cat
2. Compartimentacin Celular
La mitocondria cuenta con una doble membrana cuya naturaleza impide el paso a algunas molculas.
El Piruvato es una de las molculas que s puede atravesar la membrana a travs de un transportador
especfico. El Piruvato debe atravesar la membrana para oxidarse y convertirse en Acetil-CoA que es la
materia prima que iniciar el Ciclo de Krebs, que se realiza en la matriz mitocondrial.
El motivo por el cual la oxidacin de Piruvato a Acetil-CoA se da dentro de la matriz mitocondrial es que
Acetil-CoA no puede atravesar la membrana. Tampoco pueden hacerlo NADH, CoA, y NAD +. Decimos que
son elementos compartimentados.
Las enzimas y metabolitos necesarios para llevar a cabo una va metablica suelen estar
compartimentado all donde se de esta ruta:
- En citosol encontramos las enzimas para llevar a cabo la gluclisis, parte de gluconeognesis,
sntesis de cidos grasos y nucletidos
- En la mitocondria: Enzimas para Ciclo de Krebs, Fosforilacin oxidativa, oxidacin de cidos
grasos, catabolismo de aminocidos
- Ncleo: Enzimas para replicacin de DNA, sntesis de mRNA y tRNA.
- Nuclolo: Enzimas para sntesis de rRNA.
- RE: Enzimas para sntesis de lpidos y transporte intracelular
- Ribosomas: Enzimas para sntesis de protenas.
- AG: Enzimas para maduracin de glicoprotenas y otros componentes de las membranas.
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3.Piruvato deshidrogenasa
1. Introduccin
El prituvato es una molcula de 3 carbonos (metil, carbonil y carboxil) que se origina en el citosol a partir
de, por ejemplo, la gluclisis. Posteriormente debe atravesar la doble membrana mitocondrial para
llegar a la matriz mitocondrial. En la membrana interna mitocondrial hay un transportador de piruvato
que facilita su paso a travs de sta.
Hay que saberse
la frmula del
Piruvato
Acetil-CoA:
Grupo acetil
Enlace tioster
El grupo carboxil del piruvato parte en forma de CO2 liberando electrones que son recogidos por NAD+ y
utilizados para pasar a NADH. Esta reaccin requiere un CoA-SH libre que acabar esterificado.
Las enzimas que conforman el complejo son:
-
E1 Piruvato deshidrogenasa
E2 Dihidrolipoil transacetilasa
E3 Dihidrolipoil deshidrogenasa
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3. Enzima E3 (Dihidrolipoil deshidrogenasa) : Dos reacciones:
a) Oxidacin Dihidro-lipoamida y reduccin de FAD: La dihidro-lipoamida es oxidada a
lipoamida a fin de poderse reutilizar. FAD aprovecha la oxidacin para reducirse a FADH 2.
b) Oxidacin de FADH2 y reduccin de NAD+: El FADH2 que acabamos de obtener se oxida
a FAD y NAD+ se reduce a NADH + H+.
En general, disminuyen la actividad de PDH una alta carga energtica y un alto poder reductor en la
clula, o un exceso de combustible (acetil-CoA y cidos grasos).
La obtencin de cidos grasos a partir de lpidos produce acetil-CoA y NADH que inhiben la actividad
piruvato deshidrogenasa, dificultando el uso del piruvato de la gluclisis.
Durante el ayuno, la obtencin de energa partir de lpidos implica un ahorro importante de carbohidratos.
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El ciclo de Krebs comienza con la incorporacin del Acetil-CoA ( 2 carbonos), que se combina con
oxalacetato (4C) para formar citrato (6C). No se utiliza un oxalacetato distinto por cada ciclo, sino que
el mismo se va reutilizando. El ciclo de Krebs tiene una G global = -57 kJ/mol. Es exergnico, aunque
tiene etapas que no lo son.
