RBOL FILOGENTICO

Diagrama dibujado por Charles Darwinen El origen de las especies.

Un rbol filogentico es un rbol que muestra las relaciones evolutivas entre varias especies u
otras entidades que se cree que tienen una ascendencia comn. Un rbol filogentico es una
forma de cladograma.
rboles filogenticos en biologa
A diferencia de los rboles genealgicos, en los que se utiliza informacin proporcionada por los
familiares, para los rboles filogenticos se usa informacin proveniente de fsiles, as como
aqulla generada por la comparacin estructural y molecular de los organismos.
Tanto los rboles genealgicos como los filogenticos tienen un tronco y ramas, pero en los
ltimos se muestran las relaciones entre especies y no entre individuos.
Los rboles filogenticos se construyen tomando en cuenta la teora de la evolucin, que nos
indica que todos los organismos son descendientes de un ancestro comn: la protoclula. As,
todos los organismos, ya sean vivos o extintos, se encuentran emparentados en algn grado.
Tipos de rboles filogentico

Fig. 1: rbol filogentico enraizado para genes rRNA.

Fig. 2: Otra representacin del rbol filogentico incluyendo las transferencias horizontales

Fig. 3: rbol sin raz de la familia Miosina

Un rbol filogentico enraizado es un rbol directo, con un nico ndulo que corresponde al
ancestro comn ms reciente de todas las entidades de las hojas del rbol. La Figura 1 muestra
un rbol filogentico enraizado coloreado de acuerdo con el "sistema de tres dominios". Los
rboles genticos sin raz ilustran la relacin de los ndulos de las hojas sin hacer asunciones
sobre ascendencia. Mientras que los rboles sin raz siempre pueden ser generados a partir de
rboles enraizados omitiendo la raz, una raz no puede ser inferida a partir de un rbol sin raz
sin algunos medios para identificar la ascendencia. Esto suele hacerse incluyendo un grupo
externo en los datos entrantes o introduciendo asunciones adicionales sobre las tasas relativas
de evolucin en cada rama, como una aplicacin de la hiptesis del reloj molecular. La Figura 2
muestra un rbol filogentico sin raz para la miosina, una familia gentica de protenas.

Un dendrograma es un trmino genrico para la representacin diagrmatica de un rbol

filogentico.

Un cladograma es un rbol formado usando mtodos cladsticos. Este tipo de rbol slo
representa un patrn de ramificacin, es decir, que la longitud de sus ramas no
representan el tiempo.

Un filograma es un rbol filogentico que representa explcitamente un nmero de

cambios de rasgos de carcter a lo largo de la longitud de sus ramas; es el resultado de
la aplicacin de los principios de la sistemtica evolutiva.

Un fenograma es un dendrograma no enraizado en que se establecen las relaciones de

parentesco fentico de los organismos estudiados; surgen de la aplicacin de los
mtodos de la taxonoma numrica.

Un cronograma es un rbol filogentico que representa explcitamente el tiempo

evolutivo proporcionalmente a la longitud de sus ramas.

Cladstica y caracteres
La mejora de los mtodos computacionales para el tratamiento de la informacin ha introducido
un nmero interesante de algortmicos cladsticos para la clasificacin mediante rboles
filogenticos. Muchos de esos rboles consideran un conjunto de especies representadas por
un conjunto de caracteres. Un carcter es cualquier caractersticas bien definida de la especie
que permita dividir el conjunto de especies en grupos, segn el valor que toma el carcter para
cada especie. As un subconjunto de las especies formar un grupo respecto a dicho carcter si
comparten una misma forma o valor de dicho carcter.
Cada carcter permite construir un rbol filogentico cladstico que satisface ciertas
propiedades razonables. Los algoritmos usuales pueden construir para un conjunto de especies
numerosos rboles filogenticos, y extraer de entre ellos alguno que sea ptimo en algn
sentido. Si las condiciones de optimidad estn bien escogidas esos algoritmos permiten
encontrar el verdadero rbol filogentico para un grupo de especies relacionables.
rbol filogentico en lingstica

Ejemplo de rbol filogentico para las lenguas afroasiticas (Ehret, 1995).

