidrlisis cida de un pptido rompe todos los enlaces
peptdico.
Si se rompe solo algunos de los enlaces peptdicos, se generan
fragmentos menores.
Estos fragmentos menores son separados y se determina la
composicin de los aminocidos presentes en cada fragmento.
La ruptura enzimtica es el mtodo preferido para la hidrlisis
parcial
Las enzimas que catalizan la hidrlisis de los enlaces peptdicos
son llamadas: peptidasas, proteasas o enzimas proteolticas.

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2. Hidrlisis parcial de pptidos y protenas

2. Hidrlisis parcial de pptidos y protenas

Carboxipeptidasa

O
+
H3NCHC
R

protena

NHCHCO
R

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2. Hidrlisis parcial de pptidos y protenas

Tripsina

NHCHC

NHCHC

NHCHC

R'

R"

lisina o arginina

2. Hidrlisis parcial de pptidos y protenas

Quimiotripsina

NHCHC

NHCHC

NHCHC

R'

R"

Fenilalanina, tirosina, triptofano

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