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4. CUARTA ETAPA*: El complejo alfa-cetoglutarato deshidrogenasa cataliza la descarboxilacin
oxidativa del -cetoglutarato para obtener succinil-CoA. Lo hace de manera similar a piruvato
deshidrogenasa (son parientes evolutivos) ya que necesita NAD+ y CoA-SH y proporciona NADH,
que se usar en la cadena de electrones. Es una reaccin exergnica (G = -33,5 kJ/mol).
El complejo est formado por 3 enzimas (E1, E2 y E3) que utilizan los mismos cofactores que el
complejo piruvato deshidrogenasa, aunque como parte de sustrato diferente, genera producto
diferente. Los coenzimas son 5: TPP, lipoamida, CoA-SH, NAD+ y FAD.
5. QUINTA ETAPA: La succinil-CoA sintetasa utiliza la energa libre del enlace tioster para formar
succinato y GTP en un proceso de fosforilacin a nivel de sustrato:
1. La energa libre del enlace tioester se utiliza para formar succinilfosfato unido al enzima
2. El fosfato queda unido al enzima y se libera succinato.
3. El enzima transfiere el fosfato al GDP. Obtenemos el GTP.
Esta reaccin es exergnica, pero muy poco (G = -2,9 kJ/mol). Por lo que podr darse la
reaccin en ambos sentidos.
El GTP obtenido se puede transformar en ATP gracias a la Nuclesido difosfato quinasa (Se
requiere H2O en el proceso):
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6. SEXTA ETAPA: La succinato deshidrogenasa oxida el succinato reduciendo FAD. Obtenemos
fumarato, que estar oxidado y tendr un doble enlace. Reaccin con G = 0 kJ/mol aprox,
podr darse en ambos sentidos.
7. SEPTIMA ETAPA: La fumarasa cataliza la hidratacin del fumarato. Obtenemos L-malato. Es una
raccin exergnica (G = -3,8 kJ/mol), pero reversible.
La fumarasa es una enzima esteroespecfico que slo puede hidratar el doble enlace en
configuracin trans del fumarato (cuando los dos grupos carboxilos estn en plano diferente).
*si los dos carboilos estuviesen en el mismo plano se llamara maleato (que no forma parte de
CK). El producto de la transformacin del maleato, el D-malato, es un inhibidor del ciclo de
Krebbs.
8. OCTAVA ETAPA: La malato deshidrogenasa oxida el L-malato a oxalacetato transfiriendo electrones
al NAD+, reducindolo. La reaccin es endergnica (G = 29,7 kJ/mol). Lo que provoca que la
reaccin ocurra es la alta concentracin de L-malato y la baja concentracin de oxalacetato.
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4.2.2.Isocitrato deshidrogenasa
Es inhibida si hay alta concentracin de NADH (dificultar la unin de NAD+), adems de que una elevada
relacin NADH/NAD+ provocar un balance desfavorable para la reaccin.
Si la relacin ATP/ADP es elevada, tambin es inhibida.
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5.1.Reacciones Anaplerticas
Permiten que las concentraciones de los metabolitos intermediadios del CK permanezcan constantes.
Son procesos que requieren ATP y poder reductor, pero como se dan en condiciones en la que ambos
elementos estn en abundancia, esto no es problema.
Otros ejemplos de reacciones anaplerticas son catalizadas por transaminasas (catalizan transferencia
de grupos amino entre Aa y cetocidos) como ALT (Alanina aminotransferasa) y AST (Aspartato
aminotransferasa). Por ejemplo, podr convertir el oxalacetato en aspartato (Aa) y cetoglutarato en
glutamato (Aa).
Adems, del Ciclo de Krebs tambin se extraen metabolitos para la sntesis de lpidos y para grupos
prostticos (como grupo hemo), que son esenciales para protenas, como la hemoglobina, y estn
presentes en los citocromos.
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La
de
Esto es importante en el caso de un hgado en ayuno, que obtiene grandes cantidades de acetil-CoA y
NADH de la oxidacin de cidos grasos y podr utilizar stos intermediarios para generar glucosa y obtener
energa.