En lingstica histrica tambin ha sido comn el uso de rboles filogenticos para clasificar las
lenguas descendientes de una lengua madre comn o protolengua. Su uso empez en el siglo
XIX cuando el uso extensivo de varias metforas biolgicas aplicadas a la evolucin y
diversificacin de las lenguas humanas y la aparicin del mtodo comparativo llev al intento de
dibujar rboles genealgicos para las familias de lenguas.
Modernamente la construccin de rboles filogenticos se basa en el anlisis cladstico
aplicado, bien al lxico (considerando que dos lenguas comparten alguna caracterstica cuando
mantienen ambas cierta forma lxica concreta), o bien a caractersticas fonolgicas o
gramaticales.
Sin embargo, la representacin de las familias de lenguas mediante rboles filogenticos tiene
limitaciones cuando se aplica a ciertas familias, ya que las lenguas, a diferencia de los
individuos biolgicos, no tienen caractersticas permanentes por la influencia mutua, el
sprachbund o convergencia comn por factores sociales. La construccin de rboles
filogenticos resulta ms sencilla para unas familias lingsticas que para otras, por ejemplo,
para las lenguas austronesias, cuya expansin por el pacfico se produjo saltando de isla en
isla, la construccin de rboles resulta ms sencilla que para las lenguas urlicas o altaicas en
las que las influencias de unas lenguas en otras y la presencia de prstamo gramatical dificulta
enormemente la elaboracin de rboles filogenticos.
rboles cladsticos como modelos de cambio
rboles filogenticamente perfectos
Una condicin importante en los rboles empleados en lingstica es la condicin de filogenia
perfecta. Los rboles que satisfacen dicha condicin son los rboles filogentciamente
perfectos, que satisfacen la siguiente definicin:
Un rbol para un conjunto de lenguas tiene filogenia perfecta si para un conjunto de
caracteres , si es posible etiquetar los nodos del rbol de tal manera que los
caracteres evolucionen a lo largo del rbol sin retromutaciones o evolucin paralela en
. En este caso se dice que es compatible con los valores observados en las "hojas"
(nodos extremos) para todos los caracteres.
Cuando un nodo o proto-lengua B que no posee una caracterstica que s posee algn otro
nodo o proto-lengua A de la que deriva, experimenta un cambio o mutacin dando lugar a una
proto-lengua C que vuelve a poseer la caracterstica presente en la proto-lengua A y ausente en
la proto-lengua B.
Redes filogenticas

Red filogentica para las lenguas indoeuropeas, las lneas rojas son lneas de contacto que
permiten definir subrboles especiales para los caracteres heredados.
Es bien conocido, que los rboles filogenticos no pueden representar adecuadamente
situaciones de evolucin lingstica si hay un contacto lingstico importante entre las ramas del
rbol. En la medida que el prstamo lingstico entre ramas puede ser claramente identificado,
pueden ignorarse las caractersticas prestadas y seguir usndose rboles. Sin embargo, en los
casos en que la historia pasada no es bien conocida y los rasgos heradados no puden ser
separados de los rasgos prestados pueden introducirse las llamadas redes filogenticas, que en
esencia son una generalizacin de los rboles filogenticos (de hecho un rbol filogentico es
un tipo muy particular de red filogentica).3
Una red filogentica es un objeto topolgico etiquietado cuya topologa no es estrictamente un
rbol, sino un rbol al que se aaden lneas adicionales entre nodos de ramificacin para
representar situaciones de contacto o prstamo lingstico. Estas lneas adicionales hacen que
una red filogentica usa grafos que topolgicamente pueden contener ciclos y, por tanto, no
necesariamente son rboles topolgicos. En una red filogentica se consideran todos los
subrboles posibles, siendo filogenticamente adecuados si la evolucin temporal de cualquier
carcter puede ser representado por un un rbol filogentico contenido en la red.
CLASIFICACION DE WHITTAKER

Reinos y Dominios
La clasificacin biolgica es la manera en la que los cientficos clasifican a los diferentes
organismos vivos. Las ms utilizadas son la clasificacin biolgica segn el Criterio de
Whittaker o la que se rige por el Criterio de Woese.
El Criterio de Whittaker para la clasificacin de los organismos tiene en cuenta 4 aspectos
importantes de los mismos: el tipo celular (procariota, eucariota), el nivel de organizacin (si son
unicelulares o pluricelulares), el tipo de nutricin (auttrofos o hetertrofos) y el tipo de
reproduccin (sexual o asexual). Es as que divide a los organismos en 5 Reinos:
-Reino Monera: la clula es procariota, son organismos unicelulares tanto auttrofos como
hetertrofos y su reproduccin es asexual (se dividen por fisin binaria). Ejemplo: las bacterias
-Reino protista: la clula es de tipo eucaritico, son organismos tanto unicelulares como
pluricelulares, auttrofos y hetertrofos, de reproduccin sexuada y asexuada. Ejemplo: las
algas y los parsitos protozoos.
-Reino Fungi: la clula es eucariota, son uni o pluricelulares, hetertrofos (por absorcin), de
reproduccin sexuada y asexuada. Ejemplo: los hongos.
-Reino Plantae: la clula es eucariota, son organismos pluricelulares siempre, auttrofos y de
reproduccin tanto sexual como asexual. Ejemplo: las plantas.
-Reino Animalia: su clula es eucariota, son organismos pluricelulares en su totalidad,
hetertrofos (por ingestin) y se reproducen por la va sexual pero tambin lo hacen por va
asexual. Ejemplo: animales.
Por otro lado, tenemos el Criterio de clasificacin biolgica segn Woese. El mismo aade
un nivel superior al de Reino que se denomina Dominio. Por lo tanto para esta clasificacin
tenemos 3 Dominios y dentro de estos los diferentes reinos:
-Dominio Bacteria: dentro de este se encuentra el Reino Eubacteria
-Dominio Archea: dentro del cual encontramos el Reino Archibacterias (son bacterias ms
antiguas que las del Reino Bacteria muy similares a ellas pero con caractersticas particulares
que merecen su distincin y separacin) .
-Dominio Eukarya: dentro del cual se encuentran el Reino Protista, Reino Fungi, Reino Plantae
y Reino Animalia.