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INFOS CTIFL

MICHEL GIRAUD,
ctifl

infos ctifl
octobre 2012 N285

OBSERVATIONS SUR LA FLORE

FONGIQUE DU NOYER

cas PARTICULIER DU
COLLETOTRICHUM
rsum

La flore fongique du noyer a t particulirement tudie dans le cadre du

programme concert Ctifl-CreysseSENuRA-universit de Grone sur la
bactriose du noyer; en particulier sur
la possible interaction entre bactries
et champignons dans lexpression des
symptmes de bactrioses. Des analyses systmatiques ont t effectues
au Laboratoire de phytopathologie fruits
du Ctifl au centre de Lanxade, en 2007
et 2008. Un bilan de ces travaux ont
t prsents, notamment, au cours de
Conseil dadministration de la SENuRA
en avril dernier.

PRSENCE DE CHAMPIGNONS
Lors des prlvements effectus pour
le suivi des populations de bactries
Xanthomonas arboricola pv. juglandis,
la prsence de champignons dans les
bourgeons dormants, lors des isolements en botes de Ptri, a t constate. Ces champignons appartiennent
principalement trois genres : Alternaria, Fusarium et Colletotrichum (Figure 1). Le Colletotrichum isol a t
par la suite identifi comme tant de
lespce C. gloeosporioides. Quant aux
Fusarium, plusieurs espces sont prsentes, parmi lesquelles F. equisetii est
apparue comme dominante dans les
chantillons. Or, on sait que F. equisetii est associ avec X.a. pv. juglandis
dans lexpression du BAN (Brown
Apical Necrosis), maladie du noyer plus
frquente en Espagne, Italie, Grce,
ou Turquie, mais non formellement
reconnue en France (Belisario et al.,
1999). Les trois genres de champignon
sont connus comme parasites de nombreuses plantes, et certaines espces
4

> Colletotrichum : gauche, taches arrondies affectant le brou ; droite, noix

entirement ncrose avec formation de spores en masses oranges

sont pathognes des cultures. Dautres

espces ont t rencontres, mais sont
saprophytes : Epicoccum nigrum, Trichoderma sp., Sordaria fimicola.
Les bourgeons dormants de noyer sont
occups (les propagules ou spores de
champignon sont installs la surface
des cailles dans le bourgeon, mais
celui-ci reste sain ; les champignons
y survivent pendant lhiver) majoritairement par Alternaria sp. (80 90%)
dans les deux bassins (Figure 2). Par
ordre dimportance, Fusarium est en
deuxime position (20-30 %) galement dans les deux zones. En 2007
et 2008, Colletotrichum tait plus frquemment rencontr dans le Lot que
lIsre.
Paralllement, les recherches se sont
portes sur les types de ncroses (apicales et latrales) observes sur les
noix atteintes de bactriose au cours de
ces campagnes. On a alors constat la
prsence des trois espces fongiques,
parfois, mais pas toujours, associes
celle de X.a. pv. juglandis, aussi
bien dans des ncroses apicales que
latrales. Lorsque la bactrie est associe avec Colletotrichum, les ncroses
semblent plus importantes, pntrant
parfois lintrieur du brou. Dans certains cas de petites ncroses latrales,
aucune bactrie na t isole, mais un
mlange despces fongiques dont C.
gloeosporioides est lespce dominante.
La question sest alors pose de savoir
quel ventuel rle pouvait jouer ces

champignons dans lexpression de la

bactriose, sils intervenaient de faon saprophytique, cest--dire en colonisant les ncroses produites par la
bactriose, ou bien sils prparaient le
terrain la bactrie par une premire
attaque. Pour cela il fallait faire des
recherches divers stades de dveloppement depuis le bourgeon jusqu la
noix, en passant par la fleur, dans des
parcelles prsentant ou non de la bactriose. Deux couples de parcelles ont
t ainsi choisis en 2008 dans chaque
bassin. On a ainsi constat quAlternaria
tait prsent de faon quivalente dans
les bourgeons issus de toutes les parcelles, quelles soient ou non atteintes
par la bactriose, ainsi que sur les
fleurs et sur les noix. Quant Fusarium et Colletotrichum, trs prsents
dans les bourgeons et sur les noix,
ils taient quasiment absents sur les
fleurs. Lhypothse dune contamination saprophytique des ncroses dues
la bactriose est donc la plus probable,
et le bourgeon dormant reste le site
de survie des champignons, comme
dailleurs de Xanthomonas (Garcin et
al., 2001).
NCROSES ATYPIQUES
En 2008, plusieurs chantillons de
noix prsentant des ncroses atypiques
ont t reus au laboratoire : il sagissait de taches marron en dpression ;