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A + BH2
E = E del par aceptor E del par donador (en condiciones estndar l usar E y E)
G=-E n F
n= n de electrones; F= constante de Faraday (96,480 KJ/Vmol)
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Otro donador de electrones puede ser succinato. (Gracias a la succinato deshidrogenasa, de succinato
podemos obtener FADH2).
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5. Va de Transporte de electrones.
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6.2. Grupos hemo de los citocromos:
Los citocromos son protenas con una intensa absorcin de luz porque tienen un grupo prosttico en el
que estn coordinados tomos de hierro. Hay tres tipos de citocromos:
B
A
El citocromo C slo puede transportar un solo electrn. Por tanto, puede presentar dos formas: Oxidada
y Reducida. Es una protena cuyo grupo hemo recuerda al grupo hemo tipo A de la hemoglobina.
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Reaccin Global:
*P: intermembrana
*N: matriz
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7.2. Complejo II
Tambin
llamado
complejo
succinato
deshidrogenasa (es una de las enzimas del Ciclo de
Krebs).Tiene 4 subunidades A, B, C y D. C y D le
permiten estar integrada en la membrana debido a
su naturaleza hidrofbica. El FADH2 que se forma en
el ciclo de Krebs tiene como destino dar electrones
a la coenzima Q.
La subunidad A es una flavoprotena hidroflica que
utiliza como cofactor una molcula FAD y tiene un
dominio de unin a succinato. La subunidad B,
tambin hidroflica, tiene tres clsters de Fe-S.
En resumen: contiene un grupo hemo B, un dominio
de unin a la ubiquinona (Q), tres centros de Fe-S,
FAD y un dominio de unin al succinato. La ruta de
transferencia es desde el dominio de unin del
succinato (que se convertir en fumarato) a travs
de los d centros de Fe-S hasta el dominio de unin a
la coenzima Q.
Una de las principales diferencias con el Complejo I
es que este complejo no bombea protones, slo
permite el paso de electrones hacia la coenzima Q.
*Imagen: De la oxidacin de los cidos grasos, que tiene lugar en la matriz mitocondrial, se obtienen
Acil-CoA grasos. La enzima Acil-CoA grasos deshidrogenasa puede dar electrones hacia la membrana
interna mitocondrial.
La gluclisis, que se realiza en el citosol, proporciona NADH. De ste se obtienen tambin electrones que
se aprovechan en la transferencia de electrones a la coenzima Q.
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8. Resto de complejos
8.1. Complejo III
Conocido como ubiquinol citocromo C reductasa. Acopla la transferencia de electrones desde el
ubiquinol. (QH2) al citocromo C, aprovechando la energa para el bombeo de protones de la matriz al
espacio intermembrana.
Tiene dos dominios de unin a la coenzima Q:
-
QH2 + 2 Cit C
(oxidat)
Cuando la coenzima Q se reduce, gana protones de la matriz. Cuando se oxida, en cambio, deja protones
en el espacio intermembranal. Por cada 2 electrones transferidos, se bombean 4 protones de la matriz
al espacio intermembranoso.
La coenzima Q puede transportar 1 o 2 electrones, mientras que citocromo C slo puede transportarlos
de uno en uno. Por este motivo, en ocasiones encontraremos coenzimas Q semireducidas, que debern
ser reducidas del todo antes de poder oxidarse completamente y liberar protones en el espacio
intermembranal.
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8.2. Complejo IV (en caso de intoxicacin con cianuro, se inhibe).
Tambien llamado citocromo oxidasa. Es el ltimo paso de la cadena respiratoria. Transporta electrones
desde el citocromo C hasta el oxgeno molecular, reducindolo a H2O.
La transferencia de electrones a travs de este complejo va desde el citocromo C al centro Cu A, despus
al centro hemo A, despus al centro hemo A 3-CuB y finalmente al O2.
Se necesitan dos citocromos C (dos electrones) para poder reducir dos tomos de oxgeno. Los citocromos
C pasan secuencialmente. El oxgeno se une al cobre recibiendo electrones a la vez que capta H + de la
matriz, de manera que se forma la molcula de agua.
Por cada 2 electrones, un tomo de oxgeno es reducido captando dos protones de la matriz. Adems se
bombardean dos protones al espacio intermembrana.
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Esta imagen explica cmo se lleva acabo el gradiente. Primero hay una acumulacin de H + en la
intermembrana y una acumulacin de iones en la matriz, cosa que genera un potencial elctrico en la
membrana (positivo fuera, negativo en la matriz).
Una vez generado el potencial elctrico, los protones vuelven a la matriz ayudados por la ATP sintasa y
por el potencial electroqumico generado. El trabajo necesario para crear el gradiente de protones
depende del gradiente preexistente.
La acumulacin de protones y la repulsin de cargas (los H+ se repelen entre ellos) son las dos fuerzas
que impulsan la ATP sintasa.
Si el gradiente de protones fuese muy alto, podra llegar un momento en que el gradiente fuese
demasiado elevado como para que NADH pudiese oxidarse y entregase los electrones al oxgeno. As pues,
la transferencia de electrones tambin depende de las concentraciones de los compuestos.
Si la ATP sintasa no se abriera y no pudiesen retornar los protones, el gradiente se acumulara. Este
fenmeno provocara que NADH no pudiese oxidarse y, por tanto, quedase acumulado en forma reducida,
cosa que frenara el ciclo de Krebs.
Si el gradiente disminuyera, y tambin el potencial elctrico, tendramos menos energa libre
almacenada para sintetizar ATP. Por otro lado, la oxidacin de NADH sera ms fcil. Si no se produjese
ATP, se favorecera el bombeo de protones a la intermembrana y estos no retornaran a la matriz. Cosa
que volvera a provocar una acumulacin de gradiente que volvera a dificultar la oxidacin de NADH.
Por otro lado, si la sntesis de ATP es alta, la oxidacin de NADH estara facilitada.
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8.4. Complejo V
ATP sintetasa:
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En esta imagen vemos la misma seccin de la ATP sintasa en diferentes momentos. Podemos observar
cada una de las 3 subunidades en una etapa distinta.
Etapa 1: Unin ADP+Pi a la subunidad
Etapa 2: Formacin del ATP
Etapa 3: Liberacin del ATP. Est impulsada por la entrada de 3 protones a la matriz.
La flecha verde de la imagen representa a la subunidad de F0. Al girar esta, cada subunidad realiza
los 3 pasos.
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Por 2 electrones del NADH, salen 10 H+, se reduce un tomo de O2 y se forman 2,5 ATP aprox.
Por 2 electrones del succinato o FADH2, salen 6 H+, se reduce un tomo de O2 y se forma 1,5 ATP
aprox.
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Los radicales libres y otras especies reactivas son peligrosos porque se unen a cualquier elemento libre
que encuentren. Son muy peligrosos para la clula porque pueden provocar, por ejemplo, la inhibicin
de vas unindose a reguladores.
Un ejemplo de radical libre es el ion superxido, que es generado por el complejo IV cuando en vez de
obtener 2 electrones, obtiene slo 1. Las clulas tienen mecanismos para neutralizar stos radicales
libres:
1. La enzima superxido dismutasa elimina el ion superxido generando perxido de hidrgeno.
Este perxido de hidrgeno es eliminado por una peroxidasa, como la glutatin peroxidasa, muy
importante. Sobre todo en eritrocitos.
2. Existen tambin molculas antioxidantes. A nivel sanguneo encontramos, por ejemplo, la
bilirrubina. Otro ejemplo es el cido ascrbico.
Cuando las mitocondrias tienen un exceso de protones, el ciclo de transporte de electrones puede verse
afectado. En este caso, la coenzima Q cedera los electrones directamente al oxgeno generando
superxido. Este superxido puede generar la expresin de protenas desacoplantes UCP, que se
encargaran de disipar el gradiente de protones excesivo.
En resumen, la presencia de superxido, generado por culpa del exceso de protones en la mitocondria,
provoca la expresin de protenas que tienen como funcin acabar con ese exceso de protones para
prevenir la generacin de ms superxido.
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