OBSERVATIONS SUR LA FLORE FONGIQUE DU NOYER

cas PARTICULIER DU COLLETOTRICHUM

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octobre 2012 N285

Figure1: En culture (bote de Ptri), de gauche droite, Alternaria, Fusarium equisetii

et Colletotrichum gloeosporioides. Dans la bote de C. gloeosporioides, on distingue les
lignes oranges des acervules (fructifications porteuses de spores) qui se sont dveloppes
au point de contact entre deux souches de cette espce cultives ensemble.

certaines taient dj tapisses par les

acervules oranges de Colletotrichum.
Plusieurs souches ont t ainsi isoles
pour des examens complmentaires,
en particulier pour sassurer de lespce implique. Daprs les caractristiques morphologiques des colonies,
la forme des spores, le comportement
en prsence de certaines substances
dans le milieu de culture, il semble
plus probable que lon ait affaire C.
gloeosporioides, plutt qu lespce
trs voisine C. acutatum, mais une

confirmation par test biomolculaire,

laide des amorces spcifiques, serait
ncessaire pour plus de certitude. Des
tests dinoculation artificielle ont par
ailleurs t raliss avec ces souches
dabord sur pomme, puis sur jeune
noix : la formation de ncroses caractristiques sur pomme (C. acutatum et
C. gloeosporioides sont responsables du
Bitter rot, maladie connue de la pomme
en France [Giraud et al., 2001]), ce qui
est un moyen de confirmer la dtermination du genre de champignon, puis

Figure2: Frquence disolements des diffrentes espces fongiques au cours de deux

annes dtude, sur des parcelles de noyer suivies dans la rgion de Creysse (Lot) et en
Isre, exprime en % de bourgeons occups.

bibliographie

Belisario A., Forti E., Balmas V., Valier A., Corazza L., 1999. La fusariosi del frutto, una malattia del noce
commune. Linformatore Agrario 21,
p.51-52.

%
100
Alternaria
80

Fusarium
Colletotrichum
Trichoderma

60

Epicoccum
Sordaria

40

Autres genres

20

ensuite sur jeunes noix, prouvant ainsi

que lespce isole est bien pathogne
de la noix.
Le genre Colletotrichum est rpertori
sur de trs nombreuses cultures dans
le monde, responsable gnralement
des maladies appeles anthracnose
(la noix est une exception, puisque lanthracnose du noyer nest pas due un
Colletotrichum). Cependant, ce jour,
Colletotrichum nest pas inscrit comme
pathogne de la noix dans les bases
internationales. Il sagit donc dune
nouvelle maladie, peut-tre mergente,
mais confirmer. Lagent pathogne
est naturellement prsent en France
sur dautres espces vgtales et a trs
bien pu sadapter un nouvel hte suite
des conditions climatiques exceptionnelles. ce jour, il a t cit sur noix en
Slovaquie (Juhasova et al., 2005) et en
Core. Des travaux complmentaires
sont ncessaires pour mieux comprendre lpidmiologie de la maladie,
les conditions dinfection, de faon
pouvoir trouver et proposer des moyens
de protection efficaces.

2007

Quercy

2008

2007

Isre

2008

Garcin A., El Maataoui M., Prunet J.-P.,

Ginibre T., Penet C., 2001. La bactriose du noyer : nouvelles connaissances pour une vieille maladie,
synthse de travaux raliss (1995,
2000). Infos Ctifl, n 171 mai 2011,
p.27-30.
Giraud M., Westercamp P., Coureau
C., Chapon J.-F. et Berrie A., 2001.
Reconnatre les maladies de conservation pomme-poire. Brochure Ctifl.
100 pp.
Juhasova G., Ivanova H. Spizak J.,
2005. Occurrence and spread of the
parasitic microscopic fungi on walnut
(Juglans Regia L.) on